Salmonella enterica subsp. Энтерика
| Salmonella enterica subsp. Энтерика | |
|---|---|
| |
| сальмонеллы Колонии тайфимуриум на кишечной агаровой тарелке Hektoen | |
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Pseudomonadota |
| Сорт: | Gammaproteobacteria |
| Заказ: | Энтеробактераллы |
| Семья: | Enterobacteriaceae |
| Род: | Сальмонелла |
| Разновидность: | |
| Подвиды: | С. Э. подпрокат Энтерика
|
| Триномиальное название | |
| Salmonella enterica subsp. Энтерика | |
Salmonella enterica subsp. Enterica -это подвид Salmonella enterica , в форме стержня, жгутикованной , аэробной, грамотрицательной бактерии . Многие из патогенных сероваров видов S. enterica находятся в этом подвиде, в том числе ответственный за брюшной тиф . [ 1 ]
Серовары
[ редактировать ]Salmonella enterica subsp. Серовары Enterica определяются на основе их соматических (O) и жгутиковых (H) антигенов, в общей сложности более 2600 сероваров; Только около 50 из этих сероваров являются общими причинами инфекций у людей. [ 2 ] Большинство из этих сероваров встречаются в окружающей среде и выживают в растениях, воде и почве; Многие серовары имеют широкие диапазоны хозяина, которые позволяют им колонизировать различные виды у млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий и насекомых. Зонотические заболевания , такие как сальмонелла , распространяются между окружающей средой и людьми. [ 3 ]
В настоящее время используется ряд методов для различения серотипов . К ним относятся поиск наличия или отсутствия антигенов , типирования фагов , молекулярного отпечатков пальцев и биотипирования, где серовориты дифференцируются с помощью питательных веществ, которые они способны для ферментации. Возможным фактором в определении диапазона хозяев конкретных сероваров является фаг-опосредованное приобретение небольшого числа генетических элементов, которые позволяют заразить конкретного хозяина. [ 4 ] Далее постулируется, что серовары, которые заражают узкий спектр видов, расходились от предков с широким диапазоном хозяина, и с тех пор специализируются и потеряли способность заразить некоторых хозяев. [ 5 ]
CDC : публикует ежегодный отчет Salmonella со списком сероыров, наиболее часто связанных с человеческими заболеваниями, топ -10 сероваров перечислены ниже [ 6 ]
| Классифицировать | Серотип | Процент |
|---|---|---|
| 1 | Enteritidis | 16.8 |
| 2 | Ньюпорт | 10.1 |
| 3 | Тайфимурий | 9.8 |
| 4 | Хавиана | 5.8 |
| 5 | Я 4, [5], 12: я:- | 4.7 |
| 6 | Дети | 2.7 |
| 7 | Мюнхин | 2.6 |
| 8 | Монтевидео | 2.2 |
| 9 | Braenderup | 2.1 |
| 10 | Томпсон | 1.7 |
| - | Другой | 41.5 |
Исследования завершили большинство штаммов Salmonella enterica subsp. Enterica Serovars обладают специфичными для серотипа плазмиды вирулентности . Это вирулентность, связанная с плазмидой, характеризующуюся плазмидами с низкой копией, и в зависимости от серовара, его размер варьируется от 50 до 100 КБ. [ 7 ] CDC В 2012 году PulseNet узнал о появившемся мульти-лекарственном устойчивом к серо-инфантис -кластеру SNP , названной Repjfx01. Этот кластер SNP имеет большую мегаплазмиду (PESI), которая содержит множественные гены лекарственной устойчивости. [ 8 ] USDA NARMS заявила, что из-за этой PESI-плазмиды серовский инфантис является ведущим сероваром в птицеводстве. [ 9 ] NCBI имеет более 12 500 изолятов в кластере SNP Repjfx01, причем более 3700 являются клиническими изолятами. [ 10 ] Было также обнаружено, что серовар Enteritidis, который является наиболее распространенным сероваром, выделяемым в клинических случаях человека, продуцирует эндотоксины , кодируемые генами STN и хитрого , которые приписывают патогенности Enteritidis. [ 11 ] Salmonella Typhimurium, как известно, известный как причинный агент для брюшного тифа может использоваться для доставки различных методов лечения рака. Опухоли с их иммуно-супрессивными микроокружениями позволяют в 1000 раз большей локализации инженерного S. typhimurium, чем здоровые ткани, которые затем способны входить в опухолевые клетки, лизируйте и доставляют терапию. [ 12 ]
