Ортогепевирус А
| Ортогепевирус А | |
|---|---|
 | |
| ПЭМ- микрофотография вирионов А ортогепевируса | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Китриновирикота |
| Сорт: | Алсувирицетес |
| Заказ: | Гепеливирусы |
| Семья: | Гепевирусиды |
| Род: | Ортогепевирус |
| Разновидность: | Ортогепевирус А |
| Синонимы [1] | |
| |
Вирус гепатита Е ( ВГЕ ) является возбудителем Е. гепатита Это вид Ортогепевирус А. [а] [2] [1]
Во всем мире примерно 939 миллионов человек, что соответствует каждому восьмому человеку, когда-либо перенесли инфекцию ВГЕ. Около 15–110 миллионов человек недавно или в настоящее время инфицированы ВГЕ. [3] Вирусная частица была впервые обнаружена в 1983 году. [4] но был молекулярно клонирован только в 1989 году. [5]
Геном и протеом
[ редактировать ]Ортогепевирус А можно разделить на восемь различных генотипов из разных географических регионов: генотип 1 (Азия), генотип 2 (Африка и Мексика), генотип 3 (Европа и Северная Америка), генотип 4 (Азия); генотипы 5 и 6 были обнаружены у азиатского дикого кабана, а генотипы 7 и 8 — у верблюдов. [2] [6]
Вирусный геном представляет собой одноцепочечную РНК с положительным смыслом длиной около 7200 оснований. Три открытые рамки считывания (ORF1, ORF2 и ORF3) кодируют три белка (O1, O2, O3), два из которых являются полипротеинами, то есть расщеплены на фрагменты, выполняющие реальные функции вируса (см. рисунок). ). Белок О1 состоит из семи таких фрагментов, а именно Met ( метилтрансфераза ), Y (Y-домен), Plp ( папаин-подобная протеаза ), V (богатая пролином вариабельная область), X (X-домен, макродомен), Hel ( геликаза ) и Rdrp ( РНК-зависимая РНК-полимераза ). Домен Pvx представляет собой слитый белок, состоящий из доменов Plp, V и X. Белок О3 кодируется одной открытой рамкой считывания (ORF3). Белок O2 кодирует капсид, который состоит из трех доменов, а именно домена оболочки ( S ) и двух выступающих доменов ( P1 , P2 ). [7] Числа на рисунке указывают позиции в последовательности РНК.
Интерактом
[ редактировать ]Белко-белковый интерактом среди белков ортогепевируса А был картирован Osterman et al. (2015), которые обнаружили 25 взаимодействий среди 10 изученных белков. Почти все (24) из этих взаимодействий были расценены как «высококачественные». [8]
Структура
[ редактировать ]Вирусные частицы имеют от 27 до 34 нанометров и не имеют оболочки. диаметр [2] [4]
Таксономия
[ редактировать ]Ранее он был отнесен к семейству Caliciviridae . Однако его геном больше напоминает вирус краснухи . В настоящее время он классифицируется как член рода Orthohepevirus семейства Hepeviridae . [2]
Эволюция
[ редактировать ]Существующие сегодня штаммы ВГЕ могли возникнуть от общего предка вируса 536–1344 лет назад. [9] Другой анализ датировал возникновение гепатита Е примерно 6000 лет назад и предположил, что это было связано с одомашниванием свиней. [10] В какой-то момент две клады — антропотропная форма и энзоотическая форма, — которые впоследствии развились в генотипы 1 и 2 и генотипы 3 и 4 соответственно. могли разойтись [11]
Хотя генотип 2 выявляется реже, чем другие генотипы, генетический эволюционный анализ показывает, что генотипы 1, 3 и 4 существенно распространились за последние 100 лет. [12]
См. также
[ редактировать ]
Примечания
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Перди, Майкл А.; и др. (июнь 2014 г.). «Новая классификационная схема гепевирусов » (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 1 мая 2019 г.
Вид вируса гепатита Е будет переименован в Ортогепевирус А , а видовой вирус птичьего гепатита Е будет переименован в Ортогепевирус В.
