ППИК

ППИК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2ESL
Идентификаторы
Псевдонимы	PPIC , CYPC, пептидилпролилизомераза C
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 123842 ; МГИ : 97751 ; Гомологен : 727 ; GeneCards : PPIC ; ОМА : PPIC — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	123,036,725 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	53,551,187 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; tendon of biceps brachii; ; skin of hip; ; gums; ; gingival epithelium; ; pancreatic ductal cell; ; mucosa of sigmoid colon; ; periodontal fiber; ; palpebral conjunctiva; ; parotid gland;
	Top expressed in
	molar; ; calvaria; ; body of femur; ; dermis; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; efferent ductule; ; atrium; ; atrioventricular valve; ; left lung lobe; ; endocardial cushion;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cyclosporin A binding; protein binding; isomerase activity; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; unfolded protein binding;
Cellular component	cytoplasm; extracellular exosome;
Biological process	protein folding; protein peptidyl-prolyl isomerization; protein refolding;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5480
	19038
	ENSG00000168938
	ENSMUSG00000024538
	P45877
	P30412
	НМ_000943
	НМ_008908
	НП_000934
	НП_032934
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза C (PPIC) представляет собой фермент , который у человека кодируется PPIC геном на хромосоме 5. Являясь членом семейства пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы (PPIase), этот белок катализирует цис- транс- изомеризация имидных пептидных связей пролина , что позволяет облегчить сворачивание или репарацию белков. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Кроме того, PPIC участвует во многих биологических процессах, включая митохондриальный метаболизм , апоптоз , окислительно-восстановительный процесс и воспаление , а также в сопутствующих заболеваниях и состояниях, таких как ишемически-реперфузионное повреждение , СПИД и рак . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Структура

Как и другие циклофилины, PPIC образует структуру β-цилиндра с гидрофобным ядром. Этот β-цилиндр состоит из восьми антипараллельных β-нитей и увенчан двумя α-спиралями сверху и снизу. Кроме того, гибкости ствола способствуют β-витки и петли в прядях. ^{[ 10 ]} PPIC, в частности, состоит из 212 остатков и содержит гидрофобную последовательность, нацеленную на ER, на N-конце. Домен PPIase гомологичен PPIA и может связываться и ингибироваться CsA. ^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы ( PPIase ). PPIазы катализируют цис-транс-изомеризацию имидных пептидных связей пролина в олигопептидах и ускоряют сворачивание белков. ^{[ 7 ]} Как правило, PPIазы обнаруживаются у всех эубактерий и эукариот, а также у некоторых архебактерий и, таким образом, являются высококонсервативными. ^{[ 8 ]}^{[ 12 ]} Семейство PPIase далее делится на три структурно различных подсемейства: циклофилин (CyP), FK506-связывающий белок ( FKBP ) и парвулин (Pvn). ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]} Как циклофилин, ИПП связывает циклоспорин А (CsA) и может находиться внутри клетки или секретироваться клеткой. ^{[ 9 ]} У эукариот циклофилины локализуются повсеместно во многих типах клеток и тканей, хотя PPIC особенно высоко экспрессируется в почках. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 13 ]} Помимо активности PPIазы и белков-шаперонов, циклофилины участвуют в митохондриальном метаболизме, апоптозе, иммунологическом ответе, воспалении, а также росте и пролиферации клеток. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Наряду с PPIB, PPIC локализуется в эндоплазматическом ретикулуме (ER), где поддерживает окислительно-восстановительный гомеостаз. Истощение этих двух циклофилинов приводит к гиперокислению ЭР. ^{[ 11 ]} В головном мозге PPIC образует комплексы с циклофилин C-ассоциированным белком (CyCAP), активируя функцию микроглии и макрофагов через путь кальциневрин/NFAT. ^{[ 13 ]}

Клиническое значение

Как циклофилин, PPIC связывает иммунодепрессант CsA с образованием комплекса CsA-циклофилин, который затем нацеливается на кальциневрин, чтобы ингибировать сигнальный путь активации Т-клеток. ^{[ 9 ]}

