СПОП

СПОП
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2CR2, 3HQH, 3HQI, 3HQL, 3HQM, 3HTM, 3HU6, 3IVB, 3IVQ, 3IVV, 4EOZ, 4HS2, 4J8Z, 4O1V
Идентификаторы
Псевдонимы	SPOP , BTBD32, TEF2, белок спекл-типа BTB/POZ, NEDMIDF, NSDVS1, NSDVS2, NEDMACE
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602650 ; МГИ : 1343085 ; Гомологен : 68354 ; GeneCards : СПОП ; ОМА : СПОП – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	49,678,163 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	95,384,232 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	nipple; ; muscle layer of sigmoid colon; ; saphenous vein; ; pylorus; ; seminal vesicula; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; urethra; ; cardia; ; smooth muscle tissue;
	Top expressed in
	temporal muscle; ; triceps brachii muscle; ; cerebellar vermis; ; ankle; ; lobe of cerebellum; ; sternocleidomastoid muscle; ; neural layer of retina; ; digastric muscle; ; parotid gland; ; blood;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	Cul3-RING ubiquitin ligase complex; nuclear speck; nucleus; nucleoplasm; cytoplasm; SCF ubiquitin ligase complex;
Biological process	protein ubiquitination; regulation of proteolysis; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; glucose homeostasis; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8405
	20747
	ENSG00000121067
	ENSMUSG00000057522
	О43791
	Q6ZWS8
showНМ_001007226 ; НМ_001007227 ; НМ_001007228 ; НМ_001007229 ; НМ_001007230 ;
	NM_003563; NM_001370730; NM_001370731; NM_001370732
	НМ_025287 ; НМ_001359107
showНП_001007227 ; НП_001007228 ; НП_001007229 ; НП_001007230 ; НП_001007231 ;
	NP_003554; NP_001357659; NP_001357660; NP_001357661
	НП_079563 ; НП_001346036
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок POZ спекл-типа — это белок , который у человека кодируется SPOP геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует белок , который может модулировать активность репрессии транскрипции белка 6, ассоциированного со смертью ( DAXX ), который взаимодействует с деацетилазой гистонов , коровыми гистонами и другими белками, ассоциированными с гистонами. У мышей кодируемый белок связывается с предполагаемым лейциновой молнии доменом макроH2A1.2, варианта гистона H2A, который обогащен инактивированными Х-хромосомами. Было показано, что домен BTB/POZ этого белка в других белках опосредует репрессию транскрипции и взаимодействует с компонентами ко-репрессорных комплексов гистондеацетилазы. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию нескольких вариантов транскрипта, кодирующих один и тот же белок. ^{[ 7 ]}

