Jump to content

Коронавирус, связанный с SARS

(Перенаправлено с SARSr-CoV )

Пандемия бетакоронавируса
Трансмиссионная электронная микрофотография коронавирусов, связанных с атипичной пневмонией, возникающих из клеток-хозяев, культивированных в лаборатории.
Классификация вирусов Изменить эту классификацию
(без рейтинга): Вирус
Область : Рибовирия
Королевство: Орторнавиры
Тип: Писувирикота
Сорт: Пизонивирицеты
Заказ: Нидовиралес
Семья: Коронавирусы
Род: Бетакоронавирус
Подрод: Сарбековирус
Разновидность:
Пандемия бетакоронавируса
Штаммы
Синонимы
  • ТОРС коронавирус
  • Коронавирус, связанный с SARS
  • Тяжелый острый респираторный синдром, коронавирус [1]

Пандемия бетакоронавируса [2] (также известный как коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом , сокращенно SARSr-CoV или SARS-CoV ) [примечание 1] представляет собой разновидность вируса, состоящую из многих известных штаммов. Два штамма вируса стали причиной вспышек тяжелых респираторных заболеваний у человека: коронавирус 1 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV или SARS-CoV-1), причина вспышки ( тяжелого острого респираторного синдрома SARS) в 2002–2004 гг. и тяжелый острый респираторный синдром, вызванный коронавирусом 2 (SARS-CoV-2), причиной пандемии COVID -19 . [3] [4] Существуют сотни других штаммов SARSr-CoV, которые, как известно, заражают только виды млекопитающих, кроме человека: летучие мыши являются основным резервуаром многих штаммов SARSr-CoV; было идентифицировано несколько штаммов У гималайских пальмовых цивет , которые, вероятно, были предками SARS-CoV-1. [3] [5] [6] [7]

Эти оболочечные одноцепочечные РНК-вирусы с положительным смыслом проникают в клетки-хозяева путем связывания с рецептором ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2). [8] представителем рода Betacoronavirus и единственным видом подрода Sarbecovirus ( SAR S Beta coronavirus Вид SARSr CoV является - ). [9] [10]

Коронавирус, связанный с атипичной пневмонией, был одним из нескольких вирусов, определенных Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) в 2016 году как вероятная причина будущей эпидемии в новом плане, разработанном после эпидемии Эболы, для срочных исследований и разработок до и во время эпидемии в целях диагностики. тесты , вакцины и лекарства . Этот прогноз сбылся во время пандемии COVID-19 . [11] [12]

Классификация

[ редактировать ]

Коронавирус, связанный с SARS, относится к роду Betacoronavirus (группа 2) и монотипичен подроду Sarbecovirus (подгруппа B). [13] Сарбековирусы, в отличие от эмбековирусов или альфакоронавирусов , имеют только одну папаинподобную протеиназу (PLpro) вместо двух в открытой рамке считывания ORF1ab . [14] Было установлено, что SARSr-CoV является ранним отделением бетакоронавирусов на основе набора консервативных доменов, которые он разделяет с группой. [15] [16]

Летучие мыши служат основным видом-хозяином для коронавирусов, связанных с атипичной пневмонией, таких как SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2. Вирус коэволюционировал в резервуаре-хозяине летучей мыши в течение длительного периода времени. [17] Лишь недавно было замечено, что штаммы коронавируса, связанного с атипичной пневмонией, развились и стали способны вызывать межвидовой переход от летучих мышей к человеку, как в случае со штаммами SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 . [18] [8] Оба этих штамма произошли от одного предка, но заставили межвидовые переходить к людям отдельно. SARS-CoV-2 не является прямым потомком SARS-CoV-1. [3]

Организация генома и вирусные белки SARS -CoV

, родственный SARS, Коронавирус представляет собой оболочечный вирус с одноцепочечной РНК с положительным смыслом . Его геном составляет около 30 т.п.н. , что является одним из крупнейших среди РНК-вирусов. Вирус имеет 14 открытых рамок считывания , которые в некоторых случаях перекрываются. [19] Геном имеет обычную 5'-метилированную кепку и 3'-полиаденилированный хвост . [20] содержится 265 нуклеотидов В 5'UTR , а в 3'UTR – 342 нуклеотида . [19]

5'-метилированный кэп и 3'-полиаденилированный хвост позволяют положительной смысловой РНК непосредственно транслировать геном клетки-хозяина рибосомой при проникновении вируса . [21] SARSr-CoV похож на другие коронавирусы тем, что экспрессия его генома начинается с трансляции рибосомами клетки-хозяина ее первоначальных двух больших перекрывающихся открытых рамок считывания (ORF), 1a и 1b, обе из которых продуцируют полипротеины . [19]

Функция SARSr-CoV
геномные белки
ProteinFunction[22][23][24][25]
ORF1ab
P0C6X7
Replicase/transcriptase polyprotein (pp1ab)
(nonstructural proteins)
ORF2
P59594
Spike (S) protein, virus binding and entry
(structural protein)
ORF3a
P59632
Interacts with S, E, M structural proteins;
Ion channel activity;
Upregulates cytokines and chemokines such as IL-8 and RANTES;
Upregulates NF-κB and JNK;
Induces apoptosis and cell cycle arrest, via Caspase 8 and -9,
and by Bax, p53, and p38 MAP kinase
ORF3b
P59633
Upregulates cytokines and chemokines by RUNX1b;
Inhibits Type I IFN production and signaling;
Induces apoptosis and cell cycle arrest;
ORF3c
P0DTG1
Unknown; first identified in SARS-CoV-2 but also present in SARS-CoV
ORF3d
P0DTG0
Novel gene in SARS-CoV-2, of unknown function
ORF4
P59637
Envelope (E) protein, virus assembly and budding
(structural protein)
ORF5
P59596
Membrane (M) protein, virus assembly and budding
(structural protein)
ORF6
P59634
Enhances cellular DNA synthesis;
Inhibits Type I IFN production and signaling
ORF7a
P59635
Inhibits cellular protein synthesis;
Induces inflammatory response by NF-kappaB and IL-8 promotor;
Upregulate chemokines such as IL-8 and RANTES;
Upregulates JNK, p38 MAP kinase;
Induces apoptosis and cell cycle arrest
ORF7b
Q7TFA1
Unknown
ORF8a
Q7TFA0
Induces apoptosis through mitochondria pathway
ORF8b
Q80H93
Enhances cellular DNA synthesis, also known as X5.
ORF9a
P59595
Nucleocapsid (N) protein, viral RNA packaging
(structural protein)
ORF9b
P59636
Induces apoptosis
ORF9c
Q7TLC7
Also known as ORF14; function unknown and may not be protein-coding
ORF10
A0A663DJA2
Novel gene in SARS-CoV-2, of unknown function; may not be protein-coding
UniProt identifiers shown for SARS-CoV proteins unless they are specific to SARS-CoV-2

