ЭРАП2

ЭРАП2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3SE6, 4E36, 4JBS, 5CU5, 5AB2, 5AB0
Идентификаторы
Псевдонимы	ERAP2 , L-RAP, LRAP, аминопептидаза 2 эндоплазматического ретикулума
Внешние идентификаторы	Опустить : 609497 ; Гомологен : 75183 ; GeneCards : ERAP2 ; ОМА : ERAP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	96,919,703 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; granulocyte; ; lymph node; ; superficial temporal artery; ; visceral pleura; ; epithelium of nasopharynx; ; monocyte; ; epithelium of colon; ; appendix; ; Achilles tendon;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	aminopeptidase activity; metallopeptidase activity; peptidase activity; hydrolase activity; zinc ion binding; metal ion binding; peptide binding; metalloaminopeptidase activity; endopeptidase activity;
Cellular component	integral component of membrane; endoplasmic reticulum lumen; endoplasmic reticulum membrane; membrane; endoplasmic reticulum; plasma membrane; cytoplasm;
Biological process	immune system process; adaptive immune response; proteolysis; regulation of blood pressure; antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; peptide catabolic process; antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I; signal transduction; cell-cell signaling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	64167
	н/д
	ENSG00000164308
	н/д
	Q6P179
	н/д
	НМ_001130140 ; НМ_022350 ; НМ_001329229 ; НМ_001329233
	н/д
	НП_001123612 ; НП_001316158 ; НП_001316162 ; НП_071745
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Аминопептидаза 2 эндоплазматического ретикулума представляет собой аминопептидазу человека, участвующую в презентации антигена. Он кодируется геном ERAP2 .

Функция

ERAP1 и ERAP2 представляют собой аминопептидазы , способные расщеплять предшественники антигенных пептидов в эндоплазматическом ретикулуме . Они гидролизуют N-концевые аминокислоты белков или пептидных субстратов, поэтому главный комплекс гистосовместимости (MHC) класса I может представить их CD8+ Т-клеткам. ^[3]

ERAP2 играет центральную роль в презентации антигена и влияет на реакцию по меньшей мере 4 цитокинов: он положительно коррелирует с CCL3 , который участвует в рекрутировании нейтрофилов при инфекции, тогда как он обратно коррелирует с гранулоцитарным колониестимулирующим фактором , интерлейкином. 1β и IL-10 . ^[4]

Генетика

Мутации в гене ERAP2 ^[5] были обнаружены в экстрактах ДНК, полученных из скелетов людей, умерших незадолго до, во время или вскоре после Черной смерти 1348 года на трех лондонских кладбищах, включая чумное кладбище Ист-Смитфилд и Датское кладбище. Согласно этому исследованию, наличие двух защитных версий ERAP2 повышает вероятность выживания людей при инфекции Yersinia pestis на 40 процентов . ^[4] Однако эта версия гена также увеличивает риск болезни Крона . ^[6]

Есть свидетельства того, что Черная смерть сформировала генетическое разнообразие в Европе: люди, у которых был защитный вариант гена ERAP2, с гораздо большей вероятностью выжили при инфекции Yersinia pestis , возбудителе Черной смерти. ^[7]

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164308 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Таниока Т., Хаттори А., Масуда С., Номура Ю., Накаяма Х., Мизутани С., Цудзимото М. (август 2003 г.). «Аргининаминопептидаза, полученная из лейкоцитов человека. Третий член подсемейства аминопептидаз окситоциназы» . Журнал биологической химии . 278 (34): 32275–32283. дои : 10.1074/jbc.M305076200 . ПМИД 12799365 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Кланк Дж., Вилгалис Т.П., Демер С.Э., Ченг Х., Ширатори М., Мадей Дж. и др. (октябрь 2022 г.). «Эволюция иммунных генов связана с Черной смертью» . Природа . 611 (7935): 312–319. Бибкод : 2022Natur.611..312K . дои : 10.1038/s41586-022-05349-x . ПМЦ 9580435 . ПМИД 36261521 .
^ «Ген Энтрез: аминопептидаза 2 эндоплазматического ретикулума» .
^ Циммер С (19 октября 2022 г.). «Как «Черная смерть» оставила свой генетический след в будущих поколениях» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 24 октября 2022 г.
^ Кланк Дж., Вилгалис Т.П., Демер С.Э., Ченг Х., Ширатори М., Мадей Дж. и др. (ноябрь 2022 г.). «Эволюция иммунных генов связана с Черной смертью» . Природа . 611 (7935): 312–319. Бибкод : 2022Natur.611..312K . дои : 10.1038/s41586-022-05349-x . ПМЦ 9580435 . ПМИД 36261521 .

