RNF144A

RNF144A
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1WIM
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF144A , RNF144, UBCE7IP4, белок с рингевым пальцем 144A, HUIP4, UIP4
Внешние идентификаторы	MGI : 1344401 ; Гомологен : 40982 ; GeneCards : RNF144A ; OMA : RNF144A - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	7,068,286 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	26,465,253 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; ganglionic eminence; ; corpus callosum; ; body of pancreas; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; C1 segment; ; paraflocculus of cerebellum; ; internal globus pallidus; ; nucleus accumbens;
	Top expressed in
	granulocyte; ; right lung lobe; ; maxillary prominence; ; left lung lobe; ; mandibular prominence; ; Rostral migratory stream; ; medial ganglionic eminence; ; brown adipose tissue; ; external carotid artery; ; internal carotid artery;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	ubiquitin-protein transferase activity; ubiquitin conjugating enzyme binding; metal ion binding; transferase activity; ubiquitin protein ligase activity; protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; Golgi apparatus; cytoplasmic vesicle membrane; membrane; cytoplasmic vesicle; ubiquitin ligase complex; endosome membrane; intracellular membrane-bounded organelle; cytoplasm;
Biological process	protein polyubiquitination; positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein ubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9781
	108089
	ENSG00000151692
	Ensmusg00000020642
	P50876
	Q925F3
showNM_014746 ; NM_001349181 ; NM_001349182 ; NM_001349183 ; NM_001349184 ;
	NM_001349185; NM_001349186
	NM_001081977 ; NM_080563
showNP_055561 ; NP_001336110 ; NP_001336111 ; NP_001336112 ; NP_001336113 ;
	NP_001336114; NP_001336115
	NP_001075446 ; NP_542130
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

RNF144A является убиквитин-лигазой E3, принадлежащей к семейству кольцевого кольца (RBR) убиквитин- лигаз , чьи специфические элементы, как было показано, функционируют как гибридные лигазы E3-кольца. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} RNF144A наиболее тесно связан с RNF144B на уровне белка, и два белка вместе составляют субдомен в семействе RBR белков. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Убиквитиновая лигаза активность RNF144A катализирует убиквитиновые связи в положениях Ubiquitin в K6-, K11- и K48-Ubiquitin in vitro и регулируется самооссоциацией через его трансмембранное домен. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Биологические функции RNF144a являются/относительно неизвестны за пределами его внутренней ферментативной активности . Соматические мутации RNF144A были каталогизированы в генетических базах данных о раке в нескольких первичных опухолях человека , включая молочную , желудок , лимфому , глиобластому , матки и рак легких . Другие члены семейства RBR были связаны с неврологическими и иммунологическими заболеваниями, в первую очередь паркин , Hoil-1l и Hoip (RNF31). ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Текущими известными субстратами RNF144A, нацеленными на деградацию, являются белки, участвующие в репарации ДНК , функцию теплового отбора/шаперона и передачу сигналов, что согласуется с преобладающей ассоциацией этого белка с раком и включает ( ДНК-PKCS ), PARP1 , HSPA2 , BMI1 и RAF1 . ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}

