база данных ДНК
В этой статье используются голые URL-адреса , которые неинформативны и уязвимы к порче ссылок . ( сентябрь 2022 г. ) |
База данных ДНК или банк данных ДНК — это база данных профилей ДНК , которую можно использовать при анализе генетических заболеваний , генетическом снятии отпечатков пальцев в криминологии или генетической генеалогии . Базы данных ДНК могут быть публичными или частными, причем крупнейшими из них являются национальные базы данных ДНК .
Базы данных ДНК часто используются в судебно-медицинских расследованиях. Когда в национальной базе данных ДНК делается совпадение, чтобы связать место преступления с человеком, чей профиль ДНК хранится в базе данных, эту связь часто называют « холодным попаданием» . Холодное попадание имеет особую ценность для установления связи конкретного человека с местом преступления, но имеет меньшую доказательную ценность, чем совпадение ДНК, сделанное без использования базы данных ДНК. [ 1 ] Исследования показывают, что базы данных ДНК преступников снижают уровень преступности. [ 2 ] [ 3 ]
Типы
[ редактировать ]судебно-медицинская экспертиза
[ редактировать ]База данных судебно-медицинской экспертизы — это централизованная база данных ДНК для хранения профилей ДНК отдельных лиц, которая позволяет осуществлять поиск и сравнение образцов ДНК, собранных на месте преступления, с сохраненными профилями. Наиболее важной функцией базы данных судебно-медицинской экспертизы является установление совпадений между подозреваемым лицом и биомаркерами места преступления, а затем предоставление доказательств в поддержку уголовных расследований, а также приводит к выявлению потенциальных подозреваемых в ходе уголовного расследования. Большинство национальных баз данных ДНК используются в судебно-медицинских целях. [ 4 ]
База данных ДНК Интерпола используется в уголовных расследованиях. Интерпол поддерживает автоматизированную базу данных ДНК под названием DNA Gateway, которая содержит профили ДНК, предоставленные странами-членами, собранные с мест преступлений, пропавших без вести лиц и неопознанных тел. [ 5 ] DNA Gateway был создан в 2002 году, и по состоянию на конец 2013 года в нем было более 140 000 профилей ДНК из 69 стран-членов. В отличие от других баз данных ДНК, DNA Gateway используется только для обмена информацией и сравнения, он не связывает профиль ДНК с каким-либо человеком, а физическое или психологическое состояние человека не включается в базу данных. [ 5 ]
Генеалогический
[ редактировать ]Национальная или судебно-медицинская база данных ДНК недоступна для неполицейских целей. Профили ДНК также могут использоваться в генеалогических целях, поэтому генетической генеалогии необходимо создать отдельную базу данных , в которой будут храниться профили ДНК результатов генеалогического анализа ДНК . GenBank — это общедоступная база данных генетической генеалогии, в которой хранятся последовательности генома, представленные многими специалистами по генетической генеалогии. До сих пор GenBank содержал большое количество последовательностей ДНК, полученных от более чем 140 000 зарегистрированных организаций, и обновляется каждый день, чтобы обеспечить единообразный и полный сбор информации о последовательностях. Эти базы данных в основном получены из отдельных лабораторий или крупномасштабных проектов секвенирования. Файлы, хранящиеся в GenBank, разделены на различные группы, такие как BCT (бактерии), VRL (вирусы), PRI (приматы)... и т. д. Люди могут получить доступ к GenBank из поисковой системы NCBI, а затем использовать функцию «BLAST», чтобы идентифицировать определенную последовательность в GenBank или найти сходство между двумя последовательностями. [ 6 ]
Медицинский
[ редактировать ]Медицинская база данных ДНК — это база данных ДНК, содержащая генетические вариации, имеющие медицинское значение. Он собирает ДНК человека, которая может отражать его медицинские записи и детали образа жизни. Записывая профили ДНК, ученые могут выяснить взаимодействие между генетической средой и возникновением определенных заболеваний (таких как сердечно-сосудистые заболевания или рак) и, таким образом, найти новые лекарства или эффективные методы лечения этих заболеваний. Он часто сотрудничает с Национальной службой здравоохранения. [ 7 ]
Национальный
[ редактировать ]Национальная база данных ДНК — это база данных ДНК, поддерживаемая правительством для хранения профилей ДНК населения. Каждый профиль ДНК, основанный на ПЦР, использует анализ STR (короткие тандемные повторы). Обычно они используются в судебно-медицинских целях, включая поиск и сопоставление профилей ДНК потенциальных подозреваемых в совершении преступлений. [ 8 ]
В 2009 году Интерпол сообщил о наличии 54 национальных баз данных ДНК полиции в мире и еще 26 стран планировали создать такую базу данных. [ 9 ] В Европе Интерпол сообщил, что существует 31 национальная база данных ДНК и планируется создать еще шесть. [ 9 ] В 2014 году рабочая группа по ДНК Европейской сети институтов судебно-медицинской экспертизы (ENFSI) вынесла 33 рекомендации по управлению базами данных ДНК и рекомендации по аудиту баз данных ДНК. [ 10 ] Другие страны приняли частные базы данных ДНК, например Катар, который принял Bode dbSEARCH. [ 11 ]
Обычно крошечная часть генома человека отбирается из 13 или 16 регионов с высокой индивидуализацией.
Великобритания
[ редактировать ]Первая национальная база данных ДНК в Соединенном Королевстве была создана в апреле 1995 года и называлась Национальной базой данных ДНК (NDNAD). К 2006 году он содержал 2,7 миллиона профилей ДНК (около 5,2% населения Великобритании), а также другую информацию от отдельных лиц и мест преступлений. [ 12 ] в 2020 году у него было 6,6 миллиона профилей (5,6 миллиона человек без учета дубликатов). [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] Информация хранится в виде цифрового кода, который основан на номенклатуре каждого СПО. [ 16 ] В 1995 году в базе данных изначально было 6 маркеров STR для каждого профиля, с 1999 года — 10 маркеров, а с 2014 года — 16 основных маркеров и гендерный идентификатор. С 2014 года Шотландия использовала 21 локус STR, два маркера Y-ДНК и идентификатор пола. [ 17 ] В Великобритании полиция имеет широкие полномочия по взятию образцов ДНК и их хранению, если субъект признан виновным в совершении преступления, подлежащего регистрации. [ 18 ] [ 19 ] Поскольку в NDNAD хранится большое количество профилей ДНК, во время сопоставления ДНК могут произойти «холодные удары», что означает обнаружение неожиданного совпадения между профилем ДНК человека и нераскрытым профилем ДНК на месте преступления. Это может привлечь к расследованию нового подозреваемого и тем самым помочь раскрыть старые дела. [ 20 ]
В Англии и Уэльсе любой арестованный по подозрению в регистрируемом преступлении должен предоставить образец ДНК, профиль которого затем сохраняется в базе данных ДНК. Данные ДНК тех, кому не предъявлены обвинения или не признаны виновными, удаляются в течение определенного периода времени. [ 21 ] В Шотландии закон также требует удаления из базы данных профилей ДНК большинства оправданных людей.
