SHC014-КоВ

SHC014-КоВ
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Нидовиралес
Семья:	Коронавирусы
Род:	Бетакоронавирус
Подрод:	Сарбековирус
Разновидность:	Коронавирус, связанный с SARS
Напряжение:	SHC014-КоВ
Синонимы
	SARS-подобный коронавирус летучих мышей RsSHC014 ;

SHC014-CoV — это SARS -подобный коронавирус (SL-COV), поражающий подковоносов (семейство Rhinolophidae). Он был обнаружен в Куньмине в провинции Юньнань , Китай. Он был обнаружен вместе с SL-CoV Rs3367, который был первым SARS-подобным коронавирусом летучих мышей, который, как было показано, напрямую инфицировал линию клеток человека. Линия Rs3367, инфицировавшая клетки человека, получила название Bat SARS-подобный коронавирус WIV1 . ^[2]

Открытие

С апреля 2011 года по сентябрь 2012 года исследователи из Уханьского института вирусологии собрали 117 анальных мазков и образцов фекалий летучих мышей из колонии китайских рыжих подковоносов ( Rhinolophus sinicus ) в городе Куньмин (провинция Юньнань на юго-западе Китая). 27 из 117 образцов (23%) содержали семь различных изолятов SARS-подобных коронавирусов, среди которых были два ранее неизвестных, названные RsSHC014 и Rs3367. ^[2]

Вирусология

В 2013 году было показано, что SARS-подобный коронавирус летучих мышей Rs3367 способен напрямую инфицировать линию клеток HeLa человека . Это был первый случай, когда человеческие клетки были заражены в лаборатории коронавирусом, подобным атипичной пневмонии летучих мышей. Штамм Rs3367, инфицировавший клетки человека, получил название «SARS-подобный коронавирус летучих мышей WIV». ^[2]

В 2015 году Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл и Уханьский институт вирусологии провели исследование, показавшее, что SHC014 может быть создан для заражения линии клеток HeLa человека путем использования обратной генетики для создания химерного вируса, состоящего из поверхностного белка SHC014 и основа коронавируса SARS. ^[3]^[4]

Филогенетический

Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-1 и родственных коронавирусов:

Коронавирус, связанный с SARS‑CoV‑1

	16BO133 , 86,3% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Северная Чолла , Южная Корея ^[5]

	JTMC15 , 86,4% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Тунхуа , Цзилинь ^[6]

Летучая мышь SARS CoV Rf1, 87,8% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Ичан , Хубэй ^[7]

	BtCoV HKU3, 87,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Гонконг и Гуандун ^[8]

LYRa11 , 90,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus affinis , Баошань , Юньнань ^[9]

Летучая мышь SARS-CoV/Rp3, 92,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus pearsoni , Наньнин , Гуанси ^[7]

	Летучая мышь SL-CoV YNLF_31C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань ^[10]

	Летучая мышь SL-CoV YNLF_34C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань ^[10]

	SHC014-CoV , 95,4% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Куньмин , Юньнань ^[11]

	WIV1 , 95,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Куньмин , Юньнань ^[11]

WIV16 , 96,0% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus Куньмин , Юньнань ^[12]

	Циветта SARS-CoV , 99,8% до SARS-CoV-1, личинки Paguma , рынок в Гуандуне, Китай ^[8]

	SARS-CoV-1

SARS-CoV-2 , 79% до SARS-CoV-1 ^[13]

См. также

Коронавирус летучих мышей RaTG13

Ссылки

^ «Таксономический браузер (Bat SARS-подобный коронавирус RsSHC014)» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 05 января 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ge XY, Ли JL, Ян XL, Чмура А.А., Чжу Г, Эпштейн Дж. Х. и др. (ноябрь 2013 г.). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .
^ Менахери В.Д., Йонт Б.Л., Деббинк К., Агнихотрам С., Гралински Л.Е., Планте Дж.А. и др. (декабрь 2015 г.). «Подобный атипичной пневмонии кластер циркулирующих коронавирусов летучих мышей демонстрирует потенциал для появления человека» . Природная медицина . 21 (12): 1508–13. дои : 10.1038/нм.3985 . ПМЦ 4797993 . ПМИД 26552008 .
^ Батлер Д. (12 ноября 2015 г.). «Созданный вирус летучих мышей вызывает споры по поводу рискованных исследований» . Природа . дои : 10.1038/nature.2015.18787 . S2CID 182338924 .
^ Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .
^ Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .
^ Jump up to: ^а ^б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16195424 . S2CID 2971923 .
^ Jump up to: ^а ^б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .
^ Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .
^ Jump up to: ^а ^б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . ПМК 4580176 . ПМИД 26269185 .
^ Jump up to: ^а ^б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .
^ Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ 4810638 . ПМИД 26719272 .
^ Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ 7537588 . ПМИД 33024307 .

Ссылки

Данные, относящиеся к SHC014-CoV, на Wikispecies

[1] «Таксономический браузер (Bat SARS-подобный коронавирус RsSHC014)» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 05 января 2021 г.

[Ge_et_al_2013-2] Jump up to: ^а ^б ^с Ge XY, Ли JL, Ян XL, Чмура А.А., Чжу Г, Эпштейн Дж. Х. и др. (ноябрь 2013 г.). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .

[3] Менахери В.Д., Йонт Б.Л., Деббинк К., Агнихотрам С., Гралински Л.Е., Планте Дж.А. и др. (декабрь 2015 г.). «Подобный атипичной пневмонии кластер циркулирующих коронавирусов летучих мышей демонстрирует потенциал для появления человека» . Природная медицина . 21 (12): 1508–13. дои : 10.1038/нм.3985 . ПМЦ 4797993 . ПМИД 26552008 .

[4] Батлер Д. (12 ноября 2015 г.). «Созданный вирус летучих мышей вызывает споры по поводу рискованных исследований» . Природа . дои : 10.1038/nature.2015.18787 . S2CID 182338924 .

[pmid31076983-5] Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .

[6] Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .

[Li2005-7] Jump up to: ^а ^б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16195424 . S2CID 2971923 .

[book2015-8] Jump up to: ^а ^б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .

[pmid24719429-9] Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .

[LauFeng2015-10] Jump up to: ^а ^б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . ПМК 4580176 . ПМИД 26269185 .

[2013Nature-11] Jump up to: ^а ^б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .

[pmid26719272-12] Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ 4810638 . ПМИД 26719272 .

[Hu2021-13] Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ 7537588 . ПМИД 33024307 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]