Прямой повтор
Прямые повторы — это тип генетической последовательности, состоящий из двух или более повторов определенной последовательности. [1] Другими словами, прямые повторы — это нуклеотидные последовательности, присутствующие в геноме в нескольких копиях . Обычно прямое повторение происходит, когда последовательность повторяется с тем же шаблоном в дальнейшем. [1] Нет никакой инверсии [ нужны разъяснения ] и нет обратного комплемента, связанного с прямым повтором. Он может иметь или не иметь промежуточные нуклеотиды. Нуклеотидная последовательность, выделенная жирным шрифтом, означает повторяющуюся последовательность.
- 5´ TTACG nnnnnnTTACG 3´
- 3´ AATGC nnnnnnAATGC 5´
С лингвистической точки зрения типичный прямой повтор сравним со словами «пока-пока». [1]
Типы
[ редактировать ]Существует несколько типов повторяющихся последовательностей:
- Вкрапленные (или рассеянные) повторы ДНК (вкрапленные повторяющиеся последовательности) представляют собой копии мобильных элементов, разбросанных по всему геному.
- Фланкирующие (или терминальные) повторы (последовательности концевых повторов) представляют собой последовательности, которые повторяются на обоих концах последовательности, например, длинные концевые повторы (LTR) ретровирусов . Прямые терминальные повторы направлены в одном направлении, а инвертированные терминальные повторы направлены противоположно друг другу.
- Тандемные повторы (последовательности тандемных повторов) — это повторяющиеся копии, расположенные рядом друг с другом. Это также могут быть прямые или инвертированные повторы . [ нужна ссылка ] Гены рибосомальной РНК и транспортной РНК относятся к классу среднеповторяющейся ДНК.
Микросателлитная ДНК
[ редактировать ]Участок повторяющейся ДНК , в котором мотив из нескольких пар оснований тандемно повторяется множество раз (например, от 5 до 50 раз), называется микросателлитной ДНК. Таким образом, тандемные последовательности с прямыми повторами представляют собой форму микросателлитной ДНК. Процесс репарации несоответствий ДНК играет важную роль в формировании прямых экспансий тринуклеотидных повторов. [2] Такие расширения повторов лежат в основе ряда неврологических нарушений и нарушений развития у человека. [2]
Гомологичная рекомбинация
[ редактировать ]В непосредственно повторяющихся последовательностях двухцепочечные табака растения генома разрывы ДНК могут быть эффективно восстановлены путем гомологичной рекомбинации между повторяющимися последовательностями. [3]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Ассери, Дэвид В.; Вассенаар, Труди; Борини, Стефано (22 декабря 2008 г.). «Частоты слов, повторы и структуры, связанные с повторами, в бактериальных геномах». Вычисления для сравнительной микробной геномики: биоинформатика для микробиологов . Вычислительная биология. Том. 8 (1-е изд.). Спрингер. стр. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8 .
- ^ Jump up to: а б Ричард, GF (2021). «Поразительная роль репарации несоответствия в расширении тринуклеотидных повторов» . Клетки . 10 (5): 1019. doi : 10.3390/cells10051019 . ПМК 8145212 . ПМИД 33925919 .
- ^ Зиберт Р., Пухта Х. Эффективное восстановление двухцепочечных разрывов генома путем гомологичной рекомбинации между непосредственно повторяющимися последовательностями в геноме растения. Растительная клетка. Май 2002 г.;14(5):1121-31. дои: 10.1105/tpc.001727. ПМИД 12034901; PMCID: PMC150611
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |