УБАП1

УБАП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1WGN, 4AE4
Идентификаторы
Псевдонимы	UBAP1 , NAG20, UAP, UBAP, UBAP-1, убиквитин-ассоциированный белок 1, SPG80
Внешние идентификаторы	Опустить : 609787 ; МГИ : 2149543 ; Гомологен : 9554 ; Генные карты : UBAP1 ; ОМА : UBAP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	34,252,523 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	41,390,525 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gastrocnemius muscle; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; muscle of thigh; ; islet of Langerhans; ; ventricular zone; ; ectocervix; ; blood; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	granulocyte; ; ventricular zone; ; muscle of thigh; ; blood; ; tail of embryo; ; duodenum; ; right kidney; ; esophagus; ; neural layer of retina; ; spermatocyte;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ubiquitin binding; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; endosome; plasma membrane; Golgi apparatus; ESCRT I complex; endosome membrane; host cell;
Biological process	protein transport; ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; endosomal transport; viral life cycle; intracellular transport of virus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51271
	67123
	ENSG00000165006
	ENSMUSG00000028437
	Q9NZ09
	Q8BH48
	НМ_001171201 ; НМ_001171202 ; НМ_001171203 ; НМ_001171204 ; НМ_016525
	НМ_001290454 ; НМ_023305 ; НМ_001355508 ; НМ_001355509
	НП_001164672 ; НП_001164673 ; НП_001164674 ; НП_001164675 ; НП_057609
	НП_001277383 ; НП_075794 ; НП_001342437 ; НП_001342438
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-ассоциированный белок 1 — это белок , который у человека кодируется UBAP1 геном . ^{[ 5 ]}

Этот ген является членом семейства убиквитин-ассоциированных доменов (UBA), члены которого включают белки, имеющие связи с убиквитином и путем убиквитинирования . Считается, что связанный с убиквитином домен представляет собой нековалентный убиквитин-связывающий домен, состоящий из компактного трехспирального пучка . Этот конкретный белок происходит из локуса гена в усовершенствованной области хромосомы 9, теряющей гетерозиготность при карциноме носоглотки (NPC). Принимая во внимание его цитогенетическое расположение, этот член семейства доменов UBA изучается в качестве предполагаемой мишени для мутаций при карциномах носоглотки. ^{[ 5 ]} Укорачивающие мутации в UBAP1 вызывают наследственную спастическую параплегию. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165006 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028437 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 1, связанный с убиквитином UBAP1» .
^ Фарази Фард М.А., Ребело А.П., Бугло Э., Немати Х., Дастсуз Х., Гевайлер И. и др. (апрель 2019 г.). «Усекающие мутации в UBAP1 вызывают наследственную спастическую параплегию» . Американский журнал генетики человека . 104 (4): 767–773. дои : 10.1016/j.ajhg.2019.03.001 . ПМК 6451742 . ПМИД 30929741 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виман С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассл С., Ансорж В. и др. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Отчеты ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Цянь Дж., Ян Дж., Чжан Х., Чжан Б., Ван Дж., Чжоу М. и др. (октябрь 2001 г.). «Выделение и характеристика новой кДНК, UBAP1, полученной из локуса-супрессора опухоли в хромосоме 9p21-22 человека». Журнал исследований рака и клинической онкологии . 127 (10): 613–8. дои : 10.1007/s004320100252 . ПМИД 11599797 . S2CID 3160021 .
Цянь Дж, Чжан XH, Ян JB, Ван JR, Чжан BC, Тан К, Ли GY (2001). «Клонирование и анализ экспрессии нового гена UBAP1, возможно, участвующего в пути убиквитина». Шэн Ву Хуа Сюэ Юй Шэн Ву Ву Ли Сюэ Бао Acta Biochimica et Biophysica Sinica . 33 (2): 147–152. ПМИД 12050802 .
Цянь Дж, Чжан XM, Ли XL, Ван младший, Ли ВФ, Ван Р, Ли ГЮ (март 2002 г.). «[Идентификация цифровых дифференциальных паттернов экспрессии нового человеческого гена (UBAP1) с помощью стратегии метки экспрессируемой последовательности]». АИ Чжэн = Айчжэн = Китайский журнал рака . 21 (3): 225–8. ПМИД 12451983 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А. и др. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Сяо Б., Фань С., Цзэн З., Сюн В., Цао Л., Ян Ю. и др. (май 2006 г.). «Очистка нового белка UBAP1 и снижение его экспрессии на микрочипе ткани карциномы носоглотки». Экспрессия и очистка белков . 47 (1): 60–7. дои : 10.1016/j.pep.2005.08.026 . ПМИД 16226037 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф. и др. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165006 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028437 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 1, связанный с убиквитином UBAP1» .

[6] Фарази Фард М.А., Ребело А.П., Бугло Э., Немати Х., Дастсуз Х., Гевайлер И. и др. (апрель 2019 г.). «Усекающие мутации в UBAP1 вызывают наследственную спастическую параплегию» . Американский журнал генетики человека . 104 (4): 767–773. дои : 10.1016/j.ajhg.2019.03.001 . ПМК 6451742 . ПМИД 30929741 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]