CDKN2BAS

Интронная консервативная область антисмысловой РНК 1 CDKN2B
Интронная консервативная область антисмысловой РНК 1 CDKN2B
	Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности CDKN2B-AS
Идентификаторы
Символ	CDKN2B-АС
Альт. Символы	АНРИЛ
Рфам	РФ01909
Другие данные
РНК Тип	Джин ;
Домен(ы)	Эукариоты ;
ИДТИ	ПОЙДИТЕ: 0006342 ПОЙДИТЕ: 0005515
ТАК	ТАК: 0001463
PDB Структуры	ПДБе

CDKN2B-AS1
Идентификаторы
Псевдонимы	CDKN2B-AS1 , ANRIL, CDKN2B-AS, CDKN2BAS, NCRNA00089, PCAT12, p15AS, антисмысловая РНК 1 CDKN2B
Внешние идентификаторы	Опустить : 613149 ; GeneCards : CDKN2B-AS1 ; ОМА : CDKN2B-AS1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	22,128,103 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of transverse colon; ; rectum; ; epithelium of colon; ; testicle; ; gonad; ; right uterine tube; ; anterior pituitary; ; pancreatic ductal cell; ; tibialis anterior muscle; ; sural nerve;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	100048912
	н/д
	ENSG00000240498
	н/д
	н ; а
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

CDKN2B-AS , также известный как ANRIL (антисмысловая некодирующая РНК в локусе INK4), представляет собой длинную некодирующую РНК, состоящую из 19 экзонов , занимающую 126,3 т.п.н. в геноме , а ее сплайсированный продукт представляет собой РНК длиной 3834 п.н. Он расположен внутри кластера генов p15/ CDKN2B -p16/ CDKN2A -p14/ ARF , в антисмысловом направлении. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), которые изменяют экспрессию CDKN2B-AS, связаны с ожидаемой продолжительностью здоровой жизни человека , а также с множеством заболеваний, включая ишемическую болезнь сердца , диабет и многие виды рака . ^{[ 3 ]} Он связывается с хромобоксом 7 (CBX7) в репрессивном комплексе Polycomb 1 и с SUZ12 , компонентом репрессивного комплекса Polycomb 2 , и посредством этих взаимодействий участвует в репрессии транскрипции . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

См. также

Длинная некодирующая РНК

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000240498 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Каннингтон М.С., Сантибанес Кореф М., Майози Б.М., Берн Дж., Кивни Б. (апрель 2010 г.). Гибсон Дж. (ред.). «SNP 9p21 хромосомы, связанные с множественными фенотипами заболеваний, коррелируют с экспрессией ANRIL» . ПЛОС Генетика . 6 (4): e1000899. дои : 10.1371/journal.pgen.1000899 . ПМК 2851566 . ПМИД 20386740 .
^ Яп К.Л., Ли С., Муньос-Кабельо А.М., Рагуз С., Цзэн Л., Муджтаба С. и др. (июнь 2010 г.). «Молекулярное взаимодействие некодирующей РНК ANRIL и метилированного гистона H3 лизина 27 с помощью поликомба CBX7 в подавлении транскрипции INK4a» . Молекулярная клетка . 38 (5): 662–674. doi : 10.1016/j.molcel.2010.03.021 . ПМЦ 2886305 . ПМИД 20541999 .
^ Котаке Ю, Накагава Т, Китагава К, Судзуки С, Лю Н, Китагава М, Сюн Ю (апрель 2011 г.). «Длинная некодирующая РНК ANRIL необходима для рекрутирования PRC2 и подавления гена-супрессора опухоли p15 (INK4B)» . Онкоген . 30 (16): 1956–1962. дои : 10.1038/onc.2010.568 . ПМК 3230933 . ПМИД 21151178 .

