Человеческий коронавирус NL63
| Альфакоронавирус Амстердам | |
|---|---|
 | |
| Просвечивающая электронная микрофотография HCoV-NL63 | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Пизонивирицеты |
| Заказ: | Нидовиралес |
| Семья: | Коронавирусы |
| Род: | Альфакоронавирус |
| Подрод: | сетраковирус |
| Разновидность: | Альфакоронавирус Амстердам |
| Синонимы | |
| |
Альфакоронавирус Амстердам [1] (также называемый коронавирусом человека NL63, сокращенно HCoV-NL63 ) — это разновидность коронавируса , в частности сетраковирус из рода Alphacoronavirus . Он был обнаружен в конце 2004 года у пациентов в Нидерландах Лией ван дер Хук и Кшиштофом Пирцем. [2] используя новый метод обнаружения вирусов VIDISCA. [3] Позже открытие подтвердили исследователи из Роттердама . [4] Вирус представляет собой оболочечный одноцепочечный положительным смыслом , с РНК-вирус который проникает в клетку-хозяина путем связывания с ACE2 . [5] [6] [7] Заражение этим вирусом подтверждено во всем мире и связано со многими распространенными симптомами и заболеваниями. Сопутствующие заболевания включают легкие и умеренные инфекции верхних дыхательных путей , тяжелые инфекции нижних дыхательных путей , круп и бронхиолит. [8] [9] [10]
Вирус обнаруживают преимущественно у маленьких детей, пожилых людей и пациентов с ослабленным иммунитетом , страдающих острыми респираторными заболеваниями. Он также имеет сезонную ассоциацию с умеренным климатом . Исследование, проведенное в Амстердаме, выявило наличие HCoV-NL63 примерно в 4,7% распространенных респираторных заболеваний. [11] Естественными резервуарами являются пальмовые циветты и летучие мыши. [12] По оценкам, его отличие от другого коронавируса ( HCoV-229E ) датируется около 1000 лет назад; вероятно, он циркулировал среди людей на протяжении веков. [13]
Эволюция HCoV-NL63, по-видимому, включала рекомбинацию между предковым NL63-подобным вирусом, циркулирующим у африканских Triaenops летучих мышей , и CoV 229E -подобным вирусом, циркулирующим у летучих мышей Hipposideros . [14] Рекомбинантные вирусы могут возникать, когда два вирусных генома присутствуют в одной и той же клетке-хозяине.
Симптомы
[ редактировать ]Первые случаи заражения HCoV-NL63 выявлены у детей раннего возраста с тяжелыми инфекциями нижних дыхательных путей, поступивших в стационары. Хотя клиническая картина вируса может быть тяжелой, его также обнаруживают в легких случаях респираторной инфекции. Коморбидность HCoV - NL63 с другими респираторными инфекциями затрудняет определение конкретных симптомов вируса. Исследование клинических симптомов у пациентов с HCoV-NL63 без вторичной инфекции показало, что наиболее распространенными симптомами являются лихорадка, кашель, ринит , боль в горле, охриплость голоса, бронхит , бронхиолит , пневмония и круп . [9] Раннее исследование детей с заболеваниями нижних дыхательных путей показало, что HCoV-NL63 чаще обнаруживался у амбулаторных пациентов, чем у госпитализированных пациентов, что позволяет предположить, что это вирус простуды, похожий на HCoV-229E и HCoV-OC43 , которые обычно вызывают менее серьезные симптомы. . [15] Однако высокая частота крупа специфична для инфекции HCoV-NL63.