Функции некоторых вирусных белков известны. [26] ORF 1a и 1b кодируют полипротеин репликазы/транскриптазы, а более поздние ORF 2, 4, 5 и 9a кодируют соответственно четыре основных структурных белка: шип (S), оболочку (E), мембрану (M) и нуклеокапсид ( Н). [27] Более поздние ORF также кодируют восемь уникальных белков (от orf3a до orf9b), известных как вспомогательные белки , многие из которых не имеют известных гомологов. Различные функции дополнительных белков недостаточно изучены. [26]

Коронавирусы SARS были генетически модифицированы в нескольких лабораториях. [28]

Филогенетика

[ редактировать ]
Филогенетическое древо SARS-CoV-2 и близкородственных бетакоронавирусов (слева) и их географический контекст (справа)

Филогенетический анализ показал, что эволюционная ветвь, состоящая из коронавируса летучих мышей BtKY72 и BM48-31, была базовой группой эволюционного дерева CoV, связанных с SARS, которая отделилась от других CoV, связанных с SARS, раньше, чем SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2. [29] [3]

SARSr‑CoV

Летучая мышь CoV BtKY72

Летучая мышь CoV BM48-31

Коронавирус, связанный с SARS-CoV-1

Коронавирус, связанный с SARS-CoV-2

[ редактировать ]

Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-1 и родственных коронавирусов:

Коронавирус, связанный с SARS‑CoV‑1

LYRa11 , 90,9% к SARS-CoV-1, Rhinolophus affinis , Баошань , Юньнань [34]

Летучая мышь SARS-CoV/Rp3, 92,6% к SARS-CoV-1, Rhinolophus pearsoni , Наньнин , Гуанси [32]

Летучая мышь SL-CoV YNLF_31C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань [35]

Летучая мышь SL-CoV YNLF_34C, 93,5% к SARS-CoV-1, Rhinolophusferrumequinum , Луфэн , Юньнань [35]

SARS-CoV-2 , 79% до SARS-CoV-1 [38]


[ редактировать ]

Филогенетическое дерево, основанное на полногеномных последовательностях SARS-CoV-2 и родственных коронавирусов: [39] [40]

Коронавирус, родственный SARS‑CoV‑2

( Летучая мышь ) Rc-o319 , 81% к SARS-CoV-2, Rhinolophus cornutus , Ивате , Япония [41]

Летучая мышь SL-ZXC21 , 88% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Чжоушань , Чжэцзян [42]

Летучая мышь SL-ZC45 , 88% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Чжоушань, Чжэцзян [42]

Панголин SARSr-CoV-GX, 85,3% к SARS-CoV-2, Manis javanica , контрабандой доставлен из Юго-Восточной Азии. [43]

Панголин SARSr-CoV-GD, 90,1% SARS-CoV-2, Manis javanica , контрабандой доставлен из Юго-Восточной Азии. [44]

Летучая мышь RshSTT182, 92,6% к SARS-CoV-2, Rhinolophus шамли , Стеунг Тренг , Камбоджа [45]

Летучая мышь RshSTT200, 92,6% к SARS-CoV-2, Rhinolophushamli , Стеунг Тренг, Камбоджа [45]

(Летучая мышь) RacCS203 , 91,5% к SARS-CoV-2, Rhinolophus acuminatus , Чаченгсао , Таиланд [40]

(Летучая мышь) RmYN02 , 93,3% к SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Менгла , Юньнань [46]

(Летучая мышь) RpYN06 , 94,4% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Сишуанбаньна , Юньнань [39]

(Летучая мышь) RaTG13 , 96,1% к SARS-CoV-2, Rhinolophus affinis , Модзян , Юньнань [47]

(Летучая мышь) BANAL-52 , 96,8% к SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Вьентьян , Лаос [48]

SARS-CoV-2

SARS-CoV-1 , 79% до SARS-CoV-2


Морфология

[ редактировать ]
Иллюстрация, созданная в Центрах по контролю и профилактике заболеваний (CDC), демонстрирует ультраструктурную морфологию, проявляемую коронавирусами; обратите внимание на шипы , украшающие внешнюю поверхность, которые придают вид короны, окружающей вирион . [49]
Иллюстрация вириона SARSr-CoV

Морфология коронавируса, связанного с атипичной пневмонией, характерна для семейства коронавирусов в целом. Вирусы представляют собой крупные плеоморфные сферические частицы с выпуклыми выступами на поверхности, которые на электронных микрофотографиях образуют корону вокруг частиц. [50] Размер вирусных частиц находится в диапазоне 80–90 нм. Оболочка вируса на электронных микрофотографиях выглядит как четкая пара электронно-плотных оболочек. [51]

Оболочка вируса состоит из липидного бислоя , в котором мембраны (М), оболочки (Е) и шипа (S). закреплены белки [52] Белки-шипы обеспечивают вирусу выпуклые выступы на поверхности, известные как пепломеры . Взаимодействие белка-шипа с рецептором клетки-хозяина комплемента играет центральную роль в определении тропизма ткани , инфекционности и видового диапазона вируса. [53] [54]

Внутри оболочки находится нуклеокапсид , который образован из множества копий белка нуклеокапсида (N), которые связаны с геномом одноцепочечной (~30 т.п.н. ) РНК с положительным смыслом в виде непрерывных бусинок на-а- строкового типа. Конформация [55] [56] Двухслойная липидная оболочка, мембранные белки и нуклеокапсид защищают вирус, когда он находится вне хозяина. [57]

