Палладий

ПАЛЛД
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2DM2, 2DM3
Идентификаторы
Псевдонимы	PALLD , CGI-151, CGI151, MYN, PNCA1, SIH002, палладин, цитоскелет-ассоциированный белок
Внешние идентификаторы	Опустить : 608092 ; МГИ : 1919583 ; Гомологен : 75052 ; GeneCards : PALLD ; ОМА : PALLD – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	168,928,457 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	62,355,724 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	saphenous vein; ; right ventricle; ; tail of epididymis; ; hair follicle; ; visceral pleura; ; seminal vesicula; ; myometrium; ; right coronary artery; ; popliteal artery; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	belly cord; ; atrium; ; atrioventricular valve; ; interventricular septum; ; endocardial cushion; ; left lung lobe; ; ventricle; ; uterus; ; gastrula; ; left ventricle;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	muscle alpha-actinin binding; protein binding; actin binding; cell-cell adhesion mediator activity;
Cellular component	cell projection; focal adhesion; growth cone; ruffle; plasma membrane; axon; cell junction; Z discdkac; actin filament; actin cytoskeleton; podosome; cytoskeleton; nucleus; lamellipodium; cytoplasm; cytosol;
Biological process	epithelial cell morphogenesis; keratinocyte development; cytoskeleton organization; actin cytoskeleton organization; cell migration; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; axon guidance; dendrite self-avoidance;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	23022
	72333
	ENSG00000129116
	ENSMUSG00000058056
	Q8WX93
	Q9ET54
показывать НМ_001166108 ; НМ_001166109 ; НМ_001166110 ; НМ_016081 ; НМ_001367567 ;
	NM_001367568; NM_001367569; NM_001367570
	НМ_001081390 ; НМ_001293772 ; НМ_001293773 ; НМ_001293774
показывать НП_001159580 ; НП_001159581 ; НП_001159582 ; НП_057165 ; НП_001354496 ;
	NP_001354497; NP_001354498; NP_001354499
	НП_001074859 ; НП_001280701 ; НП_001280702 ; НП_001280703
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Палладин — это белок , который у человека кодируется PALLD геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Палладин является компонентом актинсодержащих микрофиламентов, которые контролируют форму клеток, адгезию и сокращение. ^{[ 8 ]}

Открытие

Палладин был охарактеризован независимо двумя исследовательскими группами, сначала в лаборатории Кэрол Оти (в 2000 г.). ^{[ 6 ]} а затем в лаборатории Олли Карпена (в 2001 г.). ^{[ 9 ]} Он является частью семейства миотилин-миопалладин-палладин и может играть важную роль в модуляции актинового цитоскелета . ^{[ 10 ]} Палладин, в отличие от миотилина и миопалладина , экспрессирующихся только в поперечнополосатых мышцах , экспрессируется повсеместно в клетках мезенхимального происхождения.

Палладин был назван в честь итальянского архитектора эпохи Возрождения Андреа Палладио , что отражает его локализацию на архитектурных элементах кельи. ^{[ 6 ]}

Эукариотический цитоскелет. Палладин является одним из компонентов этого сложного клеточного механизма.

Изоформы

У человека, по-видимому, существует семь различных изоформ, некоторые из которых возникают в результате альтернативного сплайсинга . ^{[ 11 ]} У мышей три основные изоформы палладина возникают из одного гена. Эти изоформы содержат от трех до пяти копий (в зависимости от изоформы) Ig-подобного домена и от одной до двух копий полипролинового домена. ^{[ 6 ]}

Функция

Точная биологическая роль Палладина плохо изучена, но было показано, что он играет роль в организации цитоскелета, эмбриональном развитии, подвижности клеток, образовании рубцов на коже и развитии нервных клеток. ^{[ 10 ]}

Связь с болезнями

Недавно было продемонстрировано, что палладиновая РНК сверхэкспрессируется у пациентов с поджелудочной железы неоплазией и что палладин одновременно сверхэкспрессируется и мутирует при наследственной форме рака поджелудочной железы . ^{[ 12 ]} Мутация палладина, выявленная при семейном раке поджелудочной железы, может быть уникальной для одной североамериканской семьи, поскольку эта же мутация не была обнаружена ни в одной другой европейской или североамериканской популяции, соответственно, в двух других генетических исследованиях. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Кроме того, Салария и др. показали, что палладин сверхэкспрессируется в неопухолевой строме рака поджелудочной железы, но лишь изредка в раковых клетках как таковых. ^{[ 15 ]} предполагая, что роль палладина в этом заболевании может включать изменения в микроокружении опухоли. Очевидно, что необходимы дополнительные исследования, прежде чем можно будет полностью понять этот белок и его роль в неоплазии.

