FBXO11

FBXO11
Идентификаторы
Псевдонимы	FBXO11 , FBX11, PRMT9, UBR6, VIT1, UG063H01, белок 11 F-бокса, IDDFBA
Внешние идентификаторы	Опустить : 607871 ; МГИ : 2147134 ; Гомологен : 11843 ; Генные карты : FBXO11 ; OMA : FBXO11 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	47,906,498 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	88,372,719 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; cerebellar hemisphere; ; mucosa of paranasal sinus; ; Achilles tendon; ; right hemisphere of cerebellum; ; superficial temporal artery; ; ovary; ; left ovary; ; trabecular bone;
	Top expressed in
	zygote; ; lateral septal nucleus; ; Gonadal ridge; ; ventromedial nucleus; ; mammillary body; ; pineal gland; ; anterior amygdaloid area; ; lateral hypothalamus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; ventral tegmental area;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	zinc ion binding; protein binding; protein-arginine N-methyltransferase activity; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity;
Cellular component	ubiquitin ligase complex; cytoplasm; nucleolus; nucleus; chromosome; cytosol;
Biological process	hearing; protein ubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; peptidyl-arginine N-methylation; protein polyubiquitination; post-translational protein modification; regulation of apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	80204
	225055
	ENSG00000138081
	ENSMUSG00000005371
	Q86XK2
	Q7TPD1
	НМ_001190274 ; НМ_012167 ; НМ_018693 ; НМ_025133 ; НМ_001374325
	НМ_001081034 ; НМ_001348248 ; НМ_001379303 ; НМ_001379304 ; НМ_001379305
	НП_001177203 ; НП_079409 ; НП_001361254
	НП_001074503 ; НП_001335177 ; НП_001366232 ; НП_001366233 ; НП_001366234
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 11, содержащий только F-бокс, представляет собой белок , который у человека кодируется FBXO11 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков F-бокса , состоящим примерно из 40 аминокислот , который характеризуется мотивом , F-боксом. Белки F-box составляют одну из четырех субъединиц убиквитинпротеинлигазного комплекса, называемого SCF (SKP1-куллин-F-box), которые функционируют в фосфорилирования зависимом от убиквитинировании . Белки F-box делятся на 3 класса: Fbws, содержащие домены WD-40 , Fbls, содержащие богатые лейцином повторы , и Fbxs, содержащие либо разные модули межбелкового взаимодействия, либо не содержащие распознаваемых мотивов. Белок, кодируемый этим геном, относится к классу Fbxs. Для этого гена были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы. ^{[ 8 ]}

FBXO11 консервативен от нематод до млекопитающих, и как человеческий FBXO11, так и его ортолог червя (DRE-1) образуют функциональные комплексы убиквитин-лигазы SCF . Связываясь с белками-субстратами и опосредуя их деградацию, FBXO11 играет важную роль в регуляции клеточного цикла, онкогенезе и метастазировании опухолевых клеток . Хорошо известные цели FBXO11 включают BCL6 , ^{[ 9 ]} CDT2 , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и Улитка . ^{[ 12 ]}

