Бинкард

Карта19
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4DWN, 4FH0
Идентификаторы
Псевдонимы	Card19 , Bincard, BA370F5.1, C9ORF89, Caspase Recruitment Domain член семьи 19 19
Внешние идентификаторы	Омим : 617726 ; MGI : 1915730 ; Гомологен : 12269 ; GeneCards : Card19 ; OMA : Card19 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	93,113,283 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	49,369,513 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	monocyte; ; granulocyte; ; right coronary artery; ; ascending aorta; ; right hemisphere of cerebellum; ; tibial arteries; ; Descending thoracic aorta; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; left uterine tube; ; nasal epithelium;
	Top expressed in
	granulocyte; ; muscle of thigh; ; lip; ; digastric muscle; ; triceps brachii muscle; ; temporal muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; lumbar spinal ganglion; ; right ventricle; ; yolk sac;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	CARD domain binding; protein binding;
Cellular component	endoplasmic reticulum membrane; cytosol; nucleus; membrane; integral component of membrane; mitochondrial membranes; endoplasmic reticulum; mitochondrion;
Biological process	negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84270
	68480
	ENSG00000165233
	Ensmusg00000037960
	Q96LW7
	Q9D1I2
	NM_032310 ; NM_001318010 ; NM_001318011
	NM_026738
	NP_001304939 ; NP_001304940 ; NP_115686
	NP_081014
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Белок BCL10-Interacting Card , также известный как Bincard , является белком , который у людей кодируется C9ORF89 геном на хромосоме 9. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Bincard является членом суперсемейства доменов смерти и содержит домен набора каспазы (карта). ^{[ 7 ]} Этот белок регулирует апоптоз и иммунный ответ, ингибируя BCL10, что указывает на его при заболеваниях, связанных с дисфункцией BCL10. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Структура

Bincard, как карта, содержащий белок, является членом суперсемейства доменов смерти, которая разделяет шесть-хеликс. ^{[ 7 ]} У людей белок имеет две альтернативно сплайсированные изоформы: Bincard-1 и Bincard-2. Обе изоформы совместно используют идентичные последовательности до тех пор, пока остатки 101, которые включают в себя картный домен и экзоны от 1 до 3. Более длинная изоформа, Bincard-1, имеет расширенный экзон 3, в то время как более короткий Bincard-2 имеет дополнительный трансмембранный домен. ^{[ 7 ]} Консервативная карта домена имеет три цистеина в своей нативной форме: Cys7, Cys77 и Cys63, из которых Cys7 и Cys77 образуют дисульфидную связь, а Cys63 становится цистеиновой сульфеновой кислотой при окислении. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Белок Bincard является членом суперсемейства доменов смерти, которая известна регулированием апоптоза и иммунного ответа. ^{[ 7 ]} Bincard является отрицательным регулятором, который связывается с и, таким образом, блокирует фосфорилирование BCL10, эффективно ингибируя BCL10 от активации ядерного фактора-κB (NF-κB). ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} В частности, изоформа Bincard-1 содержит расширенный C-концевой, который наблюдается, что он связывает BCL10, хотя она в основном локализуется в ядре. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Вторая изоформа, Bincard-2, более распространена и локализуется как в ER, так и в митохондрии. Ожидается, что эта изоформа будет способствовать апоптозу через окислительно -восстановительные процессы, поскольку три его модифицируемые цистеины могут быть окислены реактивными формами кислорода (АФК), чтобы стимулировать врожденный иммунный ответ. ^{[ 8 ]}

Клиническое значение

Мутации в доменах Bincard и других белках, содержащих карты, связаны с заболеваниями, связанными с BCL10, включая лимфому лимфоидной ткани, ассоциированной с слизистой оболочкой. ^{[ 8 ]} Было показано, что BCL10 индуцирует апоптоз и активирует NF-Kappab . Сообщается, что этот белок взаимодействует с другим доменом карт, содержащими белки, включая Card9, 10, 11 и 14, которые, как считается, функционируют как регуляторы выше по течению в передаче сигналов NF-Kappab. Соответственно, белок Bincard играет ключевую роль в регуляции апоптотических функций.

