ЛИН28
| ЛИН28А | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | LIN28A , CSDD1, LIN-28, LIN28, ZCCHC1, lin-28A, гомолог A lin-28, Lin28a, LIN28A (ген), гомолог A Lin-28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 611043 ; МГИ : 1890546 ; Гомологен : 32592 ; Генные карты : LIN28A ; ОМА : LIN28A — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Гомолог А Lin-28 представляет собой белок , который у человека кодируется LIN28 геном . [5] [6]
LIN28 кодирует РНК -связывающий белок. [7] который связывается и усиливает трансляцию IGF-2 (инсулиноподобного фактора роста 2) мРНК . [8] Lin28 связывается с let-7 пре- микроРНК и блокирует выработку зрелой микроРНК let-7 в эмбриональных стволовых клетках мыши . [9] [10] В плюрипотентных клетках эмбриональной карциномы LIN28 локализуется в рибосомах , Р-тельцах и стрессовых гранулах . [11]
Функция
[ редактировать ]Экспрессия стволовых клеток
[ редактировать ]Считается, что LIN28 регулирует самообновление стволовых клеток . У Caenorhabditis elegans экспрессируется только один ген Lin28, а у позвоночных присутствуют два паралога: Lin28a и Lin28b . У нематод LIN28 гомолог lin-28 представляет собой гетерохронный ген, который определяет начало ранних личиночных стадий развития C. elegans путем регуляции самообновления стволовых клеток нематоды в коже (называемых клетками шва) и вульвы ( называемые VPC) во время разработки. [12] У мышей LIN28 высоко экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках мыши и во время раннего эмбриогенеза . [13]
LIN28 высоко экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках человека. [14] и может повысить эффективность образования индуцированных плюрипотентных стволовых ( iPS ) клеток из фибробластов человека . [15]
Половое созревание
[ редактировать ]Сверхэкспрессия LIN28 у мышей может вызывать гигантизм и задержку наступления полового созревания , что согласуется с исследованиями общегеномных ассоциаций человека , предполагающими, что полиморфизмы в гене LIN28B человека связаны с ростом человека и сроками полового созревания . [16] Мутации в LIN28B связаны с преждевременным половым созреванием . [17]
LIN28 может регулировать гомеостаз глюкозы у млекопитающих путем увеличения передачи сигналов инсулина - PI3K - mTOR и чувствительности к инсулину, тем самым способствуя устойчивости к ожирению, вызванному диетой с высоким содержанием жиров, и 2 типа диабету . [18] Было замечено, что аберрантная экспрессия LIN28 регулирует аэробный гликолиз, способствуя пролиферации рака.
Регенерация тканей
[ редактировать ]Мыши, генетически измененные для выработки LIN28 в течение всей жизни, показали улучшение роста волос. [19] и регенерация здоровых тканей на дополнительных колотых ранах [19] на более поздних этапах жизни. [19] Хотя мыши могли регенерировать конечности, они не могли восстанавливать поврежденную сердечную ткань. Соответствующие лекарства воспроизвели регенерацию у неизмененных мышей, используя те же метаболические пути. Препараты увеличили скорость метаболизма субъектов, очевидно, заставляя организм восстанавливаться быстрее. Эффекты активации Lin28a исчезли с возрастом. [19] [20]
Структура
[ редактировать ]Модели комплексов Lin28/let-7, полученные с помощью рентгеновской кристаллографии и ЯМР, показывают, что два свернутых домена Lin28 распознают две разные области РНК . [21] [22] Домены достаточны для ингибирования let-7 in vivo . [10] [23]
Приложения
[ редактировать ]LIN28 — маркер недифференцированных эмбриональных стволовых клеток человека. [14] и использовался для повышения эффективности образования iPS-клеток из фибробластов человека . [15]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131914 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050966 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Мосс Э.Г., Тан Л. (июнь 2003 г.). «Консервация гетерохронного регулятора Lin-28, его экспрессия в процессе развития и комплементарные сайты микроРНК» . Биология развития . 258 (2): 432–42. дои : 10.1016/S0012-1606(03)00126-X . ПМИД 12798299 .
- ^ «Ген Энтрез: гомолог LIN28 lin-28 (C. elegans)» .
- ^ Циаликас Дж., Ромер-Зайберт Дж. (июль 2015 г.). «LIN28: роли и регулирование в развитии и за его пределами» . Разработка . 142 (14): 2397–404. дои : 10.1242/dev.117580 . ПМИД 26199409 .
