Человеческий коронавирус 229E
Альфакоронавирус Чикагоэнс | |
---|---|
Трансмиссионная электронная микрофотография коронавируса человека 229E | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Сорт: | Пизонивирицеты |
Заказ: | Ты этого не делал |
Семья: | Коронавирусы |
Род: | Альфакоронавирус |
Подрод: | Дувинаковирус |
Разновидность: | Альфакоронавирус Чикагоэнс
|
Синонимы | |
|
Альфакоронавирус Чикагоэнс [ 1 ] (также называемый коронавирусом человека 229E и сокращенно HCoV-229E ) — это разновидность коронавируса , который заражает людей и летучих мышей. [ 2 ] Это оболочечный одноцепочечный положительным смыслом , с РНК-вирус который проникает в клетку-хозяина путем связывания с рецептором APN . [ 3 ] Наряду с человеческим коронавирусом OC43 (представителем рода Betacoronavirus ) он является одним из вирусов, вызывающих простуду . [ 4 ] [ 5 ] HCoV-229E принадлежит к роду Alphacoronavirus и подроду Duvinacovirus . [ 6 ] [ 7 ]
Передача инфекции
[ редактировать ]HCoV-229E передается воздушно-капельным путем и через фомиты .
Признаки и симптомы
[ редактировать ]HCoV-229E связан с целым рядом респираторных симптомов , начиная от простуды и заканчивая тяжелыми последствиями, такими как пневмония и бронхиолит . Однако столь высокие исходы заболеваемости практически всегда наблюдаются при коинфекции другими респираторными возбудителями ; На сегодняшний день имеется единственный опубликованный отчет о случае инфекции 229E, которая вызвала острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) у здорового в остальном пациента, не имеющего обнаруживаемой коинфекции с другим патогеном . [ 8 ] HCoV-229E также входит в число коронавирусов, наиболее часто кодируемых с другими респираторными вирусами, особенно с респираторно-синцитиальным вирусом человека (HRSV). [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]
Эпидемиология
[ редактировать ]HCoV-229E — один из семи коронавирусов человека, в число которых входят HCoV-NL63 , HCoV-OC43 , HCoV-HKU1 , MERS-CoV , SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 распространены по всему миру. [ 12 ] [ 13 ] Однако вирусы были обнаружены в разных частях мира в разное время года. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] Исследование NCBI выявило предшествующую инфекцию HCoV-229E у 42,9–50,0% детей в возрасте 6–12 месяцев и у 65% детей в возрасте 2,5–3,5 лет. [ 17 ]
Вирусология
[ редактировать ]HCoV-229E — один из семи известных коронавирусов, поражающих человека. Остальные шесть: [ 18 ]
- Человеческий коронавирус NL63 (HCoV-NL63)
- Человеческий коронавирус OC43 (HCoV-OC43)
- Коронавирус человека HKU1 (HCoV-HKU1)
- Коронавирус, связанный с ближневосточным респираторным синдромом (MERS-CoV)
- Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-1)
- Тяжелый острый респираторный синдром, коронавирус 2 (SARS-CoV-2)
Исследовать
[ редактировать ]В этом разделе отсутствует информация о родственнике вируса альпака, также полученном от летучих мышей. ( октябрь 2021 г. ) |
Хлорохин , цинка ионофор , ингибирует репликацию человеческого коронавируса 229E в культуре клеток . [ 19 ]
Человеческий HCoV-229E и человеческий HCoV-NL63, вероятно, произошли от летучих мышей. [ 20 ]
История
[ редактировать ]Исследователь из Чикагского университета Дороти Хамре впервые идентифицировала 229E в 1965 году. [ 21 ] [ 22 ]
В 2021 году Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) утвердил новую систему наименования вирусов с использованием биномиальных имен. [ 23 ]
В 2023 году HCoV-229E был переименован в Alphacoronavirus Chicagoense.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Подробности о таксонах | ICTV» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 25 июля 2024 г.
