RmYN02
| RmYN02 | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Пизонивирицеты |
| Заказ: | Нидовиралес |
| Семья: | Коронавирусы |
| Род: | Бетакоронавирус |
| Подрод: | Сарбековирус |
| Разновидность: | |
| Напряжение: | RmYN02 |
RmYN02 — это штамм коронавируса, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом, полученный от летучих мышей . Он был обнаружен в помете летучих мышей, собранном в период с мая по октябрь 2019 года в округе Менгла , провинция Юньнань , Китай. Это второй ближайший известный родственник SARS-CoV-2 , штамма вируса, вызывающего COVID-19 , имеющий 93,3% нуклеотидной идентичности в масштабе полного генома вируса. RmYN02 содержит вставку в сайте расщепления S1/S2 в белке-шипе , аналогичную SARS-CoV-2, что позволяет предположить, что такие события вставки могут происходить естественным путем. [1]
Генетика
[ редактировать ]Он на 93,3% разделяет геном SARS-CoV-2. RmYN02 был на 97,2% идентичен SARS-CoV-2 в 1ab. RmYN02 был на 71,8% идентичен по нуклеотидам и на 97,4% по аминокислотам с SARS-CoV-2 в гене S, по сравнению с 97,4% идентичностью аминокислот между RaTG13 и SARS-CoV-2. Все генетические данные были найдены Вейфэном Ши и его командой. [1]
Открытие
[ редактировать ]RmYN02 был собран в период с мая по июль 2019 года в Юньнани профессором Элис К. Хьюз из тропического ботанического сада Сишуанбаньна и секвенирован Вэйфэном Ши из Шаньдунского медицинского университета на основе анализа 302 образцов фекалий, собранных у 227 летучих мышей, собранных из Округ Менгла, провинция Юньнань, Китай, недалеко от тропического ботанического сада Сишуанбаньна . [1] Сам геном был собран из пула из 11 образцов.
Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-2 и родственных коронавирусов: [2] [3]
| Коронавирус, родственный SARS‑CoV‑2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SARS-CoV-1 , 79% до SARS-CoV-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Чжоу, Хун; Чен, Син; Ху, Тао; Ли, Хуан; Сун, Хао; Лю, Янран; Ван, Пейхан; Лю, Ди; Ян, Цзин; Холмс, Эдвард К.; Хьюз, Элис К. (8 июня 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. Бибкод : 2020CBio...30E2196Z . дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ISSN 1879-0445 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .
- ^ Jump up to: а б Чжоу Х., Цзи Дж., Чен Х., Би Ю., Ли Дж., Ван Ц. и др. (август 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на эволюционное происхождение SARS-CoV-2 и родственных вирусов» . Клетка . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . ПМЦ 8188299 . ПМИД 34147139 .
- ^ Jump up to: а б Вачараплуесади С., Тан К.В., Маниорн П., Дуэнкэ П., Чжу Ф., Джойджинда Ю. и др. (февраль 2021 г.). «Доказательства наличия коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, циркулирующих у летучих мышей и панголинов в Юго-Восточной Азии» . Природные коммуникации . 12 (1): 972. Бибкод : 2021NatCo..12..972W . дои : 10.1038/s41467-021-21240-1 . ПМЦ 7873279 . ПМИД 33563978 .
- ^ Мураками С., Китамура Т., Сузуки Дж., Сато Р., Аой Т., Фуджи М. и др. (декабрь 2020 г.). «Обнаружение и характеристика сарбековируса летучих мышей, филогенетически родственного SARS-CoV-2, Япония» . Новые инфекционные заболевания . 26 (12): 3025–3029. дои : 10.3201/eid2612.203386 . ПМК 7706965 . ПМИД 33219796 .
- ^ Jump up to: а б Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .
- ^ Лам Т.Т., Цзя Н., Чжан Ю.В., Шум М.Х., Цзян Дж.Ф., Чжу Х.К. и др. (июль 2020 г.). «Идентификация коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, у малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 282–285. Бибкод : 2020Natur.583..282L . дои : 10.1038/s41586-020-2169-0 . ПМИД 32218527 . S2CID 214683303 .
- ^ Сяо К., Чжай Дж., Фэн Ю., Чжоу Н., Чжан Х., Цзоу Дж.Дж. и др. (июль 2020 г.). «Выделение коронавируса, связанного с SARS-CoV-2, от малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 286–289. Бибкод : 2020Natur.583..286X . дои : 10.1038/s41586-020-2313-x . ПМИД 32380510 . S2CID 256822274 .
- ^ Jump up to: а б Делон Д., Хул В., Карлссон Е.А., Хассанин А., Оу Т.П., Байдалюк А. и др. (ноябрь 2021 г.). «Новый коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, у летучих мышей из Камбоджи» . Природные коммуникации . 12 (1): 6563. Бибкод : 2021NatCo..12.6563D . дои : 10.1038/s41467-021-26809-4 . ПМЦ 8578604 . ПМИД 34753934 .
- ^ Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ 7211627 . ПМИД 32416074 .
- ^ Чжоу П., Ян XL, Ван XG, Ху Б, Чжан Л., Чжан В. и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей» . Природа . 579 (7798): 270–273. Бибкод : 2020Natur.579..270Z . дои : 10.1038/s41586-020-2012-7 . ПМК 7095418 . ПМИД 32015507 .
- ^ Теммам С., Вонгфайлот К., Бакеро Е., Мунье С., Бономи М., Рено Б. и др. (апрель 2022 г.). «Коронавирусы летучих мышей, родственные SARS-CoV-2 и заразные для клеток человека». Природа . 604 (7905): 330–336. Бибкод : 2022Natur.604..330T . дои : 10.1038/s41586-022-04532-4 . ПМИД 35172323 . S2CID 246902858 .
 | Эта вирусе статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |