Manuel Corpas (ученый)
 | Эта биография живого человека нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( сентябрь 2019 г. ) |
Manuel Corpas | |
|---|---|
 Портрет Manuel Corpas | |
| Рожденный | Manuel Corpas Lopez |
| Альма -матер | Университет Наварры |
| Известен для | |
| Награды | Институт устойчивого развития программного обеспечения 2016 |
| Научная карьера | |
| Поля | Биоинформатика Геномика |
| Учреждения | |
| Тезис | Паттерны складывания в белковых последовательностях (2007) |
| Докторский советник | Терри Этвуд |
| Веб -сайт | |
Manuel Corpas -англо-испаничный биолог и предприниматель, известный главным образом за его вклад в область биоинформатики и геномики . В настоящее время Corpas является главным ученом Cambridge Startup Cambridge Precision Medicine, [ 1 ] Репетитор Института непрерывного образования в Кембриджском университете и лектор в Университете международной де -ла -Риоджи . Мануэль работал над человеческим геномом с самого начала своей карьеры, будучи одним из первых потребителей, которые последовали свой собственный геном и генома близких родственников, которые он опубликовал в качестве корпорации . [ 2 ] Он занимал должности в Институте Эрлхэма в качестве руководителя проекта и Института Wellcome Sanger , разрабатывая базу данных Decipher , базу данных, которая помогает диагностику пациентов с редкими геномными расстройствами.
Образование
[ редактировать ]Корпус получил степень бакалавра наук в области биологии в Университете Наварры в 2000 году. В 2007 году он получил докторскую степень в области биоинформатики в 2007 году под руководством профессора Терри Этвуда и доктора Стива Петтифер, изучающего эволюционную консервацию складок в белках . [ 3 ]
Академическая служба
[ редактировать ]Во время своего доктора философии начал Международный совет по вычислительной биологии (ISCBSC), [ 4 ] Международная организация вычислительной биологии студентов. Международное общество вычислительной биологии официально одобрило студенческий совет в 2004 году с помощью корпораций в качестве первого председателя. На сегодняшний день в студенческом совете есть многочисленные региональные студенческие группы по всему миру, касающиеся многих тысяч студентов в этой области. [ 5 ] [ 6 ] Corpas также организовал первый симпозиум Студенческого совета в области вычислительной биологии на Европейской конференции по вычислительной биологии в Мадриде (2005). Кроме того, он занимал должность председателя Первой конференции биоинформатики в Африке Африканским обществом биоинформатики и вычислительной биологии .
Исследования и карьера
[ редактировать ]После нескольких месяцев в Испанском национальном институте биоинформатики в Мадриде под руководством Альфонсо Валенсии и Европейского института биоинформатики в рамках Эвана Бирни , корпусы поселились в Институте Уэлкома Сэнгера в качестве застройщика базы данных расшифровки под надзором доктора Хелен В. Фирта. [ 7 ] С тех пор он работал в области исследований генома человека и личной геномики . За время своего пребывания в Институте Wellcome Sanger он первоначально сосредоточился на разработке инструментов интеграции и визуализации для интерпретации наборов данных о вариации числа копий. [ 8 ] [ 9 ] Некоторое время спустя он начал свою работу в « Корпозите ». [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Он был одним из первых, кто обнародовал в Интернете свой личный генотип от 23andme , назвав процесс «блог генома». [ 13 ] Вскоре после того, как его семья проанализировала свои генотипы, сначала используя 23 и данные, а затем технологию человеческого экзома и в последнее время весь геном. [ 14 ] Это привело к ряду важных публикаций в области личной геномики, [ 15 ] Выполнение первого краудсорсингового анализа семейства геномов. [ 16 ] В конце своего пребывания в Институте Сэнгера он организовал сообщество Biojavascript (Biojs), чтобы стать его координатором с 2012 по 2017 год. Сообщество Biojs является наибольшей попыткой на сегодняшний день в предоставлении веб -компонентов с открытым исходным кодом для биологической визуализации. Исследовательская группа Corpas была вовлечена в некоторые из наиболее важных разработок этого открытого программного сообщества. [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] Biojs включает в себя усилия ведущих мировых ресурсов, таких как Европейский институт биоинформатики , Лаборатория Беркли , Кембриджский университет и другие. Corpas успешно получила 5 стажировку для Google Summer of Code , которая катапультировала Biojs как международные усилия.