Жизненный цикл

[ редактировать ]

Коронавирус, связанный с SARS, следует стратегии репликации, типичной для всех коронавирусов. [20] [58]

Приложение и запись

[ редактировать ]
коронавируса репликации Цикл

Прикрепление коронавируса, связанного с атипичной пневмонией, к клетке-хозяину опосредовано белком-шипом и его рецептором. [59] Домен, связывающий рецептор спайкового белка (RBD), распознает рецептор ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2) и прикрепляется к нему. [8] После прикрепления вирус может проникнуть в клетку-хозяина двумя разными путями. Путь, по которому движется вирус, зависит от протеазы хозяина , способной расщеплять и активировать прикрепленный к рецептору белок-шип. [60]

Было показано, что прикрепление сарбековирусов к ACE2 является эволюционно консервативным признаком, присутствующим у многих видов таксона. [61]

Первый путь, по которому коронавирус SARS может проникнуть в клетку-хозяина, — это эндоцитоз и поглощение вируса в эндосоме . Прикрепленный к рецептору белок-шип затем активируется рН-зависимой цистеиновой протеазой катепсином L хозяина . Активация прикрепленного к рецептору белка-шипа вызывает конформационные изменения и последующее слияние вирусной оболочки со стенкой эндосомы . [60]

Альтернативно, вирус может проникнуть в клетку-хозяина непосредственно путем протеолитического хозяина TMPRSS2 или TMPRSS11D расщепления прикрепленного к рецептору шиповидного белка сериновыми протеазами на поверхности клетки. [62] [63] В коронавирусе SARS активация C-концевой части белка-шипа запускает слияние вирусной оболочки с мембраной клетки-хозяина, вызывая конформационные изменения, которые до конца не изучены. [64]

Перевод генома

[ редактировать ]
Функция коронавируса
неструктурные белки (nsps) [65]
ProteinFunction
nsp1Promotes host mRNA degradation, blocks host translation;[66]
blocks innate immune response
nsp2Binds to prohibitin proteins;
unknown function
nsp3Multidoman transmembrane protein; interacts with N protein; promotes cytokine expression; PLPro domain cleaves polyprotein pp1ab and blocks host's innate immune response; other domains unknown functions
nsp4Transmembrane scaffold protein;
allows proper structure for double membrane vesicles (DMVs)
nsp53CLPro cleaves polyprotein pp1ab
nsp6Transmembrane scaffold protein;
unknown function
nsp7Forms hexadecameric complex with nsp8; processivity clamp for RdRp (nsp12)
nsp8Forms hexadecameric complex with nsp7; processivity clamp for RdRp (nsp12); acts as a primase
nsp9RNA-binding protein (RBP)
nsp10nsp16 and nsp14 cofactor; forms heterodimer with both; stimulates 2-O-MT (nsp16) and ExoN (nsp14) activity
nsp11Unknown function
nsp12RNA-dependent RNA polymerase (RdRp)
nsp13RNA helicase, 5′ triphosphatase
nsp14N7 Methyltransferase, 3′-5′ exoribonuclease (ExoN); N7 MTase adds 5′ cap, ExoN proofreads genome
nsp15Endoribonuclease (NendoU)
nsp162′-O-Methyltransferase (2-O-MT); protects viral RNA from MDA5

После слияния нуклеокапсид переходит в цитоплазму , где высвобождается вирусный геном. [59] Геном действует как информационная РНК , а рибосома клетки транслирует две трети генома, что соответствует открытой рамке считывания ORF1a и ORF1b , в два больших перекрывающихся полипротеина, pp1a и pp1ab.

Более крупный полипротеин pp1ab является результатом сдвига рамки рибосомы -1, вызванного скользкой последовательностью (UUUAAAC) и расположенным ниже псевдоузлом РНК в конце открытой рамки считывания ORF1a. [67] Сдвиг рамки рибосомы обеспечивает непрерывную трансляцию ORF1a, за которой следует ORF1b. [68]

Полипротеины содержат собственные протеазы PLpro . и 3CLpro , которые расщепляют полипротеины в разных специфических сайтах Расщепление полипротеина pp1ab дает 16 неструктурных белков (от nsp1 до nsp16). Белки-продукты включают различные белки репликации, такие как РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp), РНК-хеликаза и экзорибонуклеаза (ExoN). [68]

Две протеазы SARS-CoV-2 (PLpro и 3CLpro) также влияют на реакцию иммунной системы на вирусную инфекцию, расщепляя три белка иммунной системы. PLpro расщепляет IRF3 , а 3CLpro расщепляет как NLRP12 , так и TAB1 . «Прямое расщепление IRF3 с помощью NSP3 может объяснить притупленный ответ IFN типа I, наблюдаемый при инфекциях SARS-CoV-2, тогда как опосредованное NSP5 расщепление NLRP12 и TAB1 указывает на молекулярный механизм усиленного производства IL-6 и воспалительной реакции, наблюдаемой при COVID. -19 пациентов». [69]

Репликация и транскрипция

[ редактировать ]
Модель репликазно -транскриптазного комплекса коронавируса . RdRp для репликации (красный), ExoN для корректуры (темно-синий), кофактор ExoN (желтый), RBP для предотвращения вторичной структуры (светло-синий), скользящий зажим РНК для процессивности и примазы домен для прайминга (зеленый/оранжевый) и геликаза раскручивать РНК (вниз по течению).