Смотрите также

RING FINGEMAN

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000151692 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG0000000020642 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Венцель Д.М., Лиссунова А., Брзович П.С., Клевит Р.Е. (июнь 2011 г.). «Профиль реакционной способности UBCH7 показывает, что Паркин и Ххари являются гибридами кольца/гекта» . Природа . 474 (7349): 105–8. doi : 10.1038/nature09966 . PMC 3444301 . PMID 21532592 .
^ «RNF144A Bercing Pinger Bellin 144a [Homo sapiens (человек)] - ген - ncbi» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Национальный центр информации о биотехнологии , Национальная медицина США . Получено 2019-10-27 .
^ «RNF144A - E3 Ubiquitin -протеин лигаза RNF144A - Homo Sapiens (Human) - RNF144A Gene & Protein» . www.uniprot.org . Uniprot . Получено 2019-10-27 .
^ Dove KK, Klevit Re (ноябрь 2017 г.). «Кольцевая кольца E3 LIGASES: новые темы среди вариаций» . Журнал молекулярной биологии . 429 (22): 3363–3375. doi : 10.1016/j.jmb.2017.08.008 . PMC 5675740 . PMID 28827147 .
^ Spratt DE, Walden H, Shaw GS (март 2014 г.). «RBR E3 Ubiquitin Ligases: новые структуры, новые идеи, новые вопросы» . Биохимический журнал . 458 (3): 421–37. doi : 10.1042/bj20140006 . PMC 3940038 . PMID 24576094 .
^ Eisenhaber B, Chumak N, Eisenhaber F, Hauser MT (2007). «Кольцо между белком кольца между скрипками (RBR)» . Биология генома . 8 (3): 209. DOI : 10.1186/GB-2007-8-3-209 . PMC 1868946 . PMID 17367545 .
^ Мишель М.А., Сватек К.Н., Госпиталь М.К., Командер Д. (октябрь 2017). «Аффимеры, специфичные для убиквитина, раскрывают представление о передаче сигналов Ubiquitin, связанной с K6» . Молекулярная клетка . 68 (1): 233–246.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.08.020 . PMC 5640506 . PMID 28943312 .
^ Ho Sr, Lee YJ, Lin WC (сентябрь 2015 г.). «Регуляция активности убиквитиновой лигазы RNF144A E3 путем самоассоциации посредством его трансмембранного домена» . Журнал биологической химии . 290 (38): 23026–38. doi : 10.1074/jbc.m115.645499 . PMC 4645615 . PMID 26216882 .
^ Пикрелл А.М., Юл Р.Дж. (январь 2015 г.). «Роли Pink1, Parkin и митохондриальной верности при болезни Паркинсона» . Нейрон . 85 (2): 257–73. doi : 10.1016/j.neuron.2014.12.007 . PMC 4764997 . PMID 25611507 .
^ Oda H, Beck DB, Kuehn HS, Sampaio Moura N, Hoffmann P, Ibarra M, et al. (2019-03-18). «Второй случай дефицита HOIP расширяет клинические особенности и определяет воспалительный транскриптом, регулируемый Lubac» . Границы в иммунологии . 10 : 479. doi : 10.3389/fimmu.2019.00479 . PMC 6431612 . PMID 30936877 .
^ Boisson B, Laplantine E, Dobbs K, Cobat A, Tarantino N, Hazen M, et al. (Июнь 2015 г.). «Дефицит Hoip и Lubac лежит лежит в основе аутоинфляции, иммунодефицита, амилопектиноза и лимфангиэктазии» . Журнал экспериментальной медицины . 212 (6): 939–51. doi : 10.1084/jem.20141130 . PMC 4451137 . PMID 26008899 .
^ Boisson B, Laplantine E, Prando C, Giliani S, Israelsson E, Xu Z, et al. (Декабрь 2012 г.). «Иммунодефицит, аутоинфляция и амилопектиноз у людей с наследственным дефицитом Hoil-1 и Lubac» . Природа иммунология . 13 (12): 1178–86. doi : 10.1038/ni.2457 . PMC 3514453 . PMID 23104095 .
^ Ho Sr, Mahanic CS, Lee YJ, Lin WC (июль 2014 г.). «RNF144A, убиквитин-лигаза E3 для ДНК-PKC, способствует апоптозу во время повреждения ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (26): E2646-55. Bibcode : 2014pnas..111E2646H . doi : 10.1073/pnas.1323107111 . PMC 4084471 . PMID 24979766 .
^ Zhang Y, Liao XH, Xie HY, Shao ZM, Li DQ (ноябрь 2017). «RBR-тип E3 убиквитиновой лигазы RNF144A нацелен на PARP1 для убиквитин-зависимой деградации и регулирует чувствительность ингибитора PARP в клетках рака молочной железы» . Oncotarget . 8 (55): 94505–94518. doi : 10.18632/oncotarget.21784 . PMC 5706891 . PMID 29212245 .
^ Ян Й.Л., Чжан Ю., Ли Д.Д., Чжан Ф.Л., Лю Хи, Ляо Х.Х. и др. (Август 2019). «RNF144A функционирует в качестве супрессора опухоли при раке молочной железы посредством убиквитин-лигазы, зависящей от активности регуляции стабильности и онкогенных функций HSPA2» . Гибель клеток и дифференциация . 27 (3): 1105–1118. doi : 10.1038/s41418-019-0400-z . PMC 7205990 . PMID 31406303 .
^ Jin X, Kim LJ, Wu Q, Wallace LC, Prager BC, Sanvoranart T, et al. (Ноябрь 2017). «Нацеливание стволовых клеток глиомы посредством комбинированного ингибирования ИМТ1 и EZH2» . Природная медицина . 23 (11): 1352–1361. doi : 10.1038/nm.4415 . PMC 5679732 . PMID 29035367 .
^ Afzali B, Kim S, West E, Nova-Lamperti E, Cheru N, Nagashima H, et al. (2019-09-26). «RNF144A формирует иерархию передачи сигналов цитокинов для обеспечения защитного иммунитета против гриппа» . doi : 10.1101/782680 . {{cite journal}}: CITE Journal требует |journal= ( помощь )

