Оптическое секционирование
Оптическое сечение — это процесс, с помощью которого микроскоп соответствующей конструкции может создавать четкие изображения фокальных плоскостей глубоко внутри толстого образца. Это используется для уменьшения необходимости получения тонких срезов с использованием таких инструментов, как микротом . Используется множество различных методов получения оптических срезов, а несколько методов микроскопии специально разработаны для улучшения качества оптических срезов.
Хорошее оптическое разделение, часто называемое хорошей глубиной или разрешением по z, популярно в современной микроскопии, поскольку оно позволяет трехмерную реконструкцию образца по изображениям, снятым в разных фокальных плоскостях.
Оптические срезы в традиционных световых микроскопах
[ редактировать ]В идеальном микроскопе только свет из фокальной плоскости может достигать детектора (обычно наблюдателя или ПЗС-матрицы ), создавая четкое изображение плоскости образца, на котором фокусируется микроскоп. К сожалению, микроскоп не обладает такой специфичностью, и свет от источников за пределами фокальной плоскости также достигает детектора; может находиться значительное количество материала и, следовательно, паразитный сигнал в толстом образце между фокальной плоскостью и линзой объектива .
Без каких-либо модификаций микроскопа, то есть с помощью простого широкопольного светового микроскопа , качество оптических срезов определяется той же физикой, что и эффект глубины резкости в фотографии . Для объектива с высокой числовой апертурой , эквивалентной широкой диафрагме , глубина резкости мала ( неглубокий фокус ) и обеспечивает хорошее оптическое разрезание. с большим увеличением Объективы обычно имеют более высокую числовую апертуру (и, следовательно, лучшее оптическое сечение), чем объективы с низким увеличением. Объективы с масляной иммерсией обычно имеют еще большую числовую апертуру, что обеспечивает улучшение оптического сечения.
Разрешение в направлении глубины (« разрешение z») стандартного широкопольного микроскопа зависит от числовой апертуры и длины волны света и может быть аппроксимировано как:
где λ — длина волны, n — показатель преломления иммерсионной среды объектива, а NA — числовая апертура. [ 2 ]
Для сравнения, поперечное разрешение можно аппроксимировать как: [ 3 ]
Методы улучшения оптических срезов
[ редактировать ]Световая микроскопия светлого поля
[ редактировать ]Помимо увеличения числовой апертуры, существует несколько методов улучшения оптических срезов в световой микроскопии светлого поля. Большинство микроскопов с масляно-иммерсионными объективами достигают пределов числовой апертуры, возможных из-за ограничений рефракции .
Дифференциальный интерференционный контраст (ДИК) обеспечивает небольшое улучшение оптических срезов. В DIC образец эффективно освещается двумя слегка смещенными источниками света, которые затем интерферируют, создавая изображение, возникающее в результате разности фаз двух источников. Поскольку смещение источников света невелико, единственная разница в фазе возникает из-за материала, расположенного близко к фокальной плоскости.
Флуоресцентная микроскопия
[ редактировать ]В флуоресцентной микроскопии объекты, находящиеся вне фокальной плоскости, мешают изображению только в том случае, если они освещены и флуоресцируют. Это добавляет дополнительный способ улучшения оптического сечения, делая освещение специфичным только для фокальной плоскости.
Конфокальная микроскопия использует точку сканирования или точки света для освещения образца. В сочетании с точечным отверстием в сопряженной фокальной плоскости это позволяет фильтровать свет от источников за пределами фокальной плоскости и улучшать оптическое разделение. [ 4 ]
Флуоресцентная микроскопия на основе светового листа освещает образец возбуждающим светом под углом 90° к направлению наблюдения, т.е. освещается только фокальная плоскость с использованием лазера, который фокусируется только в одном направлении (световой лист). [ 5 ] Этот метод эффективно уменьшает расфокусированный свет и может, кроме того, привести к небольшому улучшению продольного разрешения по сравнению с эпифлуоресцентной микроскопией.
Методы двух- и многофотонного возбуждения используют тот факт, что флуорофоры могут возбуждаться не только одним фотоном правильной энергии , но также несколькими фотонами, которые вместе обеспечивают правильную энергию. Дополнительный « концентрационный » эффект, требующий одновременного взаимодействия нескольких фотонов с флуорофором, дает стимуляцию только очень близко к фокальной плоскости. Эти методы обычно используются в сочетании с конфокальной микроскопией. [ 6 ]
Дальнейшие усовершенствования в области оптического секционирования находятся в стадии активной разработки, в основном они основаны на методах обхода дифракционного предела света. Примеры включают однофотонную интерферометрию через две линзы объектива, позволяющую получить чрезвычайно точную информацию о глубине одного флуорофора. [ 7 ] и трехмерная микроскопия со структурированным освещением . [ 8 ]
Оптические срезы обычных широкопольных микроскопов можно значительно улучшить с помощью деконволюции - метода обработки изображений, позволяющего удалить размытие изображения в соответствии с измеренной или рассчитанной функцией рассеяния точки . [ 9 ]
Клиринговые агенты
[ редактировать ]Оптическое разделение можно улучшить за счет использования просветляющих агентов с высоким показателем преломления (>1,4), таких как бензиловый спирт/бензилбензоат (BABB) или бензиловый эфир. [ 10 ] которые делают образцы прозрачными и, следовательно, позволяют наблюдать внутренние структуры.
