16БО133

16БО133
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Ты этого не делал
Семья:	Коронавирусы
Род:	Бетакоронавирус
Подрод:	Сарбековирус
Разновидность:	Коронавирус, связанный с SARS
Напряжение:	16БО133

16BO133 — это SARS -подобный коронавирус (SL-COV), который был обнаружен у большой подковообразной летучей мыши в Южной Корее . Он был опубликован в 2019 году, и его геном был полностью секвенирован. Секвенированный корейский штамм SARSr-CoV относится к коронавирусу тяжелого острого респираторного синдрома 1 , сходство его геномных последовательностей составляет 82,8%.

Открытие

Вирус 16BO133 был обнаружен в ротовой полости большого подковоноса в 2016 году. Геном этого штамма вируса составляет 29075 нт. Среди SARSr-CoV 16BO133 наиболее близок к вирусу JTMC15, который был опубликован в 2016 году и обнаружен в провинции Цзилинь , Китай, со сходством последовательностей нуклеиновых кислот генома 98,3%. По сравнению с другими SARSr-CoV, эти два вируса имеют штамм ORF8 из-за мутации сдвига рамки считывания в конце ORF7b. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Сходство последовательности нуклеиновых кислот генома вируса 16BO133 и SARS-CoV составляет 82,8%. ^{[ 3 ]}

Хотя в прошлом в Корее были обнаружены и другие штаммы SARSr-CoV (вирус B15-21 и др.), ни один из них не был секвенирован. ^{[ 4 ]} Вирус 16BO133 — первый корейский штамм SARSr-CoV, который был полностью секвенирован. ^{[ 1 ]}

Филогенетический

Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-1 и родственных коронавирусов:

Коронавирус, связанный с SARS‑CoV‑1

	16BO133 , 86,3% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Северная Чолла , Южная Корея ^{[ 5 ]}

	JTMC15 , 86,4% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Тунхуа , Цзилинь ^{[ 6 ]}

Летучая мышь SARS CoV Rf1, 87,8% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Ичан , Хубэй ^{[ 7 ]}

	BtCoV HKU3, 87,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Гонконг и Гуандун ^{[ 8 ]}

LYRa11 , 90,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus affinis , Баошань , Юньнань ^{[ 9 ]}

Летучая мышь SARS-CoV/Rp3, 92,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus pearsoni , Наньнин , Гуанси ^{[ 7 ]}

	Летучая мышь SL-CoV YNLF_31C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань ^{[ 10 ]}

	Летучая мышь SL-CoV YNLF_34C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань ^{[ 10 ]}

	SHC014-CoV , 95,4% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Куньмин , Юньнань ^{[ 11 ]}

	WIV1 , 95,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus , Куньмин , Юньнань ^{[ 11 ]}

WIV16 , 96,0% к SARS-CoV-1, Rhinolophus sinicus Куньмин , Юньнань ^{[ 12 ]}

	Civet SARS-CoV , 99,8% до SARS-CoV-1, Paguma larvata , рынок в Гуандуне, Китай ^{[ 8 ]}

	SARS-CoV-1

SARS-CoV-2 , 79% до SARS-CoV-1 ^{[ 13 ]}

См. также

Коронавирус летучих мышей RaTG13

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Ким Й, Сон К, Ким Й.С., Ли С.И., Чон В., Оем Дж.К. (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .
^ Сюй Л, Чжан Ф, Ян В, Цзян Т, Лу Г, Хэ Б и др. (2016). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирол Син . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .
^ На Э.Дж., Ли С.И., Ким Х.Дж., Оем Дж.К. (2021). «Сравнительный генетический анализ корейских коронавирусов летучих мышей с SARS-CoV и недавно появившимся SARS-CoV-2» . J Vet Sci . 22 (1): е12. дои : 10.4142/jvs.2021.22.e12 . ПМЦ 7850784 . ПМИД 33522164 .
^ Ким Х.К., Юн С.В., Ким Дж., Ку Б.С., Но Дж.И., Ким Дж.Х. и др. (2016). «Обнаружение коронавирусов летучих мышей, подобных тяжелому острому респираторному синдрому, ближневосточному респираторному синдрому, подобных коронавирусу, и ротавирусу группы H в фекалиях корейских летучих мышей» . Трансбаунд Эмерг Дис . 63 (4): 365–72. дои : 10.1111/tbed.12515 . ПМК 7169817 . ПМИД 27213718 .
^ Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .
^ Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16195424 . S2CID 2971923 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .
^ Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . ПМК 4580176 . ПМИД 26269185 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .
^ Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ 4810638 . ПМИД 26719272 .
^ Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ 7537588 . ПМИД 33024307 .

Данные, относящиеся к 16BO133 , в Wikispecies

[pmid31076983b-1] Перейти обратно: ^а ^б Ким Й, Сон К, Ким Й.С., Ли С.И., Чон В., Оем Дж.К. (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .

[pmid26847648-2] Сюй Л, Чжан Ф, Ян В, Цзян Т, Лу Г, Хэ Б и др. (2016). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирол Син . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .

[pmid33522164-3] На Э.Дж., Ли С.И., Ким Х.Дж., Оем Дж.К. (2021). «Сравнительный генетический анализ корейских коронавирусов летучих мышей с SARS-CoV и недавно появившимся SARS-CoV-2» . J Vet Sci . 22 (1): е12. дои : 10.4142/jvs.2021.22.e12 . ПМЦ 7850784 . ПМИД 33522164 .

[pmid27213718-4] Ким Х.К., Юн С.В., Ким Дж., Ку Б.С., Но Дж.И., Ким Дж.Х. и др. (2016). «Обнаружение коронавирусов летучих мышей, подобных тяжелому острому респираторному синдрому, ближневосточному респираторному синдрому, подобных коронавирусу, и ротавирусу группы H в фекалиях корейских летучих мышей» . Трансбаунд Эмерг Дис . 63 (4): 365–72. дои : 10.1111/tbed.12515 . ПМК 7169817 . ПМИД 27213718 .

[pmid31076983-5] Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК 7089380 . ПМИД 31076983 .

[6] Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК 7090707 . ПМИД 26847648 .

[Li2005-7] Перейти обратно: ^а ^б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16195424 . S2CID 2971923 .

[book2015-8] Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .

[pmid24719429-9] Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК 4054348 . ПМИД 24719429 .

[LauFeng2015-10] Перейти обратно: ^а ^б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . ПМК 4580176 . ПМИД 26269185 .

[2013Nature-11] Перейти обратно: ^а ^б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ 5389864 . ПМИД 24172901 .

[pmid26719272-12] Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ 4810638 . ПМИД 26719272 .

[Hu2021-13] Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ 7537588 . ПМИД 33024307 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]