Новая Зеландия
[ редактировать ]Новая Зеландия стала второй страной, создавшей базу данных ДНК. [ 22 ] В 2019 году в банке данных профилей ДНК Новой Зеландии содержалось 40 000 профилей ДНК и 200 000 образцов. [ 23 ] [ 24 ]
Соединенные Штаты
[ редактировать ]Национальная база данных ДНК США называется Комбинированной системой индексов ДНК (CODIS). Он поддерживается на трех уровнях: национальном, государственном и местном. На каждом уровне реализована собственная система индексов ДНК. Национальная система индексов ДНК (NDIS) позволяет обмениваться профилями ДНК и сравнивать их между участвующими лабораториями на национальном уровне. Система индексации ДНК каждого штата (SDIS) позволяет обмениваться профилями ДНК и сравнивать их между лабораториями различных штатов, а местная система индексирования ДНК (LDIS) позволяет собирать профили ДНК на местных сайтах и загружать их в SDIS и NDIS.
Программное обеспечение CODIS интегрирует и соединяет все системы индексации ДНК на трех уровнях. CODIS устанавливается на каждой участвующей лаборатории и использует автономную сеть, известную как глобальная сеть информационных систем уголовного правосудия (CJIS WAN). [ 8 ] [ 25 ] для связи с другими лабораториями. Чтобы уменьшить количество нерелевантных совпадений в NDIS, Индекс осужденных правонарушителей требует всех 13 STR присутствия CODIS для загрузки профиля. Для загрузки профилей судебно-медицинской экспертизы требуется наличие только 10 STR.
По состоянию на 2011 год в CODIS хранилось более 9 миллионов записей. [ 26 ] По состоянию на март 2011 года накоплено 361 176 криминалистических анкет и 9 404 747 анкет правонарушителей. [ 27 ] что делает ее крупнейшей базой данных ДНК в мире. По состоянию на ту же дату CODIS предоставил более 138 700 совпадений с запросами, что помогло провести более 133 400 расследований. [ 28 ]
Растущее общественное одобрение баз данных ДНК привело к созданию и расширению собственных баз данных ДНК во многих штатах. Политические меры, такие как Калифорнийское предложение 69 (2004 г.), которое расширило объем базы данных ДНК, уже привели к значительному увеличению числа расследований, которым была оказана помощь. В 49 штатах США , за исключением Айдахо, хранятся профили ДНК насильственных преступников, а во многих также хранятся профили подозреваемых. [ 29 ] Исследование 2017 года показало, что базы данных ДНК в штатах США «сдерживают преступность со стороны определенных преступников, снижают уровень преступности и являются более экономически эффективными, чем традиционные инструменты правоохранительных органов». [ 3 ]
CODIS также используется для поиска пропавших без вести людей и идентификации человеческих останков. Он подключен к Национальной базе данных ДНК пропавших без вести лиц ; образцы, предоставленные членами семьи, секвенируются Центром идентификации человека Университета Северного Техаса . [ 30 ] который также управляет Национальной системой пропавших без вести и неопознанных лиц . UNTCHI может секвенировать как ядерную, так и митохондриальную ДНК . [ 31 ]
Министерство обороны ведет базу данных ДНК для идентификации останков военнослужащих. Хранилище сывороток Министерства обороны хранит более 50 000 000 записей, в первую очередь для помощи в идентификации человеческих останков. Сдача образцов ДНК обязательна для военнослужащих США, но в базе данных также есть информация о военнослужащих-иждивенцах. Закон о полномочиях национальной обороны 2003 года предоставил федеральным судам или военным судьям возможность предписывать использование собранной информации ДНК для целей расследования или судебного преследования за тяжкое преступление или любое сексуальное преступление, для которого нет другого источника. Информация о ДНК достаточно доступна. [ 32 ]
Австралия
[ редактировать ]Национальная база данных ДНК Австралии называется Национальной базой данных ДНК уголовных расследований (NCIDD). К июлю 2018 года он содержал более 837 000 профилей ДНК. [ 33 ] [ 34 ] В базе данных для анализа использовались девять локусов STR и половой ген, а в 2013 году это число было увеличено до 18 основных маркеров. [ 35 ] NCIDD объединяет все данные судебно-медицинской экспертизы, включая профили ДНК, расширенные биометрические данные или нераскрытые дела.
Канада
[ редактировать ]Канадская национальная база данных ДНК называется Национальным банком данных ДНК (NDDB), которая была создана в 1998 году, но впервые использовалась в 2000 году. [ 36 ] Законодательство, принятое парламентом для регулирования использования этой технологии в системе уголовного правосудия, было признано канадскими судами уважительным к конституционным правам и правам на неприкосновенность частной жизни подозреваемых, а также лиц, признанных виновными в определенных преступлениях. [ 37 ]
11 декабря 1999 года канадское правительство согласовало Закон об идентификации ДНК . Это позволит создать канадский банк данных ДНК и внести поправки в уголовный кодекс. Это дает судьям возможность потребовать от правонарушителя предоставить кровь, мазки из ротовой полости или образцы волос по профилям ДНК. Этот закон вступил в силу 29 июня 2000 года. Канадская полиция использует данные судебно-медицинской экспертизы ДНК уже более десяти лет. Он стал одним из самых мощных инструментов, доступных правоохранительным органам для отправления правосудия. [ 38 ]
NDDB состоит из двух индексов: Индекса осужденных преступников (COI) и Национального индекса места преступления (CSI-nat). Существует также Индекс мест местных преступлений (CSI-loc), который ведется местными лабораториями, но не NDDB, поскольку местные профили ДНК не соответствуют критериям сбора NDDB. Другой национальный индекс места преступления (CSI-nat) представляет собой совокупность трех лабораторий, находящихся в ведении Королевской канадской конной полиции (RCMP), Лабораторных наук, Юридической медицины (LSJML) и Центра судебно-медицинской экспертизы (CFS).
Дубай
[ редактировать ]В 2017 году Дубай объявил об инициативе под названием Dubai 10X, целью которой было создание в стране «подрывных инноваций». [ 39 ] Одним из проектов этой инициативы стала база данных ДНК, которая должна была собрать геномы всех 3 миллионов граждан страны за 10-летний период. Предполагалось использовать базу данных для поиска генетических причин заболеваний и создания персонализированных методов лечения. [ 40 ]
Германия
[ редактировать ]Германия создала свою базу данных ДНК для Федеральной полиции Германии (BKA) в 1998 году. [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] [ 44 ] В конце 2010 года база данных содержала профили ДНК более 700 000 человек, а в сентябре 2016 года она содержала 1 162 304 записи. [ 45 ] 23 мая 2011 года в программе «Остановите безумие по сбору ДНК!» кампании различные организации по гражданским правам и защите данных передали открытое письмо [ 46 ] министру юстиции Германии Сабине Лойтхойссер-Шнарренбергер с просьбой принять меры, чтобы остановить «превентивное расширение сбора данных ДНК» и «превентивное использование простых подозрений и государственного аппарата против отдельных лиц», а также отменить проекты международный обмен данными ДНК на европейском и трансатлантическом уровне. [ 47 ]
Израиль
[ редактировать ]Национальная база данных ДНК Израиля называется Системой индексирования ДНК полиции Израиля (IPDIS). [ 48 ] который был основан в 2007 году и имеет коллекцию из более чем 135 000 профилей ДНК. В коллекцию включены ДНК-профили подозреваемых, обвиняемых и осужденных преступников. Израильская база данных также включает в себя «банк исключений» профилей сотрудников лабораторий и других сотрудников полиции, которые могли иметь контакт с доказательствами судебно-медицинской экспертизы в ходе своей работы.
