Вирус трансмиссивного гастроэнтерита
 | Эта статья включает список общих ссылок , но в ней отсутствуют достаточные соответствующие встроенные цитаты . ( июнь 2010 г. ) |
| Вирус трансмиссивного гастроэнтерита | |
|---|---|
 | |
| Электронная микрофотография коронавируса трансмиссивного гастроэнтерита (TGEV) | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Пизонивирицеты |
| Заказ: | Нидовиралес |
| Семья: | Коронавирусы |
| Род: | Альфакоронавирус |
| Подрод: | Тегаковирус |
| Разновидность: | |
| Вирус: | Вирус трансмиссивного гастроэнтерита |
| изоляты [1] | |
Вирус трансмиссивного гастроэнтерита или коронавирус трансмиссивного гастроэнтерита ( TGEV ) — это коронавирус , поражающий свиней. Это оболочечный одноцепочечный положительным смыслом , с РНК-вирус который проникает в клетку-хозяина путем связывания с рецептором APN . [2] Вирус относится к роду Alphacoronavirus , подроду Tegacovirus, виду Alphacoronavirus 1 . [3] [4]
Белки, которые вносят вклад в общую структуру TGEV, включают шип (S), оболочку (E), мембрану (M) и нуклеокапсид (N). Размер генома коронавирусов колеблется примерно в пределах 28,6 тыс. нуклеотидов . [5] Другими коронавирусами, принадлежащими к виду Alphacoronavirus 1, являются коронавирус кошек , коронавирус собак и вирус инфекционного перитонита кошек .
Биология
[ редактировать ]ТГЕВ принадлежит к семейству Coronaviridae , роду Alphacoronavirus , виду Alphacoronavirus 1 . Это оболочечный вирус с положительным геномом одноцепочечной РНК. TGEV имеет три основных структурных белка: фосфопротеин (N), интегральный мембранный белок (E1) и большой гликопротеин (E2). Белок N инкапсулирует геномную РНК, а белок S образует вирусные проекции.
3'-сегмент длиной около 8000 нуклеотидов кодирует субгеномные РНК. Оставшаяся часть генома кодирует вирусную репликазу. Три самые большие последовательности генов от 5' до 3' расположены в порядке от E2 до E1 и N. Существует около семи других открытых рамок считывания, которые структурно не связаны. Гены очень мало перекрываются и плотно упакованы. Синтезируется отрицательная цепь, которая служит матрицей для транскрипции РНК одного размера генома и нескольких РНК размера субгенома.
Белок Е2 образует на поверхности вируса выступ в форме лепестка длиной 20 нм. Считается, что белок Е2 участвует в патогенезе, помогая вирусу проникнуть в цитоплазму хозяина. Белок Е2 первоначально имеет 1447 остатков, а затем отщепляется короткая гидрофобная последовательность. После гликозилирования белка в аппарате Гольджи белок включается в новый вирус. В белке Е2 имеется несколько функциональных доменов. Гидрофобный сегмент из 20 остатков на С-конце закрепляет белок в липидной мембране. Остальная часть белка разделена на две части: гидрофильный участок, находящийся внутри вируса, и участок, богатый цистеином, который, возможно, является сайтом жирного ацилирования. Белок Е1 в основном встроен в липидную оболочку и, следовательно, играет важную роль в архитектуре вируса. Предполагается, что белок E1 взаимодействует с мембраной лимфоцитов, что приводит к индукции генов, кодирующих IFN.
Коронавирусы проникают в хозяина, сначала прикрепляясь к клетке-хозяину с помощью гликопротеина-шипа. Белок S взаимодействует с аминопептидазой N свиньи (pAPN), клеточным рецептором, способствуя его проникновению. Тот же клеточный рецептор также является точкой контакта для коронавирусов человека. Домен в белке S-шипа распознается pAPN, и pAPN трансфицируется в непермиссивные клетки и заражает их TGEV.
Морфология
[ редактировать ]Морфологию ТГЭВ в основном определяли методами электронной микроскопии. По морфологии они сходны с миксовирусами и онкогенными вирусами, поскольку имеют поверхностные выступы и оболочку. Вирусы преимущественно имеют круглую форму и диаметр от 100 до 150 нм, включая выступы на поверхности. Выступы имели в основном лепесткообразную форму, прикрепленную к ним очень узкой ножкой. Выступы, казалось, очень легко отделялись от вируса и были обнаружены только в избранных областях.
