ДФФА

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Фактор фрагментации ДНК 45 кДа, С-концевой домен
Фактор фрагментации ДНК 45 кДа, С-концевой домен
	ЯМР-структура домена dff-c
Идентификаторы
Символ	ДФФ-С
Пфам	PF09033
ИнтерПро	ИПР015121
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

ДФФА
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1IBX, 1IYR, 1KOY
Идентификаторы
Псевдонимы	DFFA , DFF-45, DFF1, ICAD, субъединица альфа фактора фрагментации ДНК
Внешние идентификаторы	Опустить : 601882 ; МГИ : 1196227 ; Гомологен : 3240 ; GeneCards : DFFA ; OMA : DFFA – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	10,472,529 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	149,205,104 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	internal globus pallidus; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; nipple; ; cardia; ; ventral tegmental area; ; cartilage tissue; ; stromal cell of endometrium; ; renal medulla; ; subthalamic nucleus; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	soleus muscle; ; yolk sac; ; medulla oblongata; ; lip; ; pons; ; quadriceps femoris muscle; ; zone of skin; ; muscle of thigh; ; primary motor cortex; ; tibialis anterior muscle;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; protein domain specific binding; protein folding chaperone activity; deoxyribonuclease inhibitor activity;
Cellular component	cytosol; lipid droplet; intracellular anatomical structure; nucleus; nucleoplasm; cytoplasm; plasma membrane;
Biological process	positive regulation of apoptotic process; negative regulation of execution phase of apoptosis; negative regulation of apoptotic DNA fragmentation; apoptotic DNA fragmentation; thymocyte apoptotic process; apoptotic process; negative regulation of deoxyribonuclease activity; chaperone-mediated protein folding;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1676
	13347
	ENSG00000160049
	ENSMUSG00000028974
	О00273
	О54786
	НМ_213566 ; НМ_004401
	НМ_001025296 ; НМ_010044
	НП_004392 ; НП_998731 ; НП_998731.1
	НП_001020467 ; НП_034174
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица альфа фактора фрагментации ДНК (DFFA) , также известная как ингибитор каспазо-активируемой ДНКазы (ICAD) , представляет собой белок , который у людей кодируется DFFA геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Апоптоз — это процесс гибели клеток, который удаляет токсичные и/или бесполезные клетки во время развития млекопитающих. Апоптозный процесс сопровождается сжатием и фрагментацией клеток и ядер, а также деградацией хромосомной ДНК на нуклеосомные единицы. Фактор фрагментации ДНК (DFF) представляет собой гетеродимерный белок, состоящий из субъединиц массой 40 кДа (DFFB) и 45 кДа (DFFA). DFFA является субстратом каспазы-3 и запускает фрагментацию ДНК во время апоптоза. DFF активируется, когда DFFA расщепляется каспазой-3. Расщепленные фрагменты DFFA диссоциируют от DFFB, активного компонента DFF. Было обнаружено, что DFFB вызывает как фрагментацию ДНК, так и конденсацию хроматина во время апоптоза. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

С -концевой домен DFFA (DFF-C) состоит из четырех альфа-спиралей , которые свернуты в виде спиралевидной упаковки, при этом альфа-2 и альфа-3 упакованы против длинной C-концевой спирали (альфа-4). . Основная функция этого домена — ингибирование DFFB путем связывания с его С-концевым каталитическим доменом посредством ионных взаимодействий, тем самым ингибируя фрагментацию ДНК в апоптотическом процессе. Помимо блокирования ДНКазной активности DFFB, C-концевая область DFFA также важна для DFFB-специфической активности фолдинг- шаперона , о чем свидетельствует способность DFFA рефолдинга DFFB. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что DFFA взаимодействует с DFFB . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160049 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028974 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лик Дж.П., Карр И.М., Белл С.М., Маркхэм А.Ф., Ленч, Нью-Джерси (июнь 1998 г.). «Присвоение гена фактора фрагментации ДНК (DFFA) полосам хромосом человека 1p36.3 -> p36.2 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 79 (3–4): 212–3. дои : 10.1159/000134725 . ПМИД 9605855 .
^ Лю X, Цзоу Х, Слотер С, Ван X (апрель 1997 г.). «DFF, гетеродимерный белок, который действует ниже каспазы-3, вызывая фрагментацию ДНК во время апоптоза» . Клетка . 89 (2): 175–84. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80197-X . ПМИД 9108473 . S2CID 14800864 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор фрагментации ДНК DFFA, 45 кДа, альфа-полипептид» .
^ Фукусима К., Кикучи Дж., Косиба С., Кигава Т., Курода Ю., Ёкояма С. (август 2002 г.). «Структура раствора домена DFF-C DFF45/ICAD. Структурная основа регуляции апоптотической фрагментации ДНК». Журнал молекулярной биологии . 321 (2): 317–27. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00588-0 . ПМИД 12144788 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Сераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Маккарти Дж.С., Тох С.Ю., Ли П. (октябрь 1999 г.). «Исследование DFF45 в роли шаперона и ингибитора: два независимых ингибирующих домена нуклеазной активности DFF40». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 176–80. дои : 10.1006/bbrc.1999.1497 . ПМИД 10527860 .