Чтобы обеспечить высокую производительность обработки и анализа образцов ДНК с карт FTA, в базе данных ДНК израильской полиции создана полуавтоматическая программа LIMS, которая позволяет небольшому числу полицейских завершить обработку большого количества образцов за относительно небольшой период времени. период времени, а также отвечает за будущее отслеживание образцов.
Кувейт
[ редактировать ]В июле 2015 года правительство Кувейта приняло закон, требующий от всех граждан и постоянных жителей (4,2 миллиона человек) сдать ДНК для национальной базы данных. [ 49 ] Причиной принятия этого закона стали соображения безопасности после взрыва террориста-смертника ИГИЛ в мечети Имама Садика . [ 50 ] Они планировали завершить сбор ДНК к сентябрю 2016 года, что, по мнению сторонних наблюдателей, было оптимистичным. [ 51 ] В октябре 2017 года Конституционный суд Кувейта отменил закон, заявив, что это вторжение в личную жизнь, и проект был отменен. [ 52 ]
Бразилия
[ редактировать ]В 1998 году Научно-исследовательский институт судебно-медицинской экспертизы ДНК гражданской полиции Федерального округа создал базы данных ДНК, свидетельствующие о сексуальном насилии . [ 53 ] В 2012 году Бразилия утвердила национальный закон о создании баз данных ДНК на уровне штатов и страны, касающихся типирования ДНК лиц, осужденных за насильственные преступления. [ 53 ] После указа президента Республики Бразилия в 2013 году, который регулирует закон 2012 года, Бразилия начала использовать CODIS в дополнение к базам данных ДНК с доказательствами сексуального насилия для раскрытия преступлений сексуального насилия в Бразилии . [ 53 ]
Франция
[ редактировать ]Франция создала базу данных ДНК под названием FNAEG в 1998 году. К декабрю 2009 года на FNAEG было 1,27 миллиона профилей. [ 54 ]
Россия
[ редактировать ]В России активно проводится научное ДНК-тестирование с целью изучения генетического разнообразия народов России в рамках государственной задачи — научиться по ДНК определять вероятную территорию происхождения человека на основе данных о большинстве народы страны. 16 июня 2017 года Совет Министров Союзного государства Беларуси и России принял Постановление № 26, которым утвердил научно-техническую программу Союзного государства «Разработка инновационных геногеографических и геномных технологий идентификации личности и индивидуальные особенности человека на основе изучения генофондов регионов Союзного государства» (ДНК – идентификация).
В рамках этой программы планируется также включить в геногеографическое исследование на основе существующих коллекций народы соседних стран, которые являются основным источником миграции.
В соответствии с Федеральным законом от 3 декабря 2008 г. № 242-ФЗ "О государственной геномной регистрации в Российской Федерации" добровольная государственная геномная регистрация граждан Российской Федерации, а также иностранных граждан и лиц без гражданства, проживающих или временно пребывающих на территории Российской Федерации на основании письменного заявления и на платной основе. Геномная информация, полученная в результате государственной геномной регистрации, используется, в том числе, в целях установления родственных связей разыскиваемых (идентифицированных) лиц. Формой учета данных геномной регистрации граждан является Федеральная база данных геномной информации (ФБДГИ).
Статьями 10 и 11 Федерального закона от 27 июля 2006 г. № 152-ФЗ «О персональных данных» предусмотрено, что обработка специальных категорий персональных данных, касающихся расы, национальности, политических взглядов, религиозных или философских убеждений, состояния здоровья, интимная жизнь допускается, если это необходимо в связи с выполнением международных договоров Российской Федерации о реадмиссии и осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации о гражданстве Российской Федерации. Сведения, характеризующие физиологические и биологические особенности человека, на основании которых можно установить его личность (биометрические персональные данные), могут обрабатываться без согласия субъекта персональных данных в связи с реализацией международных договоров Российской Федерации о реадмиссии, осуществлении правосудия и исполнении судебных актов, обязательной государственной дактилоскопической регистрации, а также в случаях, предусмотренных законодательством Российской Федерации о обороне, безопасности, борьбе с терроризмом, транспортной безопасности, противодействии коррупции, оперативной деятельности. следственная деятельность, государственная служба, а также в случаях, предусмотренных уголовно-исполнительным законодательством России, законодательством России о порядке выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию, гражданстве Российской Федерации и нотариате. [ 55 ]
Другие европейские страны
[ редактировать ]По сравнению с другими европейскими странами Нидерланды являются крупнейшим сборщиком профилей ДНК своих граждан. На данный момент база данных ДНК Нидерландского института судебно-медицинской экспертизы содержит профили ДНК более чем 316 000 голландских граждан. [ 56 ]
В отличие от ситуации в большинстве других европейских стран, голландская полиция обладает широкими полномочиями по взятию и хранению образцов ДНК, если субъект признан виновным в совершении регистрируемого преступления, за исключением случаев, когда приговор предполагает только уплату штрафа. Если субъект откажется, например, из соображений конфиденциальности, голландская полиция применит силу.
В Швеции хранятся только профили ДНК преступников, отсидевших в тюрьме более двух лет. В Норвегии и Германии постановления суда требуются и доступны только для серьезных правонарушителей и для тех, кто осужден за определенные преступления и может совершить повторное преступление, соответственно. В Австрии в 1997 году была создана база данных ДНК преступников. [ 57 ] и Италия также создали один в 2016 году. [ 58 ] [ 59 ] Швейцария создала временную базу данных ДНК преступников в 2000 году и подтвердила ее законодательно в 2005 году. [ 60 ]
В 2005 году новое правительство Португалии предложило ввести базу данных ДНК всего населения Португалии. [ 61 ] Однако после информированных дебатов, включая мнение Португальского совета по этике, [ 62 ] введенная база данных касалась только преступного населения. [ 63 ]
Genuity Science (ранее Genomics Medicine Ireland) — ирландская медико-биологическая компания, основанная в 2015 году с целью создания научной платформы для проведения геномных исследований и разработки новых стратегий и методов профилактики заболеваний. Компания была основана группой предпринимателей, инвесторов и исследователей в области медико-биологических наук, а ее научная платформа основана на работе исландской дочерней компании Amgen , deCODE Genetics , которая стала пионером в области геномных исследований здоровья населения . [ 64 ] Компания создает геномную базу данных, которая будет включать данные примерно 10 процентов населения Ирландии, включая пациентов с различными заболеваниями и здоровых людей. [ 65 ] Идея частной компании, владеющей общедоступными данными ДНК, вызвала обеспокоенность: в редакционной статье Irish Times говорится: «На сегодняшний день Ирландия, похоже, приняла полностью коммерческий подход к геномной медицине. Этот подход ставит под угрозу свободную доступность геномных данных для научные исследования, которые могут принести пользу пациентам». [ 66 ] В редакционной статье газеты отмечается, что это резко контрастирует с подходом, принятым Великобританией, который представляет собой финансируемый государством и благотворительностью проект «100 000 геномов», осуществляемый Genomics England .
