Гистон H2A.Z

H2AZ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1F66, 3WA9, 4CAY, 4NFT, 5FUG, 5CHL
Идентификаторы
Псевдонимы	H2AZ1 , H2A.Z-1, H2A.z, H2A/z, H2AZ, член семейства гистонов H2A Z, вариант гистона 1 H2A.Z, H2AFZ
Внешние идентификаторы	Опустить : 142763 ; МГИ : 1888388 ; Гомологен : 80218 ; Генные карты : H2AZ1 ; OMA : H2AZ1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	99,950,355 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	137,572,683 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; gingival epithelium; ; palpebral conjunctiva; ; germinal epithelium; ; trabecular bone; ; human penis; ; epithelium of nasopharynx; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	ventricular zone; ; tail of embryo; ; blastocyst; ; embryo; ; genital tubercle; ; thymus; ; embryo; ; spermatocyte; ; epiblast; ; neural tube;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	nucleosomal DNA binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; chromatin DNA binding; protein binding; RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; protein heterodimerization activity;
Cellular component	nucleosome; extracellular exosome; Barr body; nucleus; chromosome;
Biological process	cellular response to estradiol stimulus; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3015
	51788
	ENSG00000164032
	ENSMUSG00000037894
	P0C0S5
	P0C0S6
	НМ_002106
	НМ_016750 ; НМ_001316995
	НП_002097
	НП_001303924 ; НП_058030
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гистон H2A.Z — это белок , кодируемый H2AZ1 геном у человека. ^[5]^[6]

Функция
Гистоны — основные ядерные белки, отвечающие за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот . Нуклеосомы состоят примерно из 146 пар оснований (п.н.) ДНК, обернутых вокруг октамера гистонов , который включает пары каждого из четырех основных гистонов ( H2A , H2B , H3 и H4 ). Хроматиновое . волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием хроматиновых структур более высокого порядка Ген H2AFZ кодирует независимого от репликации члена семейства гистонов H2A, который отличается от других членов семейства.
Биологическое значение
Исследования на мышах показали, что именно этот гистон необходим для эмбрионального развития, и указывают на то, что отсутствие функционального гистона H2A приводит к эмбриональной смертности. ^[6]

Гистон H2AZ является вариантом гистона H2A, используется для опосредования термосенсорной реакции и необходим для восприятия температуры окружающей среды. Заселенность нуклеосом H2A.Z уменьшается с температурой, и анализы in vitro показывают, что нуклеосомы, содержащие H2A.Z, оборачивают ДНК более плотно, чем канонические нуклеосомы H2A у Arabidopsis . (Cell 140: 136–147, 2010). Однако некоторые другие исследования (Nat. Genet. 41, 941–945 и Genes Dev., 21, 1519–1529) показали, что включение H2A.Z в нуклеосомы, когда оно происходит совместно с H3.3, делает их слабее.

Экспрессия генов и структура хроматина

Было показано, что расположение нуклеосом, содержащих H2A.Z, вокруг сайтов начала транскрипции влияет на экспрессию генов ниже по ходу транскрипции. ^[7] Недавние данные также указывают на роль H2A.Z в репрессии подмножества нкРНК , дерепрессии CUT , а также опосредовании формирования структур хроматина более высокого порядка. ^[8]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164032 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037894 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хэтч CL, Боннер WM (октябрь 1990 г.). «Ген человеческого гистона H2A.Z. Последовательность и регуляция» . J Биол Хим . 265 (25): 15211–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)77243-8 . ПМИД 1697587 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: семейство гистонов H2AFZ H2A, член Z» .
^ Баргадже Р., Алам П., Патовари А., Саркар М., Али Т., Гупта С., Гарг М., Сингх М., Пурканти Р., Скариа В., Сивасуббу С., Брахмачари В., Пиллаи B. (2012)Близость нуклеосомы, содержащей H2A.Z, к месту начала транскрипции влияет на уровни экспрессии генов в печени и мозге млекопитающих. Исследования нуклеиновых кислот (EPUB перед печатью) Баргадже Р., Алам М.П., Патовари А. и др. (октябрь 2012 г.). «Близость нуклеосомы, содержащей H2A.Z, к месту начала транскрипции влияет на уровни экспрессии генов в печени и мозге млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (18): 8965–78. дои : 10.1093/нар/gks665 . ПМК 3467062 . ПМИД 22821566 .
^ Реге М (2015). «Динамика хроматина и функция экзосомы РНК совместно регулируют транскрипционный гомеостаз» . Отчеты по ячейкам . 13 (8): 1610–1622. дои : 10.1016/j.celrep.2015.10.030 . ПМЦ 4662874 . ПМИД 26586442 .