Причина
[ редактировать ]
Считается, что путь распространения HCoV-NL63 лежит через прямую передачу от человека к человеку в густонаселенных районах. Вирус может выжить до недели вне организма в водных растворах при комнатной температуре и до трех часов на сухих поверхностях. [16] [17] Большинство людей заразятся коронавирусом в течение своей жизни, но некоторые группы населения более восприимчивы к HCoV-NL63. В эту группу населения входят дети в возрасте до 5 лет, пожилые люди и люди с ослабленным иммунитетом . Вероятно, вирус имеет сезонную заболеваемость, чаще всего возникающую в зимние месяцы в умеренном климате . В более экстремальном и тропическом климате вирус не имеет предпочтения к определенному времени года. Во многих исследованиях сообщалось о одновременном возникновении HCoV-NL63 с другими коронавирусами человека , вирусом гриппа А , ортопневмовирусом человека (РСВ), вирусом парагриппа и метапневмовирусом человека (hMPV). [18] [10]
Передача инфекции
[ редактировать ]Поскольку HCoV-NL63 поражает дыхательные пути, его необходимо вдыхать, и поэтому он передается воздушно-капельным путем. Вирус способен выживать в выделениях из дыхательных путей до семи дней и остается заразным при комнатной температуре. Как только вирус попадает в организм хозяина, он связывается с клеточными рецепторами через свои шиповые белки . Вирус способен использовать ангиотензинпревращающий фермент 2 (АПФ2) в качестве входного рецептора для связывания и проникновения в клетки-мишени. [19]
Диагностика
[ редактировать ]Трудно отличить симптомы, вызванные инфекцией вируса HCoV-NL63, от симптомов, вызванных другими распространенными человеческими вирусами, что усложняет диагностику и выявление. Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией образцов, собранных через мазок из носоглотки, является наиболее часто используемым методом обнаружения вируса. [10] вирусную культуру или анализ сыворотки крови на антитела Для подтверждения инфекции также можно использовать .
Профилактика
[ редактировать ]Центры США по контролю и профилактике заболеваний (CDC) рекомендуют несколько мер по предотвращению заражения HCoV-NL63, в том числе: часто мыть руки с мылом, избегать тесного контакта с больными людьми и не прикасаться к глазам, рту или нос. [20]
Лечение и прогноз
[ редактировать ]Лечение вируса HCoV-NL63 зависит от тяжести сопутствующих симптомов . Большинство инфекций легкой и средней степени тяжести проходят сами по себе. Симптомы можно облегчить, приняв обезболивающее или жаропонижающее средство, приняв горячий душ или используя увлажнитель воздуха . Противовирусное лечение может потребоваться инфицированным пациентам, которые попадают в отделение интенсивной терапии (ОИТ) из-за острой респираторной инфекции . Внутривенный иммуноглобулин является одобренным FDA ингибитором HCoV-NL63, который также используется для лечения первичного иммунодефицита , РСВ и болезни Кавасаки , хотя он не одобрен для лечения HCoV-NL63. [11]
Вирусология
[ редактировать ]HCoV-NL63 — один из семи известных коронавирусов, поражающих человека. Остальные шесть: [21]
- Человеческий коронавирус 229E (HCoV-229E)
- Человеческий коронавирус OC43 (HCoV-OC43)
- Коронавирус человека HKU1 (HCoV-HKU1)
- Коронавирус, связанный с ближневосточным респираторным синдромом (MERS-CoV)
- Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-1)
- Тяжелый острый респираторный синдром, коронавирус 2 (SARS-CoV-2)
Недавние исследования
[ редактировать ]Исследование, опубликованное в 2005 году Эспером и др. предположили связь инфекции HCoV-NL63 с болезнью Кавасаки , системным васкулитом в детстве, который может привести к аневризмам коронарных артерий . [22] В развитых странах болезнь Кавасаки является наиболее распространенной причиной приобретенных заболеваний сердца у детей. [23] Дальнейший анализ патогенности HCoV-NL63 кажется оправданным, в частности, из-за недавних доказательств того, что этот вирус использует тот же клеточный рецептор ( ACE2 ), что и SARS-CoV (возбудитель SARS ), и SARS-CoV-2 (возбудитель SARS). COVID-19 ), [19] последний из которых вызывает очень похожий иммунный ответ . HCoV-NL63 также был обнаружен в кишечном тракте инфицированных людей и связан с гастроэнтеритом . [24] Этот тип инфекции является прямым результатом вирусной инвазии в слизистую оболочку кишечника. Роль HCoV-NL63 при гастроэнтерите неясна из-за типичной коинфекции с другими вирусами при этом состоянии. HCoV-NL63, вероятно, недостаточно выявляется из-за его роли во многих легких и среднетяжелых респираторных инфекциях и коморбидности с другими заболеваниями. Исследователи предположили, что необходимы более комплексные популяционные исследования для определения воздействия этого вируса на системы за пределами дыхательных путей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Подробности о таксонах | ICTV» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 25 июля 2024 г.