- ^ Полесская А., Кювелье С., Нагубнева И., Дюке А., Мосс Э.Г., Арель-Беллан А. (май 2007 г.). «Lin-28 связывает мРНК IGF-2 и участвует в скелетном миогенезе за счет повышения эффективности трансляции» . Гены и развитие . 21 (9): 1125–38. дои : 10.1101/gad.415007 . ПМЦ 1855237 . ПМИД 17473174 .
- ^ Вишванатан С.Р., Дейли GQ, Грегори Р.И. (апрель 2008 г.). «Селективная блокада процессинга микроРНК Lin28» . Наука . 320 (5872): 97–100. Бибкод : 2008Sci...320...97V . дои : 10.1126/science.1154040 . ПМК 3368499 . ПМИД 18292307 .
- ^ Jump up to: а б Али П.С., Гошдастидер У., Хоффманн Дж., Брутши Б., Филипек С. (ноябрь 2012 г.). «Распознавание предшественника микроРНК let-7g человеческим Lin28B» . Письма ФЭБС . 586 (22): 3986–90. дои : 10.1016/j.febslet.2012.09.034 . ПМИД 23063642 . S2CID 28899778 .
- ^ Бальцер Э., Мосс Э.Г. (2007). «Локализация регулятора времени развития Lin28 в комплексах мРНП, P-тельцах и стрессовых гранулах». Биология РНК . 4 (1): 16–25. дои : 10.4161/rna.4.1.4364 . ПМИД 17617744 . S2CID 23979766 .
- ^ Мосс Э.Г., Ли Р.К., Амброс В. (март 1997 г.). «Белок домена холодового шока LIN-28 контролирует сроки развития C. elegans и регулируется РНК lin-4» . Клетка . 88 (5): 637–46. дои : 10.1016/s0092-8674(00)81906-6 . ПМИД 9054503 . S2CID 13248841 .
- ^ Ян Д.Х., Мосс Э.Г. (декабрь 2003 г.). «Временно регулируемая экспрессия Lin-28 в различных тканях развивающейся мыши». Паттерны экспрессии генов . 3 (6): 719–26. дои : 10.1016/s1567-133x(03)00140-6 . ПМИД 14643679 .
- ^ Jump up to: а б Ричардс М., Тан С.П., Тан Дж.Х., Чан В.К., Бонгсо А. (2004). «Профиль транскриптома эмбриональных стволовых клеток человека, определенный SAGE» . Стволовые клетки . 22 (1): 51–64. doi : 10.1634/stemcells.22-1-51 . ПМИД 14688391 .
- ^ Jump up to: а б Ю Дж., Водяник М.А., Смуга-Отто К., Антосевич-Бурже Дж., Фране Дж.Л., Тиан С., Ни Дж., Йонсдоттир Г.А., Руотти В., Стюарт Р., Слюквин II, Томсон Дж.А. (декабрь 2007 г.). «Индуцированные плюрипотентные линии стволовых клеток, полученные из соматических клеток человека». Наука . 318 (5858): 1917–20. Бибкод : 2007Sci...318.1917Y . дои : 10.1126/science.1151526 . ПМИД 18029452 . S2CID 86129154 .
- ^ Чжу Х, Шах С, Шых-Чанг Н, Шинода Г, Эйнхорн В.С., Вишванатан С.Р., Такеучи А., Граземанн С., Ринн Дж.Л., Лопес М.Ф., Хиршхорн Дж.Н., Палмерт М.Р., Дейли Г.К. (июль 2010 г.). «Трансгенные мыши Lin28a проявляют фенотипы размера и полового созревания, выявленные в исследованиях генетических ассоциаций человека» . Природная генетика . 42 (7): 626–30. дои : 10.1038/ng.593 . ПМК 3069638 . ПМИД 20512147 .
- ^ Пак С.В., Ли С.Т., Сон Ю.Б., Чо С.И., Ким Ш., Ким С.Дж., Ким Ч.Х., Ко А.Р., Пайк К.Х., Ким Дж.В., Джин Д.К. (октябрь 2012 г.). «Полиморфизмы LIN28B связаны с центральным преждевременным половым созреванием и ранним половым созреванием у девочек» . Корейский журнал педиатрии . 55 (10): 388–92. дои : 10.3345/kjp.2012.55.10.388 . ПМЦ 3488615 . ПМИД 23133486 .
- ^ Чжу Х, Шых-Чанг Н, Сегре А.В., Шинода Г., Шах С.П., Эйнхорн В.С., Такеучи А., Энгрейтц Дж.М., Хаган Дж.П., Харас М.Г., Урбах А., Торнтон Дж.Е., Трибуле Р., Грегори Р.И., Альтшулер Д., Дейли Г.К. ( сентябрь 2011 г.). «Ось Lin28/let-7 регулирует метаболизм глюкозы» . Клетка . 147 (1): 81–94. дои : 10.1016/j.cell.2011.08.033 . ПМЦ 3353524 . ПМИД 21962509 .