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000151692 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG0000000020642 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] Венцель Д.М., Лиссунова А., Брзович П.С., Клевит Р.Е. (июнь 2011 г.). «Профиль реакционной способности UBCH7 показывает, что Паркин и Ххари являются гибридами кольца/гекта» . Природа . 474 (7349): 105–8. doi : 10.1038/nature09966 . PMC 3444301 . PMID 21532592 .

[6] «RNF144A Bercing Pinger Bellin 144a [Homo sapiens (человек)] - ген - ncbi» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Национальный центр информации о биотехнологии , Национальная медицина США . Получено 2019-10-27 .

[7] «RNF144A - E3 Ubiquitin -протеин лигаза RNF144A - Homo Sapiens (Human) - RNF144A Gene & Protein» . www.uniprot.org . Uniprot . Получено 2019-10-27 .

[8] Dove KK, Klevit Re (ноябрь 2017 г.). «Кольцевая кольца E3 LIGASES: новые темы среди вариаций» . Журнал молекулярной биологии . 429 (22): 3363–3375. doi : 10.1016/j.jmb.2017.08.008 . PMC 5675740 . PMID 28827147 .

[9] Spratt DE, Walden H, Shaw GS (март 2014 г.). «RBR E3 Ubiquitin Ligases: новые структуры, новые идеи, новые вопросы» . Биохимический журнал . 458 (3): 421–37. doi : 10.1042/bj20140006 . PMC 3940038 . PMID 24576094 .

[10] Eisenhaber B, Chumak N, Eisenhaber F, Hauser MT (2007). «Кольцо между белком кольца между скрипками (RBR)» . Биология генома . 8 (3): 209. DOI : 10.1186/GB-2007-8-3-209 . PMC 1868946 . PMID 17367545 .

[11] Мишель М.А., Сватек К.Н., Госпиталь М.К., Командер Д. (октябрь 2017). «Аффимеры, специфичные для убиквитина, раскрывают представление о передаче сигналов Ubiquitin, связанной с K6» . Молекулярная клетка . 68 (1): 233–246.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.08.020 . PMC 5640506 . PMID 28943312 .

[12] Ho Sr, Lee YJ, Lin WC (сентябрь 2015 г.). «Регуляция активности убиквитиновой лигазы RNF144A E3 путем самоассоциации посредством его трансмембранного домена» . Журнал биологической химии . 290 (38): 23026–38. doi : 10.1074/jbc.m115.645499 . PMC 4645615 . PMID 26216882 .