Мутации, вызывающие заболевания, также были выявлены у двух других членов этого семейства генов. Мутации миотилина вызывают форму конечностно-поясной мышечной дистрофии, а мутации миопалладина вызывают наследственную форму заболеваний сердца ( дилатационная кардиомиопатия ).

Взаимодействия

Было показано, что PALLD взаимодействует с EZR . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000129116 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058056 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июль 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . ДНК Рез . 6 (1): 63–70. дои : 10.1093/dnares/6.1.63 . ПМИД 10231032 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Параст М.М., Отей, Калифорния (сентябрь 2000 г.). «Характеристика палладина, нового белка, локализованного в стрессовых волокнах и клеточных адгезиях» . J Клеточная Биол . 150 (3): 643–56. дои : 10.1083/jcb.150.3.643 . ПМК 2175193 . ПМИД 10931874 .
^ Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б, Кляйн М, Пустка А (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: PALLD палладин, белок, ассоциированный с цитоскелетом» . nih.gov.
^ Перейти обратно: ^а ^б Микканен О.М., Грёнхольм М., Ронти М., Лаловски М., Салмикангас П., Суила Х., Карпен О. (2001). «Характеристика человеческого палладина, белка, связанного с микрофиламентами» . Мол. Биол. Клетка . 12 (10): 3060–73. дои : 10.1091/mbc.12.10.3060 . ПМК 60155 . ПМИД 11598191 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Оти К.А., Рахлин А., Моза М., Арнеман Д., Карпен О. (2005). Семейство актин-ассоциированных каркасов палладин/миотилин/миопалладин . Международный обзор цитологии. Том. 246. стр. 31–58. дои : 10.1016/S0074-7696(05)46002-7 . ISBN 9780123646507 . ПМИД 16164966 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )
^ Рахлин А.С., Оти Калифорния (2006). «Идентификация изоформ палладина и характеристика специфического взаимодействия между Lasp-1 и палладином» . Дж. Клеточная наука . 119 (Часть 6): 995–1004. дои : 10.1242/jcs.02825 . ПМИД 16492705 .
^ Пог-Гейл К.Л., Чен Р., Броннер М.П., Црногорак-Юрцевич Т., Мойес К.В., Дауэн С., Оти К.А., Криспин Д.А., Джордж Р.Д., Уиткомб, округ Колумбия, Брентналл Т.А. (2006). «Мутация Палладина вызывает семейный рак поджелудочной железы и предполагает новый механизм рака» . ПЛОС Мед . 3 (12): е516. doi : 10.1371/journal.pmed.0030516 . ПМЦ 1751121 . ПМИД 17194196 .
^ Слейтер Э., Амриллаева В., Фендрих В., Барч Д., Эрл Дж., Витон Л.Дж., Неоптолемос Дж.П., Гринхалф В. (2007). «Мутация Палладина вызывает семейный рак поджелудочной железы: отсутствие в европейских семьях» . ПЛОС Мед . 4 (4): е164. doi : 10.1371/journal.pmed.0040164 . ПМЦ 1855695 . ПМИД 17455999 .
^ Зогопулос Г., Ротенмунд Х., Эппель А., Эш С., Акбари М.Р., Хедли Д., Народ С.А., Галлингер С. (2007). «Вариант палладина P239S не является причиной значительной доли наследственного или раннего рака поджелудочной железы». Хм. Жене . 121 (5): 635–7. дои : 10.1007/s00439-007-0361-z . ПМИД 17415588 . S2CID 2445261 .
^ Салария С.Н., Иллей П., Шарма Р., Уолтер К.М., Кляйн А.П., Эшлеман Дж.Р., Майтра А., Шулик Р., Винтер Дж., Уэллетт М.М., Гоггинс М., Хрубан Р. (2007). «Палладин сверхэкспрессируется в неопухолевой строме инфильтрирующих протоковых аденокарцином поджелудочной железы, но лишь изредка сверхэкспрессируется в неопластических клетках» . Рак Биол. Там . 6 (3): 324–8. дои : 10.4161/cbt.6.3.3904 . ПМК 3144721 . ПМИД 17404500 .