Дальнейшее чтение

Сюй С.Р., Хуан Дж., Сюй З.Г., Цянь Б.З., Чжу З.Д., Ян Ц. и др. (декабрь 2001 г.). «Понимание гепатоцеллюлярного канцерогенеза на уровне транскриптома путем сравнения профилей экспрессии генов гепатоцеллюлярной карциномы с профилями соответствующей нераковой печени» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (26): 15089–15094. Бибкод : 2001PNAS...9815089X . дои : 10.1073/pnas.241522398 . ПМК 64988 . ПМИД 11752456 .
Хилл Л.Д., Хиллиард Д.Д., Йорк Т.П., Шринивас С., Кусанович Дж.П., Гомес Р. и др. (май 2011 г.). «Вариации ERAP2 плода связаны с преэклампсией у афроамериканцев в исследовании случай-контроль» . BMC Медицинская генетика . 12:64 . дои : 10.1186/1471-2350-12-64 . ПМК 3103419 . ПМИД 21569342 .
Ашер Д.Б., Полехина Г., Паркер М.В. (апрель 2012 г.). «Кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ аминопептидазы 2 эндоплазматического ретикулума человека» . Акта Кристаллографика. Раздел F. Структурная биология и кристаллизационные связи . 68 (Часть 4): 468–471. дои : 10.1107/S1744309112006963 . ПМК 3325822 . ПМИД 22505422 .
Кампхаузен Э., Келлерт С., Аббас Т., Аккад Н., Тенцер С., Павелец Г. и др. (август 2010 г.). «Различные молекулярные механизмы, приводящие к недостаточной экспрессии ER-резидентных аминопептидаз при меланоме» . Иммунология рака, иммунотерапия . 59 (8): 1273–1284. дои : 10.1007/s00262-010-0856-7 . ПМК 11030553 . ПМИД 20419298 . S2CID 24302488 .
Стратикос Э., Стерн LJ (октябрь 2013 г.). «Обрезка антигенных пептидов с помощью ER-аминопептидаз - результаты структурных исследований» . Молекулярная иммунология . 55 (3–4): 212–219. дои : 10.1016/j.molimm.2013.03.002 . ПМЦ 3657621 . ПМИД 23545452 .
Бьёрнссон Х.Т., Альберт Т.Дж., Лэдд-Акоста К.М., Грин Р.Д., Ронгионе М.А., Миддл К.М. и др. (май 2008 г.). «Анализ аллель-специфической экспрессии на основе SNP-специфического массива» . Геномные исследования . 18 (5): 771–779. дои : 10.1101/гр.073254.107 . ПМК 2336807 . ПМИД 18369178 .
Мейсон CC, Хэнсон Р.Л., Оссовски В., Биан Л., Байер Л.Дж., Кракофф Дж., Богардус С. (февраль 2011 г.). «Бимодальное распределение уровней экспрессии РНК в ткани скелетных мышц человека» . БМК Геномика . 12:98 . дои : 10.1186/1471-2164-12-98 . ПМК 3044673 . ПМИД 21299892 .
Харун Н., Цуй Ф.В., Чиу Б., Цуй Х.В., Инман Р.Д. (сентябрь 2010 г.). «Сывороточные цитокиновые рецепторы при анкилозирующем спондилите: связь с маркерами воспаления и полиморфизмом аминопептидазы эндоплазматического ретикулума» . Журнал ревматологии . 37 (9): 1907–1910. дои : 10.3899/jrheum.100019 . ПМИД 20595269 . S2CID 27707315 .
Цюй HQ, Маршан Л., Фрешетт Р., Бако Ф., Лу Ю., Полихронакос С. (март 2007 г.). «Нет связи диабета 1 типа с функциональным полиморфизмом гена LRAP». Молекулярная иммунология . 44 (8): 2135–2138. дои : 10.1016/j.molimm.2006.10.015 . ПМИД 17129607 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164308 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] Таниока Т., Хаттори А., Масуда С., Номура Ю., Накаяма Х., Мизутани С., Цудзимото М. (август 2003 г.). «Аргининаминопептидаза, полученная из лейкоцитов человека. Третий член подсемейства аминопептидаз окситоциназы» . Журнал биологической химии . 278 (34): 32275–32283. дои : 10.1074/jbc.M305076200 . ПМИД 12799365 .

[klunk-4] Перейти обратно: ^а ^б Кланк Дж., Вилгалис Т.П., Демер С.Э., Ченг Х., Ширатори М., Мадей Дж. и др. (октябрь 2022 г.). «Эволюция иммунных генов связана с Черной смертью» . Природа . 611 (7935): 312–319. Бибкод : 2022Natur.611..312K . дои : 10.1038/s41586-022-05349-x . ПМЦ 9580435 . ПМИД 36261521 .

[entrez-5] «Ген Энтрез: аминопептидаза 2 эндоплазматического ретикулума» .

[nyt-6] Циммер С (19 октября 2022 г.). «Как «Черная смерть» оставила свой генетический след в будущих поколениях» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 24 октября 2022 г.

[7] Кланк Дж., Вилгалис Т.П., Демер С.Э., Ченг Х., Ширатори М., Мадей Дж. и др. (ноябрь 2022 г.). «Эволюция иммунных генов связана с Черной смертью» . Природа . 611 (7935): 312–319. Бибкод : 2022Natur.611..312K . дои : 10.1038/s41586-022-05349-x . ПМЦ 9580435 . ПМИД 36261521 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]