Спектриновый повтор
Спектриновый повтор | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | Спектрин | ||
Пфам | PF00435 | ||
ИнтерПро | ИПР002017 | ||
PROSITE | PDOC50083 | ||
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1aj3 / СФЕРА / СУПФАМ | ||
CDD | cd00176 | ||
|
Спектриновые повторы [ 2 ] обнаружены в нескольких белках, участвующих в структуре цитоскелета . К ним относятся спектрин , альфа- актинин , дистрофин и, в последнее время, семейство плакинов . Спектриновый повтор образует трехспиральный пучок . Они соответствуют правилам семикратного повтора . Спектриновые повторы дают начало линейным белкам. Однако это может быть связано с предвзятостью образца, при которой линейные и жесткие структуры более поддаются кристаллизации. Однако есть намеки на то, что некоторые белки, содержащие повторы спектрина, также могут быть гибкими. Скорее всего, это связано со специфически сложившимися функциональными целями.
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]АКТН1 ; АКТН2 ; АКТН3 ; АКТН4 ; АКАП6 ; СИНЭ3 ; КАТХ-15 ; ДМД ; ДРП2 ; летнее время ; КАЛРН ; МАКФ1 ; МЦФ2Л ; ЗИП1 ; СПТАН1 ; СПТБ ; СПТБН1 ; СПТБН2 ; СПТБН4 ; СПТБН5 ; СИНЭ1 ; СИНЭ2 ; ТРИО ; УТРН ;
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Паскуаль Дж., Пфуль М., Вальтер Д., Сарасте М., Нильгес М. (октябрь 1997 г.). «Структура раствора повтора спектрина: левосторонняя антипараллельная тройная спиральная спираль». Дж. Мол. Биол . 273 (3): 740–51. дои : 10.1006/jmbi.1997.1344 . ПМИД 9356261 .
- ^ Харрисон С.К., Ян Ю., Виноград Э., Вил А., Кронин Т., Брэнтон Д. (1993). «Кристаллическая структура повторяющихся сегментов спектрина». Наука . 262 (5142): 2027–2030. дои : 10.1126/science.8266097 . ПМИД 8266097 .
- Джефферсон, Джей-Джей; Чатто, К; Шапиро, Л; Лием, РК (2007). «Структурный анализ плакинового домена буллезного пемфигоидного антигена 1 (BPAG1) предполагает, что плакины являются членами суперсемейства спектринов» . Журнал молекулярной биологии . 366 (1): 244–57. дои : 10.1016/j.jmb.2006.11.036 . ПМК 1850962 . ПМИД 17161423 .
- Грум, В.Л.; Ли, Д; Макдональд, Род-Айленд; Мондрагон, А (1999). «Структуры двух повторов спектрина предполагают модели гибкости» . Клетка . 98 (4): 523–35. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81980-7 . ПМИД 10481916 . S2CID 1710820 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Джинович-Каруго К., Гаутель М., Юленне Дж., Янг П. (февраль 2002 г.). «Повтор спектрина: структурная платформа для сборок цитоскелетных белков» . ФЭБС Летт . 513 (1): 119–23. дои : 10.1016/S0014-5793(01)03304-X . ПМИД 11911890 . S2CID 10581541 .
- Паскуаль Дж., Кастресана Дж., Сарасте М. (сентябрь 1997 г.). «Эволюция спектринового повтора». Биоэссе . 19 (9): 811–7. дои : 10.1002/bies.950190911 . ПМИД 9297972 . S2CID 42145758 .
- Аль-Джассар, К; Ноулз, Т; Дживс, М; Ками, К; Бер, Э; Биккер, Х; Овердуин, М; Чиджи, М. (2 июля 2011 г.). «Нелинейная структура домена десмоплакин-плакин и эффекты мутаций, связанных с кардиомиопатией». Журнал молекулярной биологии . 411 (5): 1049–61. дои : 10.1016/j.jmb.2011.06.047 . ПМИД 21756917 .