Elmo1

Elmo1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2RQR, 2VSZ, 3A98
Идентификаторы
Псевдонимы	Elmo1 , CED-12, CED12, Elmo-1, Engulfment and Cell Mothithy 1
Внешние идентификаторы	Омим : 606420 ; MGI : 2153044 ; Гомологен : 56685 ; GeneCards : Elmo1 ; OMA : Elmo1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	37,449,223 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	20,792,523 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	prefrontal cortex; ; C1 segment; ; corpus callosum; ; Brodmann area 9; ; sural nerve; ; right frontal lobe; ; islet of Langerhans; ; lateral nuclear group of thalamus; ; postcentral gyrus; ; ganglionic eminence;
	Top expressed in
	medial dorsal nucleus; ; medial geniculate nucleus; ; lateral geniculate nucleus; ; pallidum of neuraxis; ; globus pallidus; ; pontine nuclei; ; deep cerebellar nuclei; ; inferior colliculus; ; granulocyte; ; cerebellar cortex;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	guanyl-nucleotide exchange factor activity; SH3 domain binding; protein binding;
Cellular component	cytosol; cytoplasm; guanyl-nucleotide exchange factor complex; plasma membrane; membrane;
Biological process	Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; actin filament-based process; mitigation of host defenses by virus; phagocytosis, engulfment; vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; phagocytosis; Rac protein signal transduction; cell migration; actin cytoskeleton organization; apoptotic process; cell motility; regulation of molecular function;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9844
	140580
	ENSG00000155849
	Ensmusg00000041112
	Q92556
	Q8BPU7
	NM_001039459 ; NM_001206480 ; NM_001206482 ; NM_014800 ; NM_130442
	NM_080288 ; NM_198093
	NP_001034548 ; NP_001193409 ; NP_001193411 ; NP_055615 ; NP_569709
	NP_525027 ; NP_932761
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Белок 1 поглощения и мощности клеток - это белок , который у людей кодируется ELMO1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} ELMO1 расположен на хромосоме № Седьмой у людей и расположен на номере хромосомы тринадцать у мышей.

Структура

Белок 1 -го поглощения человека и мощность клеток, ELMO1, составляет 720 остатков в длину. Белок содержит следующие три домена:

N-концевой домен Armadillo (остатки 82-262)
Центральный Эльмо ( E- ngulfment and cel l mo ility) домен (301-492)
С-концевой домен гомологии Pleckstrin (остатки 527-674)

Elmo1 также имеет пробу-богатый мотив на экстремальном Cerminus. Анализ вторичной структуры предсказал, что в N N и C-конце существуют альфа-спиральные области. ^{[ 7 ]}

Структура гомологической области PLECKSTRIN ELMO1 определялась с помощью рентгеновской кристаллографии. ^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, взаимодействует с посвятителем белка цито-кинезиса 1, чтобы способствовать изменению фагоцитоза и эффекта. Сходство с белком C. elegans предполагает, что этот белок может функционировать при апоптозе и при миграции клеток. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскрипта, кодирующих различные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ELMO1 взаимодействует с DOCK180 ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} и HCK . ELMO1 напрямую взаимодействует с доменом SH3 HCK. Связь между ELMO1 и HCK зависит от полипролиновых взаимодействий. ^{[ 9 ]}

