Человеческий коронавирус OC43
| Человеческий коронавирус OC43 | |
|---|---|
 | |
| Трансмиссионная электронная микрофотография коронавируса человека OC43 | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Пизонивирицеты |
| Заказ: | Нидовиралес |
| Семья: | Коронавирусы |
| Род: | Бетакоронавирус |
| Подрод: | Эмбековирус |
| Разновидность: | |
| Вирус: | Человеческий коронавирус OC43 |
Человеческий коронавирус OC43 [1] ( HCoV-OC43 ) является представителем вида Betacoronavirus 1 , который заражает людей и крупный рогатый скот. [2] [3] Инфицирующий коронавирус представляет собой оболочечный одноцепочечный положительным смыслом , с РНК-вирус который проникает в клетку-хозяина путем связывания с рецептором N-ацетил-9-О-ацетилнейраминовой кислоты . [4] OC43 — один из семи известных коронавирусов, заражающих человека. Это один из вирусов, вызывающих простуду . [5] [6] и, возможно, был ответственен за пандемию 1889–1890 годов . [7] Как и другие коронавирусы из рода Betacoronavirus , подрода Embecovirus , он имеет дополнительный белок с более короткими шипами, называемый гемагглютинин-эстеразой (HE). [8] [2]
Вирусология
[ редактировать ]HCoV-OC43 четыре генотипа Были идентифицированы (от A до D), причем генотип D, скорее всего, возник в результате генетической рекомбинации . Полное секвенирование генома генотипов C и D и бутскан-анализ показывают события рекомбинации между генотипами B и C в генерации генотипа D. Из 29 выявленных вирусных вариантов ни один не принадлежит к более древнему генотипу A. Анализ молекулярных часов спайка и нуклеокапсида. с использованием генов датирует самого последнего общего предка всех генотипов 1950-ми годами. Генотипы B и C датируются 1980-ми годами. Генотип B — к 1990-м годам, а генотип C — к концу 1990-х — началу 2000-х годов. Рекомбинантные варианты генотипа D были обнаружены еще в 2004 году. [5]
Сравнение HCoV-OC43 с наиболее близким штаммом вида бетакоронавируса 1, бычьим коронавирусом BCoV, показало, что у них был самый последний общий предок в конце 19 века, при этом несколько методов дали наиболее вероятные даты около 1890 года, что привело авторов к предположению, что Введение пандемию первого штамма в человеческую популяцию могло вызвать 1889–1890 годов , которую в то время приписывали гриппу . [9] Пандемия COVID-19 предоставила дополнительные доказательства связи, поскольку пандемия 1889–1890 годов вызывала симптомы, более близкие к симптомам, связанным с COVID-19 (инфекцией, вызываемой бетакоронавирусом SARS-CoV-2 ), чем с гриппом. [10] Брюссов в августе 2021 года назвал доказательства того, что OC43 вызвал вспышку 1889–1890 годов, как «косвенные, хотя и слабые» и «предположительные», однако эпидемия 1889 года была лучшим историческим рекордом, позволяющим делать прогнозы относительно текущего пути распространения COVID-19. из-за схожих «клинико-эпидемиологических характеристик». [11]
Происхождение HCoV-OC43 неясно, но предполагается, что он мог возникнуть у грызунов, а затем передаться крупному рогатому скоту в качестве промежуточных хозяев. [12] Делеция из BCoV в HCoV-OC43 могла иметь место в случае межвидовой передачи от крупного рогатого скота к человеку. [9]
Патогенез
[ редактировать ]Наряду с HCoV-229E , разновидностью рода Alphacoronavirus , HCoV-OC43 входит в число вирусов, вызывающих простуду . Оба вируса могут вызывать тяжелые инфекции нижних дыхательных путей , включая пневмонию , у младенцев, пожилых людей и людей с ослабленным иммунитетом , например, у тех, кто проходит химиотерапию , и у людей с ВИЧ/СПИДом . [13] [14] [15]
Если бы HCoV-OC43 действительно был возбудителем, ответственным за пандемию 1889–1890 годов, которая напоминала пандемию COVID-19 , то тяжелое заболевание было бы гораздо более распространенным, а смертность была бы намного выше в популяциях, которые ранее не подвергались воздействию вируса. [16]
Эпидемиология
[ редактировать ]Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая 10–15% случаев простуды (вирус, чаще всего вызывающий простуду, — это риновирус , обнаруживаемый в 30–50% случаев). [17] Инфекции имеют сезонный характер: большинство случаев приходится на зимние месяцы в умеренном климате и летом и весной в теплом климате. [18] [17] [19] [20] Поскольку OC43 способен инфицировать ткани свиньи, [21] вполне вероятно, что свиньи служат зоонозным резервуаром этой болезни, повторно заражая человеческую популяцию.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ли, Пол (2007). Молекулярная эпидемиология коронавируса человека OC43 в Гонконге (Диссертация). Библиотеки Гонконгского университета. doi : 10.5353/th_b4501128 (неактивен 12 апреля 2024 г.). hdl : 10722/131538 .