Corpas также был техническим координатором Elixir-UK, [ 20 ] Британская филиал Европейской сети Эликсира для биоинформатики и ресурсов данных. В течение своего времени в качестве технического координатора Elixir он участвовал в разработке лучших практик и стандартизированных метрик для измерения влияния ресурсов данных по всей Европе. За это время он также был вовлечен в глобальную организацию по обучению, образованию и обучению биоинформатики, [ 21 ] [ 22 ] Выступая в качестве председателя их технического комитета и разработки их учебного портала, который предоставляет учебные ресурсы с открытым доступом для сообщества биоинформатики.
Помимо своей работы в Cambridge Precision Medicine, Мануэль является репетитором в Кембриджского университета Институте непрерывного образования , [ 23 ] а также преподает онлайн -курсы по точной медицине как на английском, так и на испанском. Мануэль имеет более 50 рецензированных научных публикаций на его имя, [ 24 ] и книга Идеальная ДНК , [ 25 ] в котором он исследует более широкие проблемы, помимо науки о генетическом секвенировании.
Награды и награды
[ редактировать ]Corpas является научным сотрудником Института устойчивого развития программного обеспечения , [ 26 ] и частый докладчик на всемирно известных мероприятиях в геномике, таких как Festival of Genomics London, Biodata West, World Forum Longevity и другие. Он был каталогизирован как один из ведущих людей из Малаги (Испания), оказывающий влияние на мир. [ 27 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ "CPM - домашняя страница" . www.cpm.onl . Получено 2019-09-04 .
- ^ Corpas, Manuel (2013). "Корпозит" . Figshare. doi : 10.6084/m9.figshare.693052.v3 . Получено 2019-09-04 .
{{cite journal}}: CITE Journal требует|journal=( помощь ) - ^ Corpas, Manuel (2007). Складные паттерны в белковых последовательностях (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. doi : 10.6084/m9.figshare.964811.v1 .
- ^ Корпус, Мануэль (август 2005 г.). «Ученые и общества» . Природа . 436 (7054): 1204. doi : 10.1038/nj7054-1204b . ISSN 0028-0836 . PMID 16144051 . S2CID 186242202 .
- ^ "ISCB-SC RSGS" . Получено 1 февраля 2017 года .
- ^ Macintyre, Джефф (2013). «Региональная программа студенческой группы Студенческого совета ISCB: истории с дороги» . PLOS Computational Biology . 9 (9): E1003241. BIBCODE : 2013PLSCB ... 9E3241M . doi : 10.1371/journal.pcbi.1003241 . PMC 3784494 . PMID 24098107 .
- ^ www-core (webteam). «Хелен против Ферта» . www.sanger.ac.uk . Получено 2019-09-04 .
- ^ Firth HV, Richards SM, Bevan AP, Clayton S, Corpas M, et al. (Апрель 2009 г.). «Детифруется: база данных хромосомного дисбаланса и фенотипа у людей с использованием ресурсов ансамбля» . Являюсь. J. Hum. Генет . 84 (4): 524–33. doi : 10.1016/j.ajhg.2009.03.010 . PMC 2667985 . PMID 19344873 .
- ^ Swaminathan GJ; Брагин Е; Chatzimichali ea; Corpas M; и др. (2012). «Decipher: веб-ресурс сообщества для клинической интерпретации редких вариантов при расстройствах развития» . Гул Мол Генет . 21 (R1): R37 - R44. doi : 10.1093/hmg/dds362 . PMC 3459644 . PMID 22962312 .
- ^ Corpas M , Cariaso M, Coletta A, Weiss D, Harrison AP, Moran F, Yang H (12 ноября 2013 г.). «Полный набор данных геномики семьи общественных достояний». Biorxiv 10.1101/000216 .
- ^ Corpas, Manuel (2013). «Краудсорсинг корпорации» . Исходный код для биологии и медицины . 8 (1): 13. doi : 10.1186/1751-0473-8-13 . PMC 3706263 . PMID 23799911 .
