TSG-6

TNFIP6
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1O7B, 1O7C, 2PF5, 2WNO, 2N40
Идентификаторы
Псевдонимы	TNFAIP6 , TSG-6, TSG6, TNF Альфа-индуцированный белок 6
Внешние идентификаторы	Омим : 600410 ; MGI : 1195266 ; Гомологен : 5162 ; GeneCards : TNFAIP6 ; OMA : TNFAIP6 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	151,380,046 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	51,946,698 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	cartilage tissue; ; testicle; ; vena cava; ; buccal mucosa cell; ; sperm; ; periodontal fiber; ; synovial membrane; ; synovial joint; ; Achilles tendon; ; blood;
	Top expressed in
	dermis; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; medial ganglionic eminence; ; deep cerebellar nuclei; ; intercostal muscle; ; granulocyte; ; skin of abdomen; ; cumulus cell; ; pineal gland; ; skin of external ear;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	hyaluronic acid binding; protein binding;
Cellular component	extracellular region; extracellular space; tertiary granule lumen; ficolin-1-rich granule lumen;
Biological process	cell-cell signaling; cell adhesion; inflammatory response; negative regulation of inflammatory response; signal transduction; positive regulation of cell migration; ovulation; neutrophil degranulation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7130
	21930
	ENSG00000123610
	Ensmusg00000053475
	P98066
	O08859
	NM_007115
	NM_009398
	NP_009046
	NP_033424
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Протеин 6-индуцируемого фактора некроза опухоли, также известный как стимулированный TNF белок гена 6 или TSG-6, является белком ^{[ 5 ]} что у людей кодируется TNFAIP6 (фактор некроза опухоли, альфа-индуцированный белок 6) геном . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Структура и функция

TSG-6 представляет собой 30 кДа белок, секретированный , который содержит гиалуронановый домен связывания, и, следовательно, является членом гиалуронанового семейства белков, также называемого гиаладгеринами . Известно, что гиалуронан-связывающий домен участвует в стабильности внеклеточного матрикса и миграции клеток . Было показано, что этот белок образует стабильный, ковалентный комплекс с ингибитором между альфа ( IαI ) и, таким образом, усиливает ингибирующую активность сериновой протеазы IαI, которая важна в сети протеазы, связанной с воспалением. Экспрессия этого гена может быть вызвана рядом сигнальных молекул, главным образом фактора некроза опухоли α ( TNF-α ) и интерлейкина-1 ( IL-1 ). Экспрессия также может быть индуцирована механическими стимулами в клетках гладких мышц сосудов и, как установлено, коррелирует с протеогликана . синтезом и агрегацией ^{[ 7 ]} Было показано, что TSG-6 модулирует пластичность макрофагов и сигнализирует о переходе макрофагов, обработанных LPS из про-противовоспалительного фенотипа. ^{[ 8 ]}

TSG-6 также взаимодействует с рядом матричных связанных молекул, таких как Aggrecan , Versican , Thrombospondin (1 и 2), пентраксин-3 и фибронектин .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000123610 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000053475 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Lee TH, Wisniewski HG, Vilcek J (январь 1992 г.). «Новый секреторный фактор некроза опухоли, индуцируемый белком (TSG-6), является членом семейства гиалуронатных связывающих белков, тесно связанных с рецептором адгезии CD44» . Журнал клеточной биологии . 116 (2): 545–57. doi : 10.1083/jcb.116.2.545 . PMC 2289279 . PMID 1730767 .
^ Lee TH, Klampfer L, показывает TB, Vilcek J (март 1993 г.). «Транскрипционная регуляция TSG6, фактор некроза опухоли-и индуцируемый интерлейкином-1 геном первичного ответа, кодирующий секретируемый гиалуронан-связывающий белок» . Журнал биологической химии . 268 (9): 6154–60. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 53232-4 . PMID 8454591 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: фактор некроза опухоли TNFAIP6, альфа-индуцированный белок 6» .
^ Миттал М., Тируппати С., Непал С., Чжао Й.Ю., Грич Д., Сони Д., Прок -Д.Дж., Малик А.Б. (декабрь 2016 г.). «Стимулированный TNFα ген-6 (TSG6) активирует переход фенотипа макрофага для предотвращения воспалительного повреждения легких» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (50): E8151 - E8158. BIBCODE : 2016PNAS..113E8151M . doi : 10.1073/pnas.1614935113 . PMC 5167170 . PMID 27911817 .