Клиническое значение

Было показано, что инактивация FBXO11-опосредованной деградации BCL6 способствует аномальному образованию зародышевых центров и онкогенезу. ^{[ 13 ]} созревания . Сообщалось, что Caenorhabditis elegans DRE-1/FBXO11 нацелен на консервативный фактор транскрипции BLMP-1 для протеасомной деградации и тем самым регулирует сроки развития и ^{[ 14 ]} Было обнаружено, что ген, кодирующий FBXO11, удален или мутирован во множественных клеточных линиях диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы (DLBCL), и эта инактивация FBXO11 способствует повышению уровней BCL6 и, как следствие, патогенезу DLBCL. ^{[ 9 ]} Мутации FBXO11 также были выявлены при других видах рака человека, таких как опухоли толстой кишки, легких, яичников, а также головы и шеи. У мышей гомозиготная мутация FBXO11 приводит к дефектам расщелины неба , расщелине лица и перинатальной смертности . Более того, гаплонедостаточные мутантные аллели вызывают средний отит — заболевание, которым страдают примерно 15% детей. ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000138081 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005371 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сенчарелли К., Чиаур Д.С., Гуардаваккаро Д., Паркс В., Видал М., Пагано М. (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Современная биология . 9 (20): 1177–9. Бибкод : 1999CBio....9.1177C . дои : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . ПМИД 10531035 . S2CID 7467493 .
^ Кук-младший, Ли Дж.Х., Ян З.Х., Краузе К.Д., Херт Н., Хоффманн Р., Пестка С. (апрель 2006 г.). «FBXO11/PRMT9, новый белок аргининметилтрансфераза, симметрично диметилирует остатки аргинина». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 342 (2): 472–81. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.01.167 . ПМИД 16487488 .
^ Ли М.Дж., Пал К., Тасаки Т., Рой С., Цзян Ю., Ан Дж.Ю., Банерджи Р., Квон Ю.Т. (январь 2008 г.). «Синтетические гетеровалентные ингибиторы, нацеленные на распознавание компонентов E3 пути правила N-конца» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (1): 100–5. Бибкод : 2008PNAS..105..100L . дои : 10.1073/pnas.0708465105 . ПМК 2224166 . ПМИД 18162545 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 11 F-бокса FBXO11» .
^ Jump up to: ^а ^б Дуан С., Чермак Л., Паган Дж.К., Росси М., Мартиненго С., ди Челле П.Ф., Чапуй Б., Шипп М., Чиарле Р., Пагано М. (январь 2012 г.). «FBXO11 нацелен на деградацию BCL6 и инактивируется при диффузных крупных B-клеточных лимфомах» . Природа . 481 (7379): 90–3. Бибкод : 2012Natur.481...90D . дои : 10.1038/nature10688 . ПМЦ 3344385 . ПМИД 22113614 .
^ Аббас Т., Мюллер А.С., Шибата Э., Китон М., Росси М., Датта А. (март 2013 г.). «CRL1-FBXO11 способствует убиквитилированию и деградации Cdt2 и регулирует клеточную миграцию, опосредованную Pr-Set7/Set8» . Молекулярная клетка . 49 (6): 1147–58. doi : 10.1016/j.molcel.2013.02.003 . ПМК 3615078 . ПМИД 23478445 .
^ Росси М., Дуан С., Чон Ю.Т., Хорн М., Сараф А., Флоренс Л., Уошберн М.П., Антеби А., Пагано М. (март 2013 г.). «Регуляция убиквитинлигазы CRL4 (Cdt2) и выхода из клеточного цикла с помощью убиквитинлигазы SCF (Fbxo11)» . Молекулярная клетка . 49 (6): 1159–66. doi : 10.1016/j.molcel.2013.02.004 . ПМЦ 3624904 . ПМИД 23478441 .
