Clavibacter Michiganensis

Clavibacter Michiganensis
	Симптомы Clavibacter Michiganensis на помидоре
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Actinomycetota
Сорт:	Актиномицетия
Заказ:	Микрококк
Семья:	Microbacteriaceae
Род:	Клавибактер
Разновидность:	C. Michiganensis
Биномиальное название
	Clavibacter Michiganensis ; Коррига ( Смит , 1910) Davis et al . 1984
Подвид
	См. подпрокат Californiaensis Yasuhara-Bell и Alvarez 2015 ; См. подпрокат Альварес Белл и ; См. подпрокат Michiganensis Corrig. (Смит, 1910) Davis et al. 1984 ; См. подпрокат Phaseoli González и Trapiello 2014 ;
Синонимы
	Aplanobacter Michiganense [ sic ] ( Smith 1910) Smith 1914 ; Bacterium Michiganense Smith 1910 ; Corynebacterium Michiganense ( Smith 1910) Jensen 1934 ; Mycobacterium flavum subsp. michiganense ( Smith 1910) Krasil’nikov 1941 ; Phytomonas Michiganensis ( Smith 1910) Bergey et al . 1923 ; Pseudomonas Michiganensis ( Smith 1910) Stevens 1913 ;

Clavibacter Michiganensis -это аэробный не спорулирующий грамположительный растения патогенный актиномицет рода Clavibacter . Clavibacter Michiganensis имеет несколько подвидов. Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis вызывает существенные экономические потери во всем мире, повреждая помидоры и картофель . ^{[ 2 ]}

Контекст

Clavibacter Michiganensis , также известный как кольцевая гниль, является необычным род фитопатогенных бактерий в том, что она является грамположительной и не имеет системы секреции третьего типа . Все виды и подвиды Clavibacter типа B2γ, имеют клеточную стенку сшитая в остатках диаминобутирата . Clavibacter - это аэробная бактерия с морфологией Coryneform . Там нет мицелия не , и споры производятся. ^{[ 3 ]}

Clavibacter Michiganensis заражает первичного хозяина одним из трех способов: раны, гидатоды или загрязненным семенем. Если бактерии достигают подходящего кворума, результатом является системная сосудистая инфекция. На первых этапах инвазии C. michiganensis находится в качестве биотрофического патогена в ксилемных сосудах. ^{[ 3 ]}

Clavibacter имеет сложную историю таксономических имен. был только один признанный вид В течение долгого времени в роде Clavibacter . есть девять подвидов В видах Michiganensis . Недавно некоторые штаммы были реклассифицированы в другие роды. Эта сложная история связана с трудностями в характеристике бактерий . В отличие от грибов , морфология бактерий недостаточно для таксономических целей. С этой целью штаммы фитопатогенных бактерий, называемых патоварами , отличаются культурными (селективными средствами среды), физиологическими, биохимическими (например, секретируемыми ферментами. Химические реакции растения) или патологические характеристики (включая диапазон восприимчивых хозяев). ^{[ 4 ]}

Недавно два штамма этих бактерий - субп. Sepidonicum и Subsp. Michiganensis - их геномы секвенировали и аннотировали. Об этом взаимодействии с патогеном хост еще предстоит многое узнать, но теперь, когда геном был секвенирован, скорость открытий, вероятно, увеличится. Одной из основных целей, относящихся к исследованиям этих бактериальных геномов, является разработка устойчивых сортов. К сожалению, устойчивых сортов еще не найдено. ^{[ 5 ]}

Генетика

Вид имеет единую хромосому. ^{[ 3 ]}

См. подпрокат Michiganensis

См. подпрокат Michiganensis является причинным агентом бактериального увядания и томата ( Lycopersicon Esculentum ). ^{[ 3 ]}

Хозяева и симптомы

Когда инфекция происходит на ранней стадии растения томата, на листьях может быть увязен, потому что Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis попадает в растение ранами, включая корневые раны, и если бактерия доходит до ксилема, то, вероятно, системная инфекция, которая может подключить ксилемыми сосудами. Увязывание может показаться только на одной стороне листа и может восстанавливаться в течение более прохладных периодов. ^{[ 6 ]} Вся система ксилема внутри растения позволяет бактериям образовывать титры до 10 ⁹ бактерии на грамм растительной ткани. Увядание может в конечном итоге распространяться на все листья, и эти листья, наряду с их черешками , также могут показать искаженные, скручиваемые рост. Один из способов диагностики тяжелой сосудистой инфекции - это ущипнуть стебель. Если эпидермис и внешний слой коры отдельно от внутреннего стебля, то существует тяжелая сосудистая инфекция. Эти открытые части будут иметь мыльную ощущение. ^{[ 6 ]} Повреждения Canker, хотя и редкие, могут развиваться на стебле. Эти канки являются некротическими областями, где эпидермис исчез. Поскольку бактерии продолжают свою колонизацию, язва углубит и расширяется. С точки зрения развития фруктов, помидоры могут не развиваться вообще или могут выглядеть мраморными, потому что они созревают неравномерно. ^{[ 6 ]}

Если инфекция происходит на поздней стадии развития растений, растения могут выжить и генерировать фрукты. Тем не менее, растение может показаться стрессовым, а не увядшим, и могут развиваться белые интернатные области, которые будут развиваться в коричневую некротическую ткань. Часто семена также заражены. ^{[ 2 ]}

Поверхностные инфекции увеличивают риск эпидемий. ^{[ 6 ]} Они возникают, когда бактерии размножаются на эпидермисе хозяина, проникают через устья или проходят через очень мелкую рану, которая не позволяет патогену достигать ксилемы. Хозяин может выглядеть так, как будто его потерто кукурузной мукой или грубой мукой , но на самом деле это серия волдырей, которые я могу поднять или затонуть, и выглядеть белым и бледно -оранжевым. ^{[ 6 ]} Наиболее распространенным симптомом листьев является темно-коричневое пятно, окруженное своего рода оранжевой областью на краю листа. Фрукты могут развить пятна «птичьего глаза», которые являются бледно -зелеными и белыми приподнятыми пустулами, которые имеют коричневый центр и хлоротическое ореол. ^{[ 6 ]} Фотографии этих симптомов доступны при цитируемой ссылке.

Однако скрытые инфекции распространены. ^{[ 3 ]}

Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis штамм дикого типа NCPPB382 несет две плазмиды, связанные с вирулентностью: PCM1 и PCM2. Авирулентный штамм, CMM100, не содержит этих плазмид. Штаммы, которые несли одну из двух плазмид, было обнаружено, что вирулентные, но симптомы увядания были отложены. Вирулентные и авирулентные штаммы производили одинаковое количество экзополисахаридов , что позволяет предположить, что EPS не играет существенной роли в патогенности. ^{[ 7 ]}

Цикл болезней

Причинный агент бактериального увядания и томата выживает в семенах или на семенах на срок до 8 месяцев ^{[ 6 ]} Но иногда и в отходе растений в почве. Патоген может распространяться на большие расстояния из -за его связи с семенами. ^{[ 8 ]} Риск распространения бактерий на здоровые растения томата является наибольшим во время пересадки , привязки и сосания или в любое время, когда хозяин может быть ранен. Как только бактерии попадают в растение через рану, он будет двигаться и размножаться в основном в ксилемых сосудах. После установки бактерии могут перемещаться в флоэму , питу и кору. ^{[ 9 ]} Инфекция может привести к системному или поверхностному заболеванию. Системные инфекции появляются через 3–6 недель, и риск вторичной инфекции увеличивается с водным сплайкой. ^{[ 6 ]} Общее появление латентных инфекций - наличие патогена в хозяине, но у хозяина нет симптомов - делает этот патоген особенно опасным. ^{[ 10 ]}

Тем не менее, предположение, что C. michiganensis не превышает зимовку в почве, не без споров. Геном C. Michiganesis недавно был секвенирован, и новые теории, безусловно, возникнут еще раз, работа будет завершена. Что известно, так это то, что CMM может использовать продукты гидролиза в качестве источников углерода и энергии с помощью ряда АТФ-связывающих транспортеров и α- и β-глюкозидаз . ^{[ 11 ]} Это говорит о том, что CMM может выжить в почве, пока присутствует распадающийся материал хозяина. Также было установлено, что геном субп. Michiganensis не имеет генов, которые кодируют нитрат и нитрат редуктазы . Это означает, что бактерии зависит от ранее сниженных азотных соединений или аминокислот для его источника азота. ^{[ 11 ]} В геноме CMM также отсутствуют гены для восстановления ассимиляторных сульфатов , что связано с ауксотрофией для метионина - одной из двух аминокислот, которые содержат серные . ^{[ 11 ]}

CMM имеет остров патогенности (PI), который кодируется в хромосоме и, вероятно, связан с колонизацией и уклонкой от обороны растений или подавлением. Этот остров был подразделен на два субрегиона: CHP и TOMA . Сериновые протеазы семей S1A, PPA и PPA-E кодируются в субрегионе CHP , а также Subtilase SBTA. ^{[ 3 ]}