[13] Пикрелл А.М., Юл Р.Дж. (январь 2015 г.). «Роли Pink1, Parkin и митохондриальной верности при болезни Паркинсона» . Нейрон . 85 (2): 257–73. doi : 10.1016/j.neuron.2014.12.007 . PMC 4764997 . PMID 25611507 .

[14] Oda H, Beck DB, Kuehn HS, Sampaio Moura N, Hoffmann P, Ibarra M, et al. (2019-03-18). «Второй случай дефицита HOIP расширяет клинические особенности и определяет воспалительный транскриптом, регулируемый Lubac» . Границы в иммунологии . 10 : 479. doi : 10.3389/fimmu.2019.00479 . PMC 6431612 . PMID 30936877 .

[15] Boisson B, Laplantine E, Dobbs K, Cobat A, Tarantino N, Hazen M, et al. (Июнь 2015 г.). «Дефицит Hoip и Lubac лежит лежит в основе аутоинфляции, иммунодефицита, амилопектиноза и лимфангиэктазии» . Журнал экспериментальной медицины . 212 (6): 939–51. doi : 10.1084/jem.20141130 . PMC 4451137 . PMID 26008899 .

[16] Boisson B, Laplantine E, Prando C, Giliani S, Israelsson E, Xu Z, et al. (Декабрь 2012 г.). «Иммунодефицит, аутоинфляция и амилопектиноз у людей с наследственным дефицитом Hoil-1 и Lubac» . Природа иммунология . 13 (12): 1178–86. doi : 10.1038/ni.2457 . PMC 3514453 . PMID 23104095 .

[17] Ho Sr, Mahanic CS, Lee YJ, Lin WC (июль 2014 г.). «RNF144A, убиквитин-лигаза E3 для ДНК-PKC, способствует апоптозу во время повреждения ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (26): E2646-55. Bibcode : 2014pnas..111E2646H . doi : 10.1073/pnas.1323107111 . PMC 4084471 . PMID 24979766 .

[18] Zhang Y, Liao XH, Xie HY, Shao ZM, Li DQ (ноябрь 2017). «RBR-тип E3 убиквитиновой лигазы RNF144A нацелен на PARP1 для убиквитин-зависимой деградации и регулирует чувствительность ингибитора PARP в клетках рака молочной железы» . Oncotarget . 8 (55): 94505–94518. doi : 10.18632/oncotarget.21784 . PMC 5706891 . PMID 29212245 .

[19] Ян Й.Л., Чжан Ю., Ли Д.Д., Чжан Ф.Л., Лю Хи, Ляо Х.Х. и др. (Август 2019). «RNF144A функционирует в качестве супрессора опухоли при раке молочной железы посредством убиквитин-лигазы, зависящей от активности регуляции стабильности и онкогенных функций HSPA2» . Гибель клеток и дифференциация . 27 (3): 1105–1118. doi : 10.1038/s41418-019-0400-z . PMC 7205990 . PMID 31406303 .

[20] Jin X, Kim LJ, Wu Q, Wallace LC, Prager BC, Sanvoranart T, et al. (Ноябрь 2017). «Нацеливание стволовых клеток глиомы посредством комбинированного ингибирования ИМТ1 и EZH2» . Природная медицина . 23 (11): 1352–1361. doi : 10.1038/nm.4415 . PMC 5679732 . PMID 29035367 .

[21] Afzali B, Kim S, West E, Nova-Lamperti E, Cheru N, Nagashima H, et al. (2019-09-26). «RNF144A формирует иерархию передачи сигналов цитокинов для обеспечения защитного иммунитета против гриппа» . doi : 10.1101/782680 . {{cite journal}}: CITE Journal требует |journal= ( помощь )

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]