Дальнейшее чтение

Милнер К.М., День Ай Джей (май 2003 г.). «TSG-6: многофункциональный белок, связанный с воспалением» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 10): 1863–73. doi : 10.1242/jcs.00407 . PMID 12692188 .
Фри Э., Качмарчик А. (2004). «Ингибитор межалфа, гиалуронан и воспаление» (PDF ) Acta Biochimica Polonica 50 (3): 735–4 Doi : 10.18388/ abp.2003_3 14515153PMID
Милнер К.М., Хигман В.А., День Ай Джей (июнь 2006 г.). «TSG-6: плюрипотентный воспалительный посредник?». Биохимическое общество транзакций . 34 (Pt 3): 446–50. doi : 10.1042/bst0340446 . PMID 16709183 .
Wisniewski HG, Burgess WH, Oppenheim JD, Vilcek J (июнь 1994 г.). «TSG-6, связанный с артритом белок связывания гиалуронана, образует стабильный комплекс с меж-альфа-ингибитором сывороточного белка». Биохимия . 33 (23): 7423–9. doi : 10.1021/bi00189a049 . PMID 7516184 .
Klampfer L, Lee TH, HSU W, Vilcek J, Chen-Kiang S (октябрь 1994 г.). «NF-IL6 и AP-1 совместно модулируют активацию гена TSG-6 с помощью фактора некроза опухоли альфа и интерлейкина-1» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (10): 6561–9. doi : 10.1128/mcb.14.10.6561 . PMC 359186 . PMID 7935377 .
Wisniewski HG, Hua JC, Poppers DM, Naime D, Vilcek J, Cronstein BN (февраль 1996 г.). «TNF/IL-1-индуцируемый белок TSG-6 усиливает ингибирование плазмина между ингибитором между альфа-ингибитором и оказывает сильный противовоспалительный эффект in vivo» . Журнал иммунологии . 156 (4): 1609–15. doi : 10.4049/jimmunol.156.4.1609 . PMID 8568267 . S2CID 22926288 .
Кохда Д., Мортон С.Дж., Паркар А.А., Хатанака Х., Инагаки Ф.М., Кэмпбелл И.Д., День Ай Джей (сентябрь 1996 г.). «Структура решения модуля связи: гиалуронан связывающий домен, участвующий в стабильности внеклеточного матрикса и миграции клеток» . Клетка . 86 (5): 767–75. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80151-8 . PMID 8797823 . S2CID 16347386 .
Parkar AA, Kahmann JD, Howat SL, Bayliss MT, Day AJ (май 1998). «TSG-6 взаимодействует с Hyaluronan и Aggrecan в зависимости от pH с помощью общего функционального элемента: последствия для его регуляции в воспаленном хряще» . Письма Febs . 428 (3): 171–6. doi : 10.1016/s0014-5793 (98) 00523-7 . PMID 9654129 . S2CID 30827372 .
Ли Р.Т., Ямамото С., Фенг Й., Поттер-Периго С., Бриггс В.Х., Ландшулц К.Т., Тури Т.Г., Томпсон Дж. Ф., Либби П., Уайт Т.Н. (апрель 2001 г.). «Механический штамм вызывает специфические изменения в синтезе и организации протеогликанов с помощью клеток сосудистых мышц» . Журнал биологической химии . 276 (17): 13847–51. doi : 10.1074/jbc.m010556200 . PMID 11278699 .
Nentwich HA, Mustafa Z, Rugg MS, Marsden BD, Cordell MR, Mahoney DJ, Jenkins SC, Dowling B, Fries E, Milner CM, Loughlin J, Day AJ (май 2002 г.). «Новый аллельный вариант гена TSG-6 человека, кодирующего разность аминокислот в модуле CUB. Хромосомная локализация, частотный анализ, моделирование и экспрессия» . Журнал биологической химии . 277 (18): 15354–62. doi : 10.1074/jbc.m110765200 . PMID 11854277 .