В ноябре 2016 года в Пакистане появился новый штамм широко устойчивого к наркотике (XDR) Salmonella enterica serovar Typhi, в первую очередь из городов Хайдарабад и Карачи . [ 13 ] Устойчивые к мультисдавным штаммам присутствовали с конца 1970 -х годов в Африке и Азии. [ 14 ] Эти штаммы XDR устойчивы ко всем вариантам лечения антибиотиками: хлорамфеникол , ампициллин , триметоприм-сульфаметоксазол , фторхинолоны и цефалоспорины третьего поколения . Вспышка продолжается с 2016 года. [ 15 ]
Номенклатура
[ редактировать ]Номенклатура Salmonella enterica уже давно стала темой дебатов в сообществе микробиологии. [ 16 ] Первоначально в 1880 -х годах виды сальмонеллы были названы в честь болезни, хозяина или геологического положения, с которым они были связаны; Тем не менее, эта таксономическая характеристика была оспорена из -за того, что члены рода, несовместимые, несовместимо с их генетическим сходством. В 1980 -х годах появление секвенирования нуклеотидов и гибридизации ДНК привело к тому, что многие устоявшиеся бактериологи, такие как Le Minor and Popoff (1987), Euzéby (1999), и Ezaki и Yabuuchi (2000), чтобы выдвинуть свои предложения для изменений номенклатуры. [ 17 ] Лишь в 2005 году LE Minor и Popoff Replopoft и установили, что « Salmonella enterica » будет утвержденным видом названием - за исключением сальмонеллы Bongori - и что Salmonella enterica содержит шесть подвидов, из которых Salmonella enterica subsp. Enterica содержит большинство сероваров. [ 18 ] Технологические достижения позволяют исследователям использовать данные секвенирования всего генома для идентификации и группировки сероворитов, используя два метода: типирование последовательности и распознавание антигена. [ 19 ]
Названия серовара капитализированы, но не выделены курсивом или подчеркнуты. Серовары могут быть обозначены в полной форме или в короткой форме (включают только роды и имена серовара). Например, в полном обозначении Salmonella enterica subsp. Enterica Serovar Typhi написан как таковой, но в краткосрочной обозначении он написан как Salmonella Typhi. [ 20 ] Каждый серовар также может иметь много штаммов, что позволяет быстро увеличить общее количество антигено -вариабельных бактерий. [ 21 ]
Эпидемиология
[ редактировать ]Всемирная организация здравоохранения характеризует сальмонеллез как пищевое заболевание, симптомы которых включают диарею, лихорадку, тошноту, рвоту и в тяжелых случаях смерть. [ 22 ] Сальмонеллез был оценен в первую очередь у людей-хозяев из-за бактериальной колонизации кишечного тракта после потребления загрязненной пищи или воды, но также известно, что он распространяется от человека к человеку по фекально-оральному пути. [ 23 ] Чтобы снизить риск, связанный с сокращением этого заболевания, надлежащие меры безопасности пищевых продуктов должны применяться к пищевым продуктам с высоким риском, включая птицу, говядину, свинину, баранину, яйца и свежие продукты. [ 24 ] Производители продуктов питания, поставщики ингредиентов, рестораны и домашние повара должны практиковать процедуры сантехнической обработки, хранить продукты до 5 ° C и тщательно готовить все продукты для их назначенных температур с безопасным для еды. [ 24 ] Становится все труднее смягчить наличие инфекций сальмонеллеза во всей человеческой популяции из-за уникальной природы меровало устойчивых к мультиругам сероваров в результате контрпродуктивных эффектов для использования антибиотиков в качестве лечения широкого спектра. [ 25 ] Ключевые иммунные недостатки, связанные с ВИЧ , малярией и недоеданием, способствовали широкому распространению этого заболевания и необходимости использовать дорогие антимикробные препараты в самых плохих медицинских службах в мире. [ 26 ] Но также и бактериальные факторы, такие как активированная активность гена вирулентности PGTE из -за одного нуклеотидного полиморфизма (SNP) в ее промоторной области, оказывают большое влияние на патогенез этого конкретного сальмонеллы . типа последовательности [ 27 ]