Китай
[ редактировать ]К 2020 году китайская полиция собрала 80 миллионов профилей ДНК. [ 67 ] [ 68 ] Высказывались опасения, что Китай может использовать данные ДНК не только для раскрытия преступлений, но и для отслеживания активистов, в том числе уйгуров . [ 69 ]
Китайцы начали программу изучения генетики стоимостью 9 миллиардов долларов, у Fire-Eye есть лаборатории ДНК более чем в 20 странах. [ 70 ]
Индия
[ редактировать ]Индия объявила, что запустит свою геномную базу данных к осени 2019 года. [ 71 ] На первом этапе проекта «Геном Индии» будут каталогизированы геномные данные 10 000 индийцев. Департамент биотехнологии (DBT) инициировал проект. Первый частный банк ДНК в Индии находится в Лакхнау. [ 72 ] — столица индийского штата Уттар-Прадеш. В отличие от исследовательского центра, публика может хранить свою ДНК, заплатив минимальную сумму и четыре капли крови.
Корпоративный
[ редактировать ]Этот раздел нуждается в расширении . Вы можете помочь, добавив к нему . ( декабрь 2016 г. ) |
- Сообщается, что по состоянию на ноябрь 2018 года компания Ancestry собрала 14 миллионов образцов ДНК. [ 73 ]
- 23andme содержала генетическую информацию более чем девяти миллионов человек по всему миру. К 2019 году база данных ДНК [ 74 ] [ 75 ] Компания изучает возможность продажи «анонимных агрегированных генетических данных» другим исследователям и фармацевтическим компаниям для исследовательских целей, если пациенты дадут свое согласие. [ 76 ] [ 77 ] [ 78 ] [ 79 ] [ 80 ] Ахмад Харири, профессор психологии и нейробиологии в Университете Дьюка , который использует 23andMe в своих исследованиях с 2009 года, утверждает, что наиболее важным аспектом нового сервиса компании является то, что он делает генетические исследования доступными и относительно дешевыми для ученых. [ 76 ] Исследование, которое выявило 15 сайтов генома, связанных с депрессией, в базе данных 23andMe, привело к резкому увеличению запросов на доступ к хранилищу: 23andMe отправила почти 20 запросов на доступ к данным о депрессии в течение двух недель после публикации статьи. [ 81 ]
- My Heritage сообщила, что в 2019 году в их базе данных было 2,5 миллиона профилей. [ 74 ]
- Family Tree DNA в 2019 году было около двух миллионов человек. Сообщалось, что в базе данных [ 74 ]
- Огненный Глаз
Сжатие
[ редактировать ][ 82 ] Базы данных ДНК занимают больше места по сравнению с другими базами данных, не относящимися к ДНК, из-за огромного размера каждой последовательности ДНК . С каждым годом базы данных ДНК растут в геометрической прогрессии. Это создает серьезную проблему для хранения, передачи, поиска и поиска данных в этих базах данных. Для решения этих проблем базы данных ДНК сжимаются для экономии места для хранения и пропускной способности во время передачи данных. Они распаковываются во время поиска и извлечения. Для сжатия и распаковки используются различные алгоритмы сжатия. Эффективность любого алгоритма сжатия зависит от того, насколько хорошо и быстро он сжимает и распаковывает, что обычно измеряется степенью сжатия. Чем больше степень сжатия, тем выше эффективность алгоритма. В то же время для оценки также учитывается скорость сжатия и декомпрессии.
Последовательности ДНК содержат палиндромные повторы A, C, T, G. Сжатие этих последовательностей включает обнаружение и кодирование этих повторов и их декодирование во время декомпрессии.
Некоторые подходы, используемые для кодирования и декодирования:
- Кодирование Хаффмана
- Адаптивное кодирование Хаффмана
- Арифметическое кодирование
- Арифметическое кодирование
- Метод взвешивания контекстного дерева (CTW)
Алгоритмы сжатия , перечисленные ниже, могут использовать один из вышеуказанных подходов кодирования для сжатия и распаковки базы данных ДНК.
- Сжатие с использованием избыточности наборов ДНК (COMRAD) [ 83 ] [ 84 ]
- Родственник Лемпель-Зива (РЛЗ) [ 84 ]
- Генкомпресс
- Биокомпресс
- ДНККомпресс
- CTW+LZ
В 2012 году группа ученых из Университета Джонса Хопкинса опубликовала первый алгоритм генетического сжатия, который не использует для сжатия внешние генетические базы данных. HAPZIPPER был специально разработан для данных HapMap и обеспечивает более чем 20-кратное сжатие (уменьшение размера файла на 95%), обеспечивая в 2–4 раза лучшее сжатие, намного быстрее, чем ведущие утилиты сжатия общего назначения. [ 85 ]
Алгоритмы сжатия геномных последовательностей, также известные как компрессоры последовательностей ДНК, исследуют тот факт, что последовательности ДНК обладают характерными свойствами, такими как инвертированные повторы. Наиболее успешными компрессорами являются XM и GeCo. [ 86 ] Для эукариот XM немного лучше по степени сжатия, хотя для последовательностей размером более 100 МБ его вычислительные требования непрактичны.
Лекарство
[ редактировать ]Многие страны собирают образцы крови новорожденных для выявления заболеваний, в основном имеющих генетическую основу. В основном они уничтожаются вскоре после испытаний. В некоторых странах засохшая кровь (и ДНК) сохраняются для последующего тестирования.
В Дании Датский биобанк скрининга новорожденных при Statens Serum Institut хранит образцы крови людей, родившихся после 1981 года. Целью является тестирование на фенилкетонурию и другие заболевания. [ 87 ] Однако он также используется для анализа ДНК для идентификации умерших и подозреваемых преступников. [ 88 ] Родители могут потребовать уничтожить образец крови своего новорожденного после того, как станет известен результат анализа.
Проблемы конфиденциальности
[ редактировать ]Критики баз данных ДНК предупреждают, что различные варианты использования этой технологии могут представлять угрозу гражданским свободам личности . [ 89 ] [ 90 ] Личная информация, содержащаяся в генетическом материале, такая как маркеры, идентифицирующие различные генетические заболевания , физические и поведенческие черты, может использоваться для дискриминационного профилирования, а ее сбор может представлять собой вторжение в частную жизнь. [ 91 ] [ 92 ] [ 93 ] Кроме того, ДНК может быть использована для установления отцовства и того, усыновлен ли ребенок. В настоящее время вопросы конфиденциальности и безопасности баз данных ДНК привлекают огромное внимание. Некоторые люди боятся, что их личная информация о ДНК будет легко раскрыта, другие могут определить запись своих профилей ДНК в базах данных как «преступную», а ложное обвинение в преступлении может привести к появлению «уголовного» прошлого. остаток своей жизни.
