ДАМП2

ДАМП2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1S3A
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFA2 , B8, CD14, CIB8, субъединица A2 НАДН:убихиноноксидоредуктазы, MC1DN13
Внешние идентификаторы	Опустить : 602137 ; МГИ : 1343103 ; Гомологен : 37628 ; Генные карты : NDUFA2 ; ОМА : NDUFA2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	140,647,771 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	36,877,610 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	biceps brachii; ; right ventricle; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; apex of heart; ; triceps brachii muscle; ; mucosa of transverse colon; ; vastus lateralis muscle; ; thoracic diaphragm; ; left ventricle; ; body of tongue;
	Top expressed in
	aortic valve; ; fossa; ; facial motor nucleus; ; ascending aorta; ; medullary collecting duct; ; condyle; ; renal corpuscle; ; intercostal muscle; ; right kidney; ; Paneth cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity;
Cellular component	mitochondrial inner membrane; mitochondrial respiratory chain complex I; respirasome; membrane; mitochondrion; mitochondrial membranes;
Biological process	mitochondrial respiratory chain complex I assembly; mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone; blastocyst hatching;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4695
	17991
	ENSG00000131495
	ENSMUSG00000014294
	О43678
	Q9CQ75
	НМ_001185012 ; НМ_002488
	НМ_010885
	НП_001171941 ; НП_002479
	НП_035015
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 2 альфа-подкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 представляет собой белок , который у человека кодируется NDUFA2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Белок NDUFA2 представляет собой субъединицу НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . ^{[ 7 ]} Мутации гена NDUFA2 связаны с синдромом Ли . ^{[ 6 ]}

Структура

Ген NDUFA2 расположен на длинном (q) плече хромосомы 5 в положении 31,2 и охватывает 2422 пары оснований. ^{[ 6 ]} Ген NDUFA2 производит белок массой 11 кДа, состоящий из 99 аминокислот . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} NDUFA2 является субъединицей фермента НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , крупнейшего из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания НАДН. ^{[ 7 ]} NDUFA2 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, образующей трансмембранную область Комплекса I. Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен потенциально может сворачиваться в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю митохондриальную мембрану с C-концевым гидрофильным доменом. взаимодействующих с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура позволяет предположить, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН:убихиноноксидоредуктаза на внутренней митохондриальной мембране. ^{[ 6 ]}

Функция

Человеческий ген NDUFA2 кодирует субъединицу комплекса I дыхательной цепи , которая переносит электроны от НАДН к убихинону . NDUFA2 представляет собой добавочную субъединицу Комплекса I, которая, как полагают, не участвует в катализе, но может участвовать в регуляции активности Комплекса I или его сборке посредством участия в окислительно-восстановительных процессах. ^{[ 6 ]}^{[ 10 ]} Первоначально НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо протезного плеча флавинмононуклеотида (FMN ) с образованием FMNH ₂ . Электроны передаются через серию железо-серных кластеров (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH ₂ ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Мутации в гене NDUFA2 могут привести к синдрому Ли — тяжелому неврологическому расстройству, которое обычно возникает на первом году жизни. ^{[ 6 ]} Одна из таких мутаций нарушает нормальный паттерн сплайсинга и приводит к пропуску экзона 2. Это вызывает снижение активности Комплекса I и нарушает его сборку. Мутация NDUFA2 также связана с деполяризацией митохондрий. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

NDUFA2 имеет множество белковых взаимодействий, включая взаимодействия с другими членами субкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 альфа, другими субъединицами Комплекса I , а также с окислительно-восстановительными белками. Это может быть связано с его потенциальной ролью в сборке Комплекса I и содействием в окислительно-восстановительных процессах. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131495 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014294 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Эмахазион Т., Брукс Эй.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Картирование генов электрон-транспортной цепи NDUFA2, NDUFA6, NDUFA7, NDUFB8 и NDUFS8 с помощью радиационного гибридного картирования на основе интронов». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 (1–2): 114. дои : 10.1159/000015081 . ПМИД 9763676 . S2CID 46861680 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г «Ген Энтреза: NDUFA2 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 2, 8 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Пратт, Дональд Воэт, Джудит Г. Воэт, Шарлотта В. (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN 9780470547847 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ «НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-субъединица 2 субкомплекса» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
^ «NDUFA2-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-субъединица 2 субкомплекса» . UniProt: центр информации о белках . Консорциум UniProt . Проверено 24 марта 2015 г.
^ Хофс С.Дж., Дитерен К.Э., Дистельмайер Ф., Янссен Р.Дж., Эпплен А., Свартс Х.Г., Форкинк М., Роденбург Р.Дж., Нейтманс Л.Г., Виллемс П.Х., Смейтинк Дж.А., ван ден Хеувел Л.П. (июнь 2008 г.). «Мутация комплекса I NDUFA2 приводит к болезни Ли» . Американский журнал генетики человека . 82 (6): 1306–1315. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.05.007 . ПМЦ 2427319 . ПМИД 18513682 .