Когда ELMO1 комплекс с DOCK180, RAC GTPase активируются зависимые от биологические процессы. PH -домен ELMO1 функционирует в TRANS для стабилизации DOCK180 и делает его устойчивым к деградации. Когда ELMO1 связывается с DOCK180, он снимает стерическое ингибирование DOCK180, которое затем активирует RAC GTPase. Профессиональный мотив CREMINUS на ELMO1 необходим для связывания ELMO1 с доменом SH3 на N-конце DOCK180. ^{[ 7 ]} Комплекс ELMO1 и DOCK180 действует как регулятор RAC во время развития клеточной миграции. Мутация обоих сайтов взаимодействия для DOCK180 на ELMO1 приведет к нарушению комплекса ELMO1-DOCK180. ELMO1 в комплексе с DOCK180 и CRKII приводит к максимальной эффективности фагоцитоза в клетке. Этот комплекс молекул происходит выше RAC во время фагоцитоза. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000155849 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000041112 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC, Kinchen JM, Haney LB, Nishiwaki K, Walk SF, Nemergut ME, Macara IG, Francis R, Schedl T, Цинь Y, Van Aelst L, Hengartner Mo, Ravichandran KS (октябрь 2001 г. ) «CED-12/Elmo, новый член пути CRKII/DOCK180/RAC, необходим для фагоцитоза и миграции клеток» (PDF) . Клетка . 107 (1): 27–41. doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 00520-7 . PMID 11595183 . S2CID 15232864 . Архивировано из оригинала (PDF) 2021-09-22 . Получено 2020-09-28 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Elmo1 Engulfment и Cell Mothithy 1» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ВВП : 2VSZ ; Komander D, Patel M, Laurin M, Fradet N, Pelletier A, Barford D, Côté JF (ноябрь 2008 г.). «Альфа-спиральное расширение гомологического домена Elmo1 Pleckstrin обеспечивает прямое взаимодействие с DOCK180 и имеет решающее значение для передачи сигналов RAC» . Мол Биол. Клетка . 19 (11): 4837–51. doi : 10.1091/mbc.e08-04-0345 . PMC 2575150 . PMID 18768751 .
^ Бругнера Е., Хейни Л., Гримсли С., Лу М., Уолк С.Ф., Тозелло-Трампонт А.С., Макара И.Г., Мадхани Х, Финк Г.Р., Равичандран К.С. (август 2002 г.). «Нетрадиционная активность RAC-GEF опосредуется через комплекс DOCK180-ELMO». НАТ Клеточная биол . 4 (8): 574–82. doi : 10.1038/ncb824 . PMID 12134158 . S2CID 36363774 .
^ Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, Annan RS, Miller WT (август 2002 г.). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы семейства SRC HCK. Белок синдрома Вискотт-Альдрича (WASP), белок-взаимодействие WASP (WIP) и ELMO1» . Дж. Биол. Химический 277 (31): 28238–46. doi : 10.1074/jbc.m202783200 . PMID 12029088 .

Дальнейшее чтение

Ohara O, Nagase T, Ishikawa K, et al. (1997). «Конструкция и характеристика библиотек кДНК человека мозга человека, подходящих для анализа клонов кДНК, кодирующих относительно большие белки» . ДНК Res . 4 (1): 53–9. doi : 10.1093/dnares/4.1.53 . PMID 9179496 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «На пути к каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, et al. (2002). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы семейства SRC HCK. Белок синдрома Вискотт-Альдрича (WASP), белок-взаимодействие WASP (WIP) и ELMO1» . Дж. Биол. Химический 277 (31): 28238–46. doi : 10.1074/jbc.m202783200 . PMID 12029088 .
Brugnera E, Haney L, Grimsley C, et al. (2002). «Нетрадиционная активность RAC-GEF опосредуется через комплекс DOCK180-ELMO». НАТ Клеточная биол . 4 (8): 574–82. doi : 10.1038/ncb824 . PMID 12134158 . S2CID 36363774 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Scherer SW, Cheung J, MacDonald Jr, et al. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–72. Bibcode : 2003sci ... 300..767S . doi : 10.1126/science.1083423 . PMC 2882961 . PMID 12690205 .
Sanui T, Inayoshi A, Noda M, et al. (2003). «DOCK2 регулирует активацию RAC и реорганизацию цитоскелета посредством взаимодействия с ELMO1» . Кровь . 102 (8): 2948–50. doi : 10.1182/blood-2003-01-0173 . PMID 12829596 . S2CID 24167530 .
Katoh H, Negishi M (2003). «RHOG активирует RAC1 путем прямого взаимодействия с DOCK180-связывающим белком Elmo». Природа . 424 (6947): 461–4. Bibcode : 2003natur.424..461K . doi : 10.1038/nature01817 . PMID 12879077 . S2CID 4411133 .
Grimsley CM, Kinchen JM, Tosello-Trampont AC, et al. (2004). «Белки DOCK180 и ELMO1 сотрудничают, чтобы способствовать эволюционно консервативной RAC-зависимой миграции клеток» . Дж. Биол. Химический 279 (7): 6087–97. doi : 10.1074/jbc.m307087200 . PMID 14638695 .
Wang X, Wu YC, Fadok VA, et al. (2003). «Клеточное труп, опосредованное рецептором фосфатидилсерина C. elegans через CED-5 и CED-12» . Наука . 302 (5650): 1563–6. Bibcode : 2003sci ... 302.1563W . doi : 10.1126/science.1087641 . PMID 14645848 . S2CID 25672278 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Janardhan A, Swigut T, Hill B, et al. (2006). «NEF ВИЧ-1 связывает комплекс DOCK2-ELMO1, чтобы активировать RAC и ингибировать хемотаксис лимфоцитов» . PLOS BIOL . 2 (1): E6. doi : 10.1371/journal.pbio.0020006 . PMC 314466 . PMID 14737186 .
Lu M, Kinchen JM, Rossman KL, et al. (2004). «PH -домен функций ELMO в TRANS для регулирования активации RAC через DOCK180». НАТ Структура Мол Биол . 11 (8): 756–62. doi : 10.1038/nsmb800 . PMID 15247908 . S2CID 125990 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Debakker CD, Haney LB, Kinchen JM, et al. (2005). «Фагоцитоз апоптотических клеток регулируется сигнальным модулем UNC-73/Trio-Mig-2/RHOG и повторными повторениями Armadillo CED-12/Elmo» . Карт Биол . 14 (24): 2208–16. doi : 10.1016/j.cub.2004.12.029 . PMID 15620647 . S2CID 1269946 .
Akakura S, Kar B, Singh S, et al. (2005). «C-концевой домен SH3 CRKII регулирует сборку и функцию DOCK180/ELMO RAC-GEF». J. Cell. Физиол . 204 (1): 344–51. doi : 10.1002/jcp.20288 . PMID 15700267 . S2CID 29767556 .
Lu M, Kinchen JM, Rossman KL, et al. (2005). «Модель стерического ингибирования для регуляции нуклеотидного обмена через семейство GEF DOCK180» . Карт Биол . 15 (4): 371–7. Bibcode : 2005cbio ... 15..371L . doi : 10.1016/j.cub.2005.01.050 . PMID 15723800 . S2CID 14267018 .
Shimazaki A, Kawamura Y, Kanazawa A, et al. (2005). «Генетические вариации в гене, кодирующем ELMO1, связаны с восприимчивостью к диабетической нефропатии» . Диабет . 54 (4): 1171–8. doi : 10.2337/диабет.54.4.1171 . PMID 15793258 .
Yokoyama N, Debakker CD, Zappacosta F, et al. (2005). «Идентификация остатков тирозина на ELMO1, которые фосфорилируются HCK SRC-семьи HCK-семей» . Биохимия . 44 (24): 8841–9. doi : 10.1021/bi0500832 . PMC 2441568 . PMID 15952790 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 7 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000155849 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000041112 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid11595183-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC, Kinchen JM, Haney LB, Nishiwaki K, Walk SF, Nemergut ME, Macara IG, Francis R, Schedl T, Цинь Y, Van Aelst L, Hengartner Mo, Ravichandran KS (октябрь 2001 г. ) «CED-12/Elmo, новый член пути CRKII/DOCK180/RAC, необходим для фагоцитоза и миграции клеток» (PDF) . Клетка . 107 (1): 27–41. doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 00520-7 . PMID 11595183 . S2CID 15232864 . Архивировано из оригинала (PDF) 2021-09-22 . Получено 2020-09-28 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Elmo1 Engulfment и Cell Mothithy 1» .

[pmid18768751-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ВВП : 2VSZ ; Komander D, Patel M, Laurin M, Fradet N, Pelletier A, Barford D, Côté JF (ноябрь 2008 г.). «Альфа-спиральное расширение гомологического домена Elmo1 Pleckstrin обеспечивает прямое взаимодействие с DOCK180 и имеет решающее значение для передачи сигналов RAC» . Мол Биол. Клетка . 19 (11): 4837–51. doi : 10.1091/mbc.e08-04-0345 . PMC 2575150 . PMID 18768751 .

[pmid12134158-8] Бругнера Е., Хейни Л., Гримсли С., Лу М., Уолк С.Ф., Тозелло-Трампонт А.С., Макара И.Г., Мадхани Х, Финк Г.Р., Равичандран К.С. (август 2002 г.). «Нетрадиционная активность RAC-GEF опосредуется через комплекс DOCK180-ELMO». НАТ Клеточная биол . 4 (8): 574–82. doi : 10.1038/ncb824 . PMID 12134158 . S2CID 36363774 .

[pmid12029088-9] Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, Annan RS, Miller WT (август 2002 г.). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы семейства SRC HCK. Белок синдрома Вискотт-Альдрича (WASP), белок-взаимодействие WASP (WIP) и ELMO1» . Дж. Биол. Химический 277 (31): 28238–46. doi : 10.1074/jbc.m202783200 . PMID 12029088 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]