Законы Великобритании 2001 и 2003 годов позволяли делать профили ДНК сразу после ареста человека и хранить их в базе данных, даже если подозреваемый впоследствии был оправдан. [ 94 ] В ответ на общественное беспокойство по поводу этих положений, [ 94 ] Позднее Великобритания изменила это положение, приняв Закон о защите свобод 2012 года , который требовал, чтобы данные ДНК подозреваемых, которым не предъявлены обвинения или признаны невиновными, были удалены из базы данных. [ 21 ]
В европейских странах, создавших базы данных ДНК, существуют некоторые меры, которые используются для защиты конфиденциальности людей, а точнее, некоторые критерии, помогающие удалить профили ДНК из баз данных. Среди 22 европейских стран, которые были проанализированы, большинство стран будут регистрировать профили ДНК подозреваемых или тех, кто совершил серьезные преступления. В некоторых странах (например, в Бельгии и Франции) профиль преступника могут удалить через 30–40 лет, поскольку эти базы данных «уголовного расследования» больше не нужны. Большинство стран удалят профиль подозреваемого после того, как он будет оправдан... и т.д. Во всех странах имеется готовое законодательство, позволяющее в значительной степени избежать проблем конфиденциальности, которые могут возникнуть при использовании базы данных ДНК. [ 4 ] Общественное обсуждение внедрения передовых методов судебно-медицинской экспертизы (таких как генетическая генеалогия с использованием общедоступных генеалогических баз данных и подходов к фенотипированию ДНК) было ограниченным, разрозненным и несфокусированным и поднимало вопросы конфиденциальности и согласия, которые могут служить основанием для установления дополнительных правовых мер защиты. [ 95 ]
Проблемы конфиденциальности, связанные с базами данных ДНК, означают, что конфиденциальность находится под угрозой не только при сборе и анализе образцов ДНК, но также существует при защите и хранении этой важной личной информации. Поскольку профили ДНК могут храниться в базе данных ДНК неограниченное время, возникли опасения, что эти образцы ДНК могут быть использованы для новых и неустановленных целей. [ 96 ] С увеличением числа пользователей, имеющих доступ к базе данных ДНК, люди беспокоятся о том, что их информация будет раскрыта или передана ненадлежащим образом, например, их профиль ДНК может быть передан другим лицам, например правоохранительным органам или странам, без индивидуального согласия. [ 97 ]
Применение баз данных ДНК распространилось на две спорные области: поиск арестованных и семейный поиск. Арестованным является лицо, арестованное за преступление и еще не осужденное за это преступление. В настоящее время в 21 штате США принят закон, который позволяет правоохранительным органам брать ДНК у арестованного и вводить ее в базу данных ДНК штата CODIS, чтобы проверить, есть ли у этого человека судимость или может ли он быть связан с какими-либо нераскрытыми преступлениями. При семейном поиске база данных ДНК используется для поиска частичных совпадений, которые можно было бы ожидать между близкими членами семьи. Эту технологию можно использовать для того, чтобы связать преступления с членами семей подозреваемых и тем самым помочь идентифицировать подозреваемого, когда у преступника нет образца ДНК в базе данных. [ 98 ] [ 99 ]
Кроме того, базы данных ДНК могут попасть в чужие руки из-за утечки данных или обмена данными.
Сбор ДНК и права человека
[ редактировать ]В решении, вынесенном в декабре 2008 года, Европейский суд по правам человека постановил, что полиция не должна была сохранять ДНК и отпечатки пальцев двух британцев, заявив, что сохранение «не может считаться необходимым в демократическом обществе ». [ 100 ]
Пионер ДНК-отпечатков пальцев профессор сэр Алек Джеффрис осудил планы правительства Великобритании хранить генетические данные сотен тысяч невинных людей в Англии и Уэльсе на срок до 12 лет. Джеффрис сказал, что он «разочарован» этими предложениями, которые поступили после того, как Европейский суд постановил, что нынешняя политика нарушает право людей на неприкосновенность частной жизни. Джефферис сказал: «Похоже, что это настолько минимальный ответ на решение Европейского суда по правам человека, насколько можно себе представить. Здесь существует презумпция не невиновности, а будущей вины… что меня действительно очень тревожит». [ 101 ]
Влияние на преступность
[ редактировать ]Исследование 2021 года показало, что регистрация датских уголовных преступников в базе данных ДНК существенно снижает вероятность повторного правонарушения, а также повышает вероятность того, что рецидивисты будут идентифицированы, если они совершят преступления в будущем. [ 2 ]
Исследование 2017 года, опубликованное в American Economic Journal: Applied Economics, показало, что базы данных профилей ДНК преступников в штатах США «сдерживают преступность со стороны профилированных преступников, снижают уровень преступности и являются более экономически эффективными, чем традиционные инструменты правоохранительных органов». [ 3 ]
Монозиготные близнецы
[ редактировать ]У монозиготных близнецов около 99,99% общей ДНК, тогда как у других братьев и сестер — около 50%. Некоторые инструменты секвенирования следующего поколения способны обнаруживать редкие мутации de novo только у одного из близнецов (обнаруживаемые в редких однонуклеотидных полиморфизмах ). [ 102 ] Большинство инструментов тестирования ДНК не обнаруживают эти редкие SNP у большинства близнецов.
ДНК каждого человека уникальна, за небольшим исключением однояйцевых (монозиготных и моноспермотических) близнецов, которые начинаются с одной и той же генетической линии ДНК, но во время процесса близнецирования имеют невероятно малые мутации, которые можно обнаружить уже сейчас (во всех смыслах и целях). по сравнению со всеми другими людьми и даже с теоретическими «клонами, [которые не имели бы одну и ту же матку и не испытывали бы одни и те же мутации до рождения близнецов]» однояйцевые близнецы имеют более идентичную ДНК, чем, вероятно, можно достичь между любыми другими двумя людьми) . Крошечные различия между однояйцевыми близнецами теперь (2014 г.) можно обнаружить с помощью секвенирования следующего поколения. В настоящее время финансово доступное тестирование «идентичных» близнецов не может быть легко различено с помощью наиболее обычного анализа ДНК, но было доказано, что это возможно. В то время как другие братья и сестры (включая разнояйцевых близнецов) разделяют около 50% своей ДНК, монозиготные близнецы разделяют практически 99,99%. Помимо этих недавно обнаруженных различий в мутациях событий-близнецов, с 2008 года было известно, что каждый из людей, являющихся однояйцевыми близнецами, также имеет свой собственный набор вариантов числа копий, который можно рассматривать как количество копий, которые каждый из них лично демонстрирует с определенной степенью достоверности. участки ДНК. [ 103 ]
См. также
[ редактировать ]- Комбинированная система индексов ДНК (CODIS)
- Профилирование ДНК
- Служба судебно-медицинской экспертизы
- Правительственные базы данных
- LGC Криминалистика
- Национальная база данных ДНК Великобритании
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Rose & Goos: ДНК - Практическое руководство ( Carswell Publications , Торонто).