{{cite thesis}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б «Браузер таксономии (бетакоронавирус 1)» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 29 февраля 2020 г.
- ^ Лим, Ивонн Синьи; Нг, Ян Лин; Тэм, Джеймс П.; Лю, Дин Сян (25 июля 2016 г.). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса с хозяином» . Болезни . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ПМЦ 5456285 . ПМИД 28933406 .
См. Таблицу 1.
- ^ Ли, Фан (29 сентября 2016 г.). «Структура, функции и эволюция шиповых белков коронавируса» . Ежегодный обзор вирусологии . 3 (1): 237–261. doi : 10.1146/annurev-virology-110615-042301 . ПМЦ 5457962 . ПМИД 27578435 .
BCoV S1-NTD не распознает галактозу, как галектины. Вместо этого он распознает 5-N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовую кислоту (Neu5,9Ac2) (30, 43). Тот же рецептор сахара распознается человеческим коронавирусом OC43 (43, 99). OC43 и BCoV генетически тесно связаны, и OC43 мог возникнуть в результате зоонозного распространения BCoV (100, 101).
- ^ Перейти обратно: а б Лау, Сюзанна КП; Ли, Пол; Цанг, Алан К.Л.; Да, Кирилл Сай; Це, Герман; Ли, Родни А.; Итак, Лок-Йи; Лау, Ю.-Л.; Чан, Квок-Хунг; Ву, Патрик Сай; Юэнь, Квок-Юнг (2011). «Молекулярная эпидемиология коронавируса человека OC43 показывает эволюцию различных генотипов с течением времени и недавнее появление нового генотипа вследствие естественной рекомбинации» . Журнал вирусологии . 85 (21): 11325–37. дои : 10.1128/JVI.05512-11 . ПМК 3194943 . ПМИД 21849456 .
- ^ Гонт, скорая помощь; Харди, А.; Клаас, Европейский суд; Симмондс, П.; Темплтон, Кентукки (2010). «Эпидемиология и клинические проявления четырех коронавирусов человека 229E, HKU1, NL63 и OC43, обнаруженных за 3 года с использованием нового метода мультиплексной ПЦР в реальном времени» . J Clin Микробиол . 48 (8): 2940–7. дои : 10.1128/JCM.00636-10 . ПМК 2916580 . ПМИД 20554810 .
- ^ Брюссов, Харальд; Брюссов, Лютц (13 июля 2021 г.). «Клинические доказательства того, что пандемия 1889–1891 годов, обычно называемая русским гриппом, могла быть более ранней пандемией коронавируса» . Микробная биотехнология . 14 (5): 1860–1870. дои : 10.1111/1751-7915.13889 . ПМЦ 8441924 . ПМИД 34254725 .
- ^ Ву, Патрик Сай; Хуан, И; Лау, Сюзанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–20. дои : 10.3390/v2081803 . ПМК 3185738 . ПМИД 21994708 .
У всех членов подгруппы А бетакоронавирусов ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с активностью нейрамината-О-ацетилэстеразы и активным центром FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (рис. 1).
- ^ Перейти обратно: а б Виген, Лин; Кейартс, Элс; Моэс, Элиен; Толен, Инге; Воллантс, Эльке; Леми, Филипп; Вандам, Анн-Мик; Ван Ранст, Марк (2005). «Полная геномная последовательность коронавируса человека OC43: анализ молекулярных часов предполагает относительно недавнее событие передачи зоонозного коронавируса» . Журнал вирусологии . 79 (3): 1595–1604. doi : 10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005 . ПМК 544107 . ПМИД 15650185 .
