Кофактор BRCA1

НЭЛФБ
Идентификаторы
Псевдонимы	NELFB , COBRA1, NELF-B, кофактор BRCA1, член B комплекса отрицательного фактора элонгации
Внешние идентификаторы	Опустить : 611180 ; МГИ : 1931035 ; Гомологен : 121600 ; GeneCards : NELFB ; OMA : NELFB — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	137,273,542 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	25,101,501 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; ventricular zone; ; right frontal lobe; ; mucosa of transverse colon; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; ganglionic eminence; ; amygdala; ; tendon of biceps brachii; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	otic vesicle; ; saccule; ; medullary collecting duct; ; mesenteric lymph nodes; ; molar; ; otic placode; ; granulocyte; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; left lung lobe; ; neural layer of retina;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	nucleus; cytoplasm; NELF complex; nucleoplasm;
Biological process	transcription elongation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription, DNA-templated; cell population proliferation; stem cell differentiation; negative regulation of stem cell differentiation; positive regulation of viral transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25920
	58202
	ENSG00000188986
	ENSMUSG00000013465
	Q8WX92
	Q8C4Y3
	НМ_015456
	НМ_021393 ; НМ_001310157
	НП_056271
	НП_001297086 ; НП_067368
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кофактор BRCA1 , также известный как COBRA1 , является человеческим геном. ^{[ 5 ]} который кодирует NELF-B.

Функция

NELF-B представляет собой субъединицу отрицательного фактора элонгации (NELF) , которая также включает NELF-A ( WHSC2 ; MIM 606026), NELF-C или NELF-D (TH1L; MIM 605297) и NELF-E ( RDBP ; MIM). 154040). NELF действует вместе с фактором, индуцирующим чувствительность DRB ( DSIF ), гетеродимером SPT4 (SUPT4H1; MIM 603555) и SPT5 (SUPT5H; MIM 602102), вызывая приостановку транскрипции РНК-полимеразы II (см. MIM 180660). ^{[ 6 ]} COBRA1 был первоначально идентифицирован в ходе скрининга двухгибридных дрожжей с использованием домена BRCT1 BRCA1 в качестве приманки. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что кофактор BRCA1 взаимодействует с:

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000188986 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013465 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: кофактор COBRA1 BRCA1» .
^ Нарита Т., Ямагути И., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндо М., Ямада Т., Ханда Х. (2003). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (6): 1863–1873. дои : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПМК 149481 . ПМИД 12612062 .
^ Йе Кью, Ху Ю.Ф., Чжун Х., Най А.С., Бельмонт А.С., Ли Р. (2001). «Крупномасштабное развертывание хроматина, индуцированное BRCA1, и аллель-специфические эффекты мутаций, предрасполагающих к раку» . Журнал клеточной биологии . 155 (6): 911–922. дои : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . ПМИД 11739404 .
^ Йе Кью, Ху Ю.Ф., Чжун Х., Най А.С., Бельмонт А.С., Ли Р. (декабрь 2001 г.). «Крупномасштабное развертывание хроматина, индуцированное BRCA1, и аллель-специфические эффекты мутаций, предрасполагающих к раку» . Дж. Клеточная Биол . 155 (6): 911–921. дои : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . ПМИД 11739404 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чжун Х, Чжу Дж, Чжан Х, Дин Л, Сунь Ю, Хуан С, Е Ц (декабрь 2004 г.). «COBRA1 ингибирует транскрипционную активность AP-1 в трансфицированных клетках». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 325 (2): 568–573. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.10.079 . ПМИД 15530430 .
^ Айяр С.Э., Сан Дж.Л., Блер А.Л., Москалюк К.А., Лу Ю.З., Йе К.Н., Ямагути Ю., Мукерджи А., Рен Д.М., Ханда Х., Ли Р. (сентябрь 2004 г.). «Ослабление транскрипции, опосредованной альфа-рецептором эстрогена, посредством стимулированного эстрогеном рекрутирования отрицательного фактора элонгации» . Генс Дев . 18 (17): 2134–2146. дои : 10.1101/gad.1214104 . ПМК 515291 . ПМИД 15342491 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндо М., Ямада Т., Ханда Х. (март 2003 г.). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 23 (6): 1863–1873. дои : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПМК 149481 . ПМИД 12612062 .
^ Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Э., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–167. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 : 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Дальнейшее чтение

Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства» . Медресе преп . 26 (5): 595–625. дои : 10.1002/мед.20081 . ПМЦ 7168390 . ПМИД 16838299 .
Ямагути Ю, Такаги Т, Вада Т, Яно К, Фуруя А, Сугимото С, Хасегава Дж, Ханда Х (1999). «NELF, мультисубъединичный комплекс, содержащий RD, взаимодействует с DSIF, подавляя элонгацию РНК-полимеразы II» . Ячейка 97 (1): 41–51. дои : 10.1016/S0092-8674(00) 80713-8 ПМИД 10199401 . S2CID 16855257 .
Хиросава М, Нагасе Т, Исикава К, Кикуно Р, Номура Н, Охара О (2000). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК из мозга человека» . ДНК Рез . 6 (5): 329–336. дои : 10.1093/dnares/6.5.329 . ПМИД 10574461 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–1795. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Пинг Ю.Х., Рана ТМ (2001). «DSIF и NELF взаимодействуют с комплексом элонгации РНК-полимеразы II, а Tat ВИЧ-1 стимулирует P-TEFb-опосредованное фосфорилирование РНК-полимеразы II и DSIF во время элонгации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 276 (16): 12951–12958. дои : 10.1074/jbc.M006130200 . ПМИД 11112772 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б, Кляйн М, Пустка А (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–435. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–292. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Йе Кью, Ху Ю.Ф., Чжун Х., Най А.С., Бельмонт А.С., Ли Р. (2002). «Крупномасштабное развертывание хроматина, индуцированное BRCA1, и аллель-специфические эффекты мутаций, предрасполагающих к раку» . Дж. Клеточная Биол . 155 (6): 911–921. дои : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . ПМИД 11739404 .
Нарита Т., Ямагути И., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндо М., Ямада Т., Ханда Х. (2003). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 23 (6): 1863–1873. дои : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПМК 149481 . ПМИД 12612062 .
Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Э., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (2004). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–167. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
Чжу Дж, Сун С, Цзян Цз, Янь Дж, Лу Ц, Хуан С, Е Ц (2005). «Характеристика COBRA1 в клеточных линиях рака молочной железы человека с использованием нового поликлонального антитела против COBRA1» . ИУБМБ Жизнь . 56 (3): 161–166. дои : 10.1080/15216540410001699826 . ПМИД 15185750 . S2CID 31137609 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–12135. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Айяр С.Э., Сунь Дж.Л., Блэр А.Л., Москалюк К.А., Лу Ю.З., Йе К.Н., Ямагути Ю., Мукерджи А., Рен Д.М., Ханда Х., Ли Р. (2004). «Ослабление альфа-опосредованной транскрипции рецептора эстрогена посредством стимулированного эстрогеном рекрутирования отрицательного фактора элонгации» . Генс Дев . 18 (17): 2134–2146. дои : 10.1101/gad.1214104 . ПМК 515291 . ПМИД 15342491 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бехтель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–2144. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Чжун Х, Чжу Дж, Чжан Х, Дин Л, Сунь Ю, Хуан С, Е Ц (2005). «COBRA1 ингибирует транскрипционную активность AP-1 в трансфицированных клетках». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 325 (2): 568–573. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.10.079 . ПМИД 15530430 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., Дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Макчесни П.А., Айяр С.Е., Ли О.Дж., Заика А., Москалюк С., Ли Р., Эль-Рифаи В. (2006). «Кофактор BRCA1: новый регулятор фактора транскрипции при аденокарциномах верхних отделов желудочно-кишечного тракта» . Рак Рез . 66 (3): 1346–1353. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-3593 . ПМИД 16452188 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000188986 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013465 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: кофактор COBRA1 BRCA1» .

[Narita2003-6] Нарита Т., Ямагути И., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндо М., Ямада Т., Ханда Х. (2003). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (6): 1863–1873. дои : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПМК 149481 . ПМИД 12612062 .

[Ye2001-7] Йе Кью, Ху Ю.Ф., Чжун Х., Най А.С., Бельмонт А.С., Ли Р. (2001). «Крупномасштабное развертывание хроматина, индуцированное BRCA1, и аллель-специфические эффекты мутаций, предрасполагающих к раку» . Журнал клеточной биологии . 155 (6): 911–922. дои : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . ПМИД 11739404 .

[pmid11739404-8] Йе Кью, Ху Ю.Ф., Чжун Х., Най А.С., Бельмонт А.С., Ли Р. (декабрь 2001 г.). «Крупномасштабное развертывание хроматина, индуцированное BRCA1, и аллель-специфические эффекты мутаций, предрасполагающих к раку» . Дж. Клеточная Биол . 155 (6): 911–921. дои : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . ПМИД 11739404 .

[pmid15530430-9] Перейти обратно: ^а ^б Чжун Х, Чжу Дж, Чжан Х, Дин Л, Сунь Ю, Хуан С, Е Ц (декабрь 2004 г.). «COBRA1 ингибирует транскрипционную активность AP-1 в трансфицированных клетках». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 325 (2): 568–573. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.10.079 . ПМИД 15530430 .

[pmid15342491-10] Айяр С.Э., Сан Дж.Л., Блер А.Л., Москалюк К.А., Лу Ю.З., Йе К.Н., Ямагути Ю., Мукерджи А., Рен Д.М., Ханда Х., Ли Р. (сентябрь 2004 г.). «Ослабление транскрипции, опосредованной альфа-рецептором эстрогена, посредством стимулированного эстрогеном рекрутирования отрицательного фактора элонгации» . Генс Дев . 18 (17): 2134–2146. дои : 10.1101/gad.1214104 . ПМК 515291 . ПМИД 15342491 .

[pmid12612062-11] Перейти обратно: ^а ^б Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндо М., Ямада Т., Ханда Х. (март 2003 г.). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 23 (6): 1863–1873. дои : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПМК 149481 . ПМИД 12612062 .

[pmid14667819-12] Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Э., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–167. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .

[pmid17353931-13] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 : 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]