- ^ Jump up to: а б Анкер, Энн Софи Тегнер; Долак, Дженнифер Л.; Ландерсё, Расмус (2021). «Влияние баз данных ДНК на сдерживание и обнаружение преступников» . Американский экономический журнал: Прикладная экономика . 13 (4): 194–225. дои : 10.1257/app.20190207 . ISSN 1945-7782 . S2CID 239235452 .
- ^ Jump up to: а б с Долак, Дженнифер Л. (01 января 2017 г.). «Влияние баз данных ДНК на преступность». Американский экономический журнал: Прикладная экономика . 9 (1): 165–201. CiteSeerX 10.1.1.269.6210 . дои : 10.1257/app.20150043 . ISSN 1945-7782 .
- ^ Jump up to: а б Сантос, Филипе; Мачадо, Хелена; Сильва, Сусана (3 декабря 2013 г.). «Базы данных судебно-медицинской экспертизы ДНК в европейских странах: размер связан с производительностью?» . Науки о жизни, общество и политика . 9 (1): 12. дои : 10.1186/2195-7819-9-12 . ПМК 4513018 .
- ^ Jump up to: а б «ДНК/Криминалистика/Экспертиза Интерпола/Интернет/Дом – Интерпол» .
- ^ Бенсон, Деннис А.; Кавано, Марк; Кларк, Карен; Карш-Мизрачи, Илен; Липман, Дэвид Дж.; Остелл, Джеймс; Сэйерс, Эрик В. (27 ноября 2012 г.). «ГенБанк» . Нуклеиновые кислоты Рез . 41 (Проблема с базой данных): D36–42. дои : 10.1093/nar/gks1195 . ПМК 3531190 . PMID 23193287 – через nar.oxfordjournals.org.
- ^ Хагманн, М. (2000). «Великобритания планирует создать крупную базу данных медицинской ДНК» . Наука . 287 (5456): 1184б–1184. дои : 10.1126/science.287.5456.1184b . ПМИД 10712143 . S2CID 70954894 .
- ^ Jump up to: а б Батлер, Джон М. (27 июля 2011 г.). Продвинутые темы судебно-медицинского типирования ДНК: методология . Академическая пресса. ISBN 978-0-12-387823-6 .
- ^ Jump up to: а б «Глобальное исследование по профилированию ДНК: результаты и анализ» (PDF) . Отдел ДНК Интерпола. 2009. с. Приложение 1 . Проверено 12 октября 2015 г.
- ^ Рабочая группа ENFSI по ДНК. (2010). Управление базой данных ДНК: обзор и рекомендации. Гаага (Нидерланды): ENFSI. Архивировано 11 сентября 2014 г. в Wayback Machine.
- ^ http://www.bodetech.com/bodedbsearch [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Линакр, А (2003). «Национальная база данных ДНК Великобритании». Ланцет . 361 (9372): 1841–1842. дои : 10.1016/s0140-6736(03)13539-8 . ПМИД 12788567 . S2CID 31070032 .
- ^ Двухгодичный отчет Совета по стратегии национальной базы данных ДНК за 2018–2020 гг. (PDF) . Министерство внутренних дел Великобритании; Канцелярия Ее Величества. Сентябрь 2020. с. 10. ISBN 978-1-5286-1916-5 . Проверено 6 ноября 2020 г.
- ^ «Статистика Национальной базы данных ДНК, 1 квартал 2015–2016 гг.» . Статистика Национальной базы данных ДНК . Министерство внутренних дел правительства Великобритании . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ Гэв Айрлэнд; Саймон Льюис; Дэн Фукс. «Статистика» . npia.police.uk . НПИА . Архивировано из оригинала 17 июня 2012 г. Проверено 4 августа 2012 г.
- ^ Гилл, П. (февраль 2002 г.). «Роль коротких тандемных повторов ДНК в судебно-медицинской экспертизе в Великобритании: перспективы прошлого, настоящего и будущего» (PDF) . БиоТехники . 32 (2): 366–385. дои : 10.2144/02322rv01 . ПМИД 11848414 .
- ^ Судебно-медицинский анализ ДНК: пособие для судов . Лондон: Королевское общество. 2017. ISBN 978-1-78252-301-7 . OCLC 1039675621 .
- ^ Боукотт, Оуэн (13 мая 2015 г.). «Хранение профилей ДНК преступников не является противозаконным, постановляет Верховный суд» . Хранитель . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ «Идентификация по образцам тела и отпечаткам — 4.4 Раздел 82: Ограничения на использование и уничтожение отпечатков пальцев и образцов» . WikiCrimeLine . Архивировано из оригинала 23 февраля 2007 г.
- ^ Уоллес, Хелен (1 июля 2006 г.). «Национальная база данных ДНК Великобритании» . Отчеты ЭМБО . 7 (1С): С26–С30. дои : 10.1038/sj.embor.7400727 . ПМК 1490298 . ПМИД 16819445 .
- ^ Jump up to: а б «Закон о защите свобод 2012 года: положения о ДНК и отпечатках пальцев» . Закон о защите свобод 2012 года: как доказательства ДНК и отпечатков пальцев защищаются законом . Министерство внутренних дел правительства Великобритании. 4 апреля 2014 года . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ Судебная медицина
- ^ «О банке данных ДНК СОЭ» . Институт экологических наук и исследований, ESR, правительство Новой Зеландии . Проверено 07.11.2020 .
- ^ «Обзор базы данных ДНК» (PDF) . Институт экологических наук и исследований ESR Новой Зеландии - Информационный бюллетень о месте преступления . Ноябрь 2019. с. 3.
- ^ Брошюра CODIS
- ^ «Лабораторные услуги» .
- ^ «CODIS – Статистика NDIS» .
- ^ Помощь в расследовании. Архивировано 6 апреля 2009 г., в Wayback Machine.
- ^ «Верховный суд постановил, что полиция может брать образцы ДНК после ареста» . Новости CBS .
- ^ «Протокол сбора семейной ДНК» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 16 декабря 2010 г. Проверено 1 мая 2018 г.
- ^ Отделение пропавших без вести лиц
- ^ http://www.councilforresponsiblegenetics.org/geneticprivacy/DNA_mil.html.
- ^ Комиссия, Австралийская криминальная разведка (18 июля 2018 г.). «Национальная база данных ДНК уголовных расследований» .
- ^ Моббс, Джонатан Д. (2001). «Кримтрак-технологии и обнаружение» . 4-й Национальный симпозиум по проблемам преступности в Австралии: новые преступления или новые меры реагирования. Канберра.
- ^ Кертис, Кейтлин; Херевард, Джеймс (29 августа 2017 г.). «От места преступления до зала суда: путешествие образца ДНК» . Разговор . Проверено 14 октября 2017 г.