- ^ Jump up to: а б с д «Hepeviridae - Hepeviridae - РНК-вирусы с положительным смыслом - ICTV» . www.ictv.global .
- ^ Ли П, Лю Дж, Ли Й, Су Дж, Ма З, Брамер ВМ, Цао В, де Ман Р.А., Пеппеленбош член парламента, Пан Кью (июль 2020 г.). «Глобальная эпидемиология инфекции вируса гепатита Е: систематический обзор и метаанализ» . Печень Интернационал . 40 (7): 1516–1528. дои : 10.1111/liv.14468 . ПМЦ 7384095 . ПМИД 32281721 .
- ^ Jump up to: а б Балаян М.С., Анджапаридзе А.Г., Савинская С.С. и др. (1983). «Доказательства передачи вируса гепатита ни А, ни В фекально-оральным путем». Интервирусология . 20 (1): 23–31. дои : 10.1159/000149370 . ПМИД 6409836 .
- ^ Рейес Г.Р., Перди М.А., Ким Дж.П. и др. (1990). «Выделение кДНК из вируса, ответственного за кишечно-передаваемый гепатит ни А, ни В». Наука . 247 (4948): 1335–9. Бибкод : 1990Sci...247.1335R . дои : 10.1126/science.2107574 . ПМИД 2107574 .
- ^ Шлаудер, Г.Г. и Мушахвар, И.К. (2001)Генетическая гетерогенность вируса гепатита Е. Джей Мед Вирол 65, 282–92
- ^ Ахмад I, Холла Р.П., Джамиль С. (2011). «Молекулярная вирусология вируса гепатита Е» . Вирус Рес . 161 (1): 47–58. doi : 10.1016/j.virusres.2011.02.011 . ПМК 3130092 . ПМИД 21345356 .
- ^ Остерман А., Стеллбергер Т., Гебхардт А., Курц М., Фридель К.С., Утц П., Ничко Х., Байкер А., Визосо-Пинто М.Г. (2015). «Интравирусный интерактом вируса гепатита Е» . Научный представитель . 5 : 13872. Бибкод : 2015NatSR...513872O . дои : 10.1038/srep13872 . ПМЦ 4604457 . ПМИД 26463011 .
- ^ Худяков Юрий Евгеньевич; Перди, Майкл А. (17 декабря 2010 г.). «Эволюционная история и популяционная динамика вируса гепатита Е» . ПЛОС ОДИН . 5 (12): e14376. Бибкод : 2010PLoSO...514376P . дои : 10.1371/journal.pone.0014376 . ISSN 1932-6203 . ПМК 3006657 . ПМИД 21203540 .
- ^ Баха, Сарра; Бехул, Нуредин; Лю, Чжэньчжэнь; Вэй, Вэньцзюань; Ши, Жуйхуа; Мэн, Цзихун (29 октября 2019 г.). «Комплексный анализ генетических и эволюционных особенностей вируса гепатита Е» . БМК Геномика . 20 (1): 790. doi : 10.1186/s12864-019-6100-8 . ISSN 1471-2164 . ПМК 6820953 . PMID 31664890 .
- ^ Мирасо С., Мир Д., Белло Дж., Рамос Н., Мусто Х., Арбиса Дж. (2016). «Новый взгляд на филодинамику генотипа 3 вируса гепатита Е и историю эволюции». Заразить Генет Эвол . 43 : 267–73. дои : 10.1016/j.meegid.2016.06.003 . ПМИД 27264728 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Изопет Дж., Абраванель Ф., Далтон Х., Нассим Р.К. (2014) Инфекция вирусом гепатита Е. Отзывы о Клин Микро 27 (1) 116–138
Внешние ссылки
[ редактировать ]- «Hepeviridae – Hepeviridae – РНК-вирусы с положительным смыслом» .
- Вирус гепатита + Е + в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- «База данных вирусных патогенов и ресурс анализа (ViPR) – Hepeviridae – база данных генома с инструментами визуализации и анализа» .