Микобактерия африканская
| Микобактерия африканская | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | Африканский М |
| Биномиальное имя | |
| Микобактерия африканская Касте и др. 1969, [1] АТСС 25420 | |
Mycobacterium africanum — это вид микобактерий , который чаще всего встречается в странах Западной Африки, где, по оценкам, он является причиной до 40% случаев туберкулеза легких . [2] Симптомы инфекции напоминают симптомы M.tuberculosis .
Он является членом микобактерий туберкулеза комплекса . [3]
Таксономия
[ редактировать ](MTBC) имеется семь основных линий Mycobacterium Tuberculosis В комплексе , причем линии 5 и 6 классифицируются как Mycobacterium africanum . Линия MTBC 5 представляет собой тип 1 M. africanum , западноафриканский 1 (MAF1), и классифицируется на основе характерной делеции области дифференциации (RD) 711. MAF1 обычно встречается в районе Гвинейского залива. Линия MTBC 6 также известна как M. africanum type 1, West African 2 (MAF2) и классифицируется на основе делеции RD702. MAF2 распространен в Западной Африке. M. africanum типа 2, восточноафриканский, ранее был признан штаммом Mycobacterium africanum ; недавно она была реклассифицирована как генотип Mycobacterium Tuberculosis «Уганда» в сублинии линии 4 MTBC. [4]
История
[ редактировать ]M. africanum был впервые описан как подвид в пределах MTBC с фенотипическими характеристиками, промежуточными между M.tuberculosis и M.bovis , на основании биохимического тестирования, проведенного Castets в 1968 году. Ранний генетический анализ показал, что он отличается от M.tuberculosis из-за геномная делеция RD9 и отличная нуклеотидная последовательность GyrB , а также отличие от M. bovis из-за интактных RD12 и RD4. [5]
Микробиология
[ редактировать ]M. africanum выращивается на средах, содержащих пируват, в условиях низкого содержания кислорода и образует характерные «дисгонические» колонии. В отличие от M. Tuberculosis , M. africanum проявляет каталазную активность, нитрат-негативен и чувствителен к гидразиду тиопен-2-карбоновой кислоты (TCH) и пиразинамиду (PZA). M. africanum также растет медленнее, чем M.tuberculosis : для развития колоний обычно требуется 10 недель, а не 3-4 недели для M.tuberculosis . [6]
Эпидемиология
[ редактировать ]M. africanum чаще всего встречается в странах Западной Африки. [7] Это инфекция только человека, которая передается воздушно-капельным путем от лиц с открытыми случаями заболевания.
Не до конца понятно, почему распространение M. africanum ограничивается Западной Африкой, а в других регионах обнаруживаются лишь спорадические случаи. [8] Филогенетические данные показывают, что M. africanum на ранней стадии разветвился от современных линий Mtb в Америке, Европе и Азии. Некоторые исследования показывают, что M. africanum адаптирован к популяциям Западной Африки. M. africanum , возможно, уступает другим линиям Mtb в других регионах; однако генетические исследования не обнаружили различий в количестве генов вирулентности или генетическом разнообразии между M. Tuberculosis и M. africanum . среди животных не выявлено, Резервуара Mycobacterium africanum несмотря на то, что были обнаружены различные дикие животные. [9]
Он имеет ту же степень инфекционности, что и обычный организм M.tuberculosis , но с меньшей вероятностью перерастет в клиническое заболевание у иммунокомпетентного человека. [10] Однако M. africanum с большей вероятностью перейдет от инфекции к заболеванию у ВИЧ-положительного пациента. В странах, где M. africanum является эндемичным, он представляет собой важную оппортунистическую инфекцию на поздних стадиях ВИЧ-инфекции. [11]
Патогенез
[ редактировать ]Не до конца понятно, как генетические различия между M. africanum и M. Tuberculosis приводят к более низкой патогенности первого. Однако известно, что область различия 9 (RD9) отсутствует у M. africanum, но присутствует у M. Tuberculosis . [12]
M. africanum также имеет заметные различия в катаболизме и метаболизме липидов. нарушаются пути вирулентности, такие как регулон dosR/Rv0081 или регуляция ESAT-6 Кроме того, у M. africanum . [13]
Уход
[ редактировать ]Из-за схожих симптомов и разных условий роста Mycobacterium Tuberculosis и africanum культуральные методы ненадежны для диагностики. Генотипирование на основе молекулярной биологии улучшило идентификацию. В частности, «сполиготипирование» или «типирование спейсерных олигонуклеотидов» представляет собой метод, основанный на быстрой полимеразной цепной реакции, для генотипирования штаммов MTBC. Недавно были разработаны экспресс-тесты с латеральным потоком на основе антигена mpt64, обнаруженного у всех членов MTBC. [14]
M. africanum имеет более низкую скорость прогрессирования от латентного состояния до активного заболевания, чем M. Tuberculosis . Туберкулез M. africanum лечат по той же схеме, что и туберкулез, вызванный M. Tuberculosis . Общий уровень излечения аналогичен, но поскольку больше пациентов с M. africanum, вероятно, будут ВИЧ-положительными, у них может быть более высокая смертность от других заболеваний, связанных с ВИЧ. [15]
Тип штамма
[ редактировать ]АТСС 25420 = CIP 105147
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кассетс, М.; Рист, Н.; Буасверт, Х. (1969). «Африканская разновидность туберкулезной палочки человека». Черная африканская медицина . 16 :321–2.
- ^ де Йонг, Б.; Антонио, М.; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum — обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS Забытые тропические болезни . 4 (9): е744. дои : 10.1371/journal.pntd.0000744 . ПМК 2946903 . ПМИД 20927191 .
- ^ Васконселлос С.Е., Хуард Р.К., Ниманн С. и др. (2010). «Различные генотипические профили двух основных клад Mycobacterium africanum » . БМК Инфекция. Дис . 10:80 . дои : 10.1186/1471-2334-10-80 . ПМЦ 2859774 . ПМИД 20350321 .
- ^ де Йонг, Б.; Антонио, М.; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum — обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS Забытые тропические болезни . 4 (9): е744. дои : 10.1371/journal.pntd.0000744 . ПМК 2946903 . ПМИД 20927191 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; де Йонг, Буке К.; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость в комплексе микобактерий туберкулеза: ее роль в биологии, эпидемиологии и борьбе с ними . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 1019. Чам: Springer International Publishing. стр. 117–133. дои : 10.1007/978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7 . ПМИД 29116632 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; де Йонг, Буке К.; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость в комплексе микобактерий туберкулеза: ее роль в биологии, эпидемиологии и борьбе с ними . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 1019. Чам: Springer International Publishing. стр. 117–133. дои : 10.1007/978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7 . ПМИД 29116632 .
- ^ де Йонг, Б.; Антонио, М.; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum — обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS Забытые тропические болезни . 4 (9): е744. дои : 10.1371/journal.pntd.0000744 . ПМК 2946903 . ПМИД 20927191 .
- ^ де Йонг, Б.; Антонио, М.; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum — обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS Забытые тропические болезни . 4 (9): е744. дои : 10.1371/journal.pntd.0000744 . ПМК 2946903 . ПМИД 20927191 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; де Йонг, Буке К.; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость в комплексе микобактерий туберкулеза: ее роль в биологии, эпидемиологии и борьбе с ними . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 1019. Чам: Springer International Publishing. стр. 117–133. дои : 10.1007/978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7 . ПМИД 29116632 .
- ^ де Йонг, Б.; Хилл, П.; Эйкен, А.; Авин, Т.; Мартин, А.; Адетифа, И.; Джексон-Силла, Д.; Фокс, А.; ДеРимер, К.; Ганье, С.; Боргдорф, М.; Макадам, К.; Корра, Т.; Смолл, П.; Адегбола, Р. (2008). «Прогрессирование к активному туберкулезу, но не передача, зависит от линии происхождения микобактерий туберкулеза в Гамбии» . Журнал инфекционных болезней . 198 (7): 1037–1043. дои : 10.1086/591504 . ПМК 2597014 . ПМИД 18702608 .
- ^ де Йонг, Б.; Хилл, П.; Брукс, Р.; Оту, Дж.; Петерсон, К.; Смолл, П.; Адегбола, Р. (14 октября 2005 г.). «Mycobacterium africanum: новый условно-патогенный микроорганизм при ВИЧ-инфекции?». СПИД . 19 (15): 1714–1715. дои : 10.1097/01.aids.0000185991.54595.41 . ПМИД 16184053 .
- ^ Брош Р., Гордон С.В., Мармисс М. и др. (март 2002 г.). «Новый сценарий эволюции комплекса микобактерий туберкулеза » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (6): 3684–9. Бибкод : 2002PNAS...99.3684B . дои : 10.1073/pnas.052548299 . ПМК 122584 . ПМИД 11891304 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; де Йонг, Буке К.; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость в комплексе микобактерий туберкулеза: ее роль в биологии, эпидемиологии и борьбе с ними . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 1019. Чам: Springer International Publishing. стр. 117–133. дои : 10.1007/978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7 . ПМИД 29116632 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; де Йонг, Буке К.; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость в комплексе микобактерий туберкулеза: ее роль в биологии, эпидемиологии и борьбе с ними . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 1019. Чам: Springer International Publishing. стр. 117–133. дои : 10.1007/978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7 . ПМИД 29116632 .
- ^ де Йонг, Б.; Хилл, П.; Брукс, Р.; Оту, Дж.; Петерсон, К.; Смолл, П.; Адегбола, Р. (14 октября 2005 г.). «Mycobacterium africanum: новый условно-патогенный микроорганизм при ВИЧ-инфекции?». СПИД . 19 (15): 1714–1715. дои : 10.1097/01.aids.0000185991.54595.41 . ПМИД 16184053 .
Библиография
[ редактировать ]- Скерман, ВБД; Макгоуэн, В.; Снит, PHA (январь 1980 г.). «Утвержденные списки названий бактерий» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 30 (1): 225–420. дои : 10.1099/00207713-30-1-225 .