Дезинтегрин
| Дезинтегрин | |||
|---|---|---|---|
 Структура гетеродимера дезинтегрина из Echis carinatus | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Дезинтегрин | ||
| Pfam | PF00200 | ||
| InterPro | IPR001762 | ||
| PROSITE | PDOC00351 | ||
| Краткое содержание | 1kst / scope / supfam | ||
| OPM Суперсемейство | 227 | ||
| OPM protein | 2ao7 | ||
| Membranome | 538 | ||
| |||
Дезинтегрины представляют собой семейство небольших белков ( 45–84 аминокислот длиной ) из ядов гадюки , которые функционируют как мощные ингибиторы как тромбоцитов агрегации , так и интегрин -зависимой клеточной адгезии . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
Операция
[ редактировать ]Дезинтегрины работают, противодействуя шагам свертывания крови , ингибируя комки тромбоцитов . Они взаимодействуют с семействами бета -1 и -3 рецепторов интегринов . Интегрины - это клеточные рецепторы, участвующие в взаимодействиях клеточных и клеточных внеклеточных матрикс , служащих конечным общим путем, приводящим к агрегации посредством образования мостов -платетных тромбоцитов, которые необходимы для тромбоза и гемостаза . Дезинтегрины содержат мотив последовательности RGD (ARG-GLY-ASP) или KGD (Lys-Gly-ASP), который специфически связывается с интегриновыми рецепторами IIB-IIIA на поверхности тромбоцитов, тем самым блокируя связывание фибриногена с рецептором-гликопротеином комплекса активированного активированного комплекса активированного тромбоциты. Дезинтегрины действуют как антагонисты рецепторов , ингибируя агрегацию, индуцированную ADP , тромбином , активирующим тромбоцитом фактором и коллагеном . [ 4 ] The role of disintegrin in preventing blood coagulation renders it of medical interest, particularly with regard to its use as an anti-coagulant.[5]
Types of disintegrin
[edit]Disintegrins from different snake species have been characterised: albolabrin, applagin, barbourin, batroxostatin, bitistatin, obtustatin,[6] schistatin,[7] echistatin,[8] elegantin, eristicophin, flavoridin,[9] halysin, kistrin, mojastin (Crotalus scutulatus), rubistatin (Crotalus ruber), tergeminin, salmosin,[10] tzabcanin (Crotalus simus tzabcan)[11] and triflavin.
Disintegrins are split into 5 classes: small, medium, large, dimeric, and snake venom metalloproteinases.[12]
Small Disintegrins: 49-51 amino acids, 4 disulfide bonds
Medium Disintegrins: 70 amino acids, 6 disulfide bonds
Large Disintegrins: 84 amino acids, 7 disulfide bonds
Dimeric Disintegrins: 67 amino acids, 4 intra-chain disulfide bonds
Snake Venom Metalloproteinases: 100 amino acids, 8 disulfide bond
Evolution of disintegrin family
[edit]Disintegrins evolved via gene duplication of an ancestral protein family, the ADAM family. Small, medium, large, and dimeric disintegrin family are found only in the family Viperidae, suggesting duplication and diversification about 12-20 million years ago. Snake venom metalloproteinases are found through the entire superfamily Colubroidea, suggesting that they evolved before Colubroidea diversified roughly 60 million years ago.[13]
Other sources of disintegrin proteins
[edit]Disintegrin-like proteins are found in various species ranging from slime mold to humans. Some other proteins known to contain a disintegrin domain are:
- Some snake venom zinc metalloproteinases[14] consist of an N-terminal catalytic domain fused to a disintegrin domain. Such is the case for trimerelysin I (HR1B), atrolysin E (Ht-e) and trigramin. It has been suggested that these proteinases are able to cleave themselves from the disintegrin domains and that the latter may arise from such a post-translational processing.
- ADAM and ADAMTS protein families, which include important protease enzymes.
- The secreted protease ADAMTS13, found in serum, cleaves Von Willebrand factor and acts as a natural, endogenous inhibitor of platelet adhesion and aggregation.
- ADAM2 (beta-fertilin, the beta-subunit of guinea pig sperm surface protein PH30).[15] PH30 is a protein involved in sperm-egg fusion. The beta subunit contains a disintegrin at the N-terminal extremity.
- ADAM7 (Mammalian epididymial apical protein 1, EAP I).[16] ADAM7 is associated with the sperm membrane and may play a role in sperm maturation. Structurally, ADAM7 consists of an N-terminal domain, followed by a zinc metalloproteinase domain, a disintegrin domain, and a large C-terminal domain that contains a transmembrane region.
See also
[edit]References
[edit]- ^ Oliveira, Ana L.; Viegas, Matilde F.; da Silva, Saulo L.; Soares, Andreimar M.; Ramos, Maria J.; Fernandes, Pedro A. (July 2022). "The chemistry of snake venom and its medicinal potential". Nature Reviews Chemistry. 6 (7): 451–469. doi:10.1038/s41570-022-00393-7. ISSN 2397-3358. PMC 9185726.
