АБЛИМ3

АБЛИМ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1UJS, 2DJ7
Идентификаторы
Псевдонимы	ABLIM3 , HMFN1661, актин-связывающий член семейства белков LIM 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 611305 ; МГИ : 2442582 ; Гомологен : 69175 ; Генные карты : ABLIM3 ; ОМА : ABLIM3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	149,260,542 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	62,044,895 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; right auricle; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; glutes; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; left ventricle; ; paraflocculus of cerebellum; ; subcutaneous adipose tissue; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	lumbar spinal ganglion; ; right lung lobe; ; interventricular septum; ; supraoptic nucleus; ; trigeminal ganglion; ; otolith organ; ; cerebellum; ; cerebellar cortex; ; utricle; ; myocardium of ventricle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; actin binding; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; stress fiber; lamellipodium;
Biological process	cytoskeleton organization; actin cytoskeleton organization; transcription, DNA-templated; lamellipodium assembly; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of protein targeting to mitochondrion; cilium assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	22885
	319713
	ENSG00000173210
	ENSMUSG00000032735
	О94929
	Q69ZX8
showНМ_001301015 ; НМ_001301018 ; НМ_001301027 ; НМ_001301028 ; НМ_014945 ;
	NM_001345858; NM_001345859; NM_001345860; NM_001345861; NM_001370417; NM_001370418
	НМ_001164491 ; НМ_198649 ; НМ_001360868
showНП_001287944 ; НП_001287947 ; НП_001287957 ; НП_001332787 ; НП_001332788 ;
	NP_001332789; NP_001332790; NP_055760; NP_001357346; NP_001357347
	НП_001157963 ; НП_941051 ; НП_001347797
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Актин-связывающий белок LIM 3 представляет собой белок , который у человека кодируется ABLIM3 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Домен LIM представляет собой структуру с двойными цинковыми пальцами , которая способствует межбелковым взаимодействиям . Белки домена LIM, такие как ABLIM3, играют роль в эмбриональном развитии , определении клеточного происхождения и раке . ^{[ 6 ]} Важным паралогом этого гена является LIMS1 .

Клиническая значимость

Заболевания, связанные с ABLIM3, включают гепатобластому , а среди родственных ей суперпутей - наведение аксонов и привлекательная передача сигналов, опосредованная DCC.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173210 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032735 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Entrez: семейство белков LIM, связывающих актин ABLIM3, член 3» .
^ Крупп М., Вайнманн А., Галле П.Р., Тойфель А. (январь 2006 г.). «Актин-связывающий белок LIM 3 (abLIM3)». Международный журнал молекулярной медицины . 17 (1): 129–33. дои : 10.3892/ijmm.17.1.129 . ПМИД 16328021 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (6): 355–64. дои : 10.1093/dnares/5.6.355 . ПМИД 10048485 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б, Кляйн М, Пустка А (Март 2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Ямада С , Охира М , Хорие Х , Андо К , Такаясу Х , Сузуки Ю , Сугано С , Хирата Т , Гото Т , Мацунага Т , Хияма Э , Хаяси Ю , Андо Х , Суита С , Канеко М , Сасаки Ф , Хасидзумэ К , Онума Н., Накагавара А. (август 2004 г.). «Профилирование экспрессии и дифференциальный скрининг гепатобластом и соответствующей нормальной печени: идентификация высокой экспрессии онкогена PLK1 как индикатора плохого прогноза гепатобластом». Онкоген . 23 (35): 5901–5911. дои : 10.1038/sj.onc.1207782 . ПМИД 15221005 . S2CID 3114318 .
Чжэн Б., Вэнь Дж. К., Хан М., Чжоу А. Р. (сентябрь 2004 г.). «Белок hhLIM участвует в гипертрофии сердца » Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1690 (1): 1–1 дои : 10.1016/j.bbadis.2004.04.009 . ПМИД 15337165 .
Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Тиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накаи К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Крупп М., Вайнманн А., Галле П.Р., Тойфель А. (январь 2006 г.). «Актин-связывающий белок LIM 3 (abLIM3)» . Международный журнал молекулярной медицины . 17 (1): 129–33. дои : 10.3892/ijmm.17.1.129 . ПМИД 16328021 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Барриентос Т., Фрэнк Д., Кувахара К., Безпрозванная С., Пайпс Г.К., Бассель-Дюби Р., Ричардсон Дж.А., Катус Х.А., Олсон Э.Н., Фрей Н. (март 2007 г.). «Два новых члена семейства белков ABLIM, ABLIM-2 и -3, связываются со STARS и напрямую связывают F-актин» . Журнал биологической химии . 282 (11): 8393–8403. дои : 10.1074/jbc.M607549200 . ПМИД 17194709 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома ABLIM3 и страница сведений о гене ABLIM3 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173210 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032735 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Entrez: семейство белков LIM, связывающих актин ABLIM3, член 3» .

[6] Крупп М., Вайнманн А., Галле П.Р., Тойфель А. (январь 2006 г.). «Актин-связывающий белок LIM 3 (abLIM3)». Международный журнал молекулярной медицины . 17 (1): 129–33. дои : 10.3892/ijmm.17.1.129 . ПМИД 16328021 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]