Получение SJ, Mahoney DJ, Cao T, Rugg MS, Fries E, Milner CM, Perretti M, Day AJ (декабрь 2002 г.). «Модуль канала от человеческого TSG-6 ингибирует миграцию нейтрофилов в гиалуронано- и между альфа-ингибитором, независимым от способа» . Журнал биологической химии . 277 (52): 51068–76. doi : 10.1074/jbc.m205121200 . PMID 12401803 .
Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р., Гатлин Т., Тирумалай Р.С., Конрадс Т.П., Венстра Т.Д., Адкинс Дж.Н., Фунс Дж.Г., Фаган Р., Лобе А (апрель 2004 г.). «Протеом плазмы человека: нередактирующий список, разработанный комбинацией четырех отдельных источников» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (4): 311–26. doi : 10.1074/mcp.m300127-mcp200 . PMID 14718574 .
Sanggaard KW, Karring H, Valnickova Z, Thøgersen IB, Enghild JJ (март 2005 г.). «Взаимодействие TSG-6 и I Alpha I способствует перекрестному связующему связке белка-гликозаминогликана (PGP)» . Журнал биологической химии . 280 (12): 11936–42. doi : 10.1074/jbc.m409016200 . PMID 15653696 .
Blundell CD, Almond A, Mahoney DJ, Deangelis PL, Campbell ID, Day AJ (май 2005 г.). «На пути к структуре для комплекса TSG-6.Hyaluronan с помощью моделирования и спектроскопии ЯМР: понимание других членов суперсемейства модуля Link» . Журнал биологической химии . 280 (18): 18189–201. doi : 10.1074/jbc.m414343200 . PMID 15718240 .
Mindrescu C, Le J, Wisniewski Hg, Vilcek J (май 2005). «Повышенная регуляция экспрессии циклооксигеназы-2 белком TSG-6 в клеточной линии макрофагов». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 330 (3): 737–45. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.03.040 . PMID 15809059 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 2 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000123610 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000053475 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid1730767-5] Lee TH, Wisniewski HG, Vilcek J (январь 1992 г.). «Новый секреторный фактор некроза опухоли, индуцируемый белком (TSG-6), является членом семейства гиалуронатных связывающих белков, тесно связанных с рецептором адгезии CD44» . Журнал клеточной биологии . 116 (2): 545–57. doi : 10.1083/jcb.116.2.545 . PMC 2289279 . PMID 1730767 .

[pmid8454591-6] Lee TH, Klampfer L, показывает TB, Vilcek J (март 1993 г.). «Транскрипционная регуляция TSG6, фактор некроза опухоли-и индуцируемый интерлейкином-1 геном первичного ответа, кодирующий секретируемый гиалуронан-связывающий белок» . Журнал биологической химии . 268 (9): 6154–60. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 53232-4 . PMID 8454591 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: фактор некроза опухоли TNFAIP6, альфа-индуцированный белок 6» .

[Mittal_et._al-8] Миттал М., Тируппати С., Непал С., Чжао Й.Ю., Грич Д., Сони Д., Прок -Д.Дж., Малик А.Б. (декабрь 2016 г.). «Стимулированный TNFα ген-6 (TSG6) активирует переход фенотипа макрофага для предотвращения воспалительного повреждения легких» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (50): E8151 - E8158. BIBCODE : 2016PNAS..113E8151M . doi : 10.1073/pnas.1614935113 . PMC 5167170 . PMID 27911817 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]