Хакробия
| Хакробия | |
|---|---|
 | |
| Кокколитофор . Gephyrocapsa Oceanica | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Эукариоты |
| Клэйд : | потогонные средства |
| Королевство: | Хромиста |
| Subkingdom: | Хакробия Окамото и др., 2009 г. |
| Группы | |
| Синонимы | |
| |
Комплекс криптомонад -гаптофитов - это предложенная, но оспариваемая монофилетическая группа. [1] одноклеточных эукариот , не входящих в супергруппу SAR . Для группы использовалось несколько альтернативных названий, в том числе Hacrobia (производное от «ha-», относящегося к Haptophyta, «-cr-», относящегося к криптомонадам, и «-bia» как общего суффикса, обозначающего жизнь ); [2] CCTH (расшифровывается как Cryptophyta, Centrohelida, Telonemia и Haptophyta); [3] и «Эукариомонады». [4]
По состоянию на февраль 2012 г. [update], неясно, является ли эта группа монофилетической или нет; результаты филогенетических исследований «часто зависят от выбора таксонов и набора генных данных». [3] Два исследования 2012 года дали противоположные результаты. [3] [5]
Члены
[ редактировать ]В прошлом гетероконты , гаптофиты и криптомонады иногда объединялись в группу, известную как хромисты . [6] Хотя гетероконты теперь разделены, в некоторых исследованиях Cryptophyta и Haptophyta считаются тесно связанными. [7] [8] (иногда их просто называют группой «Cryptophyta+Haptophyta»). [9] В статье 2009 года было высказано предположение, что телонемии и центрогелиды могут образовывать кладу с криптофитами и гаптофитами. [10] Пикобилифиты . могут принадлежать к этой группе, но они слишком плохо известны, чтобы их можно было с уверенностью классифицировать [2]
Несколько недавних исследований пришли к выводу, что Haptophyta и Cryptophyta не образуют монофилетическую группу. [11] Первые являются сестринской группой группы SAR , вторые кластеризуются с Archaeplastida (растениями в широком смысле). [5] По состоянию на февраль 2012 г. [update], остается неясным, образует ли Hacrobia монофилетическую группу. [3]
Еще одно исследование [12] предположил следующее расположение: центрохелиды родственны гаптофитам и образуют кладу Haptista ; Haptista — дочерняя группа SAR; Cryptista родственны Archaeplastida; и Хаптиста + SAR - это сестринская клада Криптиста + Археопластида.
Филогения
[ редактировать ]На основе работы Silar 2016. [13] [14]
| Хакробия |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сакагути М., Такисита К., Мацумото Т., Хашимото Т., Инагаки Ю. (июль 2009 г.). «Прослеживая эволюцию генов EFL в совокупности криптомонад-гаптофитов: отдельное происхождение генов EFL у гаптофитов, фотосинтетических криптомонад и гониомонад». Джин . 441 (1–2): 126–31. дои : 10.1016/j.gene.2008.05.010 . ПМИД 18585873 .
- ^ Jump up to: а б Окамото, Н.; Чантангси, К.; Горак, А.; Леандер, Б.; Килинг, П.; Стаич, Дж. Э. (2009). Стаич, Джейсон Э. (ред.). «Молекулярная филогения и описание нового Katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., а также создание таксона Hacrobia nov» . ПЛОС ОДИН . 4 (9): е7080. Бибкод : 2009PLoSO...4.7080O . дои : 10.1371/journal.pone.0007080 . ПМЦ 2741603 . ПМИД 19759916 .
- ^ Jump up to: а б с д Чжао, Сен; Бурки, Фабьен; Брате, Джон; Килинг, Патрик Дж.; Клавенесс, Даг ; Шалчиан-Тебризи, Кямран (2012). «Коллодиктион — древняя линия на древе эукариотов» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (6): 1557–68. дои : 10.1093/molbev/mss001 . ПМЦ 3351787 . ПМИД 22319147 .
- ^ «ЭУКАРИОМОНАДЫ» . Архивировано из оригинала 4 марта 2016 г. Проверено 01 марта 2015 г.
- ^ Jump up to: а б Бурки, Ф.; Окамото, Н.; Помберт, Дж. Ф. и Килинг, П. Дж. (2012). «Эволюционная история гаптофитов и криптофитов: филогеномные доказательства раздельного происхождения» . Учеб. Биол. Наука . 279 (1736): 2246–54. дои : 10.1098/rspb.2011.2301 . ПМК 3321700 . ПМИД 22298847 .
- ^ Чурёш М., Рогозин И.Б., Кунин Е.В. (май 2008 г.). «Гены, чрезвычайно богатые интронами у альвеолятных предков, выявленные с помощью гибкого подхода максимального правдоподобия». Мол. Биол. Эвол . 25 (5): 903–11. дои : 10.1093/molbev/msn039 . ПМИД 18296415 .
- ^ Райс Д.В., Палмер Дж.Д. (2006). «Исключительный горизонтальный перенос генов в пластидах: замена гена отдаленным бактериальным паралогом и свидетельство того, что гаптофитные и криптофитные пластиды являются сестрами» . БМК Биол . 4:31 . дои : 10.1186/1741-7007-4-31 . ПМК 1570145 . ПМИД 16956407 .
- ^ Аарон Орен; Р. Тейн Папке (1 июля 2010 г.). Молекулярная филогения микроорганизмов . Горизонт Научная Пресса. стр. 190–. ISBN 978-1-904455-67-7 . Проверено 21 января 2011 г.
- ^ Риб В.К., Пеглар М.Т., Юн Х.С. и др. (май 2009 г.). «Взаимоотношения хромальвеолатов внутри широко выборочного дерева фотосинтезирующих простейших». Мол. Филогенет. Эвол . 53 (1): 202–11. дои : 10.1016/j.ympev.2009.04.012 . ПМИД 19398025 .
- ^ Бурки, Ф; Инагаки, Ю; Броте, Дж; Арчибальд, Дж; Килинг, П; Кавальер-Смит, Т; Сакагути, М; Хасимото, Т; Горак, А; Кумар, С; Клавенесс, Д; Якобсен, К.С.; Павловский, Дж; Шалчиан-Тебризи, К. (2009). «Крупномасштабный филогеномный анализ показывает, что две загадочные линии протистов, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтезирующими хромальвеолатами» (бесплатный полный текст) . Геномная биология и эволюция . 1 : 231–8. дои : 10.1093/gbe/evp022 . ПМК 2817417 . ПМИД 20333193 .
- ^ Баурен, Денис; Бринкманн, Хеннер; Петерсен, Йорн; Родригес-Эспелета, Найара; Штехманн, Александра; Демулен, Винсент; Роджер, Эндрю Дж.; Бургер, Гертрауд; Ланг, Б. Франц и Филипп, Эрве (2010), «Филогеномные доказательства раздельного приобретения пластид у криптофитов, гаптофитов и страменопилов», Molecular Biology and Evolution , 27 (7): 1698–1709, doi : 10.1093/molbev/ msq059 , PMID 20194427
- ^ Бурки, Ф; Каплан, М; Тихоненков Д.В.; Златогурский, В; Минь, БК; Радайкина Л.В.; Смирнов А; Мыльников А.П.; Килинг, ПиДжей (2016). «Распутывание ранней диверсификации эукариот: филогеномное исследование эволюционного происхождения Centrohelida, Haptophyta и Cryptista» . Учебник по биологическим наукам . 283 (1823): 20152802. doi : 10.1098/rspb.2015.2802 . ПМК 4795036 . ПМИД 26817772 .
- ^ Силар, Филипп (2016), «Эукариотические протисты: происхождение, эволюция и биология эукариотических микробов» , HAL Archives-ouvertes : 1–462
- ^ Руджеро; и др. (2015), «Классификация всех живых организмов более высокого уровня», PLOS ONE , 10 (4): e0119248, Bibcode : 2015PLoSO..1019248R , doi : 10.1371/journal.pone.0119248 , PMC 4418965 , PMID 25923521
- ^ Кавальер-Смит, Т.; Чао, Э.Э.; Льюис, Р. (17 апреля 2018 г.), «Мультигенная филогения и клеточная эволюция хромистского инфрацарства Rhizaria: контрастирующая клеточная организация сестринских типов Cercozoa и Retaria», Protoplasma , 255 (5): 1517–1574, doi : 10.1007/s00709-018 -1241-1 , ПМК 6133090 , ПМИД 29666938
Внешние ссылки
[ редактировать ]