- ^ McLane MA, Sanchez EE, Wong A, Paquette-Straub C, Perez JC (2004). "Disintegrins". Curr Drug Targets Cardiovasc Haematol Disord. 4 (4): 327–55. doi:10.2174/1568006043335880. PMID 15578957.
- ^ Lu X, Lu D, Scully MF, Kakkar VV (2005). "Snake venom metalloproteinase containing a disintegrin-like domain, its structure-activity relationships at interacting with integrins". Curr Med Chem Cardiovasc Hematol Agents. 3 (3): 249–60. doi:10.2174/1568016054368205. PMID 15974889.
- ^ Rahman S, Xu CS (2001). "Identification by Site-directed Mutagenesis of Amino Acid Residues Flanking RGD Motifs of Snake Venom Disintegrins for Their Structure and Function". Acta Biochim. Biophys. Sin. 33 (2): 153–157. PMID 12050803.
- ^ Lu X, Lu D, Scully MF, Kakkar VV (2006). "Integrins in drug targeting-RGD templates in toxins". Curr Pharm Des. 12 (22): 2749–69. doi:10.2174/138161206777947713. PMID 16918409.
- ^ Calvete JJ, Monleon D, Celda B, Paz Moreno-Murciano M, Marcinkiewicz C (2003). "NMR solution structure of the non-RGD disintegrin obtustatin". J. Mol. Biol. 329 (1): 135–45. doi:10.1016/S0022-2836(03)00371-1. PMID 12742023.
- ^ Betzel C, Sharma S, Singh TP, Perbandt M, Yadav S, Kaur P, Bilgrami S (2005). "Crystal structure of the disintegrin heterodimer from saw-scaled viper (Echis carinatus) at 1.9 A resolution". Biochemistry. 44 (33): 11058–66. doi:10.1021/bi050849y. PMID 16101289.
- ^ Calvete JJ, Kovacs H, Monleon D, Celda B, Esteve V (2005). "Conformation and concerted dynamics of the integrin-binding site and the C-terminal region of echistatin revealed by homonuclear NMR". Biochem J. 387 (Pt 1): 57–66. doi:10.1042/BJ20041343. PMC 1134932. PMID 15535803.
- ^ Mizuno H, Morita T, Fujii Y, Fujimoto Z, Horii K, Okuda D (2003). "Crystal structure of trimestatin, a disintegrin containing a cell adhesion recognition motif RGD". J. Mol. Biol. 332 (5): 1115–22. doi:10.1016/S0022-2836(03)00991-4. PMID 14499613.
- ^ Lee W, Shin J, Kang I, Hong SY, Chung K, Jang Y, Kim DS (2003). "Solution structure of a novel disintegrin, salmosin, from Agkistrondon halys venom". Biochemistry. 42 (49): 14408–15. doi:10.1021/bi0300276. PMID 14661951.
- ^ Saviola, A.J., Modahl, C.M. and Mackessy, S.P., 2015. Disintegrins of Crotalus simus tzabcan venom: Isolation, characterization and evaluation of the cytotoxic and anti-adhesion activities of tzabcanin, a new RGD disintegrin. Biochimie, 116, pp.92-102. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2015.07.005
- ^ Calvete, J (2005). "Structure-function correlations of snake venom disintegrins". Curr Pharm Des. 11 (7): 825–835. doi:10.2174/1381612053381783. PMID 15777237.
- ^ Хуарес П., Комы I, Гонсалес-Канделас Ф., Кальвет Дж.Дж. (2008). «Эволюция змеиного яда дезинтегрины положительным дарвиновским отбором» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (11): 2391–2407. doi : 10.1093/molbev/msn179 . PMID 18701431 .
- ^ Teixeira Cde F, Fernandes CM, Zuliani JP, Zamuner SF (2005). «Воспалительные эффекты металлопротеиназ змеи -яда» . Мем Институт Освальдо Круз . 100 : 181–4. doi : 10.1590/s0074-02762005000900031 . HDL : 1807/8219 . PMID 15962120 .
- ^ Turck CW, Myles DG, Primakoff P, Blobel CP, Wolfsberg TG, White JM (1992). «Потенциальный фьюжн-пептид и домен интегрин-лиганда в белке, активном в слиянии сперматозоидов». Природа . 356 (6366): 248–252. Bibcode : 1992natur.356..248b . doi : 10.1038/356248A0 . PMID 1552944 . S2CID 4233338 .
- ^ Холл Л., Джонс Р., Баркер П.Дж., Перри А.С. (1992). «Эпидидимальный белок млекопитающего с замечательным сходством последовательностей с геморрагическими пептидами змеи -яда» . Биохимия. Дж . 286 (3): 671–675. doi : 10.1042/bj2860671 . PMC 1132955 . PMID 1417724 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Дезинтегрины в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)