Дальнейшее чтение

Мюсоттер Т., Клюве Л., Хёгель Дж., Нгуен Р., Купер Д.Н., Маутнер В.Ф., Керер-Савацки Х. (октябрь 2012 г.). «Некодирующая РНК ANRIL и количество плексиформных нейрофибром у пациентов с микроделециями NF1» . BMC Медицинская генетика . 13:98 . дои : 10.1186/1471-2350-13-98 . ПМК 3500256 . ПМИД 23101500 .
Макферсон Р., Перцемлидис А., Каваслар Н., Стюарт А., Робертс Р., Кокс Д.Р. и др. (июнь 2007 г.). «Общий аллель на хромосоме 9, связанный с ишемической болезнью сердца» . Наука . 316 (5830): 1488–1491. Бибкод : 2007Sci...316.1488M . дои : 10.1126/science.1142447 . ПМК 2711874 . ПМИД 17478681 .
Фолкерсен Л., Кириаку Т., Гоэль А., Педен Дж., Меларстиг А., Паулссон-Берн Г. и др. (ноябрь 2009 г.). Рейтсма П.Х. (ред.). «Связь между генотипом риска ИБС в локусе хромосомы 9p21 и экспрессией генов. Идентификация восьми новых вариантов сплайсинга ANRIL» . ПЛОС ОДИН . 4 (11): е7677. Бибкод : 2009PLoSO...4.7677F . дои : 10.1371/journal.pone.0007677 . ПМК 2765615 . ПМИД 19888323 .
Уно С., Зембуцу Х., Хирасава А., Такахаши А., Кубо М., Акахане Т. и др. (август 2010 г.). «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует генетические варианты локуса CDKN2BAS, связанные с эндометриозом у японцев». Природная генетика . 42 (8): 707–710. дои : 10.1038/ng.612 . ПМИД 20601957 . S2CID 205356736 .
Ренш М., Дженкинс Р.Б., Чанг Дж.С., Йе Р.Ф., Сяо Ю., Декер П.А. и др. (август 2009 г.). «Варианты в регионах CDKN2B и RTEL1 связаны с предрасположенностью к глиоме высокой степени» . Природная генетика . 41 (8): 905–908. дои : 10.1038/ng.408 . ПМЦ 2923561 . ПМИД 19578366 .
Билгувар К., Ясуно К., Ниемеля М., Руигрок Ю.М., фон Унд Зу Фраунберг М., ван Дуйн К.М. и др. (декабрь 2008 г.). «Локусы восприимчивости к внутричерепной аневризме у населения Европы и Японии» . Природная генетика . 40 (12): 1472–1477. дои : 10.1038/ng.240 . ПМК 2682433 . ПМИД 18997786 .
Сато К., Накагава Х., Тадзима А., Ёсида К., Иноуэ И. (сентябрь 2010 г.). «ANRIL участвует в регуляции ядра и потенциальной мишени транскрипции E2F1» . Отчеты онкологии . 24 (3): 701–707. дои : 10.3892/or_00000910 . ПМИД 20664976 .
Ясуно К., Билгувар К., Биджленга П., Лоу С.К., Кришек Б., Аубургер Г. и др. (май 2010 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование внутричерепной аневризмы выявило три новых локуса риска» . Природная генетика . 42 (5): 420–425. дои : 10.1038/ng.563 . ПМЦ 2861730 . ПМИД 20364137 .
Бродбент Х.М., Педен Дж.Ф., Лорковски С., Гоэл А., Онген Х., Грин Ф. и др. (март 2008 г.). «Восприимчивость к ишемической болезни сердца и диабету кодируется отдельными, тесно связанными SNP в локусе ANRIL на хромосоме 9p» . Молекулярная генетика человека . 17 (6): 806–814. дои : 10.1093/hmg/ddm352 . ПМИД 18048406 .
Хашиката Х., Лю В., Иноуэ К., Минехару Ю., Ямада С., Нанаяккара С. и др. (июнь 2010 г.). «Подтверждение ассоциации однонуклеотидного полиморфизма rs1333040 на 9p21 с семейными и спорадическими внутричерепными аневризмами у японских пациентов» . Гладить . 41 (6): 1138–1144. дои : 10.1161/СТРОКЕАХА.109.576694 . hdl : 2433/142049 . ПМИД 20395613 .
Хельгадоттир А., Торлейфссон Г., Манолеску А., Гретарсдоттир С., Блондал Т., Йонасдоттир А. и др. (июнь 2007 г.). «Распространенный вариант хромосомы 9p21 влияет на риск инфаркта миокарда». Наука . 316 (5830): 1491–1493. Бибкод : 2007Sci...316.1491H . дои : 10.1126/science.1142842 . ПМИД 17478679 . S2CID 71851374 .
Ян XR, Лян X, Пфайффер Р.М., Уилер В., Мэдер Д., Бердетт Л. и др. (декабрь 2010 г.). «Ассоциации вариантов 9p21 со злокачественной меланомой кожи, невусами и фенотипами пигментации в семьях, склонных к меланоме, с мутациями CDKN2A и без них» . Семейный рак . 9 (4): 625–633. дои : 10.1007/s10689-010-9356-3 . ПМЦ 3233727 . ПМИД 20574843 .
Шете С., Хоскинг Ф.Дж., Робертсон Л.Б., Доббинс С.Е., Сансон М., Малмер Б. и др. (август 2009 г.). «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует пять локусов восприимчивости к глиоме» . Природная генетика . 41 (8): 899–904. дои : 10.1038/ng.407 . ПМК 4501476 . ПМИД 19578367 .
Бэй Дж.С., Ли Ю., Цзя В.Х., Фэн Б.Дж., Чжоу Г., Чен Л.З. и др. (июль 2010 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование рака носоглотки выявило три новых локуса восприимчивости». Природная генетика . 42 (7): 599–603. дои : 10.1038/ng.601 . ПМИД 20512145 . S2CID 205356689 .
Тернбулл С., Ахмед С., Моррисон Дж., Пернет Д., Ренвик А., Маранян М. и др. (июнь 2010 г.). «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует пять новых локусов предрасположенности к раку молочной железы» . Природная генетика . 42 (6): 504–507. дои : 10.1038/ng.586 . ПМЦ 3632836 . ПМИД 20453838 .
Шефер А.С., Рихтер Г.М., Гросснер-Шрайбер Б., Ноак Б., Нотнагель М., Эль Мохтари Н.Е. и др. (февраль 2009 г.). Марчини Дж. (ред.). «Идентификация общего генетического локуса предрасположенности к ишемической болезни сердца и пародонтиту» . ПЛОС Генетика . 5 (2): e1000378. дои : 10.1371/journal.pgen.1000378 . ПМЦ 2632758 . ПМИД 19214202 .
Чен Л., Цюй Х., Го М., Чжан Ю., Цуй Ю., Ян Ц. и др. (апрель 2020 г.). «АНРИЛ и атеросклероз» . Журнал клинической фармации и терапии . 45 (2): 240–248. дои : 10.1111/jcpt.13060 . ПМИД 31703157 . S2CID 207956113 .