- ^ Corpas M, Valdivia-Granda W, Torres N, Greshake B, Coletta A, Knaus A, Harrison AP, Cariaso M, Moran F, Nielsen F, Swan D, Weiss Solis Dy, Krawitz P, Schacherer F, Schols P, Yang H , Borry P, Glusman G, Robinson PN (ноябрь 2015). «Краудсорсинговый геномный анализ семейного квартета» . BMC Genomics . 16 (910): 910. DOI : 10.1186/S12864-015-1973-7 . PMC 4636840 . PMID 26547235 .
- ^ Corpas, Manuel (2012). «Манифест блоггера генома» . Гигаскаука . 1 (1): 15. doi : 10.1186/2047-217x-1-15 . PMC 3626510 . PMID 23587446 .
- ^ «Корпозирование в BMC» . blogss.biomedcentral.com . 28 июня 2013 года . Получено 2020-09-29 .
- ^ Corpas M (июнь 2012 г.). «Семейный опыт личной геномики» . Журнал генетического консультирования . 21 (3): 386–391. doi : 10.1007/s10897-011-9473-7 . PMC 134180 . PMID 22223063 .
- ^ «Держать это в семье» . www.sciencemag.org . Получено 13 августа 2012 года .
- ^ Корпус ; Хименес, Рафаэль; Углерод, Сет Дж; Гарсия, Алекс; Гарсия, Лейла; Голдберг, Татьяна; Гомес, Джон; Калдеримис, Алексис; Льюис, Сюзанна Э; Малвани, Ян; Павлик, Александра; Роуленд, Фрэнсис; Салазар, Густаво; Шрайбер, Фабиан; Силлито, Ян; Спунер, Уильям Х; Спасибо, Анил; Villaveces, Хосе М; Яхдав, парень; Hermjakob, Henning (2014). «Biojs: стандарт с открытым исходным кодом для биологической визуализации - его статус в 2014 году» . F1000Research . 3 : 55. doi : 10.12688/f1000research.3-55.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4103492 . PMID 25075290 .
- ^ Спасибо, Анил С.; Caim, Shabhonam; Корпус, Мануэль ; Дэйви, Роберт П. (2014). «DnacontentViewer Компонент Biojs для визуализации GC/AT Content» . F1000Research . 3 : 54. DOI : 10.12688/f1000research.3-54.v1 . ISSN 2046-1402 .
- ^ Спасибо, Анил С.; Хименес, Рафаэль С.; Kaithakottil, Gemy G.; Корпус, Мануэль ; Дэйви, Роберт П. (2014). «Wigexplorer, компонент Biojs для визуализации данных париков» . F1000Research . 3 : 53. doi : 10.12688/f1000research.3-53.v2 . ISSN 2046-1402 . PMC 5054804 . PMID 27781080 .
- ^ «Эликсир-юк-инфраструктура жизни в области жизни в Великобритании для биологической информации» . Получено 2019-09-04 .
- ^ «Комитеты | Гобет» . www.mygoblet.org . 16 ноября 2014 года . Получено 24 августа 2016 года .
- ^ Корпус, м .; Хименес, RC; Bongcam-Rudloff, e .; Budd, A.; Бразас, MD; Фернандес, PL; Van Gelder, C.; Korpelainen, E.; Lewitter, F.; McGrath, A.; Маклин, Д.; Палаги, П.; Ротер, К.; Тейлор, Дж.; Вдали, а.; Уотсон, М.; Schneider, MV; Attwood, TK (2015). «Портал обучения кубочек: глобальный репозиторий учебных материалов, курсов и тренеров биоинформатики» . Биоинформатика . 31 (1): 140–142. Doi : 10.1093/bioinformatics/btu601 . PMC 4271145 . PMID 25189782 .
- ^ «Manuel Corpas - Институт непрерывного образования (ICE)» . Ice.cam.ac.uk. 12 июля 2018 года . Получено 2020-09-29 .
- ^ "Manuel Corpas - цитаты Google Scholar" . Scholar.google.com . Получено 2019-09-04 .
- ^ Manuel Corpas (2016). Идеальная ДНК . Кембридж: Днадидест. ISBN 978-1539783725 .
- ^ «Коллеги -институт устойчивого развития программного обеспечения» . Software.ac.uk . 2016 Получено 2020-09-29 .
- ^ Сегодня Малага (2016-04-10). «Числа 1 Малага» . Малага сегодня (на испанском) . Получено 2019-09-04 .