- ^ Лим, Ивонн Синьи; Нг, Ян Лин; Тэм, Джеймс П.; Лю, Дин Сян (25 июля 2016 г.). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса с хозяином» . Болезни . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ISSN 2079-9721 . ПМЦ 5456285 . ПМИД 28933406 .
См. Таблицу 1.
- ^ Фер А.Р., Перлман С. (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Майер Х.Дж., Бикертон Э., Бриттон П. (ред.). Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 1282. Спрингер. стр. 1–23. дои : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . ISBN 978-1-4939-2438-7 . ПМЦ 4369385 . ПМИД 25720466 .
См. Таблицу 1.
- ^ Лау, СК; Ли, П.; Цанг, АК; Ага, CC; Це, Х.; Ли, РА; Итак, ЛИ; Лау, ЮЛ; Чан, К.Х.; Ву, ПК; Юэнь, Кентукки (2011). «Молекулярная эпидемиология человеческого коронавируса OC43 показывает эволюцию различных генотипов с течением времени и недавнее появление нового генотипа в результате естественной рекомбинации» . Журнал вирусологии . 85 (21): 11325–11337. дои : 10.1128/JVI.05512-11 . ПМК 3194943 . ПМИД 21849456 .
- ^ Гонт, скорая помощь; Харди, А.; Клаас, ЕС; Симмондс, П.; Темплтон, Кентукки (2010). «Эпидемиология и клинические проявления четырех коронавирусов человека 229E, HKU1, NL63 и OC43, обнаруженных за 3 года с использованием нового метода мультиплексной ПЦР в реальном времени» . Журнал клинической микробиологии . 48 (8): 2940–2947. дои : 10.1128/JCM.00636-10 . ПМК 2916580 . ПМИД 20554810 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018 года . Проверено 13 января 2019 г.
- ^ Ву, Патрик Сай; Хуан, И; Лау, Сюзанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. дои : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915 . ПМК 3185738 . ПМИД 21994708 .
Рисунок 2. Филогенетический анализ РНК-зависимых РНК-полимераз (Pol) коронавирусов с доступными полными последовательностями генома. Дерево было построено методом объединения соседей и укоренено с использованием полипротеина вируса Бреда.
- ^ Вассилара, Ф.; Спиридаки, А.; Потитос, Г.; Деливелиоту, А.; Пападопулос, А. (2018). «Редкий случай заражения коронавирусом человека 229E, связанный с острым респираторным дистресс-синдромом у здорового взрослого человека» . Отчеты о случаях инфекционных заболеваний . 2018 : 1–4. дои : 10.1155/2018/6796839 . ПМК 5925015 . ПМИД 29850307 .
- ^ Пене, Ф.; Мерла, А.; Вабрет, А.; Розенберг, Ф.; Бузин А.; Дрейфус, Ф.; Кариу, А.; Фреймут, Ф.; Лебон, П. (2003). «Пневмония, связанная с коронавирусом 229E, у пациентов с ослабленным иммунитетом» . Клинические инфекционные болезни . 37 (7): 929–932. дои : 10.1086/377612 . ПМЦ 7107892 . ПМИД 13130404 .
- ^ Вабрет, А.; Мурес, Т.; Гуарен, С.; Петижан, Ж.; Фреймут, Ф. (2003). «Вспышка респираторной инфекции, вызванной коронавирусом OC43, в Нормандии, Франция» . Клинические инфекционные болезни . 36 (8): 985–989. дои : 10.1086/374222 . ПМЦ 7109673 . ПМИД 12684910 .
- ^ Ву, ПК; Лау, СК; Цой, Х.В.; Хуанг, Ю.; Пун, RW; Чу, СМ; Ли, РА; Лук, ВК; Вонг, ГК; Вонг, Б.Х.; Ченг, ВК; Тан, бакалавр наук; Ву, АК; Юнг, RW; Чен, Х.; Гуань, Ю.; Чан, К.Х.; Юэнь, Кентукки (2005). «Клинические и молекулярно-эпидемиологические особенности коронавирусной HKU1-ассоциированной внебольничной пневмонии» . Журнал инфекционных болезней . 192 (11): 1898–2707. дои : 10.1086/497151 . ПМК 7110183 . ПМИД 16267760 .