Было обнаружено, что в миогенных клетках сердца циклофилины активируются при тепловом шоке и гипоксии-реоксигенации, а также образуют комплекс с белками теплового шока. Таким образом, циклофилины могут выполнять кардиозащитную функцию при ишемически-реперфузионном повреждении. ^{[ 9 ]} Аналогичным образом, PPIC может обеспечивать нейропротекцию, образуя комплекс с CyCAP для активации механизмов выживания и смягчения ишемического повреждения головного мозга. ^{[ 13 ]}

В настоящее время экспрессия циклофилина тесно коррелирует с патогенезом рака, но конкретные механизмы еще предстоит выяснить. ^{[ 9 ]} Например, исследования идентифицируют PPIC как надежный индикатор циркулирующих опухолевых клеток при эпителиальном раке яичников (ЭРЯ) и, таким образом, могут служить биомаркером для выявления и лечения рака. ^{[ 14 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PPIC взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000168938 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024538 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сугано С., Ким Д.В., Ю.С., Мидзушима-Сугано Дж., Ёситомо К., Ватанабэ С., Сузуки Ф., Ямагути Н. (октябрь 1992 г.). «Использование библиотеки кДНК, меченной эпитопом, для выделения кДНК, кодирующих белки с потенциалом ядерной локализации». Джин . 120 (2): 227–33. дои : 10.1016/0378-1119(92)90097-9 . ПМИД 1383094 .
^ Jump up to: ^а ^б Шнайдер Х., Чарара Н., Шмитц Р., Верли С., Микол В., Зурини М.Г., Кеньо В.Ф., Мовва Н.Р. (июль 1994 г.). «Человеческий циклофилин C: первичная структура, распределение в тканях и определение специфичности связывания циклоспоринов». Биохимия . 33 (27): 8218–24. дои : 10.1021/bi00193a007 . ПМИД 8031755 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: пептидилпролилизомераза C PPIC (циклофилин C)» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Кадзуи Т., Иноуэ Н., Ямада О., Комацу С. (январь 1992 г.). «Селективная перфузия головного мозга во время операции по поводу аневризмы дуги аорты: переоценка» . Анналы торакальной хирургии . 53 (1): 109–14. дои : 10.1016/0003-4975(92)90767-x . ПМИД 1530810 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Яо Q, Ли М, Ян Х, Чай Х, Фишер В, Чен С (март 2005 г.). «Роль циклофилинов при раке и других системах органов». Всемирный журнал хирургии . 29 (3): 276–80. дои : 10.1007/s00268-004-7812-7 . ПМИД 15706440 . S2CID 11678319 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Ван Т, Юн Ч., Гу С.Ю., Чанг В.Р., Лян, округ Колумбия (август 2005 г.). «1.88 Кристаллическая структура домена C hCyP33: новый домен пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 333 (3): 845–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.06.006 . ПМИД 15963461 .
^ Jump up to: ^а ^б Стоки П., Чепмен, округ Колумбия, Бич, Лос-Анджелес, Уильямс Д.Б. (август 2014 г.). «Истощение циклофилинов B и C приводит к нарушению регуляции окислительно-восстановительного гомеостаза эндоплазматического ретикулума» . Журнал биологической химии . 289 (33): 23086–96. дои : 10.1074/jbc.M114.570911 . ПМК 4132807 . ПМИД 24990953 .
^ Хоффманн Х., Шине-Фишер К. (июль 2014 г.). «Функциональные аспекты внеклеточных циклофилинов». Биологическая химия . 395 (7–8): 721–35. дои : 10.1515/hsz-2014-0125 . ПМИД 24713575 . S2CID 32395688 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Ямагути Р., Хосака М., Тории С., Хоу Н., Сайто Н., Ёшимото Ю., Имаи Х., Такеучи Т. (июнь 2011 г.). «Регуляция фагоцитарных функций, ассоциированная с циклофилином С, посредством активации NFAT в макрофагах». Исследования мозга . 1397 : 55–65. дои : 10.1016/j.brainres.2011.03.036 . ПМИД 21435337 . S2CID 28737748 .
^ Обермайр Э., Кастильо-Тонг Д.К., Пилс Д., Спейзер П., Браику И., Ван Горп Т., Манер С., Сехули Дж., Верготе И., Цайлингер Р. (январь 2013 г.). «Молекулярная характеристика циркулирующих опухолевых клеток у больных раком яичников повышает их прогностическую значимость — исследование консорциума OVCAD». Гинекологическая онкология . 128 (1): 15–21. дои : 10.1016/j.ygyno.2012.09.021 . ПМИД 23017820 .
^ Jump up to: ^а ^б Трэйи М., Вайсман И.Л. (март 1999 г.). «Белок, ассоциированный с циклофилином С: нормальный секретируемый гликопротеин, который снижает уровень эндотоксина и провоспалительные реакции in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 3006–11. Бибкод : 1999PNAS...96.3006T . дои : 10.1073/pnas.96.6.3006 . ПМК 15885 . ПМИД 10077627 .