Дальнейшее чтение

Наканума Ю., Цунеяма К., Сасаки М., Харада К. (август 2000 г.). «Деструкция желчных протоков при первичном билиарном циррозе». Лучшие практики и исследования Байьера. Клиническая гастроэнтерология . 14 (4): 549–70. дои : 10.1053/bega.2000.0103 . ПМИД 10976014 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Энари М., Сакахира Х., Ёкояма Х., Окава К., Ивамацу А., Нагата С. (январь 1998 г.). «ДНКаза, активируемая каспазой, которая разрушает ДНК во время апоптоза, и ее ингибитор ICAD». Природа 391 (6662): 43–50. Бибкод : 1998Nature.391...43E . дои : 10.1038/34112 . ПМИД 9422506 . S2CID 4407426 .
Лю X, Цзоу Х, Видлак П., Гаррард В., Ван Х (май 1999 г.). «Активация апоптотической эндонуклеазы DFF40 (активируемая каспазой ДНКаза или нуклеаза). Олигомеризация и прямое взаимодействие с гистоном H1» . Журнал биологической химии . 274 (20): 13836–40. дои : 10.1074/jbc.274.20.13836 . ПМИД 10318789 .
Гу Дж, Донг Р.П., Чжан С., Маклафлин Д.Ф., Ву MX, Шлоссман С.Ф. (июль 1999 г.). «Функциональное взаимодействие DFF35 и DFF45 с активируемой каспазой нуклеазой фрагментации ДНК DFF40» . Журнал биологической химии . 274 (30): 20759–62. дои : 10.1074/jbc.274.30.20759 . ПМИД 10409614 .
О Джей-Джей, Гроссханс Д.Р., Вонг С.Г., Slamon DJ (октябрь 1999 г.). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов, связанных со сверхэкспрессией HER-2/neu в клетках рака молочной железы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (20): 4008–17. дои : 10.1093/нар/27.20.4008 . ПМК 148668 . ПМИД 10497265 .
Маккарти Дж.С., Тох С.Ю., Ли П. (октябрь 1999 г.). «Исследование DFF45 в роли шаперона и ингибитора: два независимых ингибирующих домена нуклеазной активности DFF40». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 176–80. дои : 10.1006/bbrc.1999.1497 . ПМИД 10527860 .
Маккарти Дж.С., Тох С.Ю., Ли П. (октябрь 1999 г.). «Несколько доменов DFF45 синергически связываются с DFF40: роль расщепления каспазы и секвестрации активаторного домена DFF40». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 181–5. дои : 10.1006/bbrc.1999.1498 . ПМИД 10527861 .
Луговской А.А., Чжоу П., Чжоу Дж.Дж., Маккарти Дж.С., Ли П., Вагнер Г. (декабрь 1999 г.). «Структура раствора домена CIDE-N CIDE-B и модель взаимодействия CIDE-N/CIDE-N в пути фрагментации ДНК при апоптозе» . Клетка . 99 (7): 747–55. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81672-4 . ПМИД 10619428 .
Отомо Т., Сакахира Х., Уэгаки К., Нагата С., Ямадзаки Т. (август 2000 г.). «Структура гетеродимерного комплекса между CAD-доменами CAD и ICAD». Структурная биология природы . 7 (8): 658–62. дои : 10.1038/77957 . ПМИД 10932250 . S2CID 12925074 .
Ксерри Л., Палмерини Ф., Девилар Э., Дефранс Т., Буабдаллах Р., Хассун Дж., Бирг Ф. (октябрь 2000 г.). «Частая ядерная локализация ICAD и цитоплазматическая совместная экспрессия каспазы-8 и каспазы-3 в лимфомах человека». Журнал патологии . 192 (2): 194–202. doi : 10.1002/1096-9896(2000)9999:9999<::AID-PATH685>3.0.CO;2-M . ПМИД 11004695 . S2CID 23831471 .
Чжоу П., Луговской А.А., Маккарти Дж.С., Ли П., Вагнер Г. (май 2001 г.). «Структура раствора N-концевого доменного комплекса DFF40 и DFF45 и взаимная шаперонная активность DFF40 и DFF45» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (11): 6051–5. Бибкод : 2001PNAS...98.6051Z . дои : 10.1073/pnas.111145098 . ПМК 33420 . ПМИД 11371636 .
Шариф-Аскари Э., Алам А., Реом Э., Бересфорд П.Дж., Скотто С., Шарма К., Ли Д., ДеВольф В.Е., Наттолл М.Е., Либерман Дж., Секали Р.П. (июнь 2001 г.). «Прямое расщепление фактора фрагментации ДНК-45 человека гранзимом B индуцирует активируемую каспазой высвобождение ДНКазы и фрагментацию ДНК» . Журнал ЭМБО . 20 (12): 3101–13. дои : 10.1093/emboj/20.12.3101 . ПМК 150191 . ПМИД 11406587 .
Цукада Т., Ватанабэ М., Ямасима Т. (декабрь 2001 г.). «Влияние CAD и ДНКазы II на ишемический некроз нейронов, специфичный для гиппокампа приматов» . Журнал нейрохимии . 79 (6): 1196–206. дои : 10.1046/j.1471-4159.2001.00679.x . ПМИД 11752060 .
Абель Ф., Сьёберг Р.М., Эйескэр К., Крона С., Мартинссон Т. (февраль 2002 г.). «Анализ регуляторов апоптоза CASP9 и DFFA на участке 1P36.2 выявил редкие варианты аллелей в опухолях нейробластомы человека» . Британский журнал рака . 86 (4): 596–604. дои : 10.1038/sj.bjc.6600111 . ПМК 2375272 . ПМИД 11870543 .
Шарье Л., Жарри А., Токе С., Бу-Ханна С., Чедорж М., Денис М., Валлетт Дж., Лабуас К.Л. (апрель 2002 г.). «Зависимая от фазы роста экспрессия ICAD-L/DFF45 модулирует характер апоптоза в клетках рака толстой кишки человека». Исследования рака . 62 (7): 2169–74. ПМИД 11929840 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR015121.

