Th1l

Nelfcd
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	5L3X
Идентификаторы
Псевдонимы	NELFCD , NELF-C, NELF-D, TH1, TH1L, HSPC130, Член комплекса отрицательного удлинения C/D
Внешние идентификаторы	Омим : 605297 ; MGI : 1926424 ; Гомологен : 9496 ; GeneCards : Nelfcd ; OMA : NELFCD - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	58,995,133 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	174,269,295 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	anterior pituitary; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; left ovary; ; right hemisphere of cerebellum; ; right ovary; ; islet of Langerhans; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	yolk sac; ; ventricular zone; ; otic vesicle; ; superior cervical ganglion; ; neural layer of retina; ; genital tubercle; ; epiblast; ; otic placode; ; saccule; ; tail of embryo;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	membrane; NELF complex; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	transcription elongation from RNA polymerase II promoter; positive regulation of viral transcription; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51497
	57314
	ENSG00000101158
	Ensmusg00000016253
	Q8ixh7
	Q922L6
	NM_016397 ; NM_198976
	NM_020580
	NP_945327
	NP_065605
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор отрицательного удлинения C/D - это белок , который у людей кодируется Th1L геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

НЕФЛ ^{[ нужно разъяснения ]} Комплекс белков взаимодействует с DSIF ^{[ нужно разъяснения ]} Белковой комплекс для подавления транскрипционной удлинения РНК -полимеразой II. Белок, кодируемый этим геном, является неотъемлемой частью комплекса NELF. Альтернативное использование сайта инициации перевода приводит к формированию двух изоформ с различными N-концами . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что Th1l взаимодействует :

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000101158 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000016253 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Bonthron DT, Hayward BE, Moran V, Strain L (август 2000 г.). «Характеристика TH1 и CTSZ, два не заметных гена ниже GNAS1 в хромосоме 20q13». Человеческая генетика . 107 (2): 165–75. doi : 10.1007/s004390000344 . PMID 11030415 . S2CID 25570066 .
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan Hy, Lu G, Zhong M, Xu xr, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми кадрами считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых/клетках -предшественниках» . Исследование генома . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Th1l Th1-подобный (Drosophila)» .
^ Yuryev A, Wennogle LP (февраль 2003 г.). «Новые взаимодействия белка-белка RAF-киназы, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2): 112–25. doi : 10.1016/s0888-7543 (02) 00008-3 . PMID 12620389 .
^ Инь XL, Chen S, Gu JX (февраль 2002 г.). «Идентификация Th1 как партнера по взаимодействию A-Raf-киназы». Молекулярная и клеточная биохимия . 231 (1–2): 69–74. doi : 10.1023/a: 1014437024129 . PMID 11952167 . S2CID 19362635 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Нарита Т., Ямагухи Ю., Доано К., Стормс С., Чанарат С., Нет Т, Ким Д.К., Хассегава М., Омори М., Акобс Н., Эндох М, Ямада Т, Хара Х (март 2003 г.). NELF : Молекулярный и клеточный биолог 23 (6): 1863–7 doi : 10.1128/ mcb.23.1863-1873.2003 149481PMC PMID 12612062 .

Дальнейшее чтение

Стивенс М., Де Слерк Е., Бальзарини Дж (сентябрь 2006 г.). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства» . Обзоры лекарственных исследований . 26 (5): 595–625. doi : 10.1002/med.20081 . PMC 7168390 . PMID 16838299 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Исследование генома . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Yamaguchi Y, Takagi T, Wada T, Tano K, Furuya A, Sugimoto S, Hasewaga J, Handa H (Apr 1999). «Неллф, мультиспасный комплекс, содержащий RD, сотрудничает с DSIF для подавления элегации РНК -полимеразы II » Ячейка 97 (1): 41–5 Doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80713-8 PMID 10199401 S2CID 168555257
Ping YH, Rana TM (апрель 2001 г.). «DSIF и NELF взаимодействуют с комплексом удлинения РНК-полимеразы II, а ВИЧ-1 ТАТ стимулирует P-TEFB-опосредованное фосфорилирование РНК-полимеразы II и DSIF во время удлинения транскрипции» . Журнал биологической химии . 276 (16): 12951–8. doi : 10.1074/jbc.m006130200 . PMID 11112772 .
Инь XL, Chen S, Gu JX (февраль 2002 г.). «Идентификация Th1 как партнера по взаимодействию A-Raf-киназы». Молекулярная и клеточная биохимия . 231 (1–2): 69–74. doi : 10.1023/a: 1014437024129 . PMID 11952167 . S2CID 19362635 .
Нарита Т., Ямагухи Ю., Доано К., Стормс С., Чанарат С., Нет Т, Ким Д.К., Хассегава М., Омори М., Акобс Н., Эндох М, Ямада Т, Хара Х (март 2003 г.). NELF : Молекулярный и клеточный биолог 23 (6): 1863–7 doi : 10.1128/ mcb.23.1863-1873.2003 149481PMC PMID 12612062 .
Yuryev A, Wennogle LP (февраль 2003 г.). «Новые взаимодействия белка-белка RAF-киназы, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2): 112–25. doi : 10.1016/s0888-7543 (02) 00008-3 . PMID 12620389 .
Лю В., Шен Х, Ян Й., Инь Х, Се Дж, Ян Дж., Цзян Дж., Лю В., Ван Х, Сан М., Чжэн Ю, Гу Дж (март 2004 г.). «Тригидрофобин 1 является новым негативным регулятором a-raf-киназы» . Журнал биологической химии . 279 (11): 10167–75. doi : 10.1074/jbc.m307994200 . PMID 14684750 .
Colland F, Jacq X, Truplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (Jul 2004). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Исследование генома . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Sturl U, Worm U, Lalowski M, Hammeck FH, Goicer C, T, Shortz Flash A, Goldöz A, Goadös I Deep и Calbides Sa Corites Se B, Brice B, Wo, Brighter H, Wakermer One (сентябрь в 2005 году) Полем «Человеческий белок-белок взаимодействует сеть NetAcition: ресурс для аннотирования Protemome» . Клетка . 122 (6): 957-68. Doi : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . HDL : 11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
Ян Й., Лю В., Зоу В., Ван Х, Джанганг Дж., Ван Дж., Ван Ю., Гу Дж. (2007). "EH1 (TH1). Журнал сотовой биохимии . 101 (1): 167–8 doi : 10.1002/jcb.21164 . PMID 17131388 . S2CID 2367528 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000101158 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000016253 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid11030415-5] Bonthron DT, Hayward BE, Moran V, Strain L (август 2000 г.). «Характеристика TH1 и CTSZ, два не заметных гена ниже GNAS1 в хромосоме 20q13». Человеческая генетика . 107 (2): 165–75. doi : 10.1007/s004390000344 . PMID 11030415 . S2CID 25570066 .

[pmid11042152-6] Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan Hy, Lu G, Zhong M, Xu xr, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми кадрами считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых/клетках -предшественниках» . Исследование генома . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Th1l Th1-подобный (Drosophila)» .

[pmid12620389-8] Yuryev A, Wennogle LP (февраль 2003 г.). «Новые взаимодействия белка-белка RAF-киназы, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2): 112–25. doi : 10.1016/s0888-7543 (02) 00008-3 . PMID 12620389 .

[pmid11952167-9] Инь XL, Chen S, Gu JX (февраль 2002 г.). «Идентификация Th1 как партнера по взаимодействию A-Raf-киназы». Молекулярная и клеточная биохимия . 231 (1–2): 69–74. doi : 10.1023/a: 1014437024129 . PMID 11952167 . S2CID 19362635 .

[pmid17353931-10] Jump up to: ^а ^{беременный} Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[pmid12612062-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Нарита Т., Ямагухи Ю., Доано К., Стормс С., Чанарат С., Нет Т, Ким Д.К., Хассегава М., Омори М., Акобс Н., Эндох М, Ямада Т, Хара Х (март 2003 г.). NELF : Молекулярный и клеточный биолог 23 (6): 1863–7 doi : 10.1128/ mcb.23.1863-1873.2003 149481PMC PMID 12612062 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]