Среда

Тепловая температура в диапазоне 23–28 ° C (73–82 ° F) и высокая относительная влажность (> 80%) представляют собой оптимальную среду для подплаты Clavibacter Michiganesis . Мичиганезис , развитие симптомов томатной бактерий. ^{[ 12 ]} При влажной или влажной погоде слизистые массы бактерий сливаются через трещины на поверхность стебля, из которой они распространяются на листья и фрукты и вызывают вторичные инфекции ^{[ 9 ]} Зараженные растения -хозяева будут иметь серьезные симптомы в жаркие дни, когда будет высокая скорость транспирации, поскольку бактерии могут подключить ксилемые сосуды. ^{[ Цитация необходима ]}

Управление

Лучший способ контроля заболевания - это использование здоровых семян, которые уже были извлечены кислотой. Кроме того, использование химических обработок, таких как гидроксид меди ^{[ 13 ]} или стрептомицин в семенном русле, ^{[ 9 ]} Удаление или изоляция больных культур может быть полезным для снижения скорости инфекции. ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ " Clavibacter Michiganensis " . Таксономия NCBI . Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации . Получено 13 декабря 2018 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Gartemann et al. « Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis : первые шаги в понимании вирулентности грамположительной фитопатогенной бактерии», Журнал биотехнологии , Германия, 16 июля 2003 года. Получено на 2011-10-26.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Эйхенлауб, Рудольф; Гартеманн, Карл-Хейнц (8 сентября 2011 г.). « Подвиды Clavibacter Michiganensis : молекулярное исследование грамположительных бактериальных патогенов растений». Ежегодный обзор фитопатологии . 49 (1). Ежегодные обзоры : 445–464. doi : 10.1146/annurev-phyto-072910-095258 . ISSN 0066-4286 . PMID 21438679 . S2CID 207707582 .
^ Eichenlaub R, Gartemann KH, Burger A. 2006 Clavibacter Michiganensis , группа грамположительных фитопатогенных бактерий. В «Ассоциированных растениях бактериях», изд. SS Gnanamanickam, с. 385–422. Дордрехт: Спрингер
^ Coaker GL, Willard B, Kinter M, Stockinger EJ, Francis DM. 2004. Протеомный анализ резистентности, опосредованный REM 2.0 и REM 5.1, двумя локусами, контролирующими устойчивость к бактериальному ящину томата. Мол Раститель-микроб взаимодействует. 17: 1019–28
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Эльфинстон Дж., О'Нил Т. Бактериальный увядание и язву томата (Clavibacter Michiganensis subsp.michiganensis) . ТОМАТА ФАКТИКА. 2010. Компания по развитию садоводства
^ Meltzus D, Bermpohl A, Dimer J, Eichenlaub R. 1993. Данные факторов вирулентности, кодируемых плазмидой в фитопатогенной бактерии Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis ncppb382. J. Bacteriol. 175: 2131-36.
^ Tsiantos J.1987 Передача бактерии Corneybacterium Michiganense Pv. Мичигаэнсинс семенами. J. Phytopathol. 119: 142-46
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Agrios, George N (2005). Патология растений , Берлингтон, Массачусетс: Elsevier Academic Press. ISBN 978-0-12-044565-3 .
^ Gitaitis Rd, Beaver RW, Voloudakis AE.1991. Обнаружение Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis в пересадке томатов. Plant DIS .75: 834-38
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Gartemann KH, ABT B, Bekel T, Burger A, Engemann J, et al. 2008. Последовательность генома томатного патогенного актиномицета Clavibacter Michiganensis subsp Michiganensis ncppb382 раскрывает большой остров, участвующий в патогенности. J.Bacteriol.190: 2138-49
^ Xu et al. «Колонизация саженцев томатов биолюминесцентными Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganesis при различных режимах влажности», Phytopathology , Ohio. Получено на 2011-11-16.
^ [1] , Вернер в Ал. «Ограничение популяций и распространения Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis на помидорах саженцев в теплице», Болезнь растений , East Lansing, май 2002 г., полученные на 2011-10-26.
^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 17 мая 2011 года . Получено 25 октября 2011 года . {{cite web}}: Cs1 Maint: архивная копия как заголовок ( ссылка ) , cabi и eppo для ЕС. « Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis », Eppo Quantine Pest . Получено на 2011-10-26.

Внешние ссылки

Бактериальный контроль рака ( Clavibacter Michiganensis ) на помидор на испанском языке.
Clavibacter Michigansis subsp. Michigansis S 05, SO5 - штамм типа - DSM 46364, ICPB CM 177, 818, LMG 7333, NCPPB 2979, PDDC 2550 BACDIVEID (ID 7289)

[NCBI-1] " Clavibacter Michiganensis " . Таксономия NCBI . Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации . Получено 13 декабря 2018 года .

