ПИКАРД

ПИКАРД
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1UCP, 2KN6, 3J63, 5H8O
Идентификаторы
Псевдонимы	PYCARD , ASC, CARD5, TMS, TMS-1, TMS1, PYD и домен CARD, содержащий
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 606838 ; МГИ : 1931465 ; Гомологен : 8307 ; Генные карты : PYCARD ; ОМА : ПИКАРД — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 16 (human) Band 16p11.2 Start 31,201,486 bp End 31,203,450 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7|7 F3 Start 127,588,880 bp End 127,593,039 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in monocyte granulocyte mucosa of transverse colon blood vulva human penis skin of leg skin of abdomen spleen gingival epithelium Top expressed in Paneth cell migratory enteric neural crest cell ileum crypt of lieberkuhn of small intestine epithelium of small intestine duodenum large intestine colon left colon esophagus More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function protein homodimerization activity interleukin-6 receptor binding BMP receptor binding protein binding identical protein binding enzyme binding cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process Pyrin domain binding cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process myosin I binding tropomyosin binding protease binding transmembrane transporter binding protein dimerization activity cysteine-type endopeptidase activity Cellular component cytoplasm NLRP3 inflammasome complex NLRP1 inflammasome complex AIM2 inflammasome complex nucleolus endoplasmic reticulum mitochondrion IkappaB kinase complex nucleus secretory granule lumen azurophil granule lumen extracellular region cytosol protein-containing complex neuronal cell body Golgi membrane Golgi apparatus membrane Biological process positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity regulation of apoptotic process intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator positive regulation of adaptive immune response defense response to Gram-negative bacterium immune system process cellular response to tumor necrosis factor regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway positive regulation of DNA-binding transcription factor activity tumor necrosis factor-mediated signaling pathway positive regulation of JNK cascade negative regulation of interferon-beta production negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling myeloid dendritic cell activation positive regulation of T cell activation defense response to virus cellular response to interleukin-1 positive regulation of apoptotic process positive regulation of tumor necrosis factor production positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria negative regulation of protein serine/threonine kinase activity positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway inflammatory response cellular response to lipopolysaccharide negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity signal transduction apoptotic process innate immune response neutrophil degranulation positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity activation of innate immune response myeloid dendritic cell activation involved in immune response positive regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process positive regulation of actin filament polymerization regulation of protein stability positive regulation of interferon-gamma production positive regulation of interleukin-6 production positive regulation of activated T cell proliferation positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process macropinocytosis positive regulation of phagocytosis positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade positive regulation of T cell migration positive regulation of defense response to virus by host intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage response to bacterium regulation of autophagy interleukin-1 beta production regulation of GTPase activity regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process regulation of inflammatory response protein homooligomerization activation of cysteine-type endopeptidase activity negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response proteolysis positive regulation of interleukin-1 beta production Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 29108 66824 Вместе ENSG00000103490 ENSMUSG00000030793 ЮниПрот Q9ULZ3 Q9EPB4 RefSeq (мРНК) НМ_145183 НМ_013258 НМ_145182 НМ_023258 RefSeq (белок) НП_037390 НП_660183 НП_075747 Местоположение (UCSC) Чр 16: 31,2 – 31,2 Мб Чр 7: 127,59 – 127,59 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

PYCARD, часто называемый ASC (пятнистый белок, связанный с апоптозом, содержащий CARD), представляет собой белок , который у человека кодируется PYCARD геном . Локализуется преимущественно ядрах моноцитов макрофагов и в . Однако в случае заражения патогеном он быстро перемещается в цитоплазму , перинуклеарное пространство, эндоплазматический ретикулум и митохондрии и является ключевым белком-адаптером в активации воспалительной сомы .

ЯМР-структура полноразмерного ASC: PDB ID 2KN6 [1]

Функция

Этот ген кодирует адаптерный белок, который состоит из двух доменов белок-белкового взаимодействия: N-концевого домена PYRIN-PAAD-DAPIN ( PYD ) и C-концевого домена рекрутирования каспазы ( CARD ). Домены PYD и CARD являются членами суперсемейства доменов смерти пучка шести спиралей, которые опосредуют сборку больших сигнальных комплексов в воспалительных и апоптотических сигнальных путях посредством активации каспазы . В нормальных клетках этот белок локализован в цитоплазме ; однако в клетках, подвергающихся апоптозу, он образует шарообразные агрегаты вблизи периферии ядра.

