Субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COP9

COPS5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4D10, 4D18, 4F7O, 4WSN
Идентификаторы
Псевдонимы	COPS5 , CSN5, JAB1, MOV-34, SGN5, субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COP9, субъединица 5 сигналосомы COP9
Внешние идентификаторы	Опустить : 604850 ; МГИ : 1349415 ; Гомологен : 55992 ; GeneCards : COPS5 ; OMA : COPS5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	67,083,783 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	10,108,393 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; right ventricle; ; myocardium of left ventricle; ; gastrocnemius muscle; ; biceps brachii; ; vastus lateralis muscle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; right testis; ; left testis;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; medial ganglionic eminence; ; facial motor nucleus; ; temporal muscle; ; ventricular zone; ; lens; ; muscle of thigh; ; triceps brachii muscle; ; seminiferous tubule;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	translation initiation factor activity; transcription coactivator activity; metal ion binding; peptidase activity; protein binding; thiol-dependent deubiquitinase; hydrolase activity; metallopeptidase activity; NEDD8-specific protease activity; enzyme binding; macrophage migration inhibitory factor binding; metalloendopeptidase activity;
Cellular component	cytoplasm; eukaryotic translation initiation factor 3 complex; synaptic vesicle; synapse; nucleoplasm; cell junction; perinuclear region of cytoplasm; COP9 signalosome; cytoplasmic vesicle; nucleus; chromatin; cytosol;
Biological process	protein biosynthesis; nucleotide-excision repair, DNA damage recognition; transcription by RNA polymerase II; proteolysis; regulation of cell cycle; protein deubiquitination; regulation of JNK cascade; exosomal secretion; transcription-coupled nucleotide-excision repair; regulation of IRE1-mediated unfolded protein response; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; translational initiation; protein deneddylation; post-translational protein modification; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of DNA-binding transcription factor activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10987
	26754
	ENSG00000121022
	ENSMUSG00000025917
	Q92905
	О35864
	НМ_006837
	НМ_001277101 ; НМ_013715
	НП_006828 ; НП_006828.2
	НП_001264030 ; НП_038743
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COP9 (Arabidopsis) , также известная как COPS5 или Csn5, представляет собой ген , консервативный от человека до Saccharomyces cerevisiae . ^{[ 5 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является одной из восьми субъединиц сигналосомы COP9 , высококонсервативного белкового комплекса, который действует как важный регулятор во многих сигнальных путях. Структура и функция сигналосомы COP9 сходны со структурой и функцией регуляторной частицы 19S протеасомы 26S. Было показано, что сигналосома COP9 взаимодействует с убиквитинлигазами E3 SCF-типа и действует как положительный регулятор убиквитинлигаз E3. Сообщается, что этот белок участвует в деградации ингибитора циклин-зависимой киназы CDKN1B/p27Kip1. Также известно, что он является коактиватором, повышающим специфичность факторов транскрипции JUN/AP1. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COP9 взаимодействует с фактором, ингибирующим миграцию макрофагов . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} ГФЭР , ^{[ 8 ]} БКЛ3 , ^{[ 9 ]} Убиквитинкарбоксиконцевая гидролаза L1 , ^{[ 10 ]} С100А7 ^{[ 11 ]} и С-июнь . ^{[ 12 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000121022 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025917 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COPS5 COP9 (Arabidopsis)» .