- ^ ван дер Хук, Лия; Пирц, Кшиштоф; Джеббинк, Мартен Ф.; Вермёлен-Ост, Вильма; Берхаут, Рон Дж. М.; Уолтерс, Катя С.; Вертхайм-ван Диллен, Полин М.Э.; Каандорп, Джос; Экономия пряжи, Шутка; Беркхаут, Бен (апрель 2004 г.). «Идентификация нового коронавируса человека» . Природная медицина . 10 (4): 368–373. дои : 10.1038/нм1024 . ISSN 1546-170Х . ПМЦ 7095789 . ПМИД 15034574 .
- ^ Пирц, Кшиштоф; Джеббинк, Мартен Ф.; Беркхаут, Бен; Ван дер Хук, Лия (2008), Кавана, Дэйв (редактор), «Обнаружение новых вирусов с помощью VIDISCA: открытие вируса на основе полиморфизма длины фрагментов, амплифицированного кДНК» , SARS- и другие коронавирусы: лабораторные протоколы , методы молекулярной биологии , том. 454, Тотова, Нью-Джерси: Humana Press, стр. 73–89, doi : 10.1007/978-1-59745-181-9_7 , ISBN. 978-1-59745-181-9 , PMC 7121709 , PMID 19057862 , получено 9 июня 2023 г.
- ^ Фушье Р.А., Хартвиг Н.Г., Бестеброер Т.М., Нимейер Б., де Йонг Дж.К., Саймон Дж.Х., Остерхаус А.Д. (апрель 2004 г.). «Ранее неописанный коронавирус, связанный с респираторными заболеваниями у людей» . Proc Natl Acad Sci США . 101 (16): 6212–6216. Бибкод : 2004PNAS..101.6212F . дои : 10.1073/pnas.0400762101 . ПМЦ 395948 . ПМИД 15073334 .
- ^ Хофманн, Хайке; Пирц, Кшиштоф; ван дер Хук, Лия; Гейер, Мартина; Беркхаут, Бен; Пёльманн, Стефан (31 мая 2005 г.). «Человеческий коронавирус NL63 использует рецептор коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома для проникновения в клетку» . Труды Национальной академии наук . 102 (22): 7988–7993. Бибкод : 2005PNAS..102.7988H . дои : 10.1073/pnas.0409465102 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 1142358 . ПМИД 15897467 .
- ^ «Фермент 2, превращающий ангиотензин I ACE2 - Ген» . НКБИ . 28 февраля 2020 г. Проверено 21 марта 2020 г.
Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству ангиотензинпревращающих ферментов дипептидилкарбоксипептидаз и имеет значительную гомологию с ангиотензин-1-превращающим ферментом человека. Этот секретируемый белок катализирует расщепление ангиотензина I на ангиотензин 1–9, а ангиотензина II на ангиотензин 1–7, расширяющий сосуды. Органо- и клеточно-специфическая экспрессия этого гена предполагает, что он может играть роль в регуляции сердечно-сосудистой и почечной функции, а также фертильности. Кроме того, кодируемый белок является функциональным рецептором для шиповидного гликопротеина коронавируса человека HCoV-NL63 и коронавирусов тяжелого острого респираторного синдрома человека SARS-CoV и SARS-CoV-2 (вирус COVID-19).
- ^ Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN 978-1-4939-2438-7 . ПМЦ 4369385 . ПМИД 25720466 .
- ^ Лия ван дер Хук, Кшиштоф Пирц, Бен Берхаут. «Человеческий коронавирус NL63, новый респираторный вирус» . Academic.oup.com . Проверено 9 июня 2023 г.
{{cite web}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б Хук, Лия ван дер; Конечно, Клаус; Ихорст, Габриэле; Стэнг, Александр; Пирц, Кшиштоф; Джеббинк, Мартен Ф.; Петерсен, Гудула; Форстер, Джон; Беркхаут, Бен; Уберла, Клаус (23 августа 2005 г.). «Круп связан с новым коронавирусом NL63» . ПЛОС Медицина . 2 (8): е240. doi : 10.1371/journal.pmed.0020240 . ISSN 1549-1676 . ПМЦ 1188248 . ПМИД 16104827 .
- ^ Jump up to: а б с Абдул-Расул С., Филдинг, Британская Колумбия (май 2010 г.). «Понимание человеческого коронавируса HCoV-NL63» . Открытый вирусологический журнал . 4 : 76–84. дои : 10.2174/1874357901004010076 . ПМЦ 2918871 . ПМИД 20700397 .