Дальнейшее чтение

Кинг CM, Олив CW, Кардона РА (1975). «Активация канцерогенных арилгидроксамовых кислот тканями человека». Дж. Натл. Онкологический институт . 55 (2): 285–7. дои : 10.1093/jnci/55.2.285 . ПМИД 1159819 .
Лай Ч., Чжоу С.И., Чан Л.И. и др. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики» . Геном Рез . 10 (5): 703–13. дои : 10.1101/гр.10.5.703 . ПМК 310876 . ПМИД 10810093 .
Банг М.Л., Мудри Р.Э., МакЭлхинни А.С. и др. (2001). «Миопалладин, новый саркомерный белок массой 145 килодальтон, играющий множество ролей в белковых сборках Z-диска и I-диапазона» . Дж. Клеточная Биол . 153 (2): 413–27. дои : 10.1083/jcb.153.2.413 . ПМК 2169455 . ПМИД 11309420 .
Микканен О.М., Грёнхольм М., Ренти М. и др. (2002). «Характеристика человеческого палладина, белка, связанного с микрофиламентами» . Мол. Биол. Клетка . 12 (10): 3060–73. дои : 10.1091/mbc.12.10.3060 . ПМК 60155 . ПМИД 11598191 .
Эберле М.А., Пфютцер Р., Пог-Гайле К.Л. и др. (2002). «Новый локус восприимчивости к аутосомно-доминантному раку поджелудочной железы соответствует хромосоме 4q32-34» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 70 (4): 1044–8. дои : 10.1086/339692 . ПМК 379100 . ПМИД 11870593 .
Морияма К., Бонифачино Дж.С. (2003). «Паллидин является компонентом мультибелкового комплекса, участвующего в биогенезе лизосомальных органелл» . Трафик . 3 (9): 666–77. дои : 10.1034/j.1600-0854.2002.30908.x . ПМИД 12191018 . S2CID 29888859 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ли С.Ю., Обата Ю., Ёсида М. и др. (2003). «Иммуномный анализ саркомы человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (5): 2651–6. Бибкод : 2003PNAS..100.2651L . дои : 10.1073/pnas.0437972100 . ПМК 151395 . ПМИД 12601173 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Ренти М., Тайвайнен А., Моза М. и др. (2004). «Молекулярный анализ взаимодействия палладина и альфа-актинина». ФЭБС Летт . 566 (1–3): 30–4. дои : 10.1016/j.febslet.2004.04.006 . ПМИД 15147863 . S2CID 86151740 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Хиллер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Генерация и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Бибкод : 2005Natur.434..724H . дои : 10.1038/nature03466 . ПМИД 15815621 .
Ренти М., Тайвайнен А., Моза М. и др. (2005). «Участие палладина и альфа-актинина в нацеливании киназного адаптера Abl/Arg ArgBP2 на актиновый цитоскелет». Эксп. Сотовый Res . 310 (1): 88–98. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.06.026 . ПМИД 16125169 .
Шиффман Д., Эллис С.Г., Роуленд К.М. и др. (2005). «Идентификация четырех вариантов генов, связанных с инфарктом миокарда» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 77 (4): 596–605. дои : 10.1086/491674 . ПМК 1275608 . ПМИД 16175505 .
Бухелифа М., Моза М., Йоханссон Т. и др. (2006). «Богатый пролином белок палладин является партнером по связыванию профилина» . ФЕБС Дж . 273 (1): 26–33. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.05036.x . ПМИД 16367745 . S2CID 21207885 .
Ренти М.Ю., Лейвонен С.К., Хинц Б. и др. (2007). «Изоформ-специфическая регуляция актинорганизующего белка палладина во время дифференцировки миофибробластов, индуцированной TGF-бета1» . Дж. Инвест. Дерматол . 126 (11): 2387–96. дои : 10.1038/sj.jid.5700427 . ПМИД 16794588 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

палладин + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000129116 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058056 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10231032-5] Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июль 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . ДНК Рез . 6 (1): 63–70. дои : 10.1093/dnares/6.1.63 . ПМИД 10231032 .