Патология
[ редактировать ]TGEV заражает свиней. У поросят в возрасте до 1 недели смертность близка к 100%. Патология TGEV аналогична таковой у других коронавирусов. Как только вирус заражает хозяина, он размножается в клеточной выстилке тонкого кишечника, что приводит к потере поглощающих клеток, что, в свою очередь, приводит к укорочению ворсинок . Зараженные свиньи затем теряют способность переваривать пищу и умирают от обезвоживания. [6]
возникновение
[ редактировать ]TGE был широко распространен в США, когда он был впервые обнаружен в начале 20 века. В конце 80-х годов он стал еще более дефицитным с распространением респираторного коронавируса свиней (PRCV). Считается, что PRCV обеспечивает некоторый иммунитет к TGE. [7]
Инженерный TGEV коронавирус
[ редактировать ]Вирус трансмиссивного гастроэнтерита был разработан как вектор экспрессии. Вектор был сконструирован путем замены несущественных ORF 3a и 3b, которые управляются последовательностями, регулирующими транскрипцию (TRS), зеленым флуоресцентным белком. Полученная конструкция все еще была энтеропатогенной, но со сниженным ростом. Заражение клеток этим измененным вирусом вызывает специфический лактогенный иммунный ответ против гетерологичного белка. Применение этого вектора находится в разработке вакцины или даже генной терапии. Мотивацией для разработки генома TGEV является то, что коронавирусы имеют большие геномы, поэтому в них есть место для внедрения чужеродных генов. Коронавирусы также поражают дыхательные пути , и их можно использовать для нацеливания антигенов на эту область и генерации некоторого иммунного ответа.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN 978-1-4939-2438-7 . ПМЦ 4369385 . ПМИД 25720466 .
См. Таблицу 1.
- ^ Ву, Патрик Сай; Хуан, И; Лау, Сюзанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. дои : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915 . ПМК 3185738 . ПМИД 21994708 .
Рисунок 2. Филогенетический анализ РНК-зависимых РНК-полимераз (Pol) коронавирусов с доступными полными последовательностями генома. Дерево было построено методом объединения соседей и укоренено с использованием полипротеина вируса Бреда.
- ^ «Браузер таксономии (Альфакоронавирус 1)» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 29 февраля 2020 г.
- ^ Тиль В., изд. (2007). Коронавирусы: молекулярная и клеточная биология (1-е изд.). Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-16-5 . [ нужна страница ]
- ^ Харрис, Д.Л. Хэнк. «Трансмиссивный гастроэнтерит свиней» . Ветеринарное руководство Merck . Мерк . Проверено 7 июля 2019 г.
- ^ Трансграничные и новые болезни животных . Университет штата Айова. 2016. ISBN 978-0-9846270-5-9 .
Внутренние ссылки
[ редактировать ]Внешние ссылки
[ редактировать ]- Лауд Х., Расшарт Д., Дельмас Б., Годе М., Гелфи Дж., Чарли Б. (июнь 1990 г.). «Молекулярная биология вируса трансмиссивного гастроэнтерита» . Ветеринарная микробиология . 23 (1–4): 147–54. дои : 10.1016/0378-1135(90)90144-К . ПМЦ 7117338 . ПМИД 2169670 .
- Сола И, Алонсо С, Суньига С, Балаш М, Плана-Дуран Х, Энхуанес Л (апрель 2003 г.). «Инженерия генома вируса трансмиссивного гастроэнтерита как вектора экспрессии, индуцирующего лактогенный иммунитет» . Журнал вирусологии . 77 (7): 4357–69. doi : 10.1128/JVI.77.7.4357-4369.2003 . ПМК 150661 . ПМИД 12634392 .
- Тадзима М. (март 1970 г.). «Морфология вируса трансмиссивного гастроэнтерита свиней» . Архив вирусологии . 29 (1): 105–8. дои : 10.1007/BF01253886 . ПМК 7086923 . ПМИД 4195092 .