Выживание и стресс
[ редактировать ]Есть факторы, которые могут увеличить риск инфекции. К ним относятся более высокий рН в желудке, резекция желудка и обработку антикистной буферизацией. [ 28 ] Если желудок имеет более низкий pH, то это помогает в качестве защитной техники , чтобы потенциально избежать инфекции. [ 29 ]
Этот штамм является мезофильным, а некоторые могут выжить чрезвычайно низкие или высокие температуры, которые могут варьироваться от 2 ° C - 54 ° C. [ 30 ] Сигма факторы внутри клеток контролируют экспрессию генов, и они могут ощутить изменения в окружающей среде из внешней мембраны путем активации генов, которые затем реагируют на тепловой стресс и соответственно адаптируются. [ 31 ] S. Enterica также может быстро реагировать на холодные температуры с помощью белков холодного шока (CSP), синтезируя себя, чтобы впоследствии клетка могла возобновить рост. [ 32 ] Хлор может быть химическим стрессором для S. enterica , потому что после присутствия хлора S. enterica может создавать биопленку , которая обеспечивает себя экзополисахаридным матрицей, которая обладает способностью химической атаки против хлора. [ 33 ] Из этого хлор имеет профилактические меры для формирования биопленки в системах употребления птицы, и это снижает риск развития S. enterica . [ 34 ] Успешная адаптация позволяет S. enterica выдерживать более кислые условия, противодействуя антибактериальным эффектам желудка. [ 35 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Murray PR, Rosenthal KS, Paller MA (2009). Медицинская микробиология (6 -е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Mosby Elsevier. п. 307
- ^ Grimont PA, Weill FX (ноябрь 2007 г.). «Антигенные формулы сероворитов сальмонеллы» . ВОЗ, сотрудничающий центр для справки и исследований по сальмонелле . 9 : 1–66.
- ^ Silva C, Calva E, Maloy S (февраль 2014 г.). «Одно здоровье и болезнь пищевых продуктов: передача сальмонеллы между людьми, животными и растениями». Микробиологический спектр . 2 (1): OH-0020-2013. doi : 10.1128/microbiolspec.OH-0020-2013 . PMID 26082128 .
- ^ Rabsch W, Andrews HL, Kingsley RA, Prager R, Tschäpe H, Adams LG, Bäumler AJ (май 2002). «Salmonella enterica серотип Typhimurium и его адаптированные варианты» . Инфекция и иммунитет . 70 (5): 2249–2255. doi : 10.1128/iai.70.5.2249-2255.2002 . PMC 127920 . PMID 11953356 .
- ^ Langridge GC, Fookes M, Connor TR, Feltwell T, Feasey N, Parsons BN, et al. (Январь 2015). «Модели эволюции генома, которые сопровождали адаптацию хозяина в сальмонелле» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (3): 863–868. Bibcode : 2015pnas..112..863L . doi : 10.1073/pnas.1416707112 . PMC 4311825 . PMID 25535353 .
- ^ «Национальное наблюдение за кишечным заболеванием: годовой отчет Salmonella, 2016» (PDF) . CDC.gov . 2016
- ^ Rotger R, Hospisus J (сентябрь 1999 г.). PDF ) ( Международная микробиология 2 (3): 177–184. 10943411PMID
- ^ CDC (2023-07-21). «Постоянный штамм Salmonella infantis (repjfx01), связанный с курицей» . Центры для контроля и профилактики заболеваний . Получено 2023-11-19 .
- ^ «Многолетний отчет FSIS NARMS-2014-2019» . fsis.usda.gov . 2023-02-10 . Получено 2023-11-15 .
- ^ «Изоляты браузера - обнаружение патогена - NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2023-11-19 .