- ^ Кнудсен, Йеппе Кюне (13 августа 2020 г.). «Overraskende opdagelse: Coronavirus har tidligere lagt verden ned» [Удивительное открытие: ранее коронавирус обрушивал мир]. ДР (на датском языке) . Проверено 13 августа 2020 г. .
Предполагаемая пандемия гриппа в 1889 году на самом деле была вызвана коронавирусом, как показывают датские исследования.
- ^ Брюссов, Харальд (2021). «Чему мы можем научиться из динамики пандемии «русского гриппа» 1889 года для будущей траектории распространения COVID-19» . Микробная биотехнология . 14 (6): 2244–2253. дои : 10.1111/1751-7915.13916 . ПМК 8601188 . ПМИД 34464023 .
- ^ Форни, Диего; Кальяни, Рашель; Клеричи, Марио; Сирони, Мануэла (2017). «Молекулярная эволюция геномов коронавируса человека» . Тенденции в микробиологии . 25 (1): 35–48. дои : 10.1016/j.tim.2016.09.001 . ISSN 0966-842X . ПМК 7111218 . ПМИД 27743750 .
- ^ Веверс, Бриджит А.; Ван дер Хук, Лия (2009). «Недавно обнаруженные коронавирусы человека» . Клиники лабораторной медицины . 29 (4): 715–724. дои : 10.1016/j.cll.2009.07.007 . ПМЦ 7131583 . ПМИД 19892230 .
- ^ Махони, Джеймс Б. (2007). "Коронавирусы". В Мюррее, Патрик Р.; Барон, Эллен Джо; Йоргенсен, Джеймс Х.; Ландри, Мария Луиза; Пфаллер, Майкл А. (ред.). Руководство по клинической микробиологии (9-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. стр. 1414–23. ISBN 978-1-55581-371-0 .
- ^ Пирк, К.; Берхаут, Б.; Ван дер Хук, Л. (2007). «Противовирусные стратегии против коронавирусов человека». Цели лечения инфекционных заболеваний . 7 (1): 59–66. дои : 10.2174/187152607780090757 . ПМИД 17346212 .
- ^ Брюссов, Харальд; Брюссов, Лютц (13 июля 2021 г.). «Клинические доказательства того, что пандемия 1889–1891 годов, обычно называемая русским гриппом, могла быть более ранней пандемией коронавируса» . Микробная биотехнология . 14 (5): 1860–1870. дои : 10.1111/1751-7915.13889 . ПМЦ 8441924 . ПМИД 34254725 .
- ^ Перейти обратно: а б Ват, Деннис (2004). «Просуда: Обзор литературы» . Европейский журнал внутренней медицины . 15 (2): 79–88. дои : 10.1016/j.ejim.2004.01.006 . ПМК 7125703 . ПМИД 15172021 .
- ^ Ван дер Хук, Л. (2007). «Человеческие коронавирусы: что они вызывают?» . Противовирусная терапия . 12 (4 части Б): 651–8. дои : 10.1177/135965350701200S01.1 . ПМИД 17944272 . S2CID 31867379 .
- ^ Кисслер, Стивен М. (14 апреля 2020 г.). «Прогнозирование динамики передачи SARS-CoV-2 в постпандемический период» . Наука . 368 (6493): 860–868. Бибкод : 2020Sci...368..860K . дои : 10.1126/science.abb5793 . ПМК 7164482 . ПМИД 32291278 .
- ^ Берри, Майкл (2015). «Идентификация новых респираторных вирусов в новом тысячелетии» . Вирусы . 7 (3): 996–1019. дои : 10.3390/v7030996 . ПМЦ 4379558 . ПМИД 25757061 .
- ^ Сюй Г, Цяо З, Шрааувен Р, Аван А, Пеппеленбош М.П., Бийвелдс М.Дж., Цзян С., Ли П (апрель 2024 г.). «Доказательства межвидовой передачи человеческого коронавируса OC43 посредством биоинформатики и моделирования инфекций в органоидах кишечника свиней» . Ветеринарная микробиология . 293 : 110101. doi : 10.1016/j.vetmic.2024.110101 . ПМИД 38718529 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Вирусология онлайн
- Коронавирусы
- Вирусная зона: Бетакоронавирус.
- База данных вирусных патогенов и ресурс анализа (ViPR): Coronaviridae