Внешние ссылки

Страница интронной консервативной области антисмысловой РНК 1 CDKN2B в Rfam
человека Расположение генома CDKN2B-AS и страница сведений о гене CDKN2B-AS в браузере генома UCSC .
человека Расположение генома CDKN2B-AS1 и CDKN2B-AS1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000240498 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid20386740-3] Каннингтон М.С., Сантибанес Кореф М., Майози Б.М., Берн Дж., Кивни Б. (апрель 2010 г.). Гибсон Дж. (ред.). «SNP 9p21 хромосомы, связанные с множественными фенотипами заболеваний, коррелируют с экспрессией ANRIL» . ПЛОС Генетика . 6 (4): e1000899. дои : 10.1371/journal.pgen.1000899 . ПМК 2851566 . ПМИД 20386740 .

[pmid20541999-4] Яп К.Л., Ли С., Муньос-Кабельо А.М., Рагуз С., Цзэн Л., Муджтаба С. и др. (июнь 2010 г.). «Молекулярное взаимодействие некодирующей РНК ANRIL и метилированного гистона H3 лизина 27 с помощью поликомба CBX7 в подавлении транскрипции INK4a» . Молекулярная клетка . 38 (5): 662–674. doi : 10.1016/j.molcel.2010.03.021 . ПМЦ 2886305 . ПМИД 20541999 .

[pmid21151178-5] Котаке Ю, Накагава Т, Китагава К, Судзуки С, Лю Н, Китагава М, Сюн Ю (апрель 2011 г.). «Длинная некодирующая РНК ANRIL необходима для рекрутирования PRC2 и подавления гена-супрессора опухоли p15 (INK4B)» . Онкоген . 30 (16): 1956–1962. дои : 10.1038/onc.2010.568 . ПМК 3230933 . ПМИД 21151178 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]