микобактерий туберкулеза Комплекс

Комплекс микобактерий туберкулеза видов микобактерий ( MTC или MTBC ) представляет собой генетически родственную группу , которые могут вызывать туберкулез у людей или других животных.

Он включает в себя:

Кроме того, существуют две ветви, которые имеют филогенетическое сходство, но не полностью описаны: бациллы маргаритки и сернобыка. Недавно бациллы Oryx были выделены в отдельный подвид orygis. ^[1]

Членов MTC можно отличить от всех других бактерий по наличию 63 консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в различных белках, которые являются общими исключительно для этих патогенов. ^[4] Благодаря своей эксклюзивности для комплекса МТС и присутствию в высококонсервативных участках белков эти CSI предоставляют новые средства для функциональных и диагностических исследований (включая потенциальные мишени для разработки новых терапевтических средств). ^[4]

С 2018 г. все представители этого видового комплекса считаются синонимами M.tuberculosis по бактериальной номенклатуре. В статье IJSEM сообщается, что M. africanum , M. bovis , M. caprae , M. pinnipedii на 99,21–99,92% идентичны M. Tuberculosis на уровне всего генома, что не соответствует критериям, позволяющим считаться независимыми видами. То же самое относится к «M. canetti», «M. mungi» и «M. orygis», видам, которые официально не опубликованы. Вариация даже ниже принятого уровня для подвидов. Авторы статьи отмечают, что эти названия действительно относятся к стабильным линиям со значимыми клиническими различиями, и рекомендуют превратить их в варианты: M. bovis станет M.tuberculosis var. бовис , например. ^[5]

Филогенетика

По мере того как MTBC расходился по разным линиям, происходила и экспрессия ключевых и метаболических патогенных генов в результате мутаций, приводящих к появлению новых TANNNT-боксов Прибнова, и мутаций, которые нарушают функцию репрессоров транскрипции. Это дает четкое доказательство того, что линии MTBC, вероятно, отражают адаптацию к различным человеческим популяциям. Фактически, изменение экспрессии генов может стать быстрым механизмом физиологической адаптации к новой среде без необходимости существенного изменения генома. ^[6]

Это можно увидеть в том, что разные клады MTBC имеют свою собственную транскриптомную подпись. Даже одноточечные мутации могут полностью изменить транскрипционный профиль штамма. Примером может служить штамм N1177, который несет единственную мутацию в гене rpoB, которая придает устойчивость к рифампицину и изменяет уровни транскрипции нескольких генов. ^[6]

Роль метилирования более неуловима, паттерн инактивации мутаций, по-видимому, подтверждает, что метилазы не сохраняются на протяжении всего mtBC. Транскрипционная адаптация может позволить изолятам M. Tuberculosis оптимизировать свою инфекционность и передачу в слегка различающихся средах, обеспечиваемых разными популяциями людей-хозяев. ^[6]

См. также

Нетуберкулезные микобактерии

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ван Инген Дж., Рахим З., Малдер А., Бори М.Дж., Симеоне Р., Брош Р., ван Соолинген Д. (апрель 2012 г.). «Характеристика Mycobacterium orygis как сложного подвида M. Tuberculosis» . Новые инфекционные заболевания . 18 (4): 653–5. дои : 10.3201/eid1804.110888 . ПМК 3309669 . ПМИД 22469053 .
^ Паттерсон С., Дрю Дж. А., Пфайффер Д.Ю., Клаттон-Брок Т.Х. (2017). «Социальные и экологические факторы влияют на смертность диких сурикатов, связанную с туберкулезом» . Журнал экологии животных . 86 (3): 442–450. Бибкод : 2017JAnEc..86..442P . дои : 10.1111/1365-2656.12649 . ПМЦ 5413830 . ПМИД 28186336 .
^ Васконселлос С.Е., Хуард Р.К., Ниманн С., Кремер К., Сантос А.Р., Суффис П.Н., Хо Дж.Л. (март 2010 г.). «Различные генотипические профили двух основных клад Mycobacterium africanum» . БМК Инфекционные болезни . 10:80 . дои : 10.1186/1471-2334-10-80 . ПМЦ 2859774 . ПМИД 20350321 .
^ Jump up to: ^а ^б Гупта, Рэдхи С. (2 октября 2018 г.). «Влияние геномики на выяснение эволюционных взаимоотношений между микобактериями: идентификация молекулярных сигнатур, специфичных для туберкулезного комплекса бактерий, с потенциальным применением для новой диагностики и терапии» . Высокая пропускная способность . 7 (4): 31. дои : 10.3390/ht7040031 . ISSN 2571-5135 . ПМК 6306742 . ПМИД 30279355 .
^ Риохас, Марко А.; Макгоф, Катя Дж.; Райдер-Риохас, Кристин Дж.; Растоги, Налин; Хасбон, Мансур Эрнандо (1 января 2018 г.). «Филогеномный анализ видов комплекса микобактерий туберкулеза показывает, что Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis, Mycobacterium caprae, Mycobacterium microti и Mycobacterium pinnipedii являются более поздними гетеротипическими синонимами микобактерии туберкулеза» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (1): 324–332. дои : 10.1099/ijsem.0.002507 . ПМИД 29205127 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Чинер-Омс А, Берни М., Бойнетт С., Гонсалес-Канделас Ф., Янг Д.Б., Ганье С. и др. (сентябрь 2019 г.). «Общегеномные мутационные искажения способствуют транскрипционному разнообразию в комплексе Mycobacterium Tuberculosis» . Природные коммуникации . 10 (1): 3994. Бибкод : 2019NatCo..10.3994C . дои : 10.1038/s41467-019-11948-6 . ПМК 6728331 . PMID 31488832 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

Эта о микобактериях статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[a-1] Jump up to: ^а ^б ван Инген Дж., Рахим З., Малдер А., Бори М.Дж., Симеоне Р., Брош Р., ван Соолинген Д. (апрель 2012 г.). «Характеристика Mycobacterium orygis как сложного подвида M. Tuberculosis» . Новые инфекционные заболевания . 18 (4): 653–5. дои : 10.3201/eid1804.110888 . ПМК 3309669 . ПМИД 22469053 .

[Patterson-2] Паттерсон С., Дрю Дж. А., Пфайффер Д.Ю., Клаттон-Брок Т.Х. (2017). «Социальные и экологические факторы влияют на смертность диких сурикатов, связанную с туберкулезом» . Журнал экологии животных . 86 (3): 442–450. Бибкод : 2017JAnEc..86..442P . дои : 10.1111/1365-2656.12649 . ПМЦ 5413830 . ПМИД 28186336 .

[pmid20350321-3] Васконселлос С.Е., Хуард Р.К., Ниманн С., Кремер К., Сантос А.Р., Суффис П.Н., Хо Дж.Л. (март 2010 г.). «Различные генотипические профили двух основных клад Mycobacterium africanum» . БМК Инфекционные болезни . 10:80 . дои : 10.1186/1471-2334-10-80 . ПМЦ 2859774 . ПМИД 20350321 .

[:0-4] Jump up to: ^а ^б Гупта, Рэдхи С. (2 октября 2018 г.). «Влияние геномики на выяснение эволюционных взаимоотношений между микобактериями: идентификация молекулярных сигнатур, специфичных для туберкулезного комплекса бактерий, с потенциальным применением для новой диагностики и терапии» . Высокая пропускная способность . 7 (4): 31. дои : 10.3390/ht7040031 . ISSN 2571-5135 . ПМК 6306742 . ПМИД 30279355 .

[5] Риохас, Марко А.; Макгоф, Катя Дж.; Райдер-Риохас, Кристин Дж.; Растоги, Налин; Хасбон, Мансур Эрнандо (1 января 2018 г.). «Филогеномный анализ видов комплекса микобактерий туберкулеза показывает, что Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis, Mycobacterium caprae, Mycobacterium microti и Mycobacterium pinnipedii являются более поздними гетеротипическими синонимами микобактерии туберкулеза» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (1): 324–332. дои : 10.1099/ijsem.0.002507 . ПМИД 29205127 .

[Chiner-Oms_et_al_2019-6] Jump up to: ^а ^б ^с Чинер-Омс А, Берни М., Бойнетт С., Гонсалес-Канделас Ф., Янг Д.Б., Ганье С. и др. (сентябрь 2019 г.). «Общегеномные мутационные искажения способствуют транскрипционному разнообразию в комплексе Mycobacterium Tuberculosis» . Природные коммуникации . 10 (1): 3994. Бибкод : 2019NatCo..10.3994C . дои : 10.1038/s41467-019-11948-6 . ПМК 6728331 . PMID 31488832 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]