RpYN06

БатКоВ RpYN06
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Нидовиралес
Семья:	Коронавирусы
Род:	Бетакоронавирус
Подрод:	Сарбековирус
Разновидность:	Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом
Напряжение:	БатКоВ RpYN06

Коронавирус летучих мышей RpYN06 — это SARS-подобный бетакоронавирус , поражающий подковоноса Rhinolophus pusillus . Это близкий родственник SARS-CoV-2 с идентичностью последовательностей на 94,48% . ^[1]

Филогенетика

Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-2 и родственных коронавирусов: ^[2]^[3]

Коронавирус, родственный SARS‑CoV‑2

( Летучая мышь ) Rc-o319 , 81% к SARS-CoV-2, Rhinolophus cornutus , Ивате , Япония ^[4]

	Летучая мышь SL-ZXC21 , 88% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Чжоушань , Чжэцзян ^[5]

	Летучая мышь SL-ZC45 , 88% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Чжоушань, Чжэцзян ^[5]

Панголин SARSr-CoV-GX, 85,3% к SARS-CoV-2, Manis javanica , контрабандой доставлен из Юго-Восточной Азии. ^[6]

Панголин SARSr-CoV-GD, 90,1% SARS-CoV-2, Manis javanica , контрабандой доставлен из Юго-Восточной Азии. ^[7]

	Летучая мышь RshSTT182, 92,6% к SARS-CoV-2, Rhinolophus шамли , Стеунг Тренг , Камбоджа ^[8]

	Летучая мышь RshSTT200, 92,6% к SARS-CoV-2, Rhinolophushamli , Стунг Тренг, Камбоджа ^[8]

	(Летучая мышь) RacCS203 , 91,5% к SARS-CoV-2, Rhinolophus acuminatus , Чаченгсао , Таиланд ^[3]

	(Летучая мышь) RmYN02 , 93,3% к SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Менгла , Юньнань ^[9]

(Летучая мышь) RpYN06 , 94,4% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Сишуанбаньна , Юньнань ^[2]

	(Летучая мышь) RaTG13 , 96,1% к SARS-CoV-2, Rhinolophus affinis , Модзян , Юньнань ^[10]

	(Летучая мышь) BANAL-52 , 96,8% к SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Вьентьян , Лаос ^[11]

	SARS-CoV-2

SARS-CoV-1 , 79% до SARS-CoV-2

Ссылки

^ Хун Чжоу; Цзинкай Цзи; Син Чен; Юхай Би; Хуан Ли; Тао Ху; Хао Сун; Яньхуа Чен; Минсюэ Цуй; Яньян Чжан; Элис К. Хьюз; Эдвард С. Холмс; Вэйфэн Ши (8 марта 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на два эволюционных происхождения SARS-CoV-2 и родственных вирусов» . Клетка . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . ПМЦ 8188299 . ПМИД 34147139 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чжоу Х., Цзи Дж., Чен Х., Би Ю., Ли Дж., Ван Ц. и др. (август 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на эволюционное происхождение SARS-CoV-2 и родственных вирусов» . Клетка . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . ПМЦ 8188299 . ПМИД 34147139 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Вачараплуесади С., Тан К.В., Маниорн П., Дуэнкэ П., Чжу Ф., Джойджинда Ю. и др. (февраль 2021 г.). «Доказательства наличия коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, циркулирующих у летучих мышей и панголинов в Юго-Восточной Азии» . Природные коммуникации . 12 (1): 972. Бибкод : 2021NatCo..12..972W . дои : 10.1038/s41467-021-21240-1 . ПМЦ 7873279 . ПМИД 33563978 .
^ Мураками С., Китамура Т., Сузуки Дж., Сато Р., Аой Т., Фуджи М. и др. (декабрь 2020 г.). «Обнаружение и характеристика сарбековируса летучих мышей, филогенетически родственного SARS-CoV-2, Япония» . Новые инфекционные заболевания . 26 (12): 3025–3029. дои : 10.3201/eid2612.203386 . ПМК 7706965 . ПМИД 33219796 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .
^ Лам Т.Т., Цзя Н., Чжан Ю.В., Шум М.Х., Цзян Дж.Ф., Чжу Х.К. и др. (июль 2020 г.). «Идентификация коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, у малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 282–285. Бибкод : 2020Natur.583..282L . дои : 10.1038/s41586-020-2169-0 . ПМИД 32218527 . S2CID 214683303 .
^ Сяо К., Чжай Дж., Фэн Ю., Чжоу Н., Чжан Х., Цзоу Дж.Дж. и др. (июль 2020 г.). «Выделение коронавируса, связанного с SARS-CoV-2, от малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 286–289. Бибкод : 2020Natur.583..286X . дои : 10.1038/s41586-020-2313-x . ПМИД 32380510 . S2CID 256822274 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Делон Д., Хул В., Карлссон Е.А., Хассанин А., Оу Т.П., Байдалюк А. и др. (ноябрь 2021 г.). «Новый коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, у летучих мышей из Камбоджи» . Природные коммуникации . 12 (1): 6563. Бибкод : 2021NatCo..12.6563D . дои : 10.1038/s41467-021-26809-4 . ПМЦ 8578604 . ПМИД 34753934 .
^ Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .
^ Чжоу П., Ян XL, Ван XG, Ху Б, Чжан Л., Чжан В. и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей» . Природа . 579 (7798): 270–273. Бибкод : 2020Natur.579..270Z . дои : 10.1038/s41586-020-2012-7 . ПМК 7095418 . ПМИД 32015507 .
^ Теммам С., Вонгфайлот К., Бакеро Е., Мунье С., Бономи М., Рено Б. и др. (апрель 2022 г.). «Коронавирусы летучих мышей, родственные SARS-CoV-2 и заразные для клеток человека». Природа . 604 (7905): 330–336. Бибкод : 2022Natur.604..330T . дои : 10.1038/s41586-022-04532-4 . ПМИД 35172323 . S2CID 246902858 .