Ряд неструктурных репликационных белков сливаются, образуя мультибелковый комплекс репликаза-транскриптаза (RTC). [68] Основным белком репликазы-транскриптазы является РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp). Он непосредственно участвует в репликации и транскрипции РНК с цепи РНК. Другие неструктурные белки комплекса участвуют в процессе репликации и транскрипции. [65]

Белок nsp14 представляет собой 3'-5' экзорибонуклеазу , которая обеспечивает дополнительную точность процесса репликации. Экзорибонуклеаза обеспечивает функцию корректуры комплекса, которой нет у РНК-зависимой РНК-полимеразы. Точно так же белки nsp7 и nsp8 образуют гексадекамерный скользящий зажим как часть комплекса, который значительно увеличивает процессивность РНК-зависимой РНК-полимеразы. [65] Коронавирусы требуют повышенной точности и процессивности во время синтеза РНК из-за относительно большого размера генома по сравнению с другими РНК-вирусами. [70]

Одной из основных функций комплекса репликаза-транскриптаза является транскрипция вирусного генома. RdRp непосредственно опосредует синтез с отрицательным смыслом молекул субгеномной РНК из геномной РНК с положительным смыслом. За этим следует транскрипция этих субгеномных молекул РНК с отрицательным смыслом в соответствующие им мРНК с положительным смыслом . [71]

Другой важной функцией комплекса репликаза-транскриптаза является репликация вирусного генома. RdRp непосредственно опосредует синтез геномной РНК с отрицательным смыслом из геномной РНК с положительным смыслом. За этим следует репликация геномной РНК с положительным смыслом из геномной РНК с отрицательным смыслом. [71]

Реплицированная геномная РНК с положительным смыслом становится геномом вирусов-потомков . Различные более мелкие мРНК представляют собой транскрипты последней трети генома вируса, которые следуют за рамками считывания ORF1a и ORF1b. Эти мРНК транслируются в четыре структурных белка (S, E, M и N), которые станут частью дочерних вирусных частиц, а также в восемь других вспомогательных белков (от orf3 до orf9b), которые помогают вирусу. [72]

Рекомбинация

[ редактировать ]

Когда два генома в клетке-хозяине присутствуют SARS-CoV, они могут взаимодействовать друг с другом, образуя рекомбинантные геномы, которые могут передаваться вирусам-потомкам. Рекомбинация, вероятно, происходит во время репликации генома, когда РНК-полимераза переключается с одной матрицы на другую (рекомбинация с выбором копии). [73] Человеческий SARS-CoV, по-видимому, имел сложную историю рекомбинации между предковыми коронавирусами , которые находились в нескольких различных группах животных. [73] [74]

Сборка и выпуск

[ редактировать ]

Трансляция РНК происходит внутри эндоплазматической сети . Вирусные структурные белки S, E и M перемещаются по секреторному пути в промежуточный отсек Гольджи . Там белки М управляют большинством межбелковых взаимодействий, необходимых для сборки вируса после его связывания с нуклеокапсидом. [75] Вирусы-потомки высвобождаются из клетки-хозяина путем экзоцитоза через секреторные пузырьки. [75]

См. также

[ редактировать ]