[pmid10931874-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Параст М.М., Отей, Калифорния (сентябрь 2000 г.). «Характеристика палладина, нового белка, локализованного в стрессовых волокнах и клеточных адгезиях» . J Клеточная Биол . 150 (3): 643–56. дои : 10.1083/jcb.150.3.643 . ПМК 2175193 . ПМИД 10931874 .

[pmid11230166-7] Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б, Кляйн М, Пустка А (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .

[entrez-8] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: PALLD палладин, белок, ассоциированный с цитоскелетом» . nih.gov.

[pmid11598191-9] Перейти обратно: ^а ^б Микканен О.М., Грёнхольм М., Ронти М., Лаловски М., Салмикангас П., Суила Х., Карпен О. (2001). «Характеристика человеческого палладина, белка, связанного с микрофиламентами» . Мол. Биол. Клетка . 12 (10): 3060–73. дои : 10.1091/mbc.12.10.3060 . ПМК 60155 . ПМИД 11598191 .

[pmid16164966-10] Перейти обратно: ^а ^б Оти К.А., Рахлин А., Моза М., Арнеман Д., Карпен О. (2005). Семейство актин-ассоциированных каркасов палладин/миотилин/миопалладин . Международный обзор цитологии. Том. 246. стр. 31–58. дои : 10.1016/S0074-7696(05)46002-7 . ISBN 9780123646507 . ПМИД 16164966 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )

[pmid16492705-11] Рахлин А.С., Оти Калифорния (2006). «Идентификация изоформ палладина и характеристика специфического взаимодействия между Lasp-1 и палладином» . Дж. Клеточная наука . 119 (Часть 6): 995–1004. дои : 10.1242/jcs.02825 . ПМИД 16492705 .

[pmid17194196-12] Пог-Гейл К.Л., Чен Р., Броннер М.П., Црногорак-Юрцевич Т., Мойес К.В., Дауэн С., Оти К.А., Криспин Д.А., Джордж Р.Д., Уиткомб, округ Колумбия, Брентналл Т.А. (2006). «Мутация Палладина вызывает семейный рак поджелудочной железы и предполагает новый механизм рака» . ПЛОС Мед . 3 (12): е516. doi : 10.1371/journal.pmed.0030516 . ПМЦ 1751121 . ПМИД 17194196 .

[pmid17455999-13] Слейтер Э., Амриллаева В., Фендрих В., Барч Д., Эрл Дж., Витон Л.Дж., Неоптолемос Дж.П., Гринхалф В. (2007). «Мутация Палладина вызывает семейный рак поджелудочной железы: отсутствие в европейских семьях» . ПЛОС Мед . 4 (4): е164. doi : 10.1371/journal.pmed.0040164 . ПМЦ 1855695 . ПМИД 17455999 .

[pmid17415588-14] Зогопулос Г., Ротенмунд Х., Эппель А., Эш С., Акбари М.Р., Хедли Д., Народ С.А., Галлингер С. (2007). «Вариант палладина P239S не является причиной значительной доли наследственного или раннего рака поджелудочной железы». Хм. Жене . 121 (5): 635–7. дои : 10.1007/s00439-007-0361-z . ПМИД 17415588 . S2CID 2445261 .

[pmid17404500-15] Салария С.Н., Иллей П., Шарма Р., Уолтер К.М., Кляйн А.П., Эшлеман Дж.Р., Майтра А., Шулик Р., Винтер Дж., Уэллетт М.М., Гоггинс М., Хрубан Р. (2007). «Палладин сверхэкспрессируется в неопухолевой строме инфильтрирующих протоковых аденокарцином поджелудочной железы, но лишь изредка сверхэкспрессируется в неопластических клетках» . Рак Биол. Там . 6 (3): 324–8. дои : 10.4161/cbt.6.3.3904 . ПМК 3144721 . ПМИД 17404500 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]