Торархеота
| Торархеота | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Архея |
| Королевство: | Протеоархеота |
| Супертип: | Асгард |
| Тип: | « Кандидат Торархеота» Бейкер 2015 |
| Сорт | |
| |
« Candidatus Thorarchaeota », или просто , является типом супертипа Thorarchaeota архей Асгарда . Супертип Асгарда представляет собой ближайших прокариотических родственников эукариот . Поскольку существует такая тесная связь между двумя разными доменами, это дает дополнительные доказательства теории двухдоменного древа жизни , которая утверждает, что эукариоты произошли от домена архей . Асгардовые археи — это одноклеточные морские микробы, которые содержат ветвистые придатки и имеют гены, сходные с эукариями. [1] Надтип асгардных архей состоит из Thorarchaeota, Lokiarchaeota , Odinarchaeota и Heimdallarchaeota . [2] Торархеоты впервые были идентифицированы в зоне перехода сульфат-метан в отложениях приливных вод. Торархеоты широко распространены в морских и пресноводных отложениях.
Открытие
[ редактировать ]Торархеоты были обнаружены путем анализа устья отложений реки Уайт-Оук в Северной Каролине . Эстуарии — это солоноватые водоемы, где встречаются пресная и морская вода, образуя богатую и уникальную зону питательных веществ. [3] Аспирант Техасского университета обнаружил новые характеристики Thorarchaeota, живущих под отложениями и обладающих бескислородными свойствами. Аспиранты также доказали, что археи способствуют разложению органического вещества, фиксации неорганического углерода и восстановлению серы. [4] Геномы Thorarchaeota, полученные от морских животных, по-видимому, имеют разнообразие метаболических путей с возможностью разложения и поглощения белков и углеводов. [5]
Описание
[ редактировать ]Thorarchaeota не культивировали в лаборатории. Все, что известно о Thorarchaeota, получено в результате анализа частичных и почти полных геномов. Из частичных геномов было секвенировано 3029 белков. [6] Эти геномы содержат гены, которые предполагают, что Thorarchaeota может обладать способностью разлагать органические вещества, что предполагает их роль в углеродном цикле и промежуточную роль в цикле серы . Были обнаружены гены почти полного пути Вуда-Люнгдала, но в них отсутствовали гены формиатдегидрогеназы . Это может быть связано с неполными геномами. Thorachaeota может использовать путь тетрагидрометаноптерина Вуда-Люнгдала для снижения содержания углекислого газа. [7] У Thorarchaeota есть гены деградации и ассимиляции белков, в том числе гены клострипаин и гингипаин . У них также есть гены внеклеточных пептидаз . Эти гены могут свидетельствовать о том, что основным источником углерода для Thorarchaeota являются белки и пептиды. [5] В секвенированных частичных геномах Thorarchaeota также присутствуют гены гликолиза . У них отсутствуют гены гексокиназ , однако у них есть гены пируваткиназы и фосфоенолпируватсинтазы . Наличие генов этих ферментов может играть роль в способности адаптироваться к различным условиям окружающей среды. были обнаружены Гены фиксации азота в большинстве образцов, содержащих частичные геномы, однако не восстановление нитрита . было обнаружено генов ферментов, катализирующих [7] Некоторые из секвенированных частичных геномов имеют почти полные пути Кальвина-Бенсона-Бэсшама и, как было обнаружено, используют RuBisCO типа IV . В то время как другие типы супертипа Асгарда используют RuBisCO типа III и типа IV, ни один из них не имеет пути Кальвина-Бенсона-Башама. [7]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Неуловимые асгардские археи наконец культивированы в лаборатории» . Журнал «Ученый»® . Проверено 16 ноября 2019 г.
- ^ Заремба-Недзведска, Катажина; Касерес, Ева Ф.; Пила, Джимми Х.; Бэкстрем, Диса; Юзокайте, Лина; Ванкастер, Эммельен; Зейтц, Кили В.; Анантараман, Картик; Старнавский, Петр; Кьельдсен, Каспер У.; Стотт, Мэтью Б. (январь 2017 г.). «Асгардские археи проливают свет на происхождение сложности эукариотических клеток» . Природа . 541 (7637): 353–358. Бибкод : 2017Natur.541..353Z . дои : 10.1038/nature21031 . ISSN 1476-4687 . ПМИД 28077874 . S2CID 4458094 .
- ^ Адам, Панайотис С; Боррель, Гийом; Брошье-Армане, Селин; Грибальдо, Симонетта (ноябрь 2017 г.). «Растущее дерево архей: новые взгляды на их разнообразие, эволюцию и экологию» . Журнал ISME . 11 (11): 2407–2425. дои : 10.1038/ismej.2017.122 . ISSN 1751-7362 . ПМК 5649171 . ПМИД 28777382 .
- ^ «Идентифицирован новый тип микробов» . utmsi.utexas.edu . Проверено 16 ноября 2019 г.
- ^ Перейти обратно: а б Зейтц, Кили В.; Лазар, Кассандра С; Хинрикс, Кай-Уве; Теске, Андреас П; Бейкер, Бретт Дж. (июль 2016 г.). «Геномная реконструкция нового, глубоко разветвленного типа архей отложений с путями ацетогенеза и восстановления серы» . Журнал ISME . 10 (7): 1696–1705. дои : 10.1038/ismej.2015.233 . ISSN 1751-7362 . ПМЦ 4918440 . ПМИД 26824177 .
- ^ «Кандидат Торархеота археон СМТЗ1-83» . www.uniprot.org . Проверено 16 ноября 2019 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Лю, Ян; Чжоу, Чжичао; Пан, Цзе; Бейкер, Бретт Дж.; Гу, Цзи-Донг; Ли, Мэн (апрель 2018 г.). «Сравнительный геномный вывод предполагает миксотрофный образ жизни Thorarchaeota» . Журнал ISME . 12 (4): 1021–1031. дои : 10.1038/s41396-018-0060-x . ISSN 1751-7370 . ПМЦ 5864231 . ПМИД 29445130 .