НИПБЛ
| НИПБЛ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | NIPBL , CDLS, CDLS1, IDN3, IDN3-B, Scc2, коэффициент нагрузки когезина, коэффициент загрузки когезина NIPBL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 608667 ; МГИ : 1913976 ; Гомологен : 15850 ; GeneCards : NIPBL ; ОМА : НИПБЛ — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nipped-B-подобный белок ( NIPBL ), также известный как SCC2 или делангин, представляет собой белок , который у человека кодируется NIPBL геном . [ 5 ] NIPBL необходим для ассоциации когезина с ДНК и является основной субъединицей комплекса загрузки когезина. [ 6 ] Гетерозиготные мутации в NIPBL составляют примерно 60% случаев синдрома Корнелии де Ланге . [ 7 ]
Структура и взаимодействия
[ редактировать ]
NIPBL — крупный белок крючковидной формы, содержащий повторы HEAT . [ 8 ] NIPBL образует комплекс с MAU2 (Scc4 у почкующихся дрожжей), известный как комплекс загрузки когезина. [ 9 ] Как следует из этого названия, NIPBL и MAU2 необходимы для первоначальной ассоциации когезина с ДНК.
Считается, что когезин опосредует взаимодействия энхансер-промотор и генерирует топологически ассоциированные домены (TAD) . Помимо обеспечения сплоченности и регуляции архитектуры ДНК, когезиновый комплекс необходим для репарации ДНК путем гомологичной рекомбинации . Учитывая, что NIPBL необходим для ассоциации когезина с ДНК, считается, что NIPBL также необходим для всех этих процессов. Соответственно, инактивация Nipbl приводит к потере топологически связанных доменов. [ 10 ] и сплоченность. [ 11 ]
NIPBL динамически связывается с хроматином главным образом посредством ассоциации с когезином . [ 12 ] Движение NIPBL внутри хроматина согласуется с механизмом, включающим перескок между хромосомными кольцами когезина. Для NIPBL также была продемонстрирована независимая от когезина функция регуляции экспрессии генов. [ 13 ] [ 14 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в этом гене приводят к синдрому Корнелии де Ланге (CdLS), расстройству, характеризующемуся дисморфическими чертами лица, задержкой роста, дефектами уменьшения конечностей и умственной отсталостью. [ 5 ] Поскольку эти мутации обычно гетерозиготны , CdLS вызван снижением количества Nipbl, а не полной потерей. Эксперименты на клетках пациентов и мышей показывают, что снижение происходит менее чем вдвое. [ 15 ] Неизвестно, почему снижение экспрессии Nipbl приводит к CdLS.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164190 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022141 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: гомолог Nipped-B (дрозофила)» .
- ^ Чиоск Р., Шираяма М., Шевченко А., Танака Т., Тот А., Шевченко А., Нэсмит К. (2000). «Связывание когезина с хромосомами зависит от отдельного комплекса, состоящего из белков Scc2 и Scc4» . Молекулярная клетка . 5 (2): 243–54. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80420-7 . ПМИД 10882066 .
- ^ Рохатги С., Кларк Д., Клайн А.Д., Джексон Л.Г., Пи Дж., Сиу В., Рамос Ф.Дж., Кранц И.Д., Дирдорф М.А. (июль 2010 г.). «Лицевой диагноз легкой и вариантной формы CdLS: данные опроса дисморфолога» . Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 152А (7): 1641–53. дои : 10.1002/ajmg.a.33441 . ПМЦ 4133091 . ПМИД 20583156 .
- ^ Кикучи С., Борек Д.М., Отвиновски З., Томчик Д.Р., Ю Х. (ноябрь 2016 г.). «Кристаллическая структура загрузчика когезина Scc2 и понимание когезинопатии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (44): 12444–12449. Бибкод : 2016PNAS..11312444K . дои : 10.1073/pnas.1611333113 . ПМК 5098657 . ПМИД 27791135 .
- ^ Нэсмит К. (октябрь 2011 г.). «Когезин: катеназа с отдельными входными и выходными воротами?». Природная клеточная биология . 13 (10): 1170–7. дои : 10.1038/ncb2349 . ПМИД 21968990 . S2CID 25382204 .
- ^ Шварцер В., Абденнур Н., Голобородко А., Пековска А., Фуденберг Г., Ло-Ми Ю., Фонсека Н.А., Хубер В., Херинг С., Мирный Л., Шпиц Ф. (15 декабря 2016 г.). «При удалении когезина выявляются два независимых способа организации хромосом». п. 094185. bioRxiv 10.1101/094185 .
- ^ Чиоск Р., Шираяма М., Шевченко А., Танака Т., Тот А., Шевченко А., Нэсмит К. (февраль 2000 г.). «Связывание когезина с хромосомами зависит от отдельного комплекса, состоящего из белков Scc2 и Scc4» . Молекулярная клетка . 5 (2): 243–54. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80420-7 . ПМИД 10882066 .
- ^ Роудс Дж., Мацца Д., Нэсмит К., Упхофф С. (2017). «Scc2/Nipbl прыгает между хромосомными когезиновыми кольцами после загрузки» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/eLife.30000 . ПМК 5621834 . ПМИД 28914604 .
- ^ Зуин Дж., Франке В., ван Эйкен В.Ф., ван дер Слоот А., Кранц И.Д., ван дер Рейден М.И., Накато Р., Ленхард Б., Вендт К.С. (февраль 2014 г.). «Независимая от когезина роль NIPBL в промоторах дает представление о CdLS» . ПЛОС Генетика . 10 (2): e1004153. дои : 10.1371/journal.pgen.1004153 . ПМЦ 3923681 . ПМИД 24550742 .
- ^ ван ден Берг Д.Л., Азарелли Р., Оиси К., Мартынога Б., Урбан Н., Деккерс Д.Х., Деммерс Дж.А., Гиймо Ф. (январь 2017 г.). «Nipbl взаимодействует с Zfp609 и интеграторным комплексом, регулируя миграцию кортикальных нейронов» . Нейрон . 93 (2): 348–361. дои : 10.1016/j.neuron.2016.11.047 . ПМК 5263256 . ПМИД 28041881 .
- ^ Каваучи С., Калоф А.Л., Сантос Р., Лопес-Бёркс М.Э., Янг К.М., Хоанг М.П., Чуа А., Лао Т., Лехнер М.С., Дэниел Дж.А., Нусенцвейг А., Китцес Л., Йокомори К., Халлгримссон Б., Ландер А.Д. (сентябрь 2009 г.) . «Множественные дефекты систем органов и нарушение регуляции транскрипции у мышей Nipbl (+/-), модель синдрома Корнелии де Ланге» . ПЛОС Генетика . 5 (9): е1000650. дои : 10.1371/journal.pgen.1000650 . ПМЦ 2730539 . ПМИД 19763162 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
 | Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |