BE4B

BE4B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2KRE, 3L1X, 3L1Z
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE4B , E4, HDNB1, UBOX3, UFD2, UFD2A, фактор убиквитинирования E4B
Внешние идентификаторы	Опустить : 613565 ; МГИ : 1927086 ; Гомологен : 107623 ; Генные карты : UBE4B ; OMA : UBE4B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	10,181,239 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	149,426,749 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; skin of thigh; ; hair follicle; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; gastric mucosa; ; gastrocnemius muscle; ; inferior olivary nucleus; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; right adrenal cortex;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; secondary oocyte; ; zygote; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; yolk sac; ; facial motor nucleus; ; renal corpuscle; ; ureter;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ubiquitin protein ligase activity; ATPase binding; ubiquitin-protein transferase activity; enzyme binding; ATP binding; transferase activity; ubiquitin-ubiquitin ligase activity; protein binding;
Cellular component	ubiquitin ligase complex; nucleus; cytoplasm;
Biological process	protein monoubiquitination; response to endoplasmic reticulum stress; ventricular trabecula myocardium morphogenesis; protein ubiquitination; neuron projection development; granzyme-mediated apoptotic signaling pathway; response to UV; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein autoubiquitination; protein polyubiquitination; ubiquitin-dependent ERAD pathway; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10277
	63958
	ENSG00000130939
	ENSMUSG00000028960
	О95155
	Q9ES00
	НМ_001105562 ; НМ_006048
	НМ_022022
	НП_001099032 ; НП_006039
	НП_071305 ; НП_001391797 ; НП_001391798
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор конъюгации убиквитина E4 B представляет собой белок , который у человека кодируется UBE4B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют как минимум три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин , или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин , или E2, и убиквитин-белковые лигазы , или E3.

Этот ген кодирует дополнительный фактор конъюгации Е4, который участвует в сборке мультиубиквитиновой цепи. Этот ген также является наиболее сильным кандидатом в гены-супрессоры опухолей нейробластомы . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130939 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028960 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать крупные белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (3): 169–76. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .
^ Коегль М., Хоппе Т., Шленкер С., Ульрих Х.Д., Майер Т.У., Йентш С. (апрель 1999 г.). «Новый фактор убиквитинирования, Е4, участвует в сборке мультиубиквитиновой цепи» . Клетка . 96 (5): 635–44. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80574-7 . ПМИД 10089879 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор убиквитинирования UBE4B E4B (гомолог UFD2, дрожжи)» .

Дальнейшее чтение

Оньянго П., Лубёва Б., Гарделлин П. и др. (1998). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии пяти новых генов в хромосоме 1p36» . Геномика . 50 (2): 187–98. дои : 10.1006/geno.1997.5186 . ПМИД 9653645 .
Охира М., Кагеяма Х., Михара М. и др. (2000). «Идентификация и характеристика гомозиготно удаленной области размером 500 т.п.н. на участке 1p36.2-p36.3 в клеточной линии нейробластомы». Онкоген . 19 (37): 4302–7. дои : 10.1038/sj.onc.1203786 . ПМИД 10980605 . S2CID 24163907 .
Махони Дж.А., Один Дж.А., Уайт С.М. и др. (2002). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора полиубиквитинирования Ufd2p расщепляется каспазой 6 и гранзимом B во время апоптоза» . Биохим. Дж . 361 (Часть 3): 587–95. дои : 10.1042/0264-6021:3610587 . ПМЦ 1222341 . ПМИД 11802788 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Канеко С., Хатакеяма С., Мацумото М. и др. (2003). «Характеристика мышиного гена убиквитинлигазы UFD2a U-бокс-типа». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 300 (2): 297–304. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02834-6 . ПМИД 12504083 .
Крона С., Эйескэр К., Абель Ф. и др. (2003). «Скрининг генных мутаций в кандидатной области супрессора опухоли нейробластомы размером 500 т.п.н. в хромосоме 1p; мутация и стадийно-специфическая экспрессия в UBE4B / UFD2». Онкоген . 22 (15): 2343–51. дои : 10.1038/sj.onc.1206324 . ПМИД 12700669 . S2CID 7749013 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Окумура Ф., Хатакеяма С., Мацумото М. и др. (2005). «Функциональная регуляция FEZ1 с помощью убиквитинлигазы E4B U-бокс-типа способствует нейрогенезу» . Ж. Биол. Хим . 279 (51): 53533–43. дои : 10.1074/jbc.M402916200 . PMID 15466860 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека» . Природа . 441 (7091): 315–21. Бибкод : 2006Natur.441..315G . дои : 10.1038/nature04727 . ПМИД 16710414 .
Спинетт С., Махони Дж.А., Розен А. (2006). «Домен MPAC представляет собой новый митотически регулируемый домен, удаляемый апоптотическим расщеплением протеазы во время гибели клеток». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 347 (4): 1103–12. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.06.194 . ПМИД 16870146 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

UBE4B Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека UBE4B в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130939 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028960 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9734811-5] Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать крупные белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (3): 169–76. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .

[pmid10089879-6] Коегль М., Хоппе Т., Шленкер С., Ульрих Х.Д., Майер Т.У., Йентш С. (апрель 1999 г.). «Новый фактор убиквитинирования, Е4, участвует в сборке мультиубиквитиновой цепи» . Клетка . 96 (5): 635–44. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80574-7 . ПМИД 10089879 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор убиквитинирования UBE4B E4B (гомолог UFD2, дрожжи)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]