PYCARD может встречаться в четырех различных изоформах . Изоформа 1, часто называемая каноническим PYCARD, и изоформа 2 являются активаторными изоформами. Они локализуются совместно с рецепторами домена олигомеризации нуклеотидов (NLR) и каспазой-1 . В отличие от изоформы 1, изоформа 2 участвует в прямой IL-1β регуляции процессинга . Изоформа 3 является ингибирующей изоформой, поэтому она локализуется только совместно с каспазой-1, но не с NLR. Изоформа 4 не способна действовать как адаптерный белок в передаче сигналов NLR, и ее роль остается неясной.

Взаимодействия

Было показано, что PYCARD взаимодействует с MEFV .

Дальнейшее чтение

• Масумото Дж., Танигучи С., Аюкава К., Сарвотхам Х., Кишино Т., Ниикава Н., Хидака Э., Кацуяма Т., Хигучи Т., Сагара Дж. (1999). «ASC, новый белок массой 22 кДа, агрегирует во время апоптоза клеток промиелоцитарного лейкоза человека HL-60» . Ж. Биол. Хим . 274 (48): 33835–8. дои : 10.1074/jbc.274.48.33835 . ПМИД   10567338 .
• Ли С.К., На С.Ю., Юнг С.Ю., Чхве Дж.Э., Джун Б.Х., Чеонг Дж., Мельцер П.С., Ли Ю.К., Ли Дж.В. (2000). «Активация белка-1, ядерного фактора-каппаВ и фактора ответа сыворотки как новых молекул-мишеней коактиватора транскрипции, амплифицированного раком, ASC-2» . Мол. Эндокринол . 14 (6): 915–25. дои : 10.1210/mend.14.6.0471 . ПМИД   10847592 .
• Конвей К.Э., МакКоннелл Б.Б., Боуринг С.Э., Дональд К.Д., Уоррен С.Т., Вертино П.М. (2000). «TMS1, новый белок домена рекрутирования проапоптотической каспазы, является мишенью индуцированного метилированием молчания генов при раке молочной железы человека». Рак Рез . 60 (22): 6236–42. ПМИД   11103776 .
• МакКоннелл Б.Б., Вертино П.М. (2000). «Активация апоптотического пути, опосредованного каспазой-9, путем субклеточного перераспределения нового белка домена рекрутирования каспазы TMS1». Рак Рез . 60 (22): 6243–7. ПМИД   11103777 .
• Мартинон Ф, Хофманн К, Чопп Дж (2001). «Пириновый домен: возможный член семейства доменов смерти, участвующих в апоптозе и воспалении» . Курс. Биол . 11 (4): Р118-20. Бибкод : 2001CBio...11.R118M . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00056-2 . ПМИД   11250163 . S2CID   18564343 .
• Геддес Б.Дж., Ван Л., Хуанг В.Дж., Лавелли М., Манджи Г.А., Браун М., Юрман М., Цао Дж., Моргенштерн Дж., Мерриам С., Глюксманн М.А., ДиСтефано П.С., Бертин Дж. (2001). «Человеческий CARD12 — это новый член семейства CED4/Apaf-1, который индуцирует апоптоз». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 284 (1): 77–82. дои : 10.1006/bbrc.2001.4928 . ПМИД   11374873 .
• Ричардс Н., Шанер П., Диас А., Стаки Дж., Шелден Э., Вадхва А., Гумусио Д.Л. (2001). «Взаимодействие между пирином и белком апоптотического крапинка (ASC) модулирует апоптоз, индуцированный ASC» . Ж. Биол. Хим . 276 (42): 39320–9. дои : 10.1074/jbc.M104730200 . ПМИД   11498534 .
• Стимсон К.М., Вертино П.М. (2002). «Опосредованное метилированием молчание TMS1/ASC сопровождается гипоацетилированием гистонов и изменениями, локализованными в CpG-островках, в архитектуре хроматина» . Ж. Биол. Хим . 277 (7): 4951–8. дои : 10.1074/jbc.M109809200 . ПМИД   11733524 .
• Манджи Г.А., Ван Л., Геддес Б.Дж., Браун М., Мерриам С., Аль-Гарави А., Мак С., Лора Дж.М., Брискин М., Джурман М., Као Дж., ДиСтефано П.С., Бертин Дж. (2002). «PYPAF1, PYRIN-содержащий Apaf1-подобный белок, который собирается с ASC и регулирует активацию NF-каппа B» . Ж. Биол. Хим . 277 (13): 11570–5. дои : 10.1074/jbc.M112208200 . ПМИД   11786556 .
• Шринивасула С.М., Пойет Дж.Л., Размара М., Датта П., Чжан З., Алнемри Э.С. (2002). «Белок PYRIN-CARD ASC является активирующим адаптером каспазы-1» . Ж. Биол. Хим . 277 (24): 21119–22. дои : 10.1074/jbc.C200179200 . ПМИД   11967258 .
• Ван Л., Манджи Г.А., Гренье Дж.М., Аль-Гарави А., Мерриам С., Лора Дж.М., Геддес Б.Дж., Брискин М., ДиСтефано П.С., Бертин Дж. (2002). «PYPAF7, новый PYRIN-содержащий Apaf1-подобный белок, который регулирует активацию NF-каппа B и каспазо-зависимую обработку цитокинов» . Ж. Биол. Хим . 277 (33): 29874–80. дои : 10.1074/jbc.M203915200 . ПМИД   12019269 .
• Сиохара М., Танигучи С., Масумото Дж., Ясуи К., Койке К., Комияма А., Сагара Дж. (2002). «ASC, состоящий из PYD и CARD, регулируется воспалением и апоптозом нейтрофилов человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (5): 1314–8. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00384-4 . ПМИД   12054656 .
• Мартинон Ф., Бернс К., Чопп Дж. (2002). «Инфламмасома: молекулярная платформа, запускающая активацию воспалительных каспаз и процессинг proIL-бета» . Мол. Клетка . 10 (2): 417–26. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00599-3 . ПМИД   12191486 .
• Стелик С, Фиорентино Л, Дорфлейтнер А, Брюи Дж.М., Ариса Э.М., Сагара Дж., Рид Дж.К. (2002). «Белок ASC семейства PAAD/PYRIN является двойным регулятором консервативного этапа пути активации ядерного фактора каппаВ» . Дж. Эксп. Мед . 196 (12): 1605–15. дои : 10.1084/jem.20021552 . ПМК   2196065 . ПМИД   12486103 .
• Мориай Р., Цудзи Н., Кобаяши Д., Ягихаши А., Намики Ю., Такахаши Х., Ватанабэ Н. (2003). «Ген белка домена рекрутирования проапоптотической каспазы, TMS1, гиперметилирован при раке молочной железы и желудка человека». Противораковые рез . 22 (6С): 4163–8. ПМИД   12553049 .
• Даудс Т.А., Масумото Дж., Чен Ф.Ф., Огура Ю., Инохара Н., Нуньес Г. (2003). «Регуляция передачи сигналов криопирин/Pypaf1 с помощью пирина, продукта гена семейной средиземноморской лихорадки». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 302 (3): 575–80. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00221-3 . ПМИД   12615073 .
• Масумото Дж., Даудс Т.А., Шанер П., Чен Ф.Ф., Огура Ю., Ли М., Чжу Л., Кацуяма Т., Сагара Дж., Танигучи С., Гумусио Д.Л., Нуньес Г., Инохара Н. (2003). «ASC представляет собой активирующий адаптер для NF-каппа B и каспазы-8-зависимого апоптоза». Биохим. Биофиз. Рез. Коммуна 303 (1): 69–73. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00309-7 . ПМИД   12646168 .
• Стелик С., Краевска М., Уэлш К., Краевски С., Годзик А., Рид Дж.К. (2003). «Белок POP1/ASC2, содержащий только PAAD/PYRIN, является модулятором регуляции ASC-опосредованного ядерного фактора каппа B и прокаспазы-1» . Биохим. Дж . 373 (Часть 1): 101–13. дои : 10.1042/BJ20030304 . ПМЦ   1223462 . ПМИД   12656673 .
• Левин Дж. Дж., Стимсон-Кридер К.М., Вертино П.М. (2003). «Влияние метилирования на экспрессию TMS1/ASC в клетках рака молочной железы человека» . Онкоген . 22 (22): 3475–88. дои : 10.1038/sj.onc.1206430 . ПМИД   12776200 .