[1] Хун Чжоу; Цзинкай Цзи; Син Чен; Юхай Би; Хуан Ли; Тао Ху; Хао Сун; Яньхуа Чен; Минсюэ Цуй; Яньян Чжан; Элис К. Хьюз; Эдвард С. Холмс; Вэйфэн Ши (8 марта 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на два эволюционных происхождения SARS-CoV-2 и родственных вирусов» . Клетка . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . ПМЦ 8188299 . ПМИД 34147139 .

[RpYN06-2] Перейти обратно: ^а ^б Чжоу Х., Цзи Дж., Чен Х., Би Ю., Ли Дж., Ван Ц. и др. (август 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на эволюционное происхождение SARS-CoV-2 и родственных вирусов» . Клетка . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . ПМЦ 8188299 . ПМИД 34147139 .

[RacCS203-3] Перейти обратно: ^а ^б Вачараплуесади С., Тан К.В., Маниорн П., Дуэнкэ П., Чжу Ф., Джойджинда Ю. и др. (февраль 2021 г.). «Доказательства наличия коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, циркулирующих у летучих мышей и панголинов в Юго-Восточной Азии» . Природные коммуникации . 12 (1): 972. Бибкод : 2021NatCo..12..972W . дои : 10.1038/s41467-021-21240-1 . ПМЦ 7873279 . ПМИД 33563978 .

[Rc-o319-4] Мураками С., Китамура Т., Сузуки Дж., Сато Р., Аой Т., Фуджи М. и др. (декабрь 2020 г.). «Обнаружение и характеристика сарбековируса летучих мышей, филогенетически родственного SARS-CoV-2, Япония» . Новые инфекционные заболевания . 26 (12): 3025–3029. дои : 10.3201/eid2612.203386 . ПМК 7706965 . ПМИД 33219796 .

[ZXC21-5] Перейти обратно: ^а ^б Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .

[Pangolin_CoV_GX-6] Лам Т.Т., Цзя Н., Чжан Ю.В., Шум М.Х., Цзян Дж.Ф., Чжу Х.К. и др. (июль 2020 г.). «Идентификация коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, у малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 282–285. Бибкод : 2020Natur.583..282L . дои : 10.1038/s41586-020-2169-0 . ПМИД 32218527 . S2CID 214683303 .

[Pangolin_CoV_GD-7] Сяо К., Чжай Дж., Фэн Ю., Чжоу Н., Чжан Х., Цзоу Дж.Дж. и др. (июль 2020 г.). «Выделение коронавируса, связанного с SARS-CoV-2, от малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 286–289. Бибкод : 2020Natur.583..286X . дои : 10.1038/s41586-020-2313-x . ПМИД 32380510 . S2CID 256822274 .

[RshSTT-8] Перейти обратно: ^а ^б Делон Д., Хул В., Карлссон Е.А., Хассанин А., Оу Т.П., Байдалюк А. и др. (ноябрь 2021 г.). «Новый коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, у летучих мышей из Камбоджи» . Природные коммуникации . 12 (1): 6563. Бибкод : 2021NatCo..12.6563D . дои : 10.1038/s41467-021-26809-4 . ПМЦ 8578604 . ПМИД 34753934 .

[RmYN02-9] Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .

[RaTG13-10] Чжоу П., Ян XL, Ван XG, Ху Б, Чжан Л., Чжан В. и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей» . Природа . 579 (7798): 270–273. Бибкод : 2020Natur.579..270Z . дои : 10.1038/s41586-020-2012-7 . ПМК 7095418 . ПМИД 32015507 .

[BANAL-52-11] Теммам С., Вонгфайлот К., Бакеро Е., Мунье С., Бономи М., Рено Б. и др. (апрель 2022 г.). «Коронавирусы летучих мышей, родственные SARS-CoV-2 и заразные для клеток человека». Природа . 604 (7905): 330–336. Бибкод : 2022Natur.604..330T . дои : 10.1038/s41586-022-04532-4 . ПМИД 35172323 . S2CID 246902858 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]