Из -за его важных биологических и физиологических функций апоптоз является ключевым для многих клинических компонентов. Во время нормальных эмбриологических процессов или во время повреждения клеток (таких как ишемия-реперфузионное повреждение во время сердечных приступов и инсультов ) или во время развития и процессов при раке , апоптотическая клетка подвергается структурным изменениям, включая усадку клеток, блеб из плазматической мембраны, конденсацию ядерного ДНК и ядро . Затем следует фрагментация в апоптотические тела, которые быстро удаляются фагоцитами , тем самым предотвращая воспалительный ответ. ^{[ 9 ]} Это способ гибели клеток, определяемый характерными морфологическими, биохимическими и молекулярными изменениями. Сначала он был описан как «некроз усадки», а затем этот термин был заменен апоптозом, чтобы подчеркнуть его роль противоположного митоза в кинетике ткани. На более поздних стадиях апоптоза вся клетка становится фрагментированной, образуя ряд апоптотических тел, связанных в плазматической мембране, которые содержат ядерные и или цитоплазматические элементы. Ультраструктурный вид некроза весьма отличается, основными признаками являются митохондриальная отек, распад плазматической мембраны и дезинтеграция клеток. Апоптоз происходит во многих физиологических и патологических процессах. Это играет важную роль во время эмбрионального развития в качестве запрограммированной гибели клеток и сопровождает различные нормальные инволюционные процессы, в которых он служит механизмом удаления «нежелательных» клеток.

По сообщениям, Bincard подавил активацию NF-Kappa B, индуцированную BCL10 настоящим, уменьшая количество фосфорилированного BCL10. Впоследствии мутации в остатках LEU17 или LEU65, которые высоко консервативны в карте, отменили ингибирующее влияние Bincard как на BCL10, индуцированную активацией NF-Kappa B, так и фосфорилирование BCL10. Кроме того, экспрессия Bincard ингибировала фосфорилирование BCL10, индуцированное сигналом активации Т -клеток . Эти результаты предполагают, что Bincard взаимодействует с BCL10, чтобы ингибировать BCL10-опосредованную активацию NF-Kappa B и подавлять фосфорилирование BCL10. ^{[ 8 ]} Соответственно, эти процессы, регулирующие апоптоз во время клинических процессов, таких как рак и повреждение ишемии.

Взаимодействия

Было показано, что Bincard взаимодействует :

BCL10 ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000165233 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000037960 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Uniprot : Q96LW7
^ "Entrez Gene: Chromosome 9 Open Rade Rading 89" .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Чен Ке, Ричардс А.А., Карадок-Дэвис Т.Т., Ваджхала П.Р., Робин Г., Луа Л.Х., Хилл Дж. М., Шродер К., Свит М.Дж., Келли С., Кобе Б., Мартин Дж (май 2013). «Структура домена рекрутинга каспазы Bincard показывает, что все три цистеина могут быть окислены» (PDF) . Acta Crystallographica Раздел d . 69 (Pt 5): 774–84. doi : 10.1107/s0907444913001558 . HDL : 10072/171950 . PMID 23633586 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Woo Hn, Hong GS, Jun Ji, Cho DH, Choi HW, Lee HJ, Chung CW, Kim Ik, Jo DG, Pyo Jo, Bertin J, Jung Yk (декабрь 2004 г.). «Ингибирование BCL10-опосредованной активации NF-Kappa B Bincard, белка для карты BCL10-интеграции». Письма Febs . 578 (3): 239–44. doi : 10.1016/j.febslet.2004.10.094 . PMID 15637807 . S2CID 84325562 .
^ Kerr JF, Wyllie AH, Currie AR (август 1972 г.). «Апоптоз: основной биологический феномен с широкими значениями в кинетике ткани» . Британский журнал рака . 26 (4): 239–57. doi : 10.1038/bjc.1972.33 . PMC 2008650 . PMID 4561027 .

Внешние ссылки

Human Card19 Расположение генома и Card19 страница гена в браузере UCSC Genome .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000165233 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000037960 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[uniprot-5] Uniprot : Q96LW7

[entrez-6] "Entrez Gene: Chromosome 9 Open Rade Rading 89" .

[pmid23633586-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Чен Ке, Ричардс А.А., Карадок-Дэвис Т.Т., Ваджхала П.Р., Робин Г., Луа Л.Х., Хилл Дж. М., Шродер К., Свит М.Дж., Келли С., Кобе Б., Мартин Дж (май 2013). «Структура домена рекрутинга каспазы Bincard показывает, что все три цистеина могут быть окислены» (PDF) . Acta Crystallographica Раздел d . 69 (Pt 5): 774–84. doi : 10.1107/s0907444913001558 . HDL : 10072/171950 . PMID 23633586 .

[pmid15637807-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Woo Hn, Hong GS, Jun Ji, Cho DH, Choi HW, Lee HJ, Chung CW, Kim Ik, Jo DG, Pyo Jo, Bertin J, Jung Yk (декабрь 2004 г.). «Ингибирование BCL10-опосредованной активации NF-Kappa B Bincard, белка для карты BCL10-интеграции». Письма Febs . 578 (3): 239–44. doi : 10.1016/j.febslet.2004.10.094 . PMID 15637807 . S2CID 84325562 .

[9] Kerr JF, Wyllie AH, Currie AR (август 1972 г.). «Апоптоз: основной биологический феномен с широкими значениями в кинетике ткани» . Британский журнал рака . 26 (4): 239–57. doi : 10.1038/bjc.1972.33 . PMC 2008650 . PMID 4561027 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]