^ Чжэн Х, Шен М, Чжа ЮЛ, Ли В, Вэй Ю, Бланко М.А., Рен Г, Чжоу Т, Сторц П, Ван ХИ, Кан Ю (сентябрь 2014 г.). «Зависимая от фосфорилирования PKD1 деградация SNAIL с помощью SCF-FBXO11 регулирует эпителиально-мезенхимальный переход и метастазирование» . Раковая клетка 26 (3): 358–373. дои : 10.1016/j.ccr.2014.07.022 . ПМК 4159622 . ПМИД 25203322 .
^ Шнайдер С, Кон Н, Амадори Л, Шен К, Шварц Ф.Х., Тишлер Б, Боссеннек М, Домингес-Сола Д, Бхагат Г, Гу В, Бассо К, Далла-Фавера Р (август 2016 г.). «Инактивация FBXO11 приводит к аномальному образованию зародышевых центров и лимфопролиферативным заболеваниям» . Кровь . 128 (5): 660–6. дои : 10.1182/blood-2015-11-684357 . ПМК 9709922 . ПМИД 27166359 .
^ Ячейка разработки. 31 марта 2014 г.; 28 (6): 697-710. doi: 10.1016/j.devcel.2014.01.028. DRE-1/FBXO11-зависимая деградация BLMP-1/BLIMP-1 определяет сроки развития и созревания C. elegans. Хорн М., Гейзен С., Чермак Л., Беккер Б., Накамура С., Кляйн С., Пагано М., Антеби А.
^ Хардисти-Хьюз Р.Э., Татеоссян Х., Морс С.А., Ромеро М.Р., Миддлтон А., Тимовска-Лаланн З., Хантер А.Дж., Чизмен М., Браун С.Д. (ноябрь 2006 г.). «Мутация в гене F-box, Fbxo11, вызывает средний отит у мышей Джеффа» . Молекулярная генетика человека . 15 (22): 3273–9. дои : 10.1093/hmg/ddl403 . ПМИД 17035249 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Уинстон Дж. Т., Кепп Д. М., Чжу С., Элледж С. Дж., Харпер Дж. В. (октябрь 1999 г.). «Семейство белков F-бокса млекопитающих» . Современная биология . 9 (20): 1180–2. Бибкод : 1999CBio....9.1180W . дои : 10.1016/S0960-9822(00)80021-4 . ПМИД 10531037 . S2CID 14341845 .
Ле Пул И.С., Сарангараджан Р., Чжао Ю., Стеннетт Л.С., Браун Т.Л., Шет П., Мики Т., Буасси Р.Э. (декабрь 2001 г.). « VIT1, новый ген, связанный с витилиго» . Исследование пигментных клеток . 14 (6): 475–84. дои : 10.1034/j.1600-0749.2001.140608.x . ПМЦ 1747534 . ПМИД 11775060 .
Сегаде Ф, Дейли К.А., Оллред Д., Хикс П.Дж., Кокс М., Браун М., Хардисти-Хьюз Р.Э., Браун С.Д., Рич СС, Боуден Д.В. (июль 2006 г.). «Ассоциация гена FBXO11 с хроническим средним отитом с выпотом и рецидивирующим средним отитом: семейное исследование COME/ROM в Миннесоте» . Архив отоларингологии – хирургии головы и шеи . 132 (7): 729–33. дои : 10.1001/archotol.132.7.729 . ЧВК 1904347 . ПМИД 16847180 .
Абида В.М., Николаев А., Чжао В., Чжан В., Гу В. (январь 2007 г.). «FBXO11 способствует неддилированию р53 и ингибирует его транскрипционную активность» . Журнал биологической химии . 282 (3): 1797–804. дои : 10.1074/jbc.M609001200 . ПМК 3690493 . ПМИД 17098746 .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000138081 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005371 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10531035-5] Сенчарелли К., Чиаур Д.С., Гуардаваккаро Д., Паркс В., Видал М., Пагано М. (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Современная биология . 9 (20): 1177–9. Бибкод : 1999CBio....9.1177C . дои : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . ПМИД 10531035 . S2CID 7467493 .