Другой
[ редактировать ]В несветовых микроскопах оптические срезы развиты слабо. [ нужна ссылка ]
Рентгеновские и электронные микроскопы обычно имеют большую глубину резкости (плохое оптическое получение срезов), поэтому получение тонких срезов образцов все еще широко используется.
Хотя схожая физика управляет процессом фокусировки, [ 11 ] Сканирующие зондовые микроскопы и сканирующие электронные микроскопы обычно не обсуждаются в контексте получения оптических срезов, поскольку эти микроскопы взаимодействуют только с поверхностью образца.
Микроскопия полного внутреннего отражения — это метод флуоресцентной микроскопии, который намеренно ограничивает наблюдение верхней или нижней поверхностями образца, но с чрезвычайно высоким разрешением по глубине.
Теоретически и экспериментально было продемонстрировано, что 3D-изображение с использованием комбинации фокального сечения и наклона обеспечивает исключительное 3D-разрешение в больших полях зрения. [ 12 ]
Альтернативы
[ редактировать ]Основными альтернативами оптическому сечению являются:
- Изготовление тонких срезов образца, например, используемых в гистологии .
- Томография , которая особенно хорошо развита для просвечивающей электронной микроскопии .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Цянь, Цзя, Мин; Дэн, Яо, Баоли; Ян, Ян, Шаохуэй; Ю, Сянхуа (2015 ) . Научные отчеты . 5 : 14513. Бибкод : 2015NatSR...514513Q doi : 10.1038 /srep14513 . PMC 4586488. . PMID 26415516 .
- ^ Nikon MicroscopeU - Глубина резкости и глубина резкости
- ^ Nikon микроскопияU - Разрешение
- ^ Кончелло Дж. А., Лихтман Дж. В. (декабрь 2005 г.). «Оптическая микроскопия срезов». Нат. Методы . 2 (12): 920–31. дои : 10.1038/nmeth815 . ПМИД 16299477 . S2CID 17722926 .
- ^ Хьюскен, Дж.; Свогер, Дж.; Бене, Ф. Дель; Витбродт, Дж.; Стельцер, Э.Х. (2004). «Оптическое срезы глубоко внутри живых эмбрионов с помощью микроскопии с селективным плоским освещением». Наука . 305 (5686): 1007–1009. Бибкод : 2004Sci...305.1007H . CiteSeerX 10.1.1.456.2250 . дои : 10.1126/science.1100035 . ПМИД 15310904 . S2CID 3213175 .
- ^ Граттон Э., Барри Н.П., Беретта С., Челли А. (сентябрь 2001 г.). «Многофотонная флуоресцентная микроскопия» . Методы . 25 (1): 103–10. дои : 10.1006/meth.2001.1219 . ПМИД 11559001 . S2CID 822155 .
- ^ Штенгель Г., Гэлбрейт Дж.А., Гэлбрейт К.Г. и др. (март 2009 г.). «Интерферометрическая флуоресцентная микроскопия сверхвысокого разрешения позволяет определить трехмерную клеточную ультраструктуру» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (9): 3125–30. Бибкод : 2009PNAS..106.3125S . дои : 10.1073/pnas.0813131106 . ПМЦ 2637278 . ПМИД 19202073 .
- ^ Карлтон ПМ (2008). «Трехмерная структурированная световая микроскопия и ее применение к структуре хромосом» . Хромосома Рез . 16 (3): 351–65. дои : 10.1007/s10577-008-1231-9 . ПМИД 18461477 .
- ^ Сибарита Ж.Б. (2005). «Деконволюционная микроскопия». Адв. Биохим. англ. Биотехнология . Достижения в области биохимической инженерии/биотехнологии. 95 : 201–43. дои : 10.1007/b102215 . ISBN 978-3-540-23698-6 . ПМИД 16080270 .
- ^ Беккер К., Ярлинг Н., Сагафи С., Вейлер Р. и Додт ХУ (2012). «Химическая очистка и обезвоживание мозга мыши, экспрессирующего GFP» . ПЛОС ОДИН . 7 (3): e33916. Бибкод : 2012PLoSO...733916B . дои : 10.1371/journal.pone.0033916 . ПМК 3316521 . ПМИД 22479475 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Борисевич А.Ю.; Лупини, Арканзас; Пенникук, SJ (21 февраля 2006 г.). «Изготовление срезов по глубине на сканирующем просвечивающем электронном микроскопе с коррекцией аберраций» . Труды Национальной академии наук . 103 (9): 3044–3048. Бибкод : 2006PNAS..103.3044B . дои : 10.1073/pnas.0507105103 . ПМК 1413870 . ПМИД 16492746 .
- ^ Ховден, Р; Эрциус, П. (2014). «Преодолев предел Кроутера: сочетание глубинной томографии и наклонной томографии для широкоугольных 3D-реконструкций с высоким разрешением». Ультрамикроскопия . 140 : 26–31. arXiv : 1402.0028 . дои : 10.1016/j.ultramic.2014.01.013 . ПМИД 24636875 . S2CID 41919418 .