Примечания

[ редактировать ]
  1. ^ Термины SARSr-CoV и SARS-CoV иногда используются как синонимы, особенно до открытия SARS-CoV-2. Это может вызвать путаницу, если в некоторых публикациях SARS-CoV-1 будет называться SARS-CoV .
  1. ^ «История таксономии ICTV: Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом » . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 27 января 2019 г.
  2. ^ «Подробности о таксонах | ICTV» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 30 мая 2024 г.
  3. ^ Перейти обратно: а б с д Группа по изучению Coronaviridae Международного комитета по таксономии вирусов (март 2020 г.). «Вид коронавируса, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом: классификация 2019-nCoV и присвоение ему названия SARS-CoV-2» . Природная микробиология . 5 (4): 536–544. дои : 10.1038/s41564-020-0695-z . ПМК   7095448 . ПМИД   32123347 .
  4. ^ Коэн, Джон; Купфершмидт, Кай (28 февраля 2020 г.). «Стратегии меняются по мере приближения пандемии коронавируса». Наука . 367 (6481): 962–963. Бибкод : 2020Sci...367..962C . дои : 10.1126/science.367.6481.962 . ПМИД   32108093 . S2CID   211556915 .
  5. ^ Лау С.К., Ли К.С., Хуан Й., Шек КТ, Це Х., Ван М. и др. (март 2010 г.). «Экоэпидемиология и полное сравнение генома различных штаммов коронавируса летучих мышей Rhinolophus, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом, в Китае показывают, что летучие мыши являются резервуаром острой, самоограничивающейся инфекции, которая допускает события рекомбинации» . Журнал вирусологии . 84 (6): 2808–19. дои : 10.1128/JVI.02219-09 . ПМК   2826035 . ПМИД   20071579 .
  6. ^ Брансвелл Х. (9 ноября 2015 г.). «Исследование показало, что SARS-подобный вирус у летучих мышей потенциально может заражать людей» . Стат Новости . Проверено 20 февраля 2020 г.
  7. ^ Вонг AC, Ли X, Лау СК, Ву ПК (февраль 2019 г.). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей» . Вирусы . 11 (2): 174. дои : 10.3390/v11020174 . ПМК   6409556 . ПМИД   30791586 . В частности, было обнаружено, что подковоносы являются резервуаром SARS-подобных CoV, а пальмовые циветты считаются промежуточным хозяином SARS-CoV [43,44,45].
  8. ^ Перейти обратно: а б с Ge XY, Ли JL, Ян XL, Чмура А.А., Чжу Г, Эпштейн Дж. Х. и др. (ноябрь 2013 г.). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ   5389864 . ПМИД   24172901 .
  9. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018 года . Проверено 13 января 2019 г.
  10. ^ Ву ПК, Хуан Ю, Лау С.К., Юэнь Кюй (август 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–20. дои : 10.3390/v2081803 . ПМК   3185738 . ПМИД   21994708 . Рисунок 2. Филогенетический анализ РНК-зависимых РНК-полимераз (Pol) коронавирусов с доступными полными последовательностями генома. Дерево было построено методом объединения соседей и укоренено с использованием полипротеина вируса Бреда.
  11. ^ Киени депутат. «После Эболы появился план для ускорения исследований и разработок» . Сеть блогов Scientific American . Архивировано из оригинала 20 декабря 2016 года . Проверено 13 декабря 2016 г.
  12. ^ «СПИСОК ПАТОГЕНОВ» . Всемирная организация здравоохранения . Архивировано из оригинала 20 декабря 2016 года . Проверено 13 декабря 2016 г.
  13. ^ Вонг AC, Ли X, Лау СК, Ву ПК (февраль 2019 г.). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей» . Вирусы . 11 (2): 174. дои : 10.3390/v11020174 . ПМК   6409556 . ПМИД   30791586 . См. рисунок 1.
  14. ^ Ву ПК, Хуан Ю, Лау С.К., Юэнь Кюй (август 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–20. дои : 10.3390/v2081803 . ПМК   3185738 . ПМИД   21994708 . См. рисунок 1.
  15. ^ Ву ПК, Хуан Ю, Лау С.К., Юэнь Кюй (август 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–20. дои : 10.3390/v2081803 . ПМК   3185738 . ПМИД   21994708 . Более того, последующий филогенетический анализ с использованием как полной последовательности генома, так и протеомных подходов позволил сделать вывод, что SARSr-CoV, вероятно, является ранним отделением линии бетакоронавируса [1]; См. рисунок 2.
  16. ^ «Coronaviridae - Цифры - РНК-вирусы с положительным смыслом - РНК-вирусы с положительным смыслом (2011)» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Архивировано из оригинала 3 апреля 2020 года . Проверено 6 марта 2020 г. См. рисунок 2.
  17. ^ Гуй М.А., Пюхмайль С.Дж., Гонсалес Дж.П., Тилинг Э., Киттаяпонг П., Манугерра Дж.К. (октябрь 2011 г.). «Следы предка SARS-коронавируса в колониях летучих мышей Юго-Восточной Азии и теория убежища» . Инфекция, генетика и эволюция . 11 (7): 1690–702. дои : 10.1016/j.meegid.2011.06.021 . ПМК   7106191 . ПМИД   21763784 . Предки бетакоронавирусов-b, то есть предки SARSr-CoV, могли исторически находиться у общего предка Rhinolophidae и Hipposideridae, а затем могли независимо развиваться в линиях, ведущих к бетакоронавирусам Rhinolophidae и Hipposideridae.
  18. ^ Цуй Дж., Хан Н., Штрейкер Д., Ли Г., Тан Х., Ши З. и др. (октябрь 2007 г.). «Эволюционные взаимоотношения между коронавирусами летучих мышей и их хозяевами» . Новые инфекционные заболевания . 13 (10): 1526–32. дои : 10.3201/eid1310.070448 . ПМК   2851503 . ПМИД   18258002 .
  19. ^ Перейти обратно: а б с Снейдер Э.Дж., Бреденбек П.Дж., Доббе Дж.К., Тиль В., Зибур Дж., Пун Л.Л. и др. (август 2003 г.). «Уникальные и консервативные особенности генома и протеома SARS-коронавируса, раннего отделения от линии коронавируса 2-й группы» . Журнал молекулярной биологии . 331 (5): 991–1004. дои : 10.1016/S0022-2836(03)00865-9 . ПМК   7159028 . ПМИД   12927536 . Геном SARS-CoV имеет длину ~29,7 т.п.н. и содержит 14 открытых рамок считывания (ORF), фланкированных 5'- и 3'-нетранслируемыми областями из 265 и 342 нуклеотидов соответственно (рис. 1).
  20. ^ Перейти обратно: а б Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 .
