Эмбековирус
Эмбековирус | |
---|---|
мышиного коронавируса (MHV) вириона Электронная микрофотография , схематическая структура и геном. | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Сорт: | Пизонивирицеты |
Заказ: | Нидовиралес |
Семья: | Коронавирусы |
Род: | Бетакоронавирус |
Подрод: | Эмбековирус |
Разновидность [1] | |
Эмбековирус — подрод коронавирусов рода Betacoronavirus . [1] Вирусы этого подрода, в отличие от других коронавирусов , имеют ген гемагглютининэстеразы (HE). [2] Вирусы этого подрода ранее были известны как коронавирусы группы 2а . [3] [4]
Структура
[ редактировать ]Вирусы этого подрода, как и другие коронавирусы, имеют липидную двухслойную оболочку , в которой мембраны (М), оболочки (Е) и шипа (S) . закреплены структурные белки [5] В отличие от других коронавирусов, вирусы этого подрода также имеют дополнительный более короткий шипообразный структурный белок, называемый гемагглютининэстеразой (HE). [2] [6]
Рекомбинация
[ редактировать ]Генетическая рекомбинация может произойти, когда два или более вирусных генома присутствуют в одной и той же клетке-хозяине. Бета-коронавирус дромадеров (Beta-CoV HKU23) демонстрирует генетическое разнообразие в популяции африканских верблюдов . [7] Этому разнообразию способствуют несколько событий рекомбинации, которые произошли в прошлом между близкородственными бета-коронавирусами подрода Embecovirus. [7]
См. также
[ редактировать ]- Сарбековирус (группа 2б)
- Мербековирус (группа 2с)
- Нобековирус (группа 2д)
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2018 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018. Архивировано из оригинала 4 марта 2018 года . Проверено 24 января 2019 г.
- ^ Jump up to: а б Ву, Патрик Сай; Хуан, И; Лау, Сюзанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. дои : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915 . ПМК 3185738 . ПМИД 21994708 .
У всех представителей подгруппы А бетакоронавирусов ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с активностью нейрамината-О-ацетилэстеразы и активным центром FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (рис. 1).
- ^ Ву, Патрик Сай; Ван, Мин; Лау, Сюзанна КП; Сюй, Хуэйфан; Пун, Розана В.С.; Го, Жунтун; Вонг, Беатрис Х.Л.; Гао, Кай; Цой, Хой-ва; Хуан, И; Ли, Кеннет С.М. (февраль 2007 г.). «Сравнительный анализ двенадцати геномов трех новых коронавирусов группы 2c и группы 2d выявляет уникальные групповые и подгрупповые особенности» . Журнал вирусологии . 81 (4): 1574–1585. дои : 10.1128/JVI.02182-06 . ISSN 0022-538X . ПМЦ 1797546 . ПМИД 17121802 .
См. рисунок 2.
- ^ Вонг, Антонио CP; Ли, Синь; Лау, Сюзанна КП; Ву, Патрик Сай (20 февраля 2019 г.). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей» . Вирусы . 11 (2): 174. дои : 10.3390/v11020174 . ISSN 1999-4915 . ПМК 6409556 . ПМИД 30791586 .
Коронавирусы подразделяются на четыре рода: альфакоронавирусы, бетакоронавирусы, гаммакоронавирусы и дельтакоронавирусы. Внутри бетакоронавируса их можно подразделить на линии A, B, C и D [1]. В 2018 году эти четыре линии были переклассифицированы в подроды бетакоронавируса и переименованы в Embecovirus (предыдущая линия A), сарбековирус (предыдущая линия B), мербековирус (предыдущая линия C) и нобековирус (предыдущая линия D) [2]. Кроме того, был включен пятый подрод, Hibecovirus (рис. 1) [2].
- ^ Лай, Майкл MC; Кавана, Дэвид (1 января 1997 г.), Мараморош, Карл; Мерфи, Фредерик А.; Шаткин, Аарон Дж. (ред.), «Молекулярная биология коронавирусов; III. Структура вирионов; А. Морфология вирионов», « Достижения в области вирусных исследований» , 48 , Academic Press: 5–6, doi : 10.1016/S0065-3527 (08)60286-9 , ПМК 7130985 , ПМИД 9233431
- ^ Ву, Патрик Сай; Хуан, И; Лау, Сюзанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. дои : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915 . ПМК 3185738 . ПМИД 21994708 .
Наличие генов HE исключительно у членов подгруппы бетакоронавирусов А, но не у членов подгрупп бетакоронавирусов B, C и D, позволяет предположить, что рекомбинация, вероятно, произошла у предка членов подгруппы бетакоронавирусов А после дивергенции от предка других подгрупп вирусов. Бетакоронавирус.
- ^ Jump up to: а б Разнообразие коронавируса HKU23 одноцветных верблюдов у африканских верблюдов выявило множественные события рекомбинации среди близкородственных бетакоронавирусов подрода Embecovirus. Итак, RTY и др. Дж Вирол. 2019. ПМИД 31534035