- ^ Ashkenazi S, Cleary TG, Murray BE, Wanger A, Pickering LK (декабрь 1988 г.). «Количественный анализ и частичная характеристика продукции цитотоксина штаммами сальмонеллы» . Инфекция и иммунитет . 56 (12): 3089–3094. doi : 10.1128/iai.56.12.3089-3094.1988 . PMC 259706 . PMID 3182072 .
- ^ Раман, Вишну; Ван Дессель, Нел; Холл, Кристофер Л.; Wetherby, Victoria E.; Уитни, Саманта А.; Колеве, Эмили Л.; Bloom, Shoshana Mk; Шарма, Абхинад; Харди, Жанна А.; Боллен, Матье; Ван Эйнд, Алейд; Forbes, Neil S. (2021-10-21). «Внутриклеточная доставка белковых препаратов с автономно лизирующей бактериальной системой снижает рост опухоли и метастазы» . Природная связь . 12 (1): 6116. DOI : 10.1038/S41467-021-26367-9 . ISSN 2041-1723 . PMC 8531320 . PMID 34675204 .
- ^ Дейли Дж (21 февраля 2018 г.). «Вспышка тайфоида в Пакистане связана с широко устойчивыми к наркотиками бактерий» . Ученый журнал® . Получено 2018-09-03 .
- ^ Klemm EJ, Shakoor S, Page AJ, Камар Ф.Н., судья К., Саид Д.К. и др. (Февраль 2018 г.). «Появление широко устойчивого к лекарственным средствам клона Salmonella enterica serovar typhi, несущего беспорядочную плазмиду, кодирующую устойчивость к фторхинолонам и цефалоспоринам третьего поколения» . Мбио . 9 (1). doi : 10.1128/mbio.00105-18 . PMC 5821095 . PMID 29463654 .
- ^ «Тяжелая лекарственная тифская лихорадка в Пакистане-настороженность-уровень 2, практикуйте усиленные меры предосторожности» . Уведомления о здоровье путешествия . Центры США по контролю и профилактике заболеваний . Получено 2018-09-03 .
- ^ Su Lh, Chiu CH (2007). «Сальмонелла: клиническая важность и эволюция номенклатуры» (PDF) . Чанг Гунг Медицинский журнал . 30 (3): 210–219. PMID 17760271 .
- ^ Agbaje M, Begum RH, Oyekunle MA, Ojo Oe, Adenubi OT (ноябрь 2011 г.). «Эволюция номенклатуры Salmonella: критическая нота». Folia Microbiologica . 56 (6): 497–503. doi : 10.1007/s12223-011-0075-4 . PMID 22052214 . S2CID 19799923 .
- ^ Бреннер Ф.В., Вильяр Р.Г., Ангуло Ф.Дж., Таукс Р., Сваминатан Б. (июль 2000 г.). «Номенклатура сальмонелла» . Журнал клинической микробиологии . 38 (7): 2465–2467. doi : 10.1128/jcm.38.7.2465-2467.2000 . PMC 86943 . PMID 10878026 .
- ^ Chattaway MA, Langridge GC, Wain J (апрель 2021 г.). «Номенклатура Salmonella в эпоху генома: время для перемен» . Научные отчеты . 11 (1): 7494. Bibcode : 2021natsr..11.7494c . doi : 10.1038/s41598-021-86243-w . PMC 8021552 . PMID 33820940 .
- ^ «Научная номенклатура» . Появляющиеся инфекционные дито . Центры для контроля и профилактики заболеваний . Получено 17 февраля 2020 года .
- ^ «Salmonella spp. Сравнительное секвенирование» . Wellcome Tust Genome Campus . Архивировано из оригинала 2007-11-14.
- ^ «Сальмонелла (нетифоидальная)» . www.who.int . Получено 2023-10-26 .