  21. ^ Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 .
  22. ^ Макбрайд Р., Филдинг, Британская Колумбия (ноябрь 2012 г.). «Роль вспомогательных белков тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС)-коронавируса в патогенезе вируса» . Вирусы . 4 (11): 2902–23. дои : 10.3390/v4112902 . ПМК   3509677 . ПМИД   23202509 . См. Таблицу 1.
  23. ^ Тан X, Ли Г, Василакис Н, Чжан Ю, Ши З, Чжун Ю, Ван Л.Ф., Чжан С. (март 2009 г.). «Дифференциальная поэтапная эволюция функциональных белков коронавируса SARS у разных видов хозяев» . Эволюционная биология BMC . 9 (1): 52. Бибкод : 2009BMCEE...9...52T . дои : 10.1186/1471-2148-9-52 . ПМК   2676248 . ПМИД   19261195 .
  24. ^ Нарайанан, Кришна; Хуан, Ченг; Макино, Синдзи (апрель 2008 г.). «Аксессуарные белки коронавируса SARS» . Вирусные исследования . 133 (1): 113–121. дои : 10.1016/j.virusres.2007.10.009 . ISSN   0168-1702 . ПМК   2720074 . ПМИД   18045721 . См. Таблицу 1.
  25. ^ Редондо, Наталья; Сальдивар-Лопес, Сара; Гарридо, Хуан Дж.; Монтойя, Мария (7 июля 2021 г.). «Акцессорные белки SARS-CoV-2 в вирусном патогенезе: известные и неизвестные» . Границы в иммунологии . 12 : 708264. дои : 10.3389/fimmu.2021.708264 . ПМЦ   8293742 . ПМИД   34305949 .
  26. ^ Перейти обратно: а б Макбрайд Р., Филдинг, Британская Колумбия (ноябрь 2012 г.). «Роль вспомогательных белков тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС)-коронавируса в патогенезе вируса» . Вирусы . 4 (11): 2902–23. дои : 10.3390/v4112902 . ПМК   3509677 . ПМИД   23202509 .
  27. ^ Снейдер Э.Дж., Бреденбек П.Дж., Доббе Дж.К., Тиль В., Зибур Дж., Пун Л.Л. и др. (август 2003 г.). «Уникальные и консервативные особенности генома и протеома SARS-коронавируса, раннего отделения от линии коронавируса 2-й группы» . Журнал молекулярной биологии . 331 (5): 991–1004. дои : 10.1016/S0022-2836(03)00865-9 . ПМК   7159028 . ПМИД   12927536 . См. рисунок 1.
  28. ^ Кайна, Бернд (2021). «О происхождении SARS-CoV-2: привели ли эксперименты на клеточных культурах к повышению вирулентности вируса-прародителя для людей?» . В Виво . 35 (3): 1313–1326. дои : 10.21873/invivo.12384 . ПМЦ   8193286 . ПМИД   33910809 .
  29. ^ Лу Р, Чжао Икс, Ли Дж, Ню П, Ян Б, Ву Х; и др. (2020). «Геномная характеристика и эпидемиология нового коронавируса 2019 года: значение для происхождения вируса и связывания с рецепторами» . Ланцет . 395 (10224): 565–574. дои : 10.1016/S0140-6736(20)30251-8 . ПМК   7159086 . ПМИД   32007145 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  30. ^ Ким, Юнгван; Сон, Кидонг; Ким, Ён-Сик; Ли, Сук-Янг; Чжон, Веонхва; Оем, Джэ-Ку (2019). «Полный анализ генома SARS-подобного коронавируса летучих мышей, выявленного в Республике Корея» . Гены вирусов . 55 (4): 545–549. дои : 10.1007/s11262-019-01668-w . ПМК   7089380 . ПМИД   31076983 .
  31. ^ Сюй, Л; Чжан, Ф; Ян, В; Цзян, Т; Лу, Г; Он, Б; Ли, Х; Хижина; Чен, Г; Фэн, Ю; Чжан, Ю; Фан, Вопрос; Фэн, Дж; Чжан, Х; Вт, C (февраль 2016 г.). «Обнаружение и характеристика разнообразных альфа- и бетакоронавирусов у летучих мышей в Китае» . Вирусология Синика . 31 (1): 69–77. дои : 10.1007/s12250-016-3727-3 . ПМК   7090707 . ПМИД   26847648 .
  32. ^ Перейти обратно: а б Ли, В. (2005). «Летучие мыши являются естественными резервуарами SARS-подобных коронавирусов» . Наука . 310 (5748): 676–679. Бибкод : 2005Sci...310..676L . дои : 10.1126/science.1118391 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   16195424 . S2CID   2971923 .
  33. ^ Перейти обратно: а б Син-И Гэ; Бен Ху; Чжэн-Ли Ши (2015). «ЛЕТУЧИЕ КОРОНАВИРУСЫ». В Линь-Фа Ване; Кристофер Коулд (ред.). Летучие мыши и вирусы: новый рубеж новых инфекционных заболеваний (первое издание). Джон Уайли и сыновья. стр. 127–155. дои : 10.1002/9781118818824.ch5 .
  34. ^ Он, Бяо; Чжан, Южен; Сюй, Линь; Ян, Вэйхун; Ян, Фанли; Фэн, Юн; и др. (2014). «Идентификация разнообразных альфакоронавирусов и геномная характеристика нового коронавируса, подобного тяжелому острому респираторному синдрому, у летучих мышей в Китае» . Дж Вирол . 88 (12): 7070–82. дои : 10.1128/JVI.00631-14 . ПМК   4054348 . ПМИД   24719429 .
  35. ^ Перейти обратно: а б Лау, Сюзанна КП; Фэн, Юн; Чен, Хунлинь; Люк, Хейс К.Х.; Ян, Вэй-Хонг; Ли, Кеннет С.М.; Чжан, Ю-Чжэнь; Хуан, И; и др. (2015). «Белок ORF8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) получен из связанного с атипичной пневмонией коронавируса у больших подковообразных летучих мышей путем рекомбинации» . Журнал вирусологии . 89 (20): 10532–10547. дои : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN   0022-538X . ПМК   4580176 . ПМИД   26269185 .
  36. ^ Перейти обратно: а б Син-И Гэ; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и др. (2013). «Выделение и характеристика SARS-подобного коронавируса летучих мышей, использующего рецептор ACE2» . Природа . 503 (7477): 535–8. Бибкод : 2013Natur.503..535G . дои : 10.1038/nature12711 . ПМЦ   5389864 . ПМИД   24172901 .
  37. ^ Ян, Син-Лу; Ху, Бен; Ван, Бо; Ван, Мэй-Ньянг; Чжан, Цянь; Чжан, Вэй; и др. (2016). «Выделение и характеристика нового коронавируса летучих мышей, тесно связанного с прямым предшественником коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 90 (6): 3253–6. дои : 10.1128/JVI.02582-15 . ПМЦ   4810638 . ПМИД   26719272 .
  38. ^ Бен, Ху; Хуа, Го; Пэн, Чжоу; Чжэн-Ли, Ши (2020). «Характеристика SARS-CoV-2 и COVID-19» . Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 141–154. дои : 10.1038/s41579-020-00459-7 . ПМЦ   7537588 . ПМИД   33024307 .
  39. ^ Перейти обратно: а б Чжоу Х., Цзи Дж., Чен Х., Би Ю., Ли Дж., Ван Ц. и др. (август 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на эволюционное происхождение SARS-CoV-2 и родственных вирусов» . Клетка . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . ПМЦ   8188299 . ПМИД   34147139 .
