РАД54Б

РАД54Б
Идентификаторы
Псевдонимы	RAD54B , RDH54, гомолог B RAD54 (S. cerevisiae), гомолог B RAD54
Внешние идентификаторы	Опустить : 604289 ; МГИ : 3605986 ; Гомологен : 8240 ; Генные карты : RAD54B ; ОМА : RAD54B – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	94,475,115 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	11,615,805 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; gonad; ; testicle; ; ventricular zone; ; oocyte; ; secondary oocyte; ; ganglionic eminence; ; endometrium; ; retinal pigment epithelium; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	otic vesicle; ; yolk sac; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; primary oocyte; ; zygote; ; morula; ; blastocyst; ; blastocyst; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA helicase activity; DNA translocase activity; DNA binding; DNA helicase activity; nucleotide binding; hydrolase activity; ATP binding; helicase activity; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	nucleus;
Biological process	reciprocal meiotic recombination; mitotic recombination; DNA repair; cellular response to DNA damage stimulus; DNA duplex unwinding; double-strand break repair via homologous recombination; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25788
	623474
	ENSG00000197275
	ENSMUSG00000078773
	Q9Y620 ; О95073
	Q8BKE5 ; Q6PFE3
	НМ_001205262 ; НМ_001205263 ; НМ_006550 ; НМ_012415 ; НМ_134434
	НМ_001039556 ; НМ_001256145 ; НМ_177285
showНП_001192191 ; НП_001192192 ; НП_036547 ; НП_001192191 ; НП_001192192 ;
	NP_036547
	НП_001243071 ; НП_001034645 ; НП_001243074
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок репарации и рекомбинации ДНК RAD54B — это белок , который у человека кодируется RAD54B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к суперсемейству DEAD-подобных геликаз. Он имеет сходство с Saccharomyces cerevisiae RAD54 и RDH54, оба из которых участвуют в гомологичной рекомбинации и репарации ДНК. Этот белок связывается с двухцепочечной ДНК и проявляет АТФазную активность в присутствии ДНК. Этот ген высоко экспрессируется в семенниках и селезенке, что предполагает активную роль в мейотической и митотической рекомбинации. Гомозиготные мутации этого гена наблюдались при первичных лимфомах и раке толстой кишки. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RAD54B взаимодействует с RAD51 . ^{[ 6 ]}

Рак

Ген RAD54B (~3,4 % соматически мутирует или удаляется при многих типах рака, включая колоректальный рак (~3,3%), рак молочной железы ) и рак легких (~2,6%). ^{[ 8 ]} В Северной Америке только эти три вида рака составляют около 20 500 человек, у которых ежегодно диагностируется дефектный рак RAD54B . В доклиническом исследовании было установлено, что клетки рака толстой кишки, дефектные по RAD54B , избирательно уничтожаются ингибиторами репарации ДНК белка PARP1 . ^{[ 8 ]} Ингибиторы PARP1, вероятно, препятствуют альтернативным реакциям репарации ДНК, которые в противном случае могли бы компенсировать потерю пути RAD54B в раковых клетках. Таким образом, раковые клетки с дефицитом RAD54B , обработанные ингибитором PARP1, по-видимому, более уязвимы к уничтожению естественными повреждениями ДНК, чем нераковые клетки без дефекта RAD54 (см. статью «Синтетическая летальность »).

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197275 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078773 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хирамото Т., Наканиси Т., Сумиёси Т., Фукуда Т., Мацуура С., Таучи Х., Комацу К., Сибасаки Ю., Инуи Х., Вататани М., Ясутоми М., Сумии К., Кадзияма Г., Камада Н., Миягава К., Камия К. (июнь 1999 г.) ). «Мутации нового гомолога RAD54 человека, RAD54B, при первичном раке». Онкоген . 18 (22): 3422–6. : 10.1038 /sj.onc.1202691 . PMID 10362364. S2CID doi 24095399 .
^ Jump up to: ^а ^б Танака К., Хирамото Т., Фукуда Т., Миягава К. (сентябрь 2000 г.). «Новый человеческий гомолог rad54, Rad54B, ассоциируется с Rad51» . J Биол Хим . 275 (34): 26316–21. дои : 10.1074/jbc.M910306199 . ПМИД 10851248 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: RAD54B, гомолог B RAD54 (S. cerevisiae)» .
^ Jump up to: ^а ^б МакЭндрю Э.Н., Лепаж CC, Макманус К.Дж. (декабрь 2016 г.). «Синтетическое летальное уничтожение клеток колоректального рака с дефицитом RAD54B за счет ингибирования PARP1 усиливается за счет ингибирования SOD1» . Онкотаргет . 7 (52): 87417–87430. дои : 10.18632/oncotarget.13654 . ПМК 5349998 . ПМИД 27902462 .