- ^ Джаннелла, Ральф А. (1996), Барон, Самуил (ред.), «Салмонелла» , Медицинская микробиология (4 -е изд.), Галвестон (Техас): Медицинский отделение Техасского университета в Галвестоне, ISBN 978-0-9631172-1-2 , PMID 21413334 , получен 2023-10-26
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Ehuwa O, Jaiswal AK, Jaiswal S. Salmonella, Безопасность пищевых продуктов и практика обработки продуктов питания. Еда . 2021; 10 (5). doi: https://www.mdpi.com/2304-8158/10/5/907/htm
- ^ Глинн, М. Кэтлин; Бопп, Шерил; ДеВитт, Уоллис; Дабни, Пол; Мохтар, Мохаммед; Ангуло, Фредерик Дж. (7 мая 1998 г.). «Появление мультируг-резистентных Salmonella enterica serotypetityphimurium dt104 инфекций в Соединенных Штатах» . Новая Англия Журнал медицины . 338 (19): 1333–1339. doi : 10.1056/nejm199805073381901 . PMID 9571252 .
- ^ Feasey NA, Dougan G, Kingsley RA, Heyderman RS, Gordon MA (июнь 2012 г.). «Инвазивная нетифоидальная болезнь сальмонеллы: возникающее и пренебрежимое тропическое заболевание в Африке» . Лансет . 379 (9835): 2489–2499. doi : 10.1016/s0140-6736 (11) 61752-2 . PMC 3402672 . PMID 22587967 .
- ^ Hammarlöf DL, Kröger C, Owen SV, Canals R, Lacharme-Lora L, Wenner N, et al. (Март 2018 г.). «Роль одного некодирующего нуклеотида в эволюции эпидемической африканской клады сальмонеллы » . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (11): E2614 - E2623. BIBCODE : 2018PNAS..115E2614H . doi : 10.1073/pnas.1714718115 . PMC 5856525 . PMID 29487214 .
- ^ Garcia del Portillo F, Foster JW, Finlay BB (1993). «Роль генов ответа на кислоту в вирулентности сальмонеллы тифимурия » . Инфекция и иммунитет . 61 (10): 4489–4492. doi : 10.1128/iai.61.10.4489-4492.1993 . PMC 281185 . PMID 8406841 .
- ^ Foster JW, Hall HK (1990). «Адаптивная подкисленная толерантность реакция сальмонеллы тайфимурия » . Журнал бактериологии . 173 (2): 771–778. doi : 10.1128/jb.172.2.771-778.1990 . PMC 208505 . PMID 2404956 .
- ^ Kazmierczak MJ, Wiedmann M, Boor KJ (2005). «Альтернативные сигма -факторы и их роль в бактериальной вирулентности» . Микробиология и молекулярная биология обзоры . 69 (4): 527–543. doi : 10.1128/mmbr.69.4.527-543.2005 . PMC 1306804 . PMID 16339734 .
- ^ Spector MP, Kenyon WJ (2012). «Стратегии сопротивления и выживания Salmonella enterica к стрессам окружающей среды». Food Research International . 45 (2): 455–481. doi : 10.1016/j.foodres.2011.06.056 . S2CID 84333218 .
- ^ Крейг Дж., Бойл Д., Фрэнсис К.П., Галлахер М.П. (1998). «Экспрессия гена холодного шока CSPB в сальмонелле тайфимурий происходит ниже пороговой температуры» . Микробиология . 144 (3): 697–704. doi : 10.1099/00221287-144-3-697 . PMID 9534239 .
- ^ McDonnell G, Russell AD (1999). «Антисептики и дезинфицирующие средства: активность, действие и устойчивость» . Клинические обзоры микробиологии . 12 (1): 147–179. doi : 10.1128/cmr.12.1.147 . PMC 88911 . PMID 9880479 .
- ^ Byrd JA, Deloach JR, Corier DE, Nisbet DJ, Stanker LH (1999). «Оценка распределений серотипа сальмонеллы от коммерческих инкубаторов бройлеров и производителей». Птиевые заболевания . 43 (1): 39–47. doi : 10.2307/1592760 . JSTOR 1592760 . PMID 10216758 .
- ^ Rychlik I, Barrow PA (2005). « Управление стрессом сальмонеллы и его отношение к поведению во время кишечной колонизации и инфекции» . Обзоры микробиологии FEMS . 29 (5): 1021–1040. doi : 10.1016/j.femsre.2005.03.005 . PMID 16023758 .