^ Гош С., Литон Л.А., Фарр Л., Барфилд А., Муна С. (июль 2018 г.). «Взаимодействие между кодируемым паразитом JAB1/CSN5 и белками фактора ингибирования миграции макрофагов ослабляет его провоспалительную функцию» . Научные отчеты . 8 (1): 10241. Бибкод : 2018NatSR...810241G . дои : 10.1038/s41598-018-28625-1 . ПМК 6035221 . ПМИД 29980718 .
^ Климанн Р., Хауссер А., Гейгер Г., Мишке Р., Бургер-Кентишер А., Флигер О. и др. (ноябрь 2000 г.). «Внутриклеточное действие цитокина MIF по модуляции активности AP-1 и клеточного цикла посредством Jab1». Природа . 408 (6809): 211–6. Бибкод : 2000Natur.408..211K . дои : 10.1038/35041591 . ПМИД 11089976 . S2CID 205010648 .
^ Лу С., Ли Ю, Чжао Ю, Син Г, Тан Ф, Ван Ц и др. (январь 2002 г.). «Интракринный гепатопоэтин усиливает активность AP-1 через JAB1 независимо от пути MAPK» . Журнал ФАСЭБ . 16 (1): 90–2. doi : 10.1096/fj.01-0506fje . ПМИД 11709497 . S2CID 7006611 .
^ Деченд Р., Хирано Ф., Леманн К., Хейсмейер В., Ансьо С., Вулчин Ф.Г. и др. (июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB/Rel и ядерными корегуляторами». Онкоген . 18 (22): 3316–23. дои : 10.1038/sj.onc.1202717 . ПМИД 10362352 . S2CID 2356435 .
^ Кабальеро О.Л., Ресто В., Паттураджан М., Меерзаман Д., Го М.З., Энглс Дж. и др. (май 2002 г.). «Взаимодействие и колокализация PGP9.5 с JAB1 и p27 (Kip1)». Онкоген . 21 (19): 3003–10. дои : 10.1038/sj.onc.1205390 . ПМИД 12082530 . S2CID 20004395 .
^ Эмберли Э.Д., Ню Ю., Лейг Э., Томес Л., Гитц Р.Д., Мерфи Л.К., Уотсон П.Х. (апрель 2003 г.). «Псориазин взаимодействует с Jab1 и влияет на прогрессирование рака молочной железы». Исследования рака . 63 (8): 1954–61. ПМИД 12702588 .
^ Claret FX, Хиби М., Дхут С., Тода Т., Карин М. (октябрь 1996 г.). «Новая группа консервативных коактиваторов, повышающих специфичность факторов транскрипции AP-1». Природа . 383 (6599): 453–7. Бибкод : 1996Natur.383..453C . дои : 10.1038/383453a0 . ПМИД 8837781 . S2CID 4353893 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома COPS5 и COPS5 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (декабрь 2003 г.). «Сигналосома COP9: платформа сборки и обслуживания куллиноубиквитинлигаз?». Природная клеточная биология . 5 (12): 1029–33. дои : 10.1038/ncb1203-1029 . ПМИД 14647295 . S2CID 37458780 .
Claret FX, Хиби М., Дхут С., Тода Т., Карин М. (октябрь 1996 г.). «Новая группа консервативных коактиваторов, повышающих специфичность факторов транскрипции AP-1». Природа . 383 (6599): 453–7. Бибкод : 1996Natur.383..453C . дои : 10.1038/383453a0 . ПМИД 8837781 . S2CID 4353893 .
Асано К., Ворнлохер Х.П., Рихтер-Кук, Нью-Джерси, Меррик В.К., Хиннебуш АГ, Херши Дж.В. (октябрь 1997 г.). «Структура кДНК, кодирующей субъединицы фактора 3 инициации эукариот человека. Возможная роль в связывании РНК и сборке макромолекул» . Журнал биологической химии . 272 (43): 27042–52. дои : 10.1074/jbc.272.43.27042 . ПМИД 9341143 .
Сигер М., Крафт Р., Феррелл К., Бех-Отшир Д., Дамди Р., Шаде Р. и др. (апрель 1998 г.). «Новый белковый комплекс, участвующий в передаче сигнала, имеющий сходство с субъединицами 26S протеасомы» . Журнал ФАСЭБ . 12 (6): 469–78. дои : 10.1096/fasebj.12.6.469 . ПМИД 9535219 . S2CID 25424324 .
Вэй Н, Цуге Т, Серино Г, Домаэ Н, Такио К, Мацуи М, Дэн XW (1998). «Комплекс COP9 консервативен у растений и млекопитающих и связан с регуляторным комплексом 26S протеасомы» . Современная биология . 8 (16): 919–22. Бибкод : 1998CBio....8..919W . дои : 10.1016/S0960-9822(07)00372-7 . ПМИД 9707402 . S2CID 13873982 .
Томода К., Кубота Ю., Като Дж. (март 1999 г.). «Деградация ингибитора циклинзависимой киназы p27Kip1 инициируется Jab1». Природа . 398 (6723): 160–5. дои : 10.1038/18230 . ПМИД 10086358 . S2CID 204991745 .
Деченд Р., Хирано Ф., Леманн К., Хейсмейер В., Ансьо С., Вулчин Ф.Г. и др. (июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB/Rel и ядерными корегуляторами». Онкоген . 18 (22): 3316–23. дои : 10.1038/sj.onc.1202717 . ПМИД 10362352 . S2CID 2356435 .
