PABPC4

PABPC4
Идентификаторы
Псевдонимы	PABPC4 , APP-1, APP1, PABP4, iPABP, цитоплазматический белок 4, связывающий поли(А)
Внешние идентификаторы	Опустить : 603407 ; МГИ : 2385206 ; Гомологен : 37855 ; Генные карты : PABPC4 ; OMA : PABPC4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	39,576,790 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	123,192,718 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of pancreas; ; gastrocnemius muscle; ; muscle of thigh; ; secondary oocyte; ; glutes; ; skeletal muscle tissue; ; vastus lateralis muscle; ; body of tongue; ; triceps brachii muscle; ; left ovary;
	Top expressed in
	bone marrow; ; epiblast; ; muscle of thigh; ; skeletal muscle tissue; ; tail of embryo; ; quadriceps femoris muscle; ; morula; ; yolk sac; ; genital tubercle; ; primary oocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	poly(C) RNA binding; protein binding; poly(A) binding; nucleic acid binding; poly(U) RNA binding; RNA binding; mRNA binding; mRNA 3'-UTR binding;
Cellular component	cytoplasmic stress granule; nucleus; cytoplasm; cytosol; ribonucleoprotein complex;
Biological process	RNA processing; RNA catabolic process; blood coagulation; protein biosynthesis; regulation of mRNA stability; myeloid cell development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8761
	230721
	ENSG00000090621
	ENSMUSG00000011257
	Q13310
	н/д
	НМ_003819 ; НМ_001135653 ; НМ_001135654
	НМ_130881 ; НМ_148917 ; НМ_001356377
	НП_001129125 ; НП_001129126 ; НП_003810
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Полиаденилат-связывающий белок 4 ( PABPC4 ) — это белок , который у человека кодируется PABPC4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Поли(А)-связывающие белки (PABP) связываются с поли(А)-хвостом, присутствующим на 3-шрайм-концах большинства эукариотических мРНК. PABPC4 или IPABP (индуцибельный PABP) выделяли как мРНК Т-клеток, индуцируемую активацией, кодирующую белок. Активация Т-клеток увеличила уровни мРНК PABPC4 в Т-клетках примерно в 5 раз. PABPC4 содержит 4 РНК-связывающих домена и богатый пролином С-конец. PABPC4 локализуется преимущественно в цитоплазме. Предполагается, что PABPC4 может быть необходим для регуляции стабильности лабильных видов мРНК в активированных Т-клетках. PABPC4 также был идентифицирован как антиген APP1 (активированный тромбоцитарный белок-1), экспрессируемый на активированных тромбином тромбоцитах кролика. PABPC4 также может участвовать в регуляции трансляции белков в тромбоцитах и мегакариоцитах или может участвовать в связывании или стабилизации полиаденилатов в плотных гранулах тромбоцитов. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PABPC4 взаимодействует с PHLDA1 . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000090621 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000011257 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фераль С., Маттеи М.Г., Павляк А., Геллаен Г. (ноябрь 1999 г.). «Хромосомная локализация трех генов поли(А)-связывающих белков человека и четырех родственных псевдогенов» . Хум Жене . 105 (4): 347–53. дои : 10.1007/s004399900148 . ПМЦ 1865476 . ПМИД 10543404 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: поли(А)-связывающий белок PABPC4, цитоплазматический 4 (индуцибельная форма)» .
^ Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (май 2001 г.). «Ингибирование синтеза белка продуктом гена TDAG51 человека, индуцируемым Т-клеточным рецептором». Клетка. Сигнал . 13 (5): 345–52. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00141-3 . ПМИД 11369516 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Ян Х., Дакетт К.С., Линдстен Т. (1996). «iPABP, индуцибельный поли(А)-связывающий белок, обнаруженный в активированных Т-клетках человека» . Мол. Клетка. Биол . 15 (12): 6770–6. дои : 10.1128/mcb.15.12.6770 . ПМК 230930 . ПМИД 8524242 .
Хунг А.К., Маггини Л., Клемент С.И., Рид Г.Л. (1997). «Идентификация и структура активированного тромбоцитарного белка-1, белка с мотивами РНК-связывающего домена, который экспрессируется активированными тромбоцитами» . Евро. Дж. Биохим . 243 (1–2): 209–18. дои : 10.1111/j.1432-1033.1997.0209a.x . ПМИД 9030741 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Хосино С., Имаи М., Кобаяши Т., Учида Н., Катада Т. (1999). «Фактор высвобождения полипептидной цепи эукариот (eRF3/GSPT), несущий сигнал терминации трансляции на 3'-поли(А) хвост мРНК. Прямая ассоциация erf3/GSPT с полиаденилат-связывающим белком» . Ж. Биол. Хим . 274 (24): 16677–80. дои : 10.1074/jbc.274.24.16677 . ПМИД 10358005 .
Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (2001). «Ингибирование синтеза белка продуктом гена TDAG51 человека, индуцируемым рецептором Т-клеток». Клетка. Сигнал . 13 (5): 345–52. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00141-3 . ПМИД 11369516 .
Ли Дж., Хокинс И.С., Харви К.Д., Дженнингс Дж.Л., Линк Эй.Дж., Паттон Дж.Г. (2003). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и его взаимодействующих белков» . Мол. Клетка. Биол . 23 (21): 7437–47. дои : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . ПМК 207616 . ПМИД 14559993 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (2004). «Схема белкового взаимодействия для деградации мРНК человека» . Геном Рез . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Ж.М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Гёлер Х, Лаловски М, Стельцль У, Вельтер С, Стродике М, Ворм У, Дроге А, Линденберг К.С., Кноблих М, Хениг С, Хербст М, Суопанки Дж, Шерзингер Е, Абрахам С, Бауэр Б, Хазенбанк Р, Фрицше А , Людвиг А.Х., Бюссов К., Бюссов К., Коулман Ш., Гутекунст К.А., Ландвермейер Б.Г. , Лерах Х., Ванкер Э.Э. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона» . Крот. Клетка . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . ПМИД 15383276 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Онг С.Е., Миттлер Г., Манн М. (2005). «Идентификация и количественная оценка сайтов метилирования in vivo тяжелым метилсилаком». Нат. Методы . 1 (2): 119–26. дои : 10.1038/nmeth715 . ПМИД 15782174 . S2CID 6654604 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000090621 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000011257 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10543404-5] Фераль С., Маттеи М.Г., Павляк А., Геллаен Г. (ноябрь 1999 г.). «Хромосомная локализация трех генов поли(А)-связывающих белков человека и четырех родственных псевдогенов» . Хум Жене . 105 (4): 347–53. дои : 10.1007/s004399900148 . ПМЦ 1865476 . ПМИД 10543404 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: поли(А)-связывающий белок PABPC4, цитоплазматический 4 (индуцибельная форма)» .

[pmid11369516-7] Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (май 2001 г.). «Ингибирование синтеза белка продуктом гена TDAG51 человека, индуцируемым Т-клеточным рецептором». Клетка. Сигнал . 13 (5): 345–52. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00141-3 . ПМИД 11369516 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]