Оптимин

OPTC
Идентификаторы
Псевдонимы	OPTC , Opt, Opticinin
Внешние идентификаторы	Омим : 605127 ; MGI : 2151113 ; Гомологен : 8652 ; GeneCards : OPTC ; OMA : OPTC - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	203,508,949 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	133,835,737 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	tibialis anterior muscle; ; mucosa of ileum; ; deltoid muscle; ; gonad; ; smooth muscle tissue; ; placenta; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of uterus; ; myometrium; ; left uterine tube;
	Top expressed in
	ascending aorta; ; aortic valve; ; lens; ; epithelium of ciliary body; ; embryo; ; neural layer of retina; ; embryo; ; urinary bladder; ; iris; ; tunica media of zone of aorta;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	extracellular matrix structural constituent;
Cellular component	extracellular region; extracellular matrix;
Biological process	extracellular matrix disassembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	26254
	269120
	ENSG00000188770
	Ensmusg00000010311
	Q9UBM4
	Q920A0
	NM_014359
showNM_001160420 ; NM_001160421 ; NM_001160422 ; NM_054076 ; NM_001395557 ;
	NM_001395558
	NP_055174
showNP_001153892 ; NP_001153893 ; NP_001153894 ; NP_473417 ; NP_001382486 ;
	NP_001382487
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Опитин - это белок , который у людей кодируется OPTC геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Опитины принадлежат к классу III семейства небольшого богатого лейцином повторного белка (SLRP). Члены этой семьи обычно ассоциируются с внеклеточным матриксом . Опитины присутствуют в значительных количествах в стеклох глаза нерве , а также локализуются в роговице , радужной оболочке , ресничном теле , зрительном , сосуде , сетчатке и плоде . Опитины могут нековалентно связывать коллагеновые фибриллы и регулировать фибрилл морфологию, интервал и организацию . Ген оптимина отображается с областью хромосомы 1 , которая связана с наследственными заболеваниями глаз , связанной с возрастной дегенерацией макуляции (AMD) и атаксией задних колонн с ретинозой пигментом (AXPC1). ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000188770 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000010311 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Рирдон А.Дж., Ле Гофф М., Бриггс М.Д., Маклеод Д., Шихан Дж.К., Торнтон Д.Дж., епископ П.Н. (февраль 2000 г.). «Идентификация в стекловидном теле и молекулярном клонировании оптимина, нового члена семейства, богатых лейцином повторных белков внеклеточного матрикса» . J Biol Chem . 275 (3): 2123–9. doi : 10.1074/jbc.275.3.2123 . PMID 10636917 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: OPTC Opticin" .

Дальнейшее чтение

Hobby P, Wyatt Mk, Gan W, et al. (2000). «Клонирование, моделирование и хромосомная локализация для небольшого семейства семейства протеогликана (SLRP), богатого лейцином (SLRP), экспрессируемого в глазах человека». Мол Визит 6 : 72–8. PMID 10837509 .
Friedman JS, Ducharme R, Raymond V, Walter MA (2000). «Выделение нового специфического ириса и богатого лейцином повторного белка (Oculoglycan) с использованием дифференциального отбора». Инвестировать Офтальмол. Визит Наука 41 (8): 2059–66. PMID 10892843 .
Armerding D, Fuhlbrigge RC, Kieffer JD, Kupper TS (2001). «Тонсилларные В-клетки не экспрессируют PSGL-1, но значительная фракция демонстрирует антиген кожного лимфоцитов и проявляет эффективную активность лиганда E- и P-селектина». Инт. Архи Аллергия иммунол . 126 (1): 78–90. doi : 10.1159/000049497 . PMID 11641609 . S2CID 45610233 .
Friedman JS, Faucher M, Hiscott P, et al. (2002). «Локализация белка в глазах человека и генетический экран оптимина» . Гул Мол Генет . 11 (11): 1333–42. doi : 10.1093/hmg/11.11.1333 . PMID 12019215 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Le Goff MM, Hindson VJ, Jowitt TA, et al. (2003). «Характеристика оптимина и доказательства стабильной димеризации в растворе» . Дж. Биол. Химический 278 (46): 45280–7. doi : 10.1074/jbc.m303117200 . PMID 12951322 .
Рамеш С., Боншек Р.Е., Бишоп П.Н. (2004). «Иммунолокализация оптимина в человеческом глаза» . Британский журнал офтальмологии . 88 (5): 697–702. doi : 10.1136/bjo.2003.031989 . PMC 1772128 . PMID 15090426 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Лю Т., Цянь В.Дж., Гритсенко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома человека с помощью вычитания иммуноаффинности, химии гидразида и масс-спектрометрии» . J. Proteome Res . 4 (6): 2070–80. doi : 10.1021/pr0502065 . PMC 1850943 . PMID 16335952 .
Acharya M, Mookherjee S, Bhattacharjee A, et al. (2007). «Оценка гена OPTC в первичной глаукоме открытого угла: функциональная значимость молчаливого изменения» . BMC Mol. Биол . 8 : 21. doi : 10.1186/1471-2199-8-21 . PMC 1838427 . PMID 17359525 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 1 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000188770 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000010311 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10636917-5] Рирдон А.Дж., Ле Гофф М., Бриггс М.Д., Маклеод Д., Шихан Дж.К., Торнтон Д.Дж., епископ П.Н. (февраль 2000 г.). «Идентификация в стекловидном теле и молекулярном клонировании оптимина, нового члена семейства, богатых лейцином повторных белков внеклеточного матрикса» . J Biol Chem . 275 (3): 2123–9. doi : 10.1074/jbc.275.3.2123 . PMID 10636917 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: OPTC Opticin" .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]