Место внутреннего входа вируса гепатита С.
| Место внутреннего входа вируса гепатита С. | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности IRES_HCV | |
| Идентификаторы | |
| Символ | Ires_hcv |
| Альт. Символы | HCV_IRE |
| RFAM | RF00061 |
| Другие данные | |
| РНК тип | Cis-reg ; IRES |
| Домен (ы) | Вирусы |
| ИДТИ | Go: 0043022 |
| ТАК | SO: 0000243 |
| PDB Структуры | PDBE |
Место внутреннего входа вируса вируса гепатита С , или HCV IRES , представляет собой РНК структуру в 5'UTR генома HCV, которая опосредует независимую от CAP инициацию трансляции.
Трансляция белка большинства эукариотических мРНК происходит с помощью CAP-зависимого механизма и требует ассоциации меж ТРНК I Из несколько факторов эукариотического инициации и GTP с рибосомальной субъединицей 40 -х годов, наборы в 5 'Cap и сканирование по 5' UTR, чтобы достичь начала кодона. Напротив, трансляция мРНК вируса вируса гепатита С (HCV) инициируется другим механизмом из обычной 5-'модели связывания CAP. [ 1 ] Этот альтернативный механизм опирается на прямое связывание рибосомальной субъединицы 40S с помощью внутреннего сайта входа рибосомы (IRES) в 5 'UTR РНК HCV. HCV IRES принимает сложную структуру и может значительно отличаться от элементов IRES, выявленных у пикорнавирусов . Было показано, что небольшое количество эукариотических мРНК переводится внутренним входом рибосомы. [ 2 ] [ 3 ]
Структура IRES
[ редактировать ]Считается, что нуклеотиды 1–40 мРНК HCV не способствуют трансляции и скорее необходимы для репликации геномной РНК . Остальная часть HCV 5'-UTR состоит из трех доменов, а именно доменов II-IV (домен I расположен на 5'-конце мРНК). [ Цитация необходима ]
Механизм действия
[ редактировать ]HCV IRES независимо связывает два компонента механизма инициации эукариотической трансляции, мультипротеинового коэффициента инициации EIF3 и 40S малой рибосомальной субъединицы . Более того, он связывает 40-е годы таким образом, чтобы кодон инициатора AUG расположен в рибосомальном p-сайте, поэтому рибосомальное сканирование не требуется. Следовательно, сканирующие факторы EIF1 и eIF1A не подлежат неохотному для трансляции HCV, как и компоненты комплекса EIF4F ( EIF4A , EIF4E и EIF4G ) и eIF4B , которые обычно необходимы для связывания мРНК и размолания 5'UTR . Инициаторная тРНК доставляется либо EIF2 , либо, в условиях стресса, когда EIF2 инактивируется, EIF2A , EIF2D или, возможно, EIF5B , гомолога прокариотического белка IF2 . [ Цитация необходима ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Lytle Jr, Wu L, Robertson HD (август 2002 г.). «Домены на местах внутреннего входа вируса гепатита С для связывания субъединиц 40 -х» . РНК . 8 (8): 1045–1055. doi : 10.1017/s13558388202029965 . PMC 1370315 . PMID 12212848 .
- ^ Beales LP, Rowlands DJ, Holzenburg A (май 2001). «Внутренний участок входа рибосомы (IRES) вируса гепатита С, визуализируемый с помощью электронной микроскопии» . РНК . 7 (5): 661–670. doi : 10.1017/s1355838201001406 . PMC 1370118 . PMID 11350030 .
- ^ Gallego J, Varani G (апрель 2002 г.). «Внутренний сайт вируса гепатита С. Вход: новая мишень для противовирусных исследований». Биохимическое общество транзакций . 30 (2): 140–145. doi : 10.1042/bst0300140 . PMID 12023841 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Malygin AA, Kossinova OA, Shatsky In, Karpova GG (октябрь 2013 г.). «HCV IRES взаимодействует с 18S рРНК, чтобы активировать рибосому 40 -х годов для последующих этапов инициации трансляции» . Исследование нуклеиновых кислот . 41 (18): 8706–8714. doi : 10.1093/nar/gkt632 . PMC 3794592 . PMID 23873958 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница для вируса вируса гепатита С.