Дальнейшее чтение

Миягава К., Цуруга Т., Киномура А. и др. (2002). «Роль RAD54B в гомологичной рекомбинации в клетках человека» . ЭМБО Дж . 21 (1–2): 175–80. дои : 10.1093/emboj/21.1.175 . ПМЦ 125815 . ПМИД 11782437 .
Танака К., Кагава В., Кинебути Т. и др. (2002). «Человеческий Rad54B представляет собой двухцепочечную ДНК-зависимую АТФазу и имеет биохимические свойства, отличные от ее структурного гомолога в дрожжах, Tid1/Rdh54» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (6): 1346–53. дои : 10.1093/нар/30.6.1346 . ПМК 101365 . ПМИД 11884632 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Сехорн М.Г., Сигурдссон С., Буссен В. и др. (2004). «Человеческая мейотическая рекомбиназа Dmc1 способствует АТФ-зависимому обмену гомологичных цепей ДНК». Природа . 429 (6990): 433–7. Бибкод : 2004Natur.429..433S . дои : 10.1038/nature02563 . ПМИД 15164066 . S2CID 4316803 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Весоли Дж., Агарвал С., Сигурдссон С. и др. (2006). «Дифференциальный вклад паралогов Rad54 млекопитающих в рекомбинацию, восстановление повреждений ДНК и мейоз» . Мол. Клетка. Биол . 26 (3): 976–89. дои : 10.1128/MCB.26.3.976-989.2006 . ПМК 1347043 . ПМИД 16428451 .
Сараи Н., Кагава В., Кинебути Т. и др. (2006). «Стимуляция Dmc1-опосредованного обмена цепей ДНК человеческим белком Rad54B» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (16): 4429–37. дои : 10.1093/нар/gkl562 . ПМЦ 1636354 . ПМИД 16945962 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Брысь М., Новацка-Завиша М., Романович-Маковска Х. и др. (2007). «Потеря гетерозиготности в регионе RAD54B не является прогностическим фактором рака молочной железы». Пол Дж. Патол . 58 (1): 3–6. ПМИД 17585536 .

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197275 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078773 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10362364-5] Хирамото Т., Наканиси Т., Сумиёси Т., Фукуда Т., Мацуура С., Таучи Х., Комацу К., Сибасаки Ю., Инуи Х., Вататани М., Ясутоми М., Сумии К., Кадзияма Г., Камада Н., Миягава К., Камия К. (июнь 1999 г.) ). «Мутации нового гомолога RAD54 человека, RAD54B, при первичном раке». Онкоген . 18 (22): 3422–6. : 10.1038 /sj.onc.1202691 . PMID 10362364. S2CID doi 24095399 .

[pmid10851248-6] Jump up to: ^а ^б Танака К., Хирамото Т., Фукуда Т., Миягава К. (сентябрь 2000 г.). «Новый человеческий гомолог rad54, Rad54B, ассоциируется с Rad51» . J Биол Хим . 275 (34): 26316–21. дои : 10.1074/jbc.M910306199 . ПМИД 10851248 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: RAD54B, гомолог B RAD54 (S. cerevisiae)» .

[pmid27902462-8] Jump up to: ^а ^б МакЭндрю Э.Н., Лепаж CC, Макманус К.Дж. (декабрь 2016 г.). «Синтетическое летальное уничтожение клеток колоректального рака с дефицитом RAD54B за счет ингибирования PARP1 усиливается за счет ингибирования SOD1» . Онкотаргет . 7 (52): 87417–87430. дои : 10.18632/oncotarget.13654 . ПМК 5349998 . ПМИД 27902462 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]