- ^ Милот, Э; Лекомт, ММ; Жермен, Х; Криспино, Ф (2013). «Национальный банк данных ДНК Канады: взгляд Квебека» . Фронт Генет . 4 : 249. дои : 10.3389/fgene.2013.00249 . ПМЦ 3834530 . ПМИД 24312124 .
- ^ «Национальный банк данных ДНК». Архивировано 25 июня 2013 г. в Wayback Machine.
- ^ «Национальный банк данных ДНК» . Королевская канадская конная полиция . 22 апреля 2001 г.
- ^ Саттон, Марк (14 февраля 2017 г.). «Его Высочество шейх Мохаммед запускает 10-кратную инициативу» . ITP.net . Проверено 02 марта 2018 г.
- ^ Тревиньо, Джулисса (20 марта 2018 г.). «Дубай хочет протестировать ДНК миллионов своих жителей, чтобы предотвратить генетические заболевания» . Смитсоновский институт . Проверено 02 марта 2018 г.
- ^ «GeneWatch Великобритания – Германия» . Genewatch.org . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ «База данных ДНК Германии» . Архивировано из оригинала 29 декабря 2016 года . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ «Национальные базы данных ДНК-разведки в Европе – отчет о текущей ситуации» (PDF) . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Пиренбум, Э. (1 июня 1998 г.). «Центральная база данных ДНК преступников создана в Германии». Природная биотехнология . 16 (6): 510–511. дои : 10.1038/nbt0698-510 . ISSN 1087-0156 . ПМИД 9624672 . S2CID 28662677 .
- ^ Кеппнер, Иоахим (8 декабря 2016 г.). «Справедливость: контрольные образцы» (на немецком языке). Зюддойче Цайтунг . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ «Оп-письмо. Остановите безумие полиции по сбору ДНК!» (PDF) . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Шульц, Сюзанна. « Остановите безумие по сбору ДНК!»: Расширение базы данных ДНК Германии» . Инициатива по политике в области судебной генетики . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Замир, Ашира; Делл'Аричча-Кармон, Авива; Закен, Неоми; Оз, Карла (1 марта 2012 г.). «База данных ДНК Израиля — создание быстрой полуавтоматической системы анализа». Международная судебно-медицинская экспертиза: Генетика . 6 (2): 286–289. дои : 10.1016/j.fsigen.2011.06.003 . ПМИД 21727053 .
- ^ Виссер, Ник (14 июля 2015 г.). «Кувейт введет обязательное тестирование ДНК для всех жителей» . Хаффингтон Пост . Проверено 10 октября 2015 г.
- ^ «ИГИЛ взяло на себя ответственность за взрыв шиитской мечети в Кувейте» . Аль Джазира. 27 июня 2015 г. Проверено 10 октября 2015 г.
- ^ Поле, Рассвет (3 сентября 2015 г.). «Война Кувейта с ИГИЛ и ДНК» . Блог издательства Оксфордского университета . Проверено 10 октября 2015 г.
- ^ Коглан, Энди (9 октября 2017 г.). «Планы Кувейта по созданию обязательной базы данных ДНК были отменены» . Новый учёный . Проверено 02 марта 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с Феррейра, Сэмюэл Т.Г.; Паула, Карла А.; Майя, Флавия А.; Свидизинский, Артур Э.; Амарал Марина Р.; Диниз, Сильмара А.; Сикейра, Мария Э.; Мораес, Адриана В. (2015). «Использование базы данных ДНК биологических доказательств сексуальных посягательств в уголовных расследованиях: успешный опыт в Бразилиа, Бразилия» . Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 5 : 595–597. дои : 10.1016/j.fsigss.2015.09.235 .
- ^ Рауль, Эрик (12 января 2010 г.). «Вопрос №: 68468» (на французском языке). 13-й законодательный орган. Ответ от 06 апреля 2010 г.
- ^ Mirolyubova, Svetlana (2021). "Проблемы применения ДНК-теста в целях воссоединения семьи и репатриации" . Surgut State University Journal . 2021. № 1(31): 91–100. doi : 10.34822/2312-3419-2021-1-91-100 .
- ^ Безопасность, Министерство юстиции и (14 мая 2013 г.). «Главная — Голландская база данных ДНК» . dnadatabank.forensischinstituut.nl (на голландском языке) . Проверено 22 сентября 2019 г.
- ^ Хиндмаш, Ричард; Прайнсак, Барбара, ред. (12 августа 2010 г.). Генетические подозреваемые: глобальное управление судебно-медицинским анализом ДНК и базированием данных . Издательство Кембриджского университета. п. 154. ИСБН 978-0521519434 .
- ^ Негри, Джованни (26 марта 2016 г.). «Италия утверждает базу данных ДНК для борьбы с преступностью» . Il Sole 24 Ore, английское издание . Проверено 11 мая 2017 г.
- ^ «Италия создает национальную базу данных ДНК для усиления борьбы с терроризмом» . Ямайский обозреватель . 26 марта 2016 г. Проверено 11 мая 2017 г.
- ^ Хаас, К.; Вогели, П.; Хесс, М.; Кратцер, А.; Бэр, В. (1 апреля 2006 г.). «Новая правовая основа и коммуникационная платформа для швейцарской базы данных ДНК». Серия международных конгрессов . Прогресс в судебной генетике 11. Материалы 21-го Международного конгресса ISFG, проходившего в Понта-Делгада, Азорские острова, Португалия, с 13 по 16 сентября 2005 г. 1288 : 734–736. дои : 10.1016/j.ics.2005.11.040 .
- ^ «Журнал Newropeans - Европейская перспектива. Подготовка к миру завтрашнего дня» .
- ^ «CNECV — Национальный совет по этике в науках о жизни» .
- ^ Скиннер, Дэвид (14 июля 2010 г.). «Социология 52: 13: Мачадо и Силва: судебно-медицинская экспертиза ДНК в Португалии» .
- ^ «Наука о подлинности | Анализ геномных данных для открытия» . Наука о гениальности . Проверено 27 мая 2021 г.
- ^ «Геномика: открывая новые горизонты» . Ирландские Таймс . Проверено 07.11.2020 .
- ^ МакКоннелл, Дэвид; Хардиман, Орла. «В стратегии геномной медицины Ирландия ставит прибыль выше людей» . Ирландские Таймс . Проверено 07.11.2020 .
- ^ Ви, Суй-Ли (30 июля 2020 г.). «Китай собирает ДНК у десятков миллионов мужчин и мальчиков, используя американское оборудование» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 07.11.2020 .
- ^ Цяньвэй, Вэньсинь Фань и Наташа Хан в Гонконге и Лиза Линь в (27 декабря 2017 г.). «Китай ловит как невинных, так и виновных, чтобы создать крупнейшую в мире базу данных ДНК» . Уолл Стрит Джорнал . ISSN 0099-9660 . Проверено 07.11.2020 .