[pmid16487488-6] Кук-младший, Ли Дж.Х., Ян З.Х., Краузе К.Д., Херт Н., Хоффманн Р., Пестка С. (апрель 2006 г.). «FBXO11/PRMT9, новый белок аргининметилтрансфераза, симметрично диметилирует остатки аргинина». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 342 (2): 472–81. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.01.167 . ПМИД 16487488 .

[pmid18162545-7] Ли М.Дж., Пал К., Тасаки Т., Рой С., Цзян Ю., Ан Дж.Ю., Банерджи Р., Квон Ю.Т. (январь 2008 г.). «Синтетические гетеровалентные ингибиторы, нацеленные на распознавание компонентов E3 пути правила N-конца» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (1): 100–5. Бибкод : 2008PNAS..105..100L . дои : 10.1073/pnas.0708465105 . ПМК 2224166 . ПМИД 18162545 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 11 F-бокса FBXO11» .

[Duan_2012-9] Jump up to: ^а ^б Дуан С., Чермак Л., Паган Дж.К., Росси М., Мартиненго С., ди Челле П.Ф., Чапуй Б., Шипп М., Чиарле Р., Пагано М. (январь 2012 г.). «FBXO11 нацелен на деградацию BCL6 и инактивируется при диффузных крупных B-клеточных лимфомах» . Природа . 481 (7379): 90–3. Бибкод : 2012Natur.481...90D . дои : 10.1038/nature10688 . ПМЦ 3344385 . ПМИД 22113614 .

[pmid23478445-10] Аббас Т., Мюллер А.С., Шибата Э., Китон М., Росси М., Датта А. (март 2013 г.). «CRL1-FBXO11 способствует убиквитилированию и деградации Cdt2 и регулирует клеточную миграцию, опосредованную Pr-Set7/Set8» . Молекулярная клетка . 49 (6): 1147–58. doi : 10.1016/j.molcel.2013.02.003 . ПМК 3615078 . ПМИД 23478445 .

[Rossi_2013-11] Росси М., Дуан С., Чон Ю.Т., Хорн М., Сараф А., Флоренс Л., Уошберн М.П., Антеби А., Пагано М. (март 2013 г.). «Регуляция убиквитинлигазы CRL4 (Cdt2) и выхода из клеточного цикла с помощью убиквитинлигазы SCF (Fbxo11)» . Молекулярная клетка . 49 (6): 1159–66. doi : 10.1016/j.molcel.2013.02.004 . ПМЦ 3624904 . ПМИД 23478441 .

[Zheng_2014-12] Чжэн Х, Шен М, Чжа ЮЛ, Ли В, Вэй Ю, Бланко М.А., Рен Г, Чжоу Т, Сторц П, Ван ХИ, Кан Ю (сентябрь 2014 г.). «Зависимая от фосфорилирования PKD1 деградация SNAIL с помощью SCF-FBXO11 регулирует эпителиально-мезенхимальный переход и метастазирование» . Раковая клетка 26 (3): 358–373. дои : 10.1016/j.ccr.2014.07.022 . ПМК 4159622 . ПМИД 25203322 .

[Schneider_2016-13] Шнайдер С, Кон Н, Амадори Л, Шен К, Шварц Ф.Х., Тишлер Б, Боссеннек М, Домингес-Сола Д, Бхагат Г, Гу В, Бассо К, Далла-Фавера Р (август 2016 г.). «Инактивация FBXO11 приводит к аномальному образованию зародышевых центров и лимфопролиферативным заболеваниям» . Кровь . 128 (5): 660–6. дои : 10.1182/blood-2015-11-684357 . ПМК 9709922 . ПМИД 27166359 .

[14] Ячейка разработки. 31 марта 2014 г.; 28 (6): 697-710. doi: 10.1016/j.devcel.2014.01.028. DRE-1/FBXO11-зависимая деградация BLMP-1/BLIMP-1 определяет сроки развития и созревания C. elegans. Хорн М., Гейзен С., Чермак Л., Беккер Б., Накамура С., Кляйн С., Пагано М., Антеби А.

[Hardisty-Hughes_2006-15] Хардисти-Хьюз Р.Э., Татеоссян Х., Морс С.А., Ромеро М.Р., Миддлтон А., Тимовска-Лаланн З., Хантер А.Дж., Чизмен М., Браун С.Д. (ноябрь 2006 г.). «Мутация в гене F-box, Fbxo11, вызывает средний отит у мышей Джеффа» . Молекулярная генетика человека . 15 (22): 3273–9. дои : 10.1093/hmg/ddl403 . ПМИД 17035249 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]