Шошеро А., Джорджакаки М., Перрен-Вольф М., Милгром Э., Лусфелт Х. (март 2000 г.). «JAB1 взаимодействует как с рецептором прогестерона, так и с SRC-1» . Журнал биологической химии . 275 (12): 8540–8. дои : 10.1074/jbc.275.12.8540 . ПМИД 10722692 .
Бьянки Э., Денти С., Граната А., Босси Г., Гегинат Дж., Вилла А. и др. (апрель 2000 г.). «Интегрин LFA-1 взаимодействует с коактиватором транскрипции JAB1, модулируя активность AP-1». Природа . 404 (6778): 617–21. Бибкод : 2000Natur.404..617B . дои : 10.1038/35007098 . ПМИД 10766246 . S2CID 4384395 .
Климанн Р., Хауссер А., Гейгер Г., Мишке Р., Бургер-Кентишер А., Флигер О. и др. (ноябрь 2000 г.). «Внутриклеточное действие цитокина MIF по модуляции активности AP-1 и клеточного цикла посредством Jab1». Природа . 408 (6809): 211–6. Бибкод : 2000Natur.408..211K . дои : 10.1038/35041591 . ПМИД 11089976 . S2CID 205010648 .
Бех-Очир Д., Крафт Р., Хуанг Х, Хенклейн П., Капелари Б., Поллманн С., Дубиэль В. (апрель 2001 г.). «Специфическое фосфорилирование сигнала COP9 нацелено на деградацию p53 с помощью убиквитиновой системы» . Журнал ЭМБО . 20 (7): 1630–9. дои : 10.1093/emboj/20.7.1630 . ПМК 145508 . ПМИД 11285227 .
Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С. и др. (май 2001 г.). «Стимулирование расщепления конъюгата NEDD-CUL1 сигналосомой COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. Бибкод : 2001Sci...292.1382L . дои : 10.1126/science.1059780 . ПМИД 11337588 . S2CID 14224920 .
Томода К., Кубота Ю., Арата Ю., Мори С., Маэда М., Танака Т. и др. (январь 2002 г.). «Цитоплазматический челночный транспорт и последующая деградация p27Kip1, опосредованная Jab1/CSN5 и сигналосомным комплексом COP9» . Журнал биологической химии . 277 (3): 2302–10. дои : 10.1074/jbc.M104431200 . ПМИД 11704659 .
Бэ М.К., Ан М.Ю., Чон Дж.В., Бэ М.Х., Ли Ю.М., Бэ С.К. и др. (январь 2002 г.). «Jab1 напрямую взаимодействует с HIF-1альфа и регулирует его стабильность» . Журнал биологической химии . 277 (1): 9–12. дои : 10.1074/jbc.C100442200 . ПМИД 11707426 .
Лу С., Ли Ю, Чжао Ю, Син Г, Тан Ф, Ван Ц и др. (январь 2002 г.). «Интракринный гепатопоэтин усиливает активность AP-1 через JAB1 независимо от пути MAPK» . Журнал ФАСЭБ . 16 (1): 90–2. doi : 10.1096/fj.01-0506fje . ПМИД 11709497 . S2CID 7006611 .
Дай Ю.С., Чержеши П. (апрель 2002 г.). «Основной фактор спираль-петля-спираль, HAND2, действует как активатор транскрипции, связываясь с E-боксами в виде гетеродимера» . Журнал биологической химии . 277 (15): 12604–12. дои : 10.1074/jbc.M200283200 . ПМИД 11812799 .
Ван М, Цао X, Ву Ю, Бай С, Ву Л, Ши X и др. (февраль 2002 г.). «Jab1 противодействует передаче сигналов TGF-бета, вызывая деградацию Smad4» . Отчеты ЭМБО . 3 (2): 171–6. дои : 10.1093/embo-reports/kvf024 . ПМЦ 1083965 . ПМИД 11818334 .
Джеммилл Р.М., Бемис Л.Т., Ли Дж.П., Созен М.А., Барон А., Цзэн С. и др. (май 2002 г.). «Наследственный ген рака почки TRC8 подавляет рост и функционирует с VHL общим путем». Онкоген . 21 (22): 3507–16. дои : 10.1038/sj.onc.1205437 . ПМИД 12032852 . S2CID 9964634 .
Кабальеро О.Л., Ресто В., Паттураджан М., Меерзаман Д., Го М.З., Энглс Дж. и др. (май 2002 г.). «Взаимодействие и колокализация PGP9.5 с JAB1 и p27 (Kip1)». Онкоген . 21 (19): 3003–10. дои : 10.1038/sj.onc.1205390 . ПМИД 12082530 . S2CID 20004395 .
Чопра С., Фернандес Де Маттос С., Лам Э.В., Манн DJ (сентябрь 2002 г.). «Коактивация Jab1 c-Jun аннулируется серин-10-фосфорилированной формой p27Kip1» . Журнал биологической химии . 277 (36): 32413–6. дои : 10.1074/jbc.C200311200 . ПМИД 12119282 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000121022 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025917 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COPS5 COP9 (Arabidopsis)» .

[6] Гош С., Литон Л.А., Фарр Л., Барфилд А., Муна С. (июль 2018 г.). «Взаимодействие между кодируемым паразитом JAB1/CSN5 и белками фактора ингибирования миграции макрофагов ослабляет его провоспалительную функцию» . Научные отчеты . 8 (1): 10241. Бибкод : 2018NatSR...810241G . дои : 10.1038/s41598-018-28625-1 . ПМК 6035221 . ПМИД 29980718 .

[pmid11089976-7] Климанн Р., Хауссер А., Гейгер Г., Мишке Р., Бургер-Кентишер А., Флигер О. и др. (ноябрь 2000 г.). «Внутриклеточное действие цитокина MIF по модуляции активности AP-1 и клеточного цикла посредством Jab1». Природа . 408 (6809): 211–6. Бибкод : 2000Natur.408..211K . дои : 10.1038/35041591 . ПМИД 11089976 . S2CID 205010648 .

[pmid11709497-8] Лу С., Ли Ю, Чжао Ю, Син Г, Тан Ф, Ван Ц и др. (январь 2002 г.). «Интракринный гепатопоэтин усиливает активность AP-1 через JAB1 независимо от пути MAPK» . Журнал ФАСЭБ . 16 (1): 90–2. doi : 10.1096/fj.01-0506fje . ПМИД 11709497 . S2CID 7006611 .

[pmid10362352-9] Деченд Р., Хирано Ф., Леманн К., Хейсмейер В., Ансьо С., Вулчин Ф.Г. и др. (июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB/Rel и ядерными корегуляторами». Онкоген . 18 (22): 3316–23. дои : 10.1038/sj.onc.1202717 . ПМИД 10362352 . S2CID 2356435 .

[pmid12082530-10] Кабальеро О.Л., Ресто В., Паттураджан М., Меерзаман Д., Го М.З., Энглс Дж. и др. (май 2002 г.). «Взаимодействие и колокализация PGP9.5 с JAB1 и p27 (Kip1)». Онкоген . 21 (19): 3003–10. дои : 10.1038/sj.onc.1205390 . ПМИД 12082530 . S2CID 20004395 .

[pmid12702588-11] Эмберли Э.Д., Ню Ю., Лейг Э., Томес Л., Гитц Р.Д., Мерфи Л.К., Уотсон П.Х. (апрель 2003 г.). «Псориазин взаимодействует с Jab1 и влияет на прогрессирование рака молочной железы». Исследования рака . 63 (8): 1954–61. ПМИД 12702588 .

[pmid8837781-12] Claret FX, Хиби М., Дхут С., Тода Т., Карин М. (октябрь 1996 г.). «Новая группа консервативных коактиваторов, повышающих специфичность факторов транскрипции AP-1». Природа . 383 (6599): 453–7. Бибкод : 1996Natur.383..453C . дои : 10.1038/383453a0 . ПМИД 8837781 . S2CID 4353893 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]