  40. ^ Перейти обратно: а б Вачараплуесади С., Тан К.В., Маниорн П., Дуэнкэ П., Чжу Ф., Джойджинда Ю. и др. (февраль 2021 г.). «Доказательства наличия коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, циркулирующих у летучих мышей и панголинов в Юго-Восточной Азии» . Природные коммуникации . 12 (1): 972. Бибкод : 2021NatCo..12..972W . дои : 10.1038/s41467-021-21240-1 . ПМЦ   7873279 . ПМИД   33563978 .
  41. ^ Мураками С., Китамура Т., Сузуки Дж., Сато Р., Аой Т., Фуджи М. и др. (декабрь 2020 г.). «Обнаружение и характеристика сарбековируса летучих мышей, филогенетически родственного SARS-CoV-2, Япония» . Новые инфекционные заболевания . 26 (12): 3025–3029. дои : 10.3201/eid2612.203386 . ПМК   7706965 . ПМИД   33219796 .
  42. ^ Перейти обратно: а б Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ   7211627 . ПМИД   32416074 .
  43. ^ Лам Т.Т., Цзя Н., Чжан Ю.В., Шум М.Х., Цзян Дж.Ф., Чжу Х.К. и др. (июль 2020 г.). «Идентификация коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, у малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 282–285. Бибкод : 2020Natur.583..282L . дои : 10.1038/s41586-020-2169-0 . ПМИД   32218527 . S2CID   214683303 .
  44. ^ Сяо К., Чжай Дж., Фэн Ю., Чжоу Н., Чжан Х., Цзоу Дж.Дж. и др. (июль 2020 г.). «Выделение коронавируса, связанного с SARS-CoV-2, от малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 286–289. Бибкод : 2020Natur.583..286X . дои : 10.1038/s41586-020-2313-x . ПМИД   32380510 . S2CID   256822274 .
  45. ^ Перейти обратно: а б Делон Д., Хул В., Карлссон Е.А., Хассанин А., Оу Т.П., Байдалюк А. и др. (ноябрь 2021 г.). «Новый коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, у летучих мышей из Камбоджи» . Природные коммуникации . 12 (1): 6563. Бибкод : 2021NatCo..12.6563D . дои : 10.1038/s41467-021-26809-4 . ПМЦ   8578604 . ПМИД   34753934 .
  46. ^ Чжоу Х, Чен X, Ху Т, Ли Дж, Сун Х, Лю Ю и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучих мышей, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в сайте расщепления S1/S2 белка-шипа» . Современная биология . 30 (11): 2196–2203.e3. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . ПМЦ   7211627 . ПМИД   32416074 .
  47. ^ Чжоу П., Ян XL, Ван XG, Ху Б, Чжан Л., Чжан В. и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей» . Природа . 579 (7798): 270–273. Бибкод : 2020Natur.579..270Z . дои : 10.1038/s41586-020-2012-7 . ПМК   7095418 . ПМИД   32015507 .
  48. ^ Теммам С., Вонгфайлот К., Бакеро Е., Мунье С., Бономи М., Рено Б. и др. (апрель 2022 г.). «Коронавирусы летучих мышей, родственные SARS-CoV-2 и заразные для клеток человека». Природа . 604 (7905): 330–336. Бибкод : 2022Natur.604..330T . дои : 10.1038/s41586-022-04532-4 . ПМИД   35172323 . S2CID   246902858 .
  49. ^ Зонневенд, Юлия (декабрь 2020 г.). Александр, Джеффри С.; Джейкобс, Рональд Н.; Смит, Филип (ред.). «Вирус как икона: пандемия 2020 года в изображениях» (PDF) . Американский журнал культурной социологии . 8 (3: Кризис COVID и культурная социология: наедине вместе ). Бейзингсток : Пэлгрейв Макмиллан : 451–461. дои : 10.1057/s41290-020-00118-7 . eISSN   2049-7121 . ISSN   2049-7113 . ПМЦ   7537773 . ПМИД   33042541 .
  50. ^ Голдсмит К.С., Татти К.М., Ксиазек Т.Г., Роллин П.Е., Комер Дж.А., Ли У.В. и др. (февраль 2004 г.). «Ультраструктурная характеристика коронавируса SARS» . Новые инфекционные заболевания . 10 (2): 320–6. дои : 10.3201/eid1002.030913 . ПМК   3322934 . ПМИД   15030705 . Вирионы приобрели оболочку путем отпочкования в цистернах и образовали в основном сферические, иногда плеоморфные частицы, средний диаметр которых составлял 78 нм (рис. 1А).
  51. ^ Нойман Б.В., Адэр Б.Д., Йошиока С., Киспе Дж.Д., Орка Г., Кун П. и др. (август 2006 г.). «Супрамолекулярная архитектура тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса, выявленная методом электронной криомикроскопии» . Журнал вирусологии . 80 (16): 7918–28. дои : 10.1128/JVI.00645-06 . ПМЦ   1563832 . ПМИД   16873249 . Диаметр частиц находился в диапазоне от 50 до 150 нм, исключая шипы, при среднем диаметре частиц от 82 до 94 нм; См. также рисунок 1 для двойной оболочки.
  52. ^ Лай М.М., Кавана Д. (1997). «Молекулярная биология коронавирусов» . Достижения в области исследования вирусов . 48 : 1–100. дои : 10.1016/S0065-3527(08)60286-9 . ISBN  9780120398485 . ПМК   7130985 . ПМИД   9233431 .
  53. ^ Мастерс PS (1 января 2006 г.). Молекулярная биология коронавирусов . Достижения в области исследования вирусов. Том. 66. Академическая пресса. стр. 193–292. дои : 10.1016/S0065-3527(06)66005-3 . ISBN  9780120398690 . ПМК   7112330 . ПМИД   16877062 . Тем не менее, взаимодействие между S-белком и рецептором остается основным, если не единственным, определяющим диапазон видов-хозяев коронавируса и тропизм тканей.
  54. ^ Цуй Дж., Ли Ф., Ши З.Л. (март 2019 г.). «Происхождение и эволюция патогенных коронавирусов» . Обзоры природы. Микробиология . 17 (3): 181–192. дои : 10.1038/s41579-018-0118-9 . ПМК   7097006 . ПМИД   30531947 . Различные штаммы SARS-CoV, выделенные от нескольких хозяев, различаются по сродству связывания с человеческим ACE2 и, следовательно, по своей инфекционности клеток человека76,78 (рис. 6b).
  55. ^ Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. раздел: Структура вириона.
  56. ^ Чанг К.К., Хоу М.Х., Чанг К.Ф., Сяо К.Д., Хуан Т.Х. (март 2014 г.). «Белок нуклеокапсида коронавируса SARS — формы и функции» . Противовирусные исследования . 103 : 39–50. дои : 10.1016/j.antiviral.2013.12.009 . ПМЦ   7113676 . ПМИД   24418573 . См. рисунок 4в.
  57. ^ Нойман Б.В., Кисс Дж., Кундинг А.Х., Бхелла Д., Бакш М.Ф., Коннелли С. и др. (апрель 2011 г.). «Структурный анализ белка М в сборке и морфологии коронавируса» . Журнал структурной биологии . 174 (1): 11–22. дои : 10.1016/j.jsb.2010.11.021 . ПМК   4486061 . ПМИД   21130884 . См. рисунок 10.