- ^ Ви, Суй-Ли (21 февраля 2019 г.). «Китай использует ДНК для отслеживания своих людей с помощью американского опыта» . Нью-Йорк Таймс .
- ^ Уоррик, Джоби; Браун, Кейт. «Попытки Китая получить генетические данные человека вызывают опасения по поводу гонки вооружений в области ДНК» . Вашингтон Пост . Проверено 27 октября 2023 г.
- ^ РАДЖАГОПАЛ, ДИВЬЯ. «Индия запускает свой первый проект по каталогизации генома человека» . Экономические времена . Проверено 07.11.2020 .
- ^ «Уттар-Прадеш – Поиск в Google» . www.google.com . Проверено 6 апреля 2022 г.
- ^ Бурштынский, Джессика (12 февраля 2019 г.). «Более 26 миллионов человек поделились своей ДНК с фирмами, занимающимися изучением предков, что позволило исследователям проследить родство практически между всеми американцами: MIT» . CNBC . Проверено 07.11.2020 .
- ^ Jump up to: а б с Регаладо, Антонио (11 февраля 2019 г.). «Более 26 миллионов человек прошли домашний тест на происхождение» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 07.11.2020 .
- ^ «23andMe — Родословная» . 23andme.com . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Потенца, Алессандра (13 июля 2016 г.). «23andMe хочет, чтобы исследователи использовали ее наборы, чтобы расширить свою коллекцию генетических данных» . Грань . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ «Этот стартап секвенирует вашу ДНК, чтобы вы могли внести свой вклад в медицинские исследования» . Компания Фаст. 23 декабря 2016 года . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Сейф, Чарльз. «23andMe ужасен, но не по тем причинам, по которым думает FDA» . Научный американец . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Залесский, Эндрю (22 июня 2016 г.). «Этот биотехнологический стартап делает ставку на то, что ваши гены создадут следующее чудо-лекарство» . CNBC . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Регаладо, Антонио. «Как 23andMe превратила вашу ДНК в машину по разработке лекарств стоимостью 1 миллиард долларов» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ «23andMe сообщает о резком росте запросов на данные после исследования депрессии Pfizer | FierceBiotech» . www.fightbiotech.com . 22 августа 2016 года . Проверено 29 декабря 2016 г.
- ^ Атит Мехта и Банким Патель и др., 2010 г., «Сжатие ДНК с использованием структуры данных на основе хэша», Международный журнал информационных технологий и управления знаниями, июль – декабрь 2010 г., том 2, № 2, стр. 383–386
- ^ Биджи, CL; Мадху, МК; Вишну, В. (28 мая 2015 г.). «Сжатие больших наборов геномных данных с использованием COMRAD на платформе параллельных вычислений» . Биоинформация . 11 (5): 267–271. дои : 10.6026/97320630011267 . ПМЦ 4464544 . ПМИД 26124572 .
- ^ Jump up to: а б Куруппу, СС (январь 2012 г.). Сжатие больших баз данных ДНК (PDF) (доктор философии). Университет Мельбурна.
- ^ Чанда, П.; Эльхайк, Э.; Бадер, Дж. С. (2012). «HapZipper: делиться популяциями HapMap стало проще» . Нуклеиновые кислоты Рез . 40 (20): 1–7. дои : 10.1093/nar/gks709 . ПМЦ 3488212 . ПМИД 22844100 .
- ^ Пратас, Д.; Пиньо, Эй Джей; Феррейра, PJSG (2016). Эффективное сжатие геномных последовательностей . Конференция по сжатию данных. Сноуберд, Юта.
- ^ [1] [ мертвая ссылка ]
- ^ «Банк крови как криминальный альбом» . 16 сентября 2007 г.
- ^ Джеффрис, Стюарт (27 октября 2006 г.). «Подозрительная нация» . Хранитель .
- ^ Лемье, Скотт (23 марта 2012 г.). «Создает ли полиция огромную базу данных ДНК?» . АльтерНет .
- ^ «База данных ДНК «нарушение прав» » . Новости Би-би-си . 4 декабря 2008 г.
- ^ Кертис, Кейтлин; Херевард, Джеймс (2 мая 2018 г.). «Предсказание лица по ДНК может затруднить защиту вашей конфиденциальности» . Разговор . Проверено 21 мая 2018 г.
- ^ Кертис, Кейтлин; Херевард, Джеймс (4 декабря 2017 г.). «Пришло время поговорить о том, кто может получить доступ к вашим цифровым геномным данным» . Разговор . Проверено 21 мая 2018 г.
- ^ Jump up to: а б Уоллес, HM; Джексон, Арканзас; Грубер, Дж.; Тибедо, AD (1 сентября 2014 г.). «Базы данных ДНК для судебно-медицинской экспертизы – Этические и правовые стандарты: глобальный обзор» . Египетский журнал судебной медицины . 4 (3): 57–63. дои : 10.1016/j.ejfs.2014.04.002 .
- ^ Кертис, Кейтлин; Херевард, Джеймс; Мангельсдорф, Мари; Хасси, Карен; Деверо, Джон (18 декабря 2018 г.). «Защита доверия к медицинской генетике в новую эпоху судебной экспертизы» . Генетика в медицине . 21 (7): 1483–1485. дои : 10.1038/s41436-018-0396-7 . ПМК 6752261 . ПМИД 30559376 .
- ^ Роман-Сантос, Кэндис (2010). «Опасения, связанные с расширением баз данных ДНК» . Гастингсский юридический журнал по науке и технологиям . 2 : 267.
- ^ Мартен Юсеф (2 октября 2009 г.). «Предложение о банке данных ДНК вызывает обеспокоенность по поводу конфиденциальности» . Национальный .
- ^ «ДНК-криминалистика» .
- ^ Обязательный сбор ДНК: анализ четвертой поправки Исследовательская служба Конгресса
- ^ «Великобритания | База данных ДНК «нарушение прав» » . Новости Би-би-си . 04.12.2008 . Проверено 4 августа 2012 г.
- ^ Джеймс Стерке (7 мая 2009 г.). «Пионер ДНК осуждает планы по сохранению данных о невиновных | Политика | Guardian.co.uk» . Лондон: Гардиан . Проверено 4 августа 2012 г.
- ^ Вебер-Леманн, Жаклин; Шиллинг, Эльмар; Градл, Георг; Рихтер, Дэниел С.; Вилер, Йенс; Рольф, Буркхард (2014). «Найти иголку в стоге сена: дифференцировать «идентичных» близнецов при тестировании на отцовство и судебно-медицинской экспертизе с помощью сверхглубокого секвенирования нового поколения» . Международная судебно-медицинская экспертиза: Генетика . 9 : 42–46. дои : 10.1016/j.fsigen.2013.10.015 . ISSN 1872-4973 . ПМИД 24528578 .
- ^ Am J Hum Genet. Март 2008 г.;82(3):763-71. дои: 10.1016/j.ajhg.2007.12.011. Электронная публикация 2008 г., 14 февраля. Фенотипически конкордантные и дискордантные монозиготные близнецы демонстрируют разные профили вариаций числа копий ДНК.