Клиническая значимость

Мутации в SPOP приводят к типу опухоли простаты, которая, как считается, встречается примерно в 15% всех случаев рака простаты . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000121067 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057522 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагай Ю., Кодзима Т., Уолл Ю., Хачия Т., Нисидзава Ю., Вакабаяши Т., Хагивара М. (ноябрь 1997 г.). «Идентификация нового ядерного белка спекл-типа, SPOP» . Письма ФЭБС . 418 (1–2): 23–6. дои : 10.1016/S0014-5793(97) 01340-9 ПМИД 9414087 . S2CID 32204506 .
^ Сапата Дж. М., Павловски К., Хаас Э., Уэр К. Ф., Годзик А., Рид Дж. К. (июнь 2001 г.). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли» . Журнал биологической химии . 276 (26): 24242–52. дои : 10.1074/jbc.M100354200 . ПМИД 11279055 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок POZ SPOP спекл-типа» .
^ Хайди Эванс (20 мая 2012 г.). «Ученые обнаружили новый тип рака простаты – это открытие может привести к разработке индивидуального лечения» . Нью-Йорк Дейли Ньюс . Проверено 20 мая 2012 г.
^ Барбьери С.Э., Бака С.С., Лоуренс М.С., Демикелис Ф., Блаттнер М., Теурийя Дж.П., Уайт Т.А., Стоянов П., Ван Аллен Е., Странски Н., Никерсон Е., Че С.С., Бойсен Г., Оклер Д., Онофрио Р.К., Парк К., Китабаяши Н, Макдональд Т., Шейх К., Вуонг Т., Гуидуччи С., Цибульскис К., Сиваченко А., Картер С.Л., Саксена Г., Воет Д., Хуссейн В.М., Рамос А.Х., Винклер В., Редман М.К., Ардли К., Тевари А.К., Москера Дж.М., Рупп Н., Уайлд П.Дж., Мох Х., Моррисси С., Нельсон П.С., Кантофф П.В., Габриэль С.Б., Голуб Т.Р., Мейерсон М., Ландер Э.С., Гетц Г., Рубин М.А., Гаррауэй Л.А. (июнь 2012 г.). «Секвенирование экзома выявляет рецидивирующие мутации SPOP, FOXA1 и MED12 при раке простаты» . Природная генетика . 44 (6): 685–9. дои : 10.1038/ng.2279 . ПМК 3673022 . ПМИД 22610119 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ву Дж., Сонг Ю., Баккер А.Б., Бауэр С., Спайс Т., Ланье Л.Л., Филлипс Дж.Х. (июль 1999 г.). «Активирующий иммунорецепторный комплекс, образованный NKG2D и DAP10». Наука . 285 (5428): 730–2. дои : 10.1126/science.285.5428.730 . ПМИД 10426994 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Сапата Дж. М., Павловски К., Хаас Э., Уэр К. Ф., Годзик А., Рид Дж. К. (июнь 2001 г.). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли» . Журнал биологической химии . 276 (26): 24242–52. дои : 10.1074/jbc.M100354200 . ПМИД 11279055 .
Такахаши И., Камеока Ю., Хасимото К. (август 2002 г.). «МакроH2A1.2 связывает ядерный белок Spop» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1591 (1–3): 63–8. дои : 10.1016/S0167-4889(02) 00249-5 ПМИД 12183056 .
Гилфиллан С., Хо Э.Л., Селла М., Ёкояма В.М., Колонна М. (декабрь 2002 г.). «NKG2D задействует два разных адаптера для запуска активации и костимуляции NK-клеток» . Природная иммунология . 3 (12): 1150–5. дои : 10.1038/ni857 . ПМИД 12426564 . S2CID 5859797 .
Дифенбах А., Томаселло Э., Лукас М., Джеймисон А.М., Ся Дж.К., Вивье Э., Раулет Д.Х. (декабрь 2002 г.). «Селективные ассоциации с сигнальными белками определяют стимулирующую и костимулирующую активность NKG2D». Природная иммунология . 3 (12): 1142–9. дои : 10.1038/ni858 . ПМИД 12426565 . S2CID 14901451 .
Билладо Д.Д., Апшоу Дж.Л., Шун Р.А., Дик СиДжей, Лейбсон П.Дж. (июнь 2003 г.). «NKG2D-DAP10 запускает уничтожение, опосредованное NK-клетками человека, посредством Syk-независимого регуляторного пути». Природная иммунология . 4 (6): 557–64. дои : 10.1038/ni929 . ПМИД 12740575 . S2CID 7699074 .
Лю А., Десаи Б.М., Стофферс Д.А. (май 2004 г.). «Идентификация PCIF1, белка домена POZ, который ингибирует транскрипционную активность PDX-1 (MODY4)» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (10): 4372–83. дои : 10.1128/MCB.24.10.4372-4383.2004 . ПМК 400448 . ПМИД 15121856 .
Ла М, Ким К., Пак Дж., Вон Дж., Ли Дж. Х., Фу Ю. М., Медоуз Г. Г., Джо Ко (июль 2004 г.). «Daxx-опосредованная репрессия транскрипции гена MMP1 устраняется SPOP». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 320 (3): 760–5. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.06.022 . hdl : 10203/14362 . ПМИД 15240113 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Эрнандес-Муньос И., Лунд А.Х., ван дер Ступ П., Бутсма Э., Мюйрерс И., Верховен Е., Нусинов Д.А., Паннинг Б., Мараренс Ю., ван Лохуизен М. (май 2005 г.). «Стабильная инактивация Х-хромосомы включает комплекс PRC1 Polycomb и требует гистона MACROH2A1 и лигазы убиквитина E3 CULLIN3/SPOP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (21): 7635–40. дои : 10.1073/pnas.0408918102 . ПМК 1140410 . ПМИД 15897469 .
Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000121067 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057522 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9414087-5] Нагай Ю., Кодзима Т., Уолл Ю., Хачия Т., Нисидзава Ю., Вакабаяши Т., Хагивара М. (ноябрь 1997 г.). «Идентификация нового ядерного белка спекл-типа, SPOP» . Письма ФЭБС . 418 (1–2): 23–6. дои : 10.1016/S0014-5793(97) 01340-9 ПМИД 9414087 . S2CID 32204506 .

[pmid11279055-6] Сапата Дж. М., Павловски К., Хаас Э., Уэр К. Ф., Годзик А., Рид Дж. К. (июнь 2001 г.). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли» . Журнал биологической химии . 276 (26): 24242–52. дои : 10.1074/jbc.M100354200 . ПМИД 11279055 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок POZ SPOP спекл-типа» .

[NYDNHeidiEvans-8] Хайди Эванс (20 мая 2012 г.). «Ученые обнаружили новый тип рака простаты – это открытие может привести к разработке индивидуального лечения» . Нью-Йорк Дейли Ньюс . Проверено 20 мая 2012 г.

[doi.10.1038/ng.2279-9] Барбьери С.Э., Бака С.С., Лоуренс М.С., Демикелис Ф., Блаттнер М., Теурийя Дж.П., Уайт Т.А., Стоянов П., Ван Аллен Е., Странски Н., Никерсон Е., Че С.С., Бойсен Г., Оклер Д., Онофрио Р.К., Парк К., Китабаяши Н, Макдональд Т., Шейх К., Вуонг Т., Гуидуччи С., Цибульскис К., Сиваченко А., Картер С.Л., Саксена Г., Воет Д., Хуссейн В.М., Рамос А.Х., Винклер В., Редман М.К., Ардли К., Тевари А.К., Москера Дж.М., Рупп Н., Уайлд П.Дж., Мох Х., Моррисси С., Нельсон П.С., Кантофф П.В., Габриэль С.Б., Голуб Т.Р., Мейерсон М., Ландер Э.С., Гетц Г., Рубин М.А., Гаррауэй Л.А. (июнь 2012 г.). «Секвенирование экзома выявляет рецидивирующие мутации SPOP, FOXA1 и MED12 при раке простаты» . Природная генетика . 44 (6): 685–9. дои : 10.1038/ng.2279 . ПМК 3673022 . ПМИД 22610119 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]