- ^ Jump up to: а б ван дер Хук Л., Пирк К., Берхаут Б. (сентябрь 2006 г.). «Человеческий коронавирус NL63, новый респираторный вирус» . Обзоры микробиологии FEMS . 30 (5): 760–73. дои : 10.1111/j.1574-6976.2006.00032.x . ПМК 7109777 . ПМИД 16911043 .
- ^ Лим, Ивонн Синьи; Нг, Ян Лин; Тэм, Джеймс П.; Лю, Дин Сян (25 июля 2016 г.). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса с хозяином» . Болезни . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ISSN 2079-9721 . ПМЦ 5456285 . ПМИД 28933406 .
См. Таблицу 1.
- ^ Пирк, К. (2006). «Мозаичная структура человеческого коронавируса NL63, тысяча лет эволюции» . Дж. Мол. Биол . 364 (5): 964–973. дои : 10.1016/j.jmb.2006.09.074 . ISSN 0022-2836 . ПМК 7094706 . ПМИД 17054987 .
- ^ Тао, Ю.; Ши, М.; Шомманар, К.; Королева, К.; Чжан, Дж.; Маркоттер, В.; Кузьмин, ИВ; Холмс, ЕС; Тонг, С. (2017). «Наблюдение за коронавирусами летучих мышей в Кении выявило родственников коронавирусов человека NL63 и 229E и историю их рекомбинации» . Журнал вирусологии . 91 (5). дои : 10.1128/JVI.01953-16 . ПМК 5309958 . ПМИД 28077633 .
- ^ ван дер Хук Л., Берхаут Б. (июль 2005 г.). «Вопросы, касающиеся коронавируса Нью-Хейвена» . Журнал инфекционных болезней . 192 (2): 350–1, ответ автора 353–4. дои : 10.1086/430795 . ПМК 7110114 . ПМИД 15962232 .
- ^ Флорек, Доминик; Бурмистрц, Михал; Потемпа, Ян; Пирц, Кшиштоф (1 сентября 2014 г.). «Стабильность инфекционного коронавируса человека NL63» . Журнал вирусологических методов . 205 : 87–90. дои : 10.1016/j.jviromet.2014.04.001 . ISSN 0166-0934 . ПМЦ 7113654 . ПМИД 24747590 .
- ^ "Коронавирус в людях" . Агентство общественного здравоохранения Канады . 19 августа 2011 г. Проверено 22 июля 2015 г.
- ^ Голда, Анна; Малек, Наталья; Дудек, Бартош; Зеглен, Славомир; Воярски, Яцек; Охман, Марек; Куцевич, Ева; Зембала, Мариан; Потемпа, Ян; Пирц, Кшиштоф (2011). «Инфекция человеческим коронавирусом NL63 усиливает адгезию стрептококка к эпителиальным клеткам» . Журнал общей вирусологии . 92 (6): 1358–1368. дои : 10.1099/vir.0.028381-0 . ISSN 1465-2099 . ПМК 3168281 . ПМИД 21325482 .
- ^ Jump up to: а б Хофманн Х., Пирк К., ван дер Хук Л., Гейер М., Берхаут Б., Полманн С. (май 2005 г.). «Человеческий коронавирус NL63 использует рецептор коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома для проникновения в клетку» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (22): 7988–93. Бибкод : 2005PNAS..102.7988H . дои : 10.1073/pnas.0409465102 . ПМЦ 1142358 . ПМИД 15897467 .
- ^ "Про коронавирус" . Центры по контролю и профилактике заболеваний США . Проверено 22 июля 2015 г.
- ^ Эспер Ф., Шапиро Э.Д., Вейбель С., Фергюсон Д., Лэндри М.Л., Кан Дж.С. (февраль 2005 г.). «Связь между новым коронавирусом человека и болезнью Кавасаки» . J Заразить Дис . 191 (4): 499–502. дои : 10.1086/428291 . ПМК 7199489 . ПМИД 15655771 .
- ^ «Болезнь Кавасаки» . Клиника Мэйо . Проверено 22 июля 2015 г.
- ^ Филдинг, Британская Колумбия (февраль 2011 г.). «Человеческий коронавирус NL63: клинически важный вирус?» . Будущая микробиология . 6 (2): 153–9. дои : 10.2217/fmb.10.166 . ПМК 7079714 . ПМИД 21366416 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
Данные, относящиеся к человеческому коронавирусу NL63 , на Wikispecies