[Gartemann_et_al-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Gartemann et al. « Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis : первые шаги в понимании вирулентности грамположительной фитопатогенной бактерии», Журнал биотехнологии , Германия, 16 июля 2003 года. Получено на 2011-10-26.

[Eichenlaub-Gartemann-2011-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Эйхенлауб, Рудольф; Гартеманн, Карл-Хейнц (8 сентября 2011 г.). « Подвиды Clavibacter Michiganensis : молекулярное исследование грамположительных бактериальных патогенов растений». Ежегодный обзор фитопатологии . 49 (1). Ежегодные обзоры : 445–464. doi : 10.1146/annurev-phyto-072910-095258 . ISSN 0066-4286 . PMID 21438679 . S2CID 207707582 .

[4] Eichenlaub R, Gartemann KH, Burger A. 2006 Clavibacter Michiganensis , группа грамположительных фитопатогенных бактерий. В «Ассоциированных растениях бактериях», изд. SS Gnanamanickam, с. 385–422. Дордрехт: Спрингер

[5] Coaker GL, Willard B, Kinter M, Stockinger EJ, Francis DM. 2004. Протеомный анализ резистентности, опосредованный REM 2.0 и REM 5.1, двумя локусами, контролирующими устойчивость к бактериальному ящину томата. Мол Раститель-микроб взаимодействует. 17: 1019–28

[hdc-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Эльфинстон Дж., О'Нил Т. Бактериальный увядание и язву томата (Clavibacter Michiganensis subsp.michiganensis) . ТОМАТА ФАКТИКА. 2010. Компания по развитию садоводства

[Meletzus-7] Meltzus D, Bermpohl A, Dimer J, Eichenlaub R. 1993. Данные факторов вирулентности, кодируемых плазмидой в фитопатогенной бактерии Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis ncppb382. J. Bacteriol. 175: 2131-36.

[Tsiantos-8] Tsiantos J.1987 Передача бактерии Corneybacterium Michiganense Pv. Мичигаэнсинс семенами. J. Phytopathol. 119: 142-46

[Agrios-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Agrios, George N (2005). Патология растений , Берлингтон, Массачусетс: Elsevier Academic Press. ISBN 978-0-12-044565-3 .

[Gitaitis-10] Gitaitis Rd, Beaver RW, Voloudakis AE.1991. Обнаружение Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis в пересадке томатов. Plant DIS .75: 834-38

[Gartemann-11] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Gartemann KH, ABT B, Bekel T, Burger A, Engemann J, et al. 2008. Последовательность генома томатного патогенного актиномицета Clavibacter Michiganensis subsp Michiganensis ncppb382 раскрывает большой остров, участвующий в патогенности. J.Bacteriol.190: 2138-49

[Xu_et_al.-12] Xu et al. «Колонизация саженцев томатов биолюминесцентными Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganesis при различных режимах влажности», Phytopathology , Ohio. Получено на 2011-11-16.

[13] [1] , Вернер в Ал. «Ограничение популяций и распространения Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis на помидорах саженцев в теплице», Болезнь растений , East Lansing, май 2002 г., полученные на 2011-10-26.

[EPPO-14] «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 17 мая 2011 года . Получено 25 октября 2011 года . {{cite web}}: Cs1 Maint: архивная копия как заголовок ( ссылка ) , cabi и eppo для ЕС. « Clavibacter Michiganensis subsp. Michiganensis », Eppo Quantine Pest . Получено на 2011-10-26.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

Идентификаторы таксонов
Clavibacter Michiganensis	Викидата : Q2978666 Arc.Ask3.Ru : Clavibacter Michiganensis Bacdive : 7289 Col : 5yww6 EOL : 6386105 GBIF : 3225356 Натуралиста : 379762 Irmng : 10028572 ITIS : 960594 LPSN : Clavibacter-Michiganensis NCBI : 28447 NZOR: 599C0E36-0113-4CEC-A495-6F8226E92D89 Открытое дерево жизни : 998986
Клавибактер	Викидата : Q20643331 Arc.Ask3.Ru : Клавибактер Col : 3QNW Eppo : 1clabg GBIF : 3225355 Натуралиста : 373935 Irmng : 1045756 ITIS : 956961 LPSN : clavibacter.html NCBI : 1573 NZOR: 205A69E8-3F8A-4A2C-8143-67121966FDCB Открытое дерево жизни : 487716 Черви : 559642