ЛИРа11

ЛИРа11
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Ты этого не делал
Семья:	Коронавирусы
Род:	Бетакоронавирус
Подрод:	Сарбековирус
Разновидность:	Коронавирус, связанный с SARS
Напряжение:	ЛИРа11

LYRa11 — это SARS -подобный коронавирус (SL-COV), который был идентифицирован в 2011 году в образцах подковоносов среднего уровня в Баошане , Юньнань , Китай. Длина генома этого штамма вируса составляет 29805 нуклеотидов, а сходство с всей последовательностью генома SARS-CoV, вызвавшего вспышку атипичной пневмонии, составляет 91%. Он был опубликован в 2014 году. ^{[ 1 ]} Подобно SARS-CoV и SARS-CoV-2 , вирус LYRa11 использует ACE2 в качестве рецептора для заражения клеток. ^{[ 2 ]}

Филогенетический

Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-1 и родственных коронавирусов:

Коронавирус, связанный с SARS‑CoV‑1

	16BO133 , 86,3% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Северная Чолла , Южная Корея ^{[ 3 ]}

	JTMC15 , 86,4% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Тунхуа , Цзилинь ^{[ 4 ]}

Летучая мышь SARS CoV Rf1, 87,8% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Ичан , Хубэй ^{[ 5 ]}

	BtCoV HKU3, 87,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Гонконг и Гуандун ^{[ 6 ]}

LYRa11 , 90,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus affinis , Баошань , Юньнань ^{[ 7 ]}

Летучая мышь SARS-CoV/Rp3, 92,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus pearsoni , Наньнин , Гуанси ^{[ 5 ]}

	Летучая мышь SL-CoV YNLF_31C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань ^{[ 8 ]}

	Летучая мышь SL-CoV YNLF_34C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань ^{[ 8 ]}

	SHC014-CoV , 95,4% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Куньмин , Юньнань ^{[ 9 ]}

	WIV1 , 95,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Куньмин , Юньнань ^{[ 9 ]}

WIV16 , 96,0% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus Куньмин , Юньнань ^{[ 10 ]}

	Civet SARS-CoV , 99,8% до SARS-CoV-1, Paguma larvata , рынок в Гуандуне, Китай ^{[ 6 ]}

	SARS-CoV-1

SARS-CoV-2 , 79% до SARS-CoV-1 ^{[ 11 ]}

См. также

Коронавирус летучих мышей RaTG13

Ссылки

^ Он Б; Чжан Ю; Сюй Л; Ян В; Ян Ф; Фэн Ю; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .
^ Уэллс, Х.Л.; Летко, М; Лассо, Г; Себиде, Б; Нзиза, Дж; Бяругаба, ДК; Наваррете-Масиас, I; Лян, Э; и др. (2021). «Эволюционная история использования ACE2 в подроде коронавируса Sarbecovirus» . Эволюция вирусов . 7 (1): web007. дои : 10.1093/ve/veab007 . ISSN 2057-1577 . ПМЦ 7928622 . ПМИД 33754082 .
^ Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .
^ Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16195424 . S2CID 2971923 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .
^ Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . ПМК 4580176 . ПМИД 26269185 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .
^ Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ 4810638 . ПМИД 26719272 .
^ Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ 7537588 . ПМИД 33024307 .

Данные, относящиеся к LYRa11 , в Wikispecies

[pmid24719429f-1] Он Б; Чжан Ю; Сюй Л; Ян В; Ян Ф; Фэн Ю; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .

[WellsLetko2021-2] Уэллс, Х.Л.; Летко, М; Лассо, Г; Себиде, Б; Нзиза, Дж; Бяругаба, ДК; Наваррете-Масиас, I; Лян, Э; и др. (2021). «Эволюционная история использования ACE2 в подроде коронавируса Sarbecovirus» . Эволюция вирусов . 7 (1): web007. дои : 10.1093/ve/veab007 . ISSN 2057-1577 . ПМЦ 7928622 . ПМИД 33754082 .

[pmid31076983-3] Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .

[4] Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .

[Li2005-5] Перейти обратно: ^а ^б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16195424 . S2CID 2971923 .

[book2015-6] Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .

[pmid24719429-7] Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .

[LauFeng2015-8] Перейти обратно: ^а ^б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . ПМК 4580176 . ПМИД 26269185 .

[2013Nature-9] Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .

[pmid26719272-10] Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ 4810638 . ПМИД 26719272 .

[Hu2021-11] Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ 7537588 . ПМИД 33024307 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]