Дальнейшее чтение

Фридман Дж., Вайсман I (август 1991 г.). «По сродству к новому циклофилину выявляются два цитоплазматических кандидата на действие иммунофилина: один в присутствии и один в отсутствие CsA» . Клетка . 66 (4): 799–806. дои : 10.1016/0092-8674(91)90123-G . ПМИД 1652374 . S2CID 205020327 .
Прайс Э.Р., Джин М., Лим Д., Пати С., Уолш Коннектикут, МакКеон Ф.Д. (апрель 1994 г.). «Перенос циклофилина B по секреторному пути изменяется за счет связывания циклоспорина A» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (9): 3931–5. Бибкод : 1994PNAS...91.3931P . дои : 10.1073/pnas.91.9.3931 . ПМК 43696 . ПМИД 7909608 .
Фридман Дж., Трэйи М., Вайсман I (июль 1993 г.). «Клонирование и характеристика белка, связанного с циклофилином C: кандидатный природный клеточный лиганд циклофилина C» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (14): 6815–9. Бибкод : 1993PNAS...90.6815F . дои : 10.1073/pnas.90.14.6815 . ПМК 47023 . ПМИД 8341703 .
Монтегю Дж.В., Хьюз FM, Цидловски Дж.А. (март 1997 г.). «Нативные рекомбинантные циклофилины A, B и C разрушают ДНК независимо от активности пептидилпролил-цис-транс-изомеразы. Потенциальная роль циклофилинов в апоптозе» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6677–84. дои : 10.1074/jbc.272.10.6677 . ПМИД 9045699 .
Трэйи М., Вайсман И.Л. (март 1999 г.). «Белок, ассоциированный с циклофилином С: нормальный секретируемый гликопротеин, который снижает уровень эндотоксина и провоспалительные реакции in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 3006–11. Бибкод : 1999PNAS...96.3006T . дои : 10.1073/pnas.96.6.3006 . ПМК 15885 . ПМИД 10077627 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Дэвис Т.Л., Уокер Дж.Р., Кампанья-Слейтер В. и др. (2010). «Структурная и биохимическая характеристика семейства циклофилинов человека пептидил-пролилизомераз» . ПЛОС Биол . 8 (7): e1000439. дои : 10.1371/journal.pbio.1000439 . ПМЦ 2911226 . ПМИД 20676357 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000168938 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024538 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1383094-5] Сугано С., Ким Д.В., Ю.С., Мидзушима-Сугано Дж., Ёситомо К., Ватанабэ С., Сузуки Ф., Ямагути Н. (октябрь 1992 г.). «Использование библиотеки кДНК, меченной эпитопом, для выделения кДНК, кодирующих белки с потенциалом ядерной локализации». Джин . 120 (2): 227–33. дои : 10.1016/0378-1119(92)90097-9 . ПМИД 1383094 .

[pmid8031755-6] Jump up to: ^а ^б Шнайдер Х., Чарара Н., Шмитц Р., Верли С., Микол В., Зурини М.Г., Кеньо В.Ф., Мовва Н.Р. (июль 1994 г.). «Человеческий циклофилин C: первичная структура, распределение в тканях и определение специфичности связывания циклоспоринов». Биохимия . 33 (27): 8218–24. дои : 10.1021/bi00193a007 . ПМИД 8031755 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: пептидилпролилизомераза C PPIC (циклофилин C)» .

[pmid1530810-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Кадзуи Т., Иноуэ Н., Ямада О., Комацу С. (январь 1992 г.). «Селективная перфузия головного мозга во время операции по поводу аневризмы дуги аорты: переоценка» . Анналы торакальной хирургии . 53 (1): 109–14. дои : 10.1016/0003-4975(92)90767-x . ПМИД 1530810 .

[pmid15706440-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Яо Q, Ли М, Ян Х, Чай Х, Фишер В, Чен С (март 2005 г.). «Роль циклофилинов при раке и других системах органов». Всемирный журнал хирургии . 29 (3): 276–80. дои : 10.1007/s00268-004-7812-7 . ПМИД 15706440 . S2CID 11678319 .

[pmid15963461-10] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Ван Т, Юн Ч., Гу С.Ю., Чанг В.Р., Лян, округ Колумбия (август 2005 г.). «1.88 Кристаллическая структура домена C hCyP33: новый домен пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 333 (3): 845–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.06.006 . ПМИД 15963461 .

[pmid24990953-11] Jump up to: ^а ^б Стоки П., Чепмен, округ Колумбия, Бич, Лос-Анджелес, Уильямс Д.Б. (август 2014 г.). «Истощение циклофилинов B и C приводит к нарушению регуляции окислительно-восстановительного гомеостаза эндоплазматического ретикулума» . Журнал биологической химии . 289 (33): 23086–96. дои : 10.1074/jbc.M114.570911 . ПМК 4132807 . ПМИД 24990953 .

[pmid24713575-12] Хоффманн Х., Шине-Фишер К. (июль 2014 г.). «Функциональные аспекты внеклеточных циклофилинов». Биологическая химия . 395 (7–8): 721–35. дои : 10.1515/hsz-2014-0125 . ПМИД 24713575 . S2CID 32395688 .

[pmid21435337-13] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Ямагути Р., Хосака М., Тории С., Хоу Н., Сайто Н., Ёшимото Ю., Имаи Х., Такеучи Т. (июнь 2011 г.). «Регуляция фагоцитарных функций, ассоциированная с циклофилином С, посредством активации NFAT в макрофагах». Исследования мозга . 1397 : 55–65. дои : 10.1016/j.brainres.2011.03.036 . ПМИД 21435337 . S2CID 28737748 .

[pmid23017820-14] Обермайр Э., Кастильо-Тонг Д.К., Пилс Д., Спейзер П., Браику И., Ван Горп Т., Манер С., Сехули Дж., Верготе И., Цайлингер Р. (январь 2013 г.). «Молекулярная характеристика циркулирующих опухолевых клеток у больных раком яичников повышает их прогностическую значимость — исследование консорциума OVCAD». Гинекологическая онкология . 128 (1): 15–21. дои : 10.1016/j.ygyno.2012.09.021 . ПМИД 23017820 .

[pmid10077627-15] Jump up to: ^а ^б Трэйи М., Вайсман И.Л. (март 1999 г.). «Белок, ассоциированный с циклофилином С: нормальный секретируемый гликопротеин, который снижает уровень эндотоксина и провоспалительные реакции in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 3006–11. Бибкод : 1999PNAS...96.3006T . дои : 10.1073/pnas.96.6.3006 . ПМК 15885 . ПМИД 10077627 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]