- ^ Jump up to: а б с д Шых-Чанг Н., Чжу Х., Иванка де Сойса Т., Шинода Г., Селигсон М.Т., Цанов К.М., Нгуен Л., Асара Дж.М., Кэнтли Л.С., Дейли GQ (ноябрь 2013 г.). «Lin28 улучшает восстановление тканей путем перепрограммирования клеточного метаболизма» . Клетка . 155 (4): 778–792. дои : 10.1016/j.cell.2013.09.059 . ПМЦ 3917449 . ПМИД 24209617 .
- Fine D (7 ноября 2013 г.). «Новые открытия в области регенерации конечностей удивляют ученых» . Научный американец .
- ^ Шых-Чанг Н., Дейли GQ (апрель 2013 г.). «Lin28: основной регулятор роста и метаболизма стволовых клеток» . Клеточная стволовая клетка . 12 (4): 395–406. дои : 10.1016/j.stem.2013.03.005 . ПМЦ 3652335 . ПМИД 23561442 .
- ^ Нам Ю, Чен С., Грегори Р.И., Чоу Дж.Дж., Слиз П. (ноябрь 2011 г.). «Молекулярные основы взаимодействия микроРНК let-7 с Lin28» . Клетка . 147 (5): 1080–1091. дои : 10.1016/j.cell.2011.10.020 . ПМЦ 3277843 . ПМИД 22078496 .
- ^ Лафлин Ф.Е., Геберт Л.Ф., Таубин Х., Бруншвайгер А., Холл Дж., Аллен Ф.Х. (11 декабря 2011 г.). «Структурная основа распознавания микроРНК pre-let-7 цинковыми костяшками фактора плюрипотентности Lin28». Структурная и молекулярная биология природы . 19 (1): 84–89. дои : 10.1038/nsmb.2202 . ПМИД 22157959 . S2CID 2201304 .
- ^ PDB : 3TS2 ; Нам Ю, Чен С., Грегори Р.И., Чоу Дж.Дж., Слиз П. (ноябрь 2011 г.). «Молекулярные основы взаимодействия микроРНК let-7 с Lin28» . Клетка . 147 (5): 1080–91. дои : 10.1016/j.cell.2011.10.020 . ПМЦ 3277843 . ПМИД 22078496 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ричардс М., Тан С.П., Тан Дж.Х., Чан В.К., Бонгсо А. (2004). «Профиль транскриптома эмбриональных стволовых клеток человека, определенный SAGE» . Стволовые клетки . 22 (1): 51–64. doi : 10.1634/stemcells.22-1-51 . ПМИД 14688391 .
- Семпере Л.Ф., Фримантл С., Пита-Роу И., Мосс Э., Дмитровский Э., Амброс В. (2004). «Профилирование экспрессии микроРНК млекопитающих открывает подмножество экспрессируемых в мозге микроРНК, которые могут играть важную роль в дифференцировке нейронов мыши и человека» . Геномная биология . 5 (3): Р13. дои : 10.1186/gb-2004-5-3-r13 . ПМЦ 395763 . ПМИД 15003116 .
- Герехт-Нир С., Дазард Дж.Э., Голан-Машиах М., Озенберг С., Ботвинник А., Амариглио Н., Домани Е., Рехави Г., Гивол Д., Ицковиц-Элдор Дж. (февраль 2005 г.). «Экспрессия сосудистых генов и фенотипическая корреляция во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток человека» . Динамика развития . 232 (2): 487–97. дои : 10.1002/dvdy.20247 . ПМИД 15614775 . S2CID 3006762 .
- Ли Ю.С., Ким Х.К., Чунг С., Ким К.С., Датта А. (апрель 2005 г.). «Истощение человеческой микроРНК miR-125b показывает, что она имеет решающее значение для пролиферации дифференцированных клеток, но не для подавления предполагаемых мишеней во время дифференцировки» . Журнал биологической химии . 280 (17): 16635–41. дои : 10.1074/jbc.M412247200 . ПМИД 15722555 .
- Ву Л, Беласко Дж. Г. (ноябрь 2005 г.). «Регуляция микро-РНК гена lin-28 млекопитающих во время нейрональной дифференцировки клеток эмбриональной карциномы» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (21): 9198–208. дои : 10.1128/MCB.25.21.9198-9208.2005 . ПМЦ 1265813 . ПМИД 16227573 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9H9Z2 (гомолог A белка lin-28) на PDBe-KB .
галерея PDB |
|---|