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160049 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028974 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9605855-5] Лик Дж.П., Карр И.М., Белл С.М., Маркхэм А.Ф., Ленч, Нью-Джерси (июнь 1998 г.). «Присвоение гена фактора фрагментации ДНК (DFFA) полосам хромосом человека 1p36.3 -> p36.2 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 79 (3–4): 212–3. дои : 10.1159/000134725 . ПМИД 9605855 .

[pmid9108473-6] Лю X, Цзоу Х, Слотер С, Ван X (апрель 1997 г.). «DFF, гетеродимерный белок, который действует ниже каспазы-3, вызывая фрагментацию ДНК во время апоптоза» . Клетка . 89 (2): 175–84. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80197-X . ПМИД 9108473 . S2CID 14800864 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор фрагментации ДНК DFFA, 45 кДа, альфа-полипептид» .

[pmid12144788-8] Фукусима К., Кикучи Дж., Косиба С., Кигава Т., Курода Ю., Ёкояма С. (август 2002 г.). «Структура раствора домена DFF-C DFF45/ICAD. Структурная основа регуляции апоптотической фрагментации ДНК». Журнал молекулярной биологии . 321 (2): 317–27. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00588-0 . ПМИД 12144788 .

[pmid17353931-9] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Сераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid10527860-10] Маккарти Дж.С., Тох С.Ю., Ли П. (октябрь 1999 г.). «Исследование DFF45 в роли шаперона и ингибитора: два независимых ингибирующих домена нуклеазной активности DFF40». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 176–80. дои : 10.1006/bbrc.1999.1497 . ПМИД 10527860 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]