Дальнейшее чтение

Уокер Дж. Э., Арисменди Дж. М., Дюпюи А., Фернли И. М., Финель М., Медд С. М., Пилкингтон С. Дж., Рансуик М. Дж., Скехель Дж. М. (август 1992 г.). «Последовательности 20 субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы из митохондрий бычьего сердца. Применение новой стратегии секвенирования белков с использованием полимеразной цепной реакции». Журнал молекулярной биологии . 226 (4): 1051–72. дои : 10.1016/0022-2836(92)91052-Q . ПМИД 1518044 .
Данбар Д.Р., Шибасаки Ю., Добби Л., Андерссон Б., Брукс А.Дж. (1997). «Гибридизационное картирование in situ геномных клонов пяти генов комплекса I дыхательной цепи человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 78 (1): 21–4. дои : 10.1159/000134618 . ПМИД 9345899 .
Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бускенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (декабрь 1998 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 253 (2): 415–22. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .
Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ, Фу Г, Шен Ю, Фань ХИ, Лу Г, Чжун М, Сюй XR, Хань ZG, Чжан JW, Тао Дж, Хуан QH, Чжоу Дж , Ху GX, Гу J, Чен SJ, Чен Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
Брокманн С., Диль А., Ребейн К., Штраус Х., Шмидер П., Корн Б., Кюне Р., Ошкинат Х. (сентябрь 2004 г.). «Окисленная субъединица B8 человеческого комплекса I принимает тиоредоксиновую складку» . Структура . 12 (9): 1645–54. дои : 10.1016/j.str.2004.06.021 . ПМИД 15341729 .
Фогель Р.О., Дитерен К.Э., ван ден Хеувел Л.П., Виллемс П.Х., Смейтинк Дж.А., Купман В.Дж., Нейтманс Л.Г. (март 2007 г.). «Идентификация промежуточных продуктов сборки митохондриального комплекса I путем отслеживания меченого NDUFS3 демонстрирует точку входа митохондриальных субъединиц» . Журнал биологической химии . 282 (10): 7582–90. дои : 10.1074/jbc.M609410200 . hdl : 2066/52607 . ПМИД 17209039 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131495 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014294 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9763676-5] Эмахазион Т., Брукс Эй.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Картирование генов электрон-транспортной цепи NDUFA2, NDUFA6, NDUFA7, NDUFB8 и NDUFS8 с помощью радиационного гибридного картирования на основе интронов». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 (1–2): 114. дои : 10.1159/000015081 . ПМИД 9763676 . S2CID 46861680 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г «Ген Энтреза: NDUFA2 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 2, 8 кДа» .

[Biochem-7] Jump up to: ^а ^б ^с Пратт, Дональд Воэт, Джудит Г. Воэт, Шарлотта В. (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN 9780470547847 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[COPaKB-8] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[url_COPaKB-9] «НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-субъединица 2 субкомплекса» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .

[10] «NDUFA2-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-субъединица 2 субкомплекса» . UniProt: центр информации о белках . Консорциум UniProt . Проверено 24 марта 2015 г.

[11] Хофс С.Дж., Дитерен К.Э., Дистельмайер Ф., Янссен Р.Дж., Эпплен А., Свартс Х.Г., Форкинк М., Роденбург Р.Дж., Нейтманс Л.Г., Виллемс П.Х., Смейтинк Дж.А., ван ден Хеувел Л.П. (июнь 2008 г.). «Мутация комплекса I NDUFA2 приводит к болезни Ли» . Американский журнал генетики человека . 82 (6): 1306–1315. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.05.007 . ПМЦ 2427319 . ПМИД 18513682 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]