  58. ^ Лал СК, изд. (2010). Молекулярная биология SARS-коронавируса . дои : 10.1007/978-3-642-03683-5 . ISBN  978-3-642-03682-8 .
  59. ^ Перейти обратно: а б Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. раздел: Жизненный цикл коронавируса – прикрепление и проникновение.
  60. ^ Перейти обратно: а б Симмонс Г., Змора П., Гирер С., Хойрих А., Полманн С. (декабрь 2013 г.). «Протеолитическая активация шипового белка SARS-коронавируса: сокращение ферментов на переднем крае противовирусных исследований» . Противовирусные исследования . 100 (3): 605–14. doi : 10.1016/j.antiviral.2013.09.028 . ПМЦ   3889862 . ПМИД   24121034 . См. рисунок 2.
  61. ^ Старр, Тайлер Н.; Зепеда, Саманта К.; Уоллс, Александра К.; Грини, Эллисон Дж.; Альховский, Сергей; Вислер, Дэвид; Блум, Джесси Д. (1 марта 2022 г.). «Связывание ACE2 является наследственной и развивающейся чертой сарбековирусов» . Природа . 603 (7903): 913–918. Бибкод : 2022Natur.603..913S . дои : 10.1038/s41586-022-04464-z . ISSN   1476-4687 . ПМЦ   8967715 . ПМИД   35114688 .
  62. ^ Хойрих А., Хофманн-Винклер Х., Гирер С., Липольд Т., Ян О., Полманн С. (январь 2014 г.). «TMPRSS2 и ADAM17 дифференцированно расщепляют ACE2, и только протеолиз с помощью TMPRSS2 увеличивает проникновение, обусловленное белком-шипом коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Журнал вирусологии . 88 (2): 1293–307. дои : 10.1128/JVI.02202-13 . ПМЦ   3911672 . ПМИД   24227843 . SARS-CoV может захватить две клеточные протеолитические системы, чтобы обеспечить адекватную обработку своего S-белка. Расщеплению SARS-S может способствовать катепсин L, рН-зависимая эндо-/лизосомальная протеаза клетки-хозяина, при поглощении вирионов эндосомами клеток-мишеней (25). Альтернативно, трансмембранные сериновые протеазы II типа (TTSP) TMPRSS2 и HAT могут активировать SARS-S, предположительно путем расщепления SARS-S на поверхности клетки или вблизи нее, а активация SARS-S с помощью TMPRSS2 позволяет активировать катепсин-L-независимый клеточный запись (26,–28).
  63. ^ Зумла А., Чан Дж. Ф., Ажар Э. И., Хуэй Д. С., Юэнь К. Ю. (май 2016 г.). «Коронавирусы – открытие лекарств и варианты лечения» . Обзоры природы. Открытие наркотиков . 15 (5): 327–47. дои : 10.1038/номер.2015.37 . ПМК   7097181 . ПМИД   26868298 . S активируется и расщепляется на субъединицы S1 и S2 другими протеазами хозяина, такими как трансмембранная протеаза серин 2 (TMPRSS2) и TMPRSS11D, что обеспечивает проникновение неэндосомального вируса на клеточной поверхности через плазматическую мембрану.
  64. ^ Ли З., Томлинсон А.С., Вонг А.Х., Чжоу Д., Дефорж М., Талбот П.Дж. и др. (октябрь 2019 г.). «Структура S-белка человеческого коронавируса HCoV-229E и связывание с рецептором» . электронная жизнь . 8 . doi : 10.7554/eLife.51230 . ПМК   6970540 . ПМИД   31650956 .
  65. ^ Перейти обратно: а б с Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. Таблицу 2.
  66. ^ Рао, С; Хоскинс, я; Тонн, Т; Гарсия, PD; Озадам, Х; Саринай Ченик, Э; Ченик, Ц. (сентябрь 2021 г.). «Гены с 5'-концевыми олигопиримидиновыми трактами преимущественно избегают глобального подавления трансляции белком Nsp1 SARS-CoV-2» . РНК . 27 (9): 1025–1045. дои : 10.1261/rna.078661.120 . ПМК   8370740 . ПМИД   34127534 .
  67. ^ Мастерс PS (1 января 2006 г.). «Молекулярная биология коронавирусов» . Достижения в области исследования вирусов . 66 . Академическая пресса: 193–292. дои : 10.1016/S0065-3527(06)66005-3 . ISBN  9780120398690 . ПМК   7112330 . ПМИД   16877062 . См. рисунок 8.
  68. ^ Перейти обратно: а б с Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. раздел: Экспрессия белка-репликазы.
  69. ^ Мехди Мустакиль (5 июня 2020 г.). «Протеазы SARS-CoV-2 расщепляют IRF3 и важные модуляторы воспалительных путей (NLRP12 и TAB1): значение для проявления заболевания у разных видов и поиск резервуарных хозяев» . bioRxiv : 2020.06.05.135699. дои : 10.1101/2020.06.05.135699 . S2CID   219604020 .
  70. ^ Секстон Н.Р., Смит Э.К., Блан Х., Виньуцци М., Пирсен О.Б., Денисон М.Р. (август 2016 г.). «Идентификация на основе гомологии мутации РНК-зависимой РНК-полимеразы коронавируса, которая придает устойчивость к множественным мутагенам» . Журнал вирусологии . 90 (16): 7415–28. дои : 10.1128/JVI.00080-16 . ПМЦ   4984655 . ПМИД   27279608 . Наконец, эти результаты в сочетании с результатами предыдущих работ (33, 44) позволяют предположить, что CoV кодируют по крайней мере три белка, участвующих в верности (nsp12-RdRp, nsp14-ExoN и nsp10), поддерживая сборку мультипротеиновой репликазы верности. комплекс, как описано ранее (38).
  71. ^ Перейти обратно: а б Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. раздел: Жизненный цикл короны – репликация и транскрипция.
  72. ^ Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. рисунок 1.
  73. ^ Перейти обратно: а б Чжан С.В., Яп Ю.Л., Данчин А. Проверка гипотезы о рекомбинантном происхождении коронавируса, ассоциированного с атипичной пневмонией. Арх Вирол. Январь 2005 г.;150(1):1-20. Epub, 11 октября 2004 г. PMID 15480857.
  74. ^ Стэнхоуп М.Дж., Браун Дж.Р., Амрин-Мэдсен Х. Данные эволюционного анализа нуклеотидных последовательностей для рекомбинантной истории SARS-CoV. Заразить Генет Эвол. Март 2004 г.;4(1):15-9. ПМИД 15019585
  75. ^ Перейти обратно: а б Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN  978-1-4939-2438-7 . ПМЦ   4369385 . ПМИД   25720466 . См. раздел: Жизненный цикл коронавируса – сборка и выпуск.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 40e5f887cf5fb1400502ab0c26ea4890__1718643720
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/40/90/40e5f887cf5fb1400502ab0c26ea4890.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SARS-related coronavirus - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)