Дальнейшее чтение

Джейсон Л.Дж., Мур С.С., Льюис Дж.Д. и др. (2002). «Убиквитинирование гистонов: разворачивается мечущий хвост?». Биоэссе . 24 (2): 166–74. дои : 10.1002/bies.10038 . ПМИД 11835281 . S2CID 39905043 .
Хэтч CL, Боннер WM (1988). «Последовательность кДНК млекопитающих H2A.Z, эволюционно разошедшегося, но высококонсервативного вида изопротеина базального гистона H2A» . Нуклеиновые кислоты Рез . 16 (3): 1113–24. дои : 10.1093/нар/16.3.1113 . ПМК 334740 . ПМИД 3344202 .
Като С., Секин С., О С.В. и др. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Хэтч CL, Боннер WM (1995). «Характеристика проксимального промотора гена гистона человека H2A.Z» . ДНК Клеточная Биол. (Представлена рукопись). 14 (3): 257–66. дои : 10.1089/dna.1995.14.257 . ПМИД 7880446 .
Попеску Н., Зимонич Д., Хэтч С., Боннер В. (1994). «Хромосомное картирование гена гистонов человека H2AZ на 4q24 методом флуоресцентной гибридизации in situ» . Геномика (Представлена рукопись). 20 (2): 333–5. дои : 10.1006/geno.1994.1182 . ПМИД 8020992 .
Хэтч CL, Боннер WM (1996). «Вышестоящая область промотора гена H2AZ модулирует активность промотора в различных типах клеток». Биохим. Биофиз. Акта . 1305 (1–2): 59–62. дои : 10.1016/0167-4781(95)00223-5 . ПМИД 8605251 .
Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транкрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2535–44. дои : 10.1128/mcb.18.5.2535 . ПМК 110633 . ПМИД 9566873 .
Слахта К.А., Дживанандам В., Голдман Б. и др. (2000). «Коронарные артерии сердечных аллотрансплантатов человека с хроническим отторжением содержат олигоклональные Т-клетки: сохранение идентичных клонально расширенных транскриптов TCR от раннего посттрансплантационного периода (эндомиокардиальная биопсия) до хронического отторжения (коронарные артерии)» . Дж. Иммунол . 165 (6): 3469–83. дои : 10.4049/jimmunol.165.6.3469 . ПМИД 10975868 .
Паскуалуччи Л., Нери А., Бальдини Л. и др. (2000). «Мутации BCL-6 связаны с мутациями вариабельной области тяжелой цепи иммуноглобулина при В-клеточном хроническом лимфоцитарном лейкозе». Рак Рез . 60 (20): 5644–8. ПМИД 11059755 .
Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. дои : 10.1006/виро.2000.0593 . ПМИД 11080476 .
Суто Р.К., Кларксон М.Дж., Треметик Д.Д., Люгер К. (2001). «Кристаллическая структура сердцевинной частицы нуклеосомы, содержащей вариант гистона H2A.Z». Нат. Структура. Биол . 7 (12): 1121–4. дои : 10.1038/81971 . ПМИД 11101893 . S2CID 5966635 .
Браунингер А., Ян В., Вакер Х.Х. и др. (2001). «Развитие B-клеток в прогрессивно трансформированных зародышевых центрах: сходства и различия по сравнению с классическими зародышевыми центрами и болезнью Ходжкина с преобладанием лимфоцитов» . Кровь . 97 (3): 714–9. дои : 10.1182/blood.V97.3.714 . ПМИД 11157489 .
Ямамото К., Сугита Н., Кобаяши Т. и др. (2001). «Доказательства нового полиморфизма, влияющего как на N-связанное гликозилирование, так и на связывание лиганда рецептора IgG IIIB (CD16)» . Тканевые антигены . 57 (4): 363–6. дои : 10.1034/j.1399-0039.2001.057004363.x . ПМИД 11380948 .
Фааст Р., Тонглаироам В., Шульц Т.С. и др. (2001). «Вариант гистонов H2A.Z необходим для раннего развития млекопитающих» . Курс. Биол . 11 (15): 1183–7. Бибкод : 2001CBio...11.1183F . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00329-3 . ПМИД 11516949 .
Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Усиление активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. дои : 10.1006/виро.2001.1129 . ПМИД 11689053 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Рангасами Д., Бервен Л., Риджуэй П., Треметик DJ (2003). «Перицентрический гетерохроматин обогащается H2A.Z на ранних стадиях развития млекопитающих» . ЭМБО Дж . 22 (7): 1599–607. дои : 10.1093/emboj/cdg160 . ПМК 152904 . ПМИД 12660166 .
Лусич М., Марчелло А., Серезето А., Джакка М. (2004). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования факторов на промоторе LTR» . ЭМБО Дж . 22 (24): 6550–61. дои : 10.1093/emboj/cdg631 . ПМК 291826 . ПМИД 14657027 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого гистона H2A.Z.

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164032 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037894 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1697587-5] Хэтч CL, Боннер WM (октябрь 1990 г.). «Ген человеческого гистона H2A.Z. Последовательность и регуляция» . J Биол Хим . 265 (25): 15211–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)77243-8 . ПМИД 1697587 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: семейство гистонов H2AFZ H2A, член Z» .

[7] Баргадже Р., Алам П., Патовари А., Саркар М., Али Т., Гупта С., Гарг М., Сингх М., Пурканти Р., Скариа В., Сивасуббу С., Брахмачари В., Пиллаи B. (2012)Близость нуклеосомы, содержащей H2A.Z, к месту начала транскрипции влияет на уровни экспрессии генов в печени и мозге млекопитающих. Исследования нуклеиновых кислот (EPUB перед печатью) Баргадже Р., Алам М.П., Патовари А. и др. (октябрь 2012 г.). «Близость нуклеосомы, содержащей H2A.Z, к месту начала транскрипции влияет на уровни экспрессии генов в печени и мозге млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (18): 8965–78. дои : 10.1093/нар/gks665 . ПМК 3467062 . ПМИД 22821566 .

[8] Реге М (2015). «Динамика хроматина и функция экзосомы РНК совместно регулируют транскрипционный гомеостаз» . Отчеты по ячейкам . 13 (8): 1610–1622. дои : 10.1016/j.celrep.2015.10.030 . ПМЦ 4662874 . ПМИД 26586442 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]