- ^ Филдс, Б.Н., Д.М. Найп и П.М. Хоули (ред.). 1996. Поля вирусологии, 3-е изд. Липпинкотт-Рэйвен, Филадельфия, Пенсильвания.
- ^ Ван Дер Хук, Л.; Пирк, К.; Берхаут, Б. (2006). «Человеческий коронавирус NL63, новый респираторный вирус» . Обзоры микробиологии FEMS . 30 (5): 760–773. дои : 10.1111/j.1574-6976.2006.00032.x . ПМК 7109777 . ПМИД 16911043 .
- ^ Эспер, Ф.; Вейбель, К.; Фергюсон, Д.; Лэндри, ML; Кан, Дж. С. (2006). «Коронавирусная инфекция HKU1 в США» . Новые инфекционные заболевания . 12 (5): 775–779. дои : 10.3201/eid1205.051316 . ПМЦ 3374449 . ПМИД 16704837 .
- ^ Герна, Г.; Персиваль, Э.; Сарасини, А.; Кампанини, Дж.; Пиралла, А.; Ровида, Ф.; Дженини, Э.; Марчи, А.; Балданти, Ф. (2007). «Респираторный коронавирус человека HKU1 в сравнении с другими коронавирусными инфекциями у госпитализированных пациентов в Италии » Журнал клинической вирусологии . 38 (3): 244–250. дои : 10.1016/j.jcv.2006.12.008 . ПМЦ 7108341 . ПМИД 17222582 .
- ^ Кэй, HS; Марш, HB; Даудл, WR (1971). «Сероэпидемиологическое обследование случаев коронавирусной инфекции (штамм ОС 43) в детском населении» . Американский журнал эпидемиологии . 94 (1): 43–49. doi : 10.1093/oxfordjournals.aje.a121293 . ПМЦ 7109649 . ПМИД 5556222 .
- ^ Принципи, Н.; Босис, С.; Эспозито, С. (2010). «Последствия коронавирусной инфекции у детей» . Новые инфекционные заболевания . 16 (2): 183–188. дои : 10.3201/eid1602.090469 . ПМЦ 2957994 . ПМИД 20113545 .
- ^ де Уайльд, Адриан Х.; Йохманс, Дирк; Постума, Клара К.; Зевенховен-Доббе, Джессика С.; ван Ньюкооп, Стефан; Дорогой брат Тео М.; ван ден Хуген, Бернадетт Г.; Нейтс, Йохан; Каттер, Эрик Дж. (август 2014 г.). «Проверка библиотеки соединений, одобренной FDA, выявила четыре низкомолекулярных ингибитора репликации коронавируса ближневосточного респираторного синдрома в клеточной культуре» . Антимикробные средства и химиотерапия . 58 (8): 4875–4884. дои : 10.1128/AAC.03011-14 . ПМК 4136071 . ПМИД 24841269 .
- ^ Тао, Ю.; Ши, М.; Шомманар, К.; Королева, К.; Чжан, Дж.; Маркоттер, В.; Кузьмин, ИВ; Холмс, ЕС; Тонг, С. (2017). «Наблюдение за коронавирусами летучих мышей в Кении выявило родственников коронавирусов человека NL63 и 229E и историю их рекомбинации » Журнал вирусологии . 91 (5). дои : 10.1128/JVI.01953-16 . ПМК 5309958 . ПМИД 28077633 .
- ^ Кнапп, Алекс. «Тайная история первого коронавируса» . Форбс . Проверено 6 мая 2020 г.
- ^ Хамре, Д.; Прокноу, Джей-Джей (1 января 1966 г.). «Новый вирус, выделенный из дыхательных путей человека» . Экспериментальная биология и медицина . 121 (1): 190–193. дои : 10.3181/00379727-121-30734 . ISSN 1535-3702 . ПМИД 4285768 . S2CID 1314901 .
- ^ «Биномиальная номенклатура видов вирусов (продолжение)» . Глобальная